Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00178213

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H11-5p:           COX18:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsv2-miR-H11-5p COX18
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0014697 285521
Organism Human alphaherpesvirus 2 (HSV2) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - COX18HS

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR COX18
chr4:73929862(-) A-I      intronic
chr4:73929931(-) A-I      intronic
chr4:73929867(-) A-I      intronic
chr4:73923535(-) A-I      3'UTR
chr4:73922579(-) A-I      3'UTR
chr4:73923555(-) A-I      3'UTR
chr4:73922646(-) A-I      3'UTR
chr4:73923584(-) A-I      3'UTR
chr4:73923525(-) A-I      3'UTR
chr4:73922694(-) A-I      3'UTR
chr4:73922832(-) A-I      3'UTR
chr4:73922918(-) A-I      3'UTR
chr4:73922923(-) A-I      3'UTR
chr4:73923593(-) A-I      3'UTR
chr4:73923139(-) A-I      3'UTR
chr4:73923463(-) A-I      3'UTR
chr4:73923474(-) A-I      3'UTR
chr4:73923415(-) A-I      3'UTR
chr4:73922655(-) A-I      3'UTR
chr4:73923141(-) A-I      3'UTR
chr4:73923656(-) A-I      3'UTR
chr4:73923556(-) A-I      3'UTR
chr4:73923590(-) A-I      3'UTR
chr4:73923558(-) A-I      3'UTR
chr4:73923484(-) A-I      3'UTR
chr4:73923607(-) A-I      3'UTR
chr4:73922752(-) A-I      3'UTR
chr4:73923568(-) A-I      3'UTR
chr4:73923508(-) A-I      3'UTR
chr4:73922987(-) A-I      3'UTR
chr4:73923626(-) A-I      3'UTR
chr4:73923056(-) A-I      3'UTR
chr4:73920566(-) A-I      3'UTR
chr4:73922901(-) A-I      3'UTR
chr4:73922927(-) A-I      3'UTR
chr4:73923035(-) A-I      3'UTR
chr4:73923074(-) A-I      3'UTR
chr4:73922658(-) A-I      3'UTR
chr4:73923602(-) A-I      3'UTR
chr4:73922581(-) A-I      3'UTR
chr4:73923413(-) A-I      3'UTR
chr4:73922978(-) A-I      3'UTR
chr4:73922716(-) A-I      3'UTR
chr4:73923012(-) A-I      3'UTR
chr4:73923653(-) A-I      3'UTR
chr4:73923684(-) A-I      3'UTR
chr4:73922952(-) A-I      3'UTR
chr4:73922995(-) A-I      3'UTR
chr4:73923096(-) A-I      3'UTR
chr4:73923551(-) A-I      3'UTR
chr4:73922887(-) A-I      3'UTR
chr4:73922981(-) A-I      3'UTR
chr4:73923565(-) A-I      3'UTR
chr4:73923032(-) A-I      3'UTR
chr4:73923519(-) A-I      3'UTR
chr4:73922593(-) A-I      3'UTR
chr4:73922755(-) A-I      3'UTR
chr4:73922594(-) A-I      3'UTR
chr4:73923621(-) A-I      3'UTR
chr4:73923515(-) A-I      3'UTR
chr4:73923060(-) A-I      3'UTR
chr4:73923592(-) A-I      3'UTR
chr4:73923582(-) A-I      3'UTR
chr4:73923670(-) A-I      3'UTR
chr4:73923541(-) A-I      3'UTR
chr4:73922926(-) A-I      3'UTR
chr4:73922756(-) A-I      3'UTR
chr4:73923459(-) A-I      3'UTR
chr4:73923472(-) A-I      3'UTR
chr4:73923492(-) A-I      3'UTR
chr4:73923524(-) A-I      3'UTR
chr4:73923097(-) A-I      3'UTR
chr4:73923571(-) A-I      3'UTR
chr4:73923395(-) A-I      3'UTR
chr4:73922689(-) A-I      3'UTR
chr4:73923043(-) A-I      3'UTR
chr4:73923449(-) A-I      3'UTR
chr4:73923025(-) A-I      3'UTR
chr4:73923452(-) A-I      3'UTR
chr4:73922899(-) A-I      3'UTR
chr4:73923567(-) A-I      3'UTR
chr4:73923498(-) A-I      3'UTR
chr4:73923613(-) A-I      3'UTR
chr4:73922743(-) A-I      3'UTR
chr4:73922976(-) A-I      3'UTR
chr4:73922751(-) A-I      3'UTR
chr4:73922738(-) A-I      3'UTR
chr4:73923105(-) A-I      3'UTR
chr4:73929228(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED COX18
chr4:73922899(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596   //22327324
chr4:73922901(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr4:73922926(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr4:73922978(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr4:73922981(-) A-I exon 3'UTR    15258596
chr4:73923035(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr4:73923043(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596   //21960545   //22327324
chr4:73923096(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr4:73923097(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr4:73923105(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr4:73923449(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596   //21960545   //22327324
chr4:73923551(-) A-I exon 3'UTR    15258596   //21960545
chr4:73923554(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr4:73923565(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr4:73923568(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596   //22327324
chr4:73923592(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596   //21960545   //22327324
chr4:73923607(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr4:73922593(-) A-I exon 3'UTR    22327324
chr4:73922672(-) A-I exon 3'UTR    22327324
chr4:73922743(-) A-I exon 3'UTR    21960545   //22327324
chr4:73922996(-) A-I exon 3'UTR    22327324
chr4:73923414(-) A-I exon 3'UTR    21960545   //22327324
chr4:73923452(-) A-I exon 3'UTR    22327324
chr4:73923454(-) A-I exon 3'UTR    22327324
chr4:73923472(-) A-I exon 3'UTR    22327324
chr4:73923661(-) A-I exon 3'UTR    22327324
chr4:73923662(-) A-I exon 3'UTR    22327324
chr4:73923567(-) A-I exon 3'UTR    21960545
chr4:73922057(-) A-I exon 3'UTR    21960545
chr4:73922193(-) A-I exon 3'UTR    21960545
chr4:73922620(-) A-I exon 3'UTR    21960545
chr4:73922621(-) A-I exon 3'UTR    21960545
chr4:73923097(-) A-G exon 3'UTR    21725310   //22484847
chr4:73923449(-) A-G exon 3'UTR    21725310   //22484847
chr4:73922581(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73922593(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73922594(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73922620(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73922672(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73922690(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73922716(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73922743(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73922755(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73922756(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73922887(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73922899(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73922926(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73922964(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73922978(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73922981(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923035(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923043(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923091(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923105(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923392(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923413(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923414(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923452(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923454(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923472(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923483(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923498(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923502(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923515(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923524(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923541(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923551(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923566(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923567(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923568(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923571(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923583(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923592(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923605(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923607(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923621(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923626(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923653(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923661(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923662(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73923678(-) A-G exon 3'UTR    22484847
chr4:73928465(-) C-T intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase COX18
chr4:73922374-73922375(-) m6A 3'UTR       27773535
chr4:73922436-73922437(-) m6A 3'UTR       27773535
chr4:73922451-73922452(-) m6A 3'UTR       27773535
chr4:73923686-73923687(-) m6A 3'UTR       27773535
chr4:73923770-73923771(-) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate COX18
Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsv2-miR-H11-5p
Interactor2: COX18

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//Targetscan
Support Database VmiReg

Starting a new search, please wait ...