Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00182771

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H13:           DNAJC16:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsv2-miR-H13 DNAJC16
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0014700 23341
Organism Human alphaherpesvirus 2 (HSV2) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - ERdj8

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR DNAJC16
chr1:15880474(+) A-I      intronic
chr1:15857366(+) A-I      intronic
chr1:15889050(+) A-I      intronic
chr1:15884573(+) A-I      intronic
chr1:15862139(+) A-I      intronic
chr1:15884575(+) A-I      intronic
chr1:15889058(+) A-I      intronic
chr1:15884479(+) A-I      intronic
chr1:15884493(+) A-I      intronic
chr1:15862195(+) A-I      intronic
chr1:15862426(+) A-I      intronic
chr1:15863463(+) A-I      intronic
chr1:15863464(+) A-I      intronic
chr1:15884531(+) A-I      intronic
chr1:15863485(+) A-I      intronic
chr1:15863526(+) A-I      intronic
chr1:15884540(+) A-I      intronic
chr1:15889804(+) A-I      intronic
chr1:15889974(+) A-I      intronic
chr1:15884555(+) A-I      intronic
chr1:15864779(+) A-I      intronic
chr1:15884587(+) A-I      intronic
chr1:15884601(+) A-I      intronic
chr1:15885088(+) A-I      intronic
chr1:15885632(+) A-I      intronic
chr1:15865091(+) A-I      intronic
chr1:15865092(+) A-I      intronic
chr1:15865870(+) A-I      intronic
chr1:15865940(+) A-I      intronic
chr1:15862190(+) A-I      intronic
chr1:15865964(+) A-I      intronic
chr1:15866364(+) A-I      intronic
chr1:15862072(+) A-I      intronic
chr1:15889156(+) A-I      intronic
chr1:15866601(+) A-I      intronic
chr1:15885680(+) A-I      intronic
chr1:15882526(+) A-I      intronic
chr1:15902437(+) A-I      3'UTR
chr1:15865948(+) A-I      intronic
chr1:15885695(+) A-I      intronic
chr1:15877574(+) A-I      intronic
chr1:15856702(+) A-I      intronic
chr1:15856795(+) A-I      intronic
chr1:15878208(+) A-I      intronic
chr1:15857222(+) A-I      intronic
chr1:15878827(+) A-I      intronic
chr1:15878829(+) A-I      intronic
chr1:15857368(+) A-I      intronic
chr1:15857392(+) A-I      intronic
chr1:15862145(+) A-I      intronic
chr1:15862185(+) A-I      intronic
chr1:15878838(+) A-I      intronic
chr1:15889074(+) A-I      intronic
chr1:15878925(+) A-I      intronic
chr1:15857444(+) A-I      intronic
chr1:15861981(+) A-I      intronic
chr1:15884430(+) A-I      intronic
chr1:15880421(+) A-I      intronic
chr1:15878835(+) A-I      intronic
chr1:15889093(+) A-I      intronic
chr1:15889110(+) A-I      intronic
chr1:15880427(+) A-I      intronic
chr1:15884469(+) A-I      intronic
chr1:15880437(+) A-I      intronic
chr1:15880593(+) A-I      intronic
chr1:15880631(+) A-I      intronic
chr1:15880632(+) A-I      intronic
chr1:15880639(+) A-I      intronic
chr1:15862123(+) A-I      intronic
chr1:15865880(+) A-I      intronic
chr1:15880484(+) A-I      intronic
chr1:15862040(+) A-I      intronic
chr1:15880686(+) A-I      intronic
chr1:15878863(+) A-I      intronic
chr1:15885615(+) A-I      intronic
chr1:15878209(+) A-I      intronic
chr1:15880669(+) A-I      intronic
chr1:15874117(+) A-I      intronic
chr1:15856679(+) A-I      intronic
chr1:15857445(+) A-I      intronic
chr1:15878899(+) A-I      intronic
chr1:15896186(+) A-I      3'UTR
chr1:15889003(+) A-I      intronic
chr1:15862393(+) A-I      intronic
chr1:15889253(+) A-I      intronic
chr1:15880567(+) A-I      intronic
chr1:15896322(+) A-I      3'UTR
chr1:15896435(+) A-I      3'UTR
chr1:15862107(+) A-I      intronic
chr1:15885528(+) A-I      intronic
chr1:15881803(+) A-I      intronic
chr1:15864775(+) A-I      intronic
chr1:15903882(+) A-I      intronic
chr1:15862055(+) A-I      intronic
chr1:15882921(+) A-I      intronic
chr1:15856673(+) A-I      intronic
chr1:15881302(+) A-I      intronic
chr1:15896419(+) A-I      3'UTR
chr1:15878904(+) A-I      intronic
chr1:15857385(+) A-I      intronic
chr1:15896371(+) A-I      3'UTR
chr1:15880443(+) A-I      intronic
chr1:15879411(+) A-I      intronic
chr1:15884724(+) A-I      intronic
chr1:15884917(+) A-I      intronic
chr1:15873690(+) A-I      intronic
chr1:15884476(+) A-I      intronic
chr1:15865048(+) A-I      intronic
chr1:15885483(+) A-I      intronic
chr1:15896325(+) A-I      3'UTR
chr1:15856730(+) A-I      intronic
chr1:15881281(+) A-I      intronic
chr1:15862708(+) A-I      intronic
chr1:15884872(+) A-I      intronic
chr1:15866098(+) A-I      intronic
chr1:15881615(+) A-I      intronic
chr1:15866403(+) A-I      intronic
chr1:15888057(+) A-I      intronic
chr1:15881661(+) A-I      intronic
chr1:15857234(+) A-I      intronic
chr1:15880513(+) A-I      intronic
chr1:15882582(+) A-I      intronic
chr1:15896309(+) A-I      3'UTR
chr1:15885676(+) A-I      intronic
chr1:15859912(+) A-I      intronic
chr1:15882579(+) A-I      intronic
chr1:15878893(+) A-I      intronic
chr1:15862119(+) A-I      intronic
chr1:15862837(+) A-I      intronic
chr1:15877421(+) A-I      intronic
chr1:15861126(+) A-I      intronic
chr1:15889903(+) A-I      intronic
chr1:15880449(+) A-I      intronic
chr1:15867167(+) A-I      intronic
chr1:15907336(+) A-I      intronic
chr1:15889945(+) A-I      intronic
chr1:15884956(+) A-I      intronic
chr1:15878226(+) A-I      intronic
chr1:15896269(+) A-I      3'UTR
chr1:15859873(+) A-I      intronic
chr1:15889257(+) A-I      intronic
chr1:15879810(+) A-I      intronic
chr1:15890251(+) A-I      intronic
chr1:15884910(+) A-I      intronic
chr1:15888105(+) A-I      intronic
chr1:15884777(+) A-I      intronic
chr1:15872751(+) A-I      intronic
chr1:15906775(+) A-I      intronic
chr1:15884745(+) A-I      intronic
chr1:15862030(+) A-I      intronic
chr1:15862401(+) A-I      intronic
chr1:15884346(+) A-I      intronic
chr1:15885701(+) A-I      intronic
chr1:15862275(+) A-I      intronic
chr1:15862031(+) A-I      intronic
chr1:15866140(+) A-I      intronic
chr1:15896265(+) A-I      3'UTR
chr1:15866432(+) A-I      intronic
chr1:15896275(+) A-I      3'UTR
chr1:15862044(+) A-I      intronic
chr1:15862469(+) A-I      intronic
chr1:15859866(+) A-I      intronic
chr1:15878243(+) A-I      intronic
chr1:15889172(+) A-I      intronic
chr1:15890150(+) A-I      intronic
chr1:15893137(+) A-I      intronic
chr1:15862180(+) A-I      intronic
chr1:15889877(+) A-I      intronic
chr1:15862495(+) A-I      intronic
chr1:15893169(+) A-I      intronic
chr1:15893187(+) A-I      intronic
chr1:15861031(+) A-I      intronic
chr1:15862177(+) A-I      intronic
chr1:15880618(+) A-I      intronic
chr1:15862115(+) A-I      intronic
chr1:15878728(+) A-I      intronic
chr1:15854849(+) A-I      intronic
chr1:15861141(+) A-I      intronic
chr1:15861007(+) A-I      intronic
chr1:15881320(+) A-I      intronic
chr1:15896376(+) A-I      3'UTR
chr1:15863611(+) A-I      intronic
chr1:15914191(+) A-I      intronic
chr1:15882227(+) A-I      intronic
chr1:15880534(+) A-I      intronic
chr1:15884763(+) A-I      intronic
chr1:15890145(+) A-I      intronic
chr1:15859858(+) A-I      intronic
chr1:15889081(+) A-I      intronic
chr1:15885010(+) A-I      intronic
chr1:15866448(+) A-I      intronic
chr1:15862070(+) A-I      intronic
chr1:15862310(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED DNAJC16
chr1:15896309(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr1:15896322(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr1:15896325(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr1:15896371(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr1:15896376(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr1:15896419(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr1:15896435(+) A-I exon 3'UTR    15258596
chr1:15881320(+) A-G intron -    22484847
chr1:15857234(+) A-G intron -    22484847
chr1:15857385(+) A-G intron -    22484847
chr1:15861007(+) A-G intron -    22484847
chr1:15861031(+) A-G intron -    22484847
chr1:15862030(+) A-G intron -    22484847
chr1:15862031(+) A-G intron -    22484847
chr1:15862040(+) A-G intron -    22484847
chr1:15862055(+) A-G intron -    22484847
chr1:15862180(+) A-G intron -    22484847
chr1:15862401(+) A-G intron -    22484847
chr1:15864775(+) A-G intron -    22484847
chr1:15865880(+) A-G intron -    22484847
chr1:15877421(+) A-G intron -    22484847
chr1:15878728(+) A-G intron -    22484847
chr1:15880534(+) A-G intron -    22484847
chr1:15884342(+) T-C intron -    22484847
chr1:15885528(+) A-G intron -    22484847
chr1:15885701(+) A-G intron -    22484847
chr1:15889003(+) A-G intron -    22484847
chr1:15889172(+) A-G intron -    22484847
chr1:15893174(+) T-C intron -    22484847
chr1:15893181(+) T-C intron -    22484847
chr1:15896956(+) T-C intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase DNAJC16
chr1:15853404-15853405(+) m6A 5'UTR       24981863
chr1:15894311-15894312(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625//24981863//22608085
chr1:15894370-15894371(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625//24981863//26404942//22575960//22608085
chr1:15894468-15894469(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr1:15894545-15894546(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr1:15894662-15894663(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr1:15894667-15894668(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085
chr1:15894695-15894696(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr1:15894704-15894705(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr1:15894726-15894727(+) m6A 3'UTR//exon//intron       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085
chr1:15894741-15894742(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085
chr1:15894747-15894748(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085
chr1:15894760-15894761(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085
chr1:15894792-15894793(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085
chr1:15894844-15894845(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//24981863//22608085
chr1:15894929-15894930(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr1:15895037-15895038(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr1:15895132-15895133(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863
chr1:15895366-15895367(+) m6A 3'UTR//exon//intron       25456834//24981863//22608085
chr1:15895586-15895587(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15895666-15895667(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15895686-15895687(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15895716-15895717(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15895786-15895787(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15896027-15896028(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15896108-15896109(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15896638-15896639(+) m6A 3'UTR//exon//intron       27773535
chr1:15896846-15896847(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15896853-15896854(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15896927-15896928(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15897018-15897019(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15897069-15897070(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15897435-15897436(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15897466-15897467(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15897477-15897478(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15897918-15897919(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15897959-15897960(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15898075-15898076(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15898155-15898156(+) m6A 3'UTR//intron       27773535
chr1:15898208-15898209(+) m6A 3'UTR//intron       27773535

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate DNAJC16
Chromatin K562 cells     -
Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsv2-miR-H13
Interactor2: DNAJC16

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//PITA//Targetscan
Support Database RepTar//VmiReg

Starting a new search, please wait ...