Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00181293

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H12:  MIMAT0014699          OCLN:  NM_001205255     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv2-miR-H12	OCLN
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014699	100506658
Organism	Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	BLCPMG//PPP1R115//PTORCH1

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	OCLN	chr5:68815995(+) A-I      intronic chr5:68815915(+) A-I      intronic chr5:68815903(+) A-I      intronic chr5:68813349(+) A-I      intronic chr5:68813337(+) A-I      intronic chr5:68813320(+) A-I      intronic chr5:68813271(+) A-I      intronic chr5:68812758(+) A-I      intronic chr5:68796367(+) A-I      intronic chr5:68812740(+) A-I      intronic chr5:68812657(+) A-I      intronic chr5:68807338(+) A-I      intronic chr5:68807339(+) A-I      intronic chr5:68807356(+) A-I      intronic chr5:68799872(+) A-I      intronic chr5:68797761(+) A-I      intronic chr5:68796880(+) A-I      intronic chr5:68796844(+) A-I      intronic chr5:68796429(+) A-I      intronic chr5:68806254(+) A-I      intronic chr5:68803942(+) A-I      intronic chr5:68803937(+) A-I      intronic chr5:68803532(+) A-I      intronic chr5:68801029(+) A-I      intronic chr5:68796403(+) A-I      intronic chr5:68790141(+) A-I      intronic chr5:68790094(+) A-I      intronic chr5:68790131(+) A-I      intronic chr5:68790247(+) A-I      intronic chr5:68794538(+) A-I      intronic chr5:68797849(+) A-I      intronic chr5:68833094(+) A-I      intronic chr5:68828777(+) A-I      intronic chr5:68828706(+) A-I      intronic chr5:68794606(+) A-I      intronic chr5:68794607(+) A-I      intronic chr5:68794624(+) A-I      intronic chr5:68794646(+) A-I      intronic chr5:68797866(+) A-I      intronic chr5:68797865(+) A-I      intronic chr5:68797847(+) A-I      intronic chr5:68794767(+) A-I      intronic chr5:68807378(+) A-I      intronic chr5:68828701(+) A-I      intronic chr5:68819896(+) A-I      intronic chr5:68817402(+) A-I      intronic chr5:68797962(+) A-I      intronic chr5:68817368(+) A-I      intronic chr5:68816774(+) A-I      intronic chr5:68794768(+) A-I      intronic chr5:68795009(+) A-I      intronic chr5:68795026(+) A-I      intronic chr5:68795032(+) A-I      intronic chr5:68795176(+) A-I      intronic chr5:68796321(+) A-I      intronic chr5:68796327(+) A-I      intronic chr5:68796328(+) A-I      intronic chr5:68796331(+) A-I      intronic chr5:68796332(+) A-I      intronic chr5:68817410(+) A-I      intronic chr5:68806383(+) A-I      intronic chr5:68806389(+) A-I      intronic chr5:68806416(+) A-I      intronic chr5:68807029(+) A-I      intronic chr5:68807041(+) A-I      intronic chr5:68807047(+) A-I      intronic chr5:68807092(+) A-I      intronic chr5:68807185(+) A-I      intronic chr5:68799823(+) A-I      intronic chr5:68829694(+) A-I      intronic chr5:68796345(+) A-I      intronic chr5:68816744(+) A-I      intronic chr5:68797839(+) A-I      intronic chr5:68797242(+) A-I      intronic chr5:68812702(+) A-I      intronic chr5:68807583(+) A-I      intronic chr5:68797792(+) A-I      intronic chr5:68794111(+) A-I      intronic chr5:68817351(+) A-I      intronic chr5:68797336(+) A-I      intronic chr5:68796302(+) A-I      intronic chr5:68794174(+) A-I      intronic chr5:68829544(+) A-I      intronic chr5:68817330(+) A-I      intronic chr5:68797800(+) A-I      intronic chr5:68794210(+) A-I      intronic chr5:68815966(+) A-I      intronic chr5:68816775(+) A-I      intronic chr5:68807432(+) A-I      intronic chr5:68799806(+) A-I      intronic chr5:68796489(+) A-I      intronic chr5:68851281(+) A-I      3'UTR chr5:68851270(+) A-I      3'UTR chr5:68850944(+) A-I      3'UTR chr5:68813277(+) A-I      intronic chr5:68819800(+) A-I      intronic chr5:68815925(+) A-I      intronic chr5:68819463(+) A-I      intronic chr5:68796340(+) A-I      intronic chr5:68795154(+) A-I      intronic chr5:68806331(+) A-I      intronic chr5:68822909(+) A-I      intronic chr5:68828775(+) A-I      intronic chr5:68795053(+) A-I      intronic chr5:68790194(+) A-I      intronic chr5:68806324(+) A-I      intronic chr5:68817388(+) A-I      intronic chr5:68816731(+) A-I      intronic chr5:68797202(+) A-I      intronic chr5:68795137(+) A-I      intronic chr5:68807729(+) A-I      intronic chr5:68819890(+) A-I      intronic chr5:68796873(+) A-I      intronic chr5:68812802(+) A-I      intronic chr5:68794943(+) A-I      intronic chr5:68797365(+) A-I      intronic chr5:68796488(+) A-I      intronic chr5:68813303(+) A-I      intronic chr5:68796924(+) A-I      intronic chr5:68797769(+) A-I      intronic chr5:68793247(+) A-I      intronic chr5:68844528(+) A-I      intronic chr5:68807478(+) A-I      intronic chr5:68797854(+) A-I      intronic chr5:68844553(+) A-I      intronic chr5:68819957(+) A-I      intronic chr5:68834746(+) A-I      intronic chr5:68816752(+) A-I      intronic chr5:68807372(+) A-I      intronic chr5:68828752(+) A-I      intronic chr5:68790166(+) A-I      intronic chr5:68828141(+) A-I      intronic chr5:68797362(+) A-I      intronic chr5:68797358(+) A-I      intronic chr5:68829528(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	OCLN	chr5:68790095(+) A-G intron -    22484847 chr5:68790180(+) A-G intron -    22484847 chr5:68793247(+) A-G intron -    22484847 chr5:68794242(+) A-G intron -    22484847 chr5:68794689(+) A-G intron -    22484847 chr5:68794741(+) A-G intron -    22484847 chr5:68796340(+) A-G intron -    22484847 chr5:68796431(+) A-G intron -    22484847 chr5:68796488(+) A-G intron -    22484847 chr5:68796489(+) A-G intron -    22484847 chr5:68797769(+) A-G intron -    22484847 chr5:68797792(+) A-G intron -    22484847 chr5:68797795(+) A-G intron -    22484847 chr5:68797854(+) A-G intron -    22484847 chr5:68803550(+) A-G intron -    22484847 chr5:68803559(+) A-G intron -    22484847 chr5:68806331(+) A-G intron -    22484847 chr5:68806938(+) A-G intron -    22484847 chr5:68807351(+) A-G intron -    22484847 chr5:68807372(+) A-G intron -    22484847 chr5:68813303(+) A-G intron -    22484847 chr5:68815925(+) A-G intron -    22484847 chr5:68815966(+) A-G intron -    22484847 chr5:68817388(+) A-G intron -    22484847 chr5:68819463(+) A-G intron -    22484847 chr5:68819751(+) A-G intron -    22484847 chr5:68819800(+) A-G intron -    22484847 chr5:68819855(+) A-G intron -    22484847 chr5:68819890(+) A-G intron -    22484847 chr5:68828675(+) A-G intron -    22484847 chr5:68828734(+) A-G intron -    22484847 chr5:68828752(+) A-G intron -    22484847 chr5:68828775(+) A-G intron -    22484847 chr5:68834746(+) A-G intron -    22484847 chr5:68844528(+) A-G intron -    22484847 chr5:68844553(+) A-G intron -    22484847 chr5:68850944(+) A-G intron -    22484847 chr5:68851270(+) A-G intron -    22484847 chr5:68851284(+) T-C intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	OCLN	chr5:68788437-68788438(+) m6A 5'UTR       24981863 chr5:68804970-68804971(+) m6A CDS//intron       22608085 chr5:68805091-68805092(+) m6A CDS//intron       24209618//25456834//24981863//22608085 chr5:68805185-68805186(+) m6A CDS//intron       24209618//25456834//24981863//22608085 chr5:68805199-68805200(+) m6A CDS//intron       24209618//25456834//24981863//22608085 chr5:68805314-68805315(+) m6A CDS//intron       25456834//24981863//22608085 chr5:68840818-68840819(+) m6A CDS//exon       24981863 chr5:68840869-68840870(+) m6A CDS//exon       24981863 chr5:68840890-68840891(+) m6A CDS//exon       24981863 chr5:68840936-68840937(+) m6A CDS//exon       24981863 chr5:68843789-68843790(+) m6A CDS//exon       24981863 chr5:68843849-68843850(+) m6A CDS//exon       24981863 chr5:68843870-68843871(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085 chr5:68847393-68847394(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085 chr5:68849475-68849476(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085 chr5:68849485-68849486(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085 chr5:68849492-68849493(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535//22608085 chr5:68849574-68849575(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085 chr5:68849594-68849595(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085 chr5:68849684-68849685(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085 chr5:68849713-68849714(+) m6A 3'UTR//exon       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	OCLN	Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv2-miR-H12
Interactor2: OCLN

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg