Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00178205

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H11-5p:           BCLAF3:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsv2-miR-H11-5p BCLAF3
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0014697 256643
Organism Human alphaherpesvirus 2 (HSV2) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - CXorf23

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR BCLAF3
chrX:19981146(-) A-I      intronic
chrX:19939828(-) A-I      intronic
chrX:19940009(-) A-I      intronic
chrX:19981436(-) A-I      intronic
chrX:19957824(-) A-I      intronic
chrX:19957816(-) A-I      intronic
chrX:19981966(-) A-I      intronic
chrX:19981984(-) A-I      intronic
chrX:19940909(-) A-I      intronic
chrX:19982009(-) A-I      intronic
chrX:19940932(-) A-I      intronic
chrX:19942007(-) A-I      intronic
chrX:19942229(-) A-I      intronic
chrX:19942022(-) A-I      intronic
chrX:19942224(-) A-I      intronic
chrX:19942164(-) A-I      intronic
chrX:19936787(-) A-I      intronic
chrX:19936791(-) A-I      intronic
chrX:19936826(-) A-I      intronic
chrX:19942174(-) A-I      intronic
chrX:19945140(-) A-I      intronic
chrX:19945153(-) A-I      intronic
chrX:19945162(-) A-I      intronic
chrX:19936829(-) A-I      intronic
chrX:19945172(-) A-I      intronic
chrX:19936832(-) A-I      intronic
chrX:19936834(-) A-I      intronic
chrX:19936836(-) A-I      intronic
chrX:19945182(-) A-I      intronic
chrX:19936837(-) A-I      intronic
chrX:19945197(-) A-I      intronic
chrX:19945301(-) A-I      intronic
chrX:19945306(-) A-I      intronic
chrX:19936838(-) A-I      intronic
chrX:19936839(-) A-I      intronic
chrX:19936853(-) A-I      intronic
chrX:19936854(-) A-I      intronic
chrX:19936890(-) A-I      intronic
chrX:19945309(-) A-I      intronic
chrX:19945828(-) A-I      intronic
chrX:19946700(-) A-I      intronic
chrX:19950742(-) A-I      intronic
chrX:19950849(-) A-I      intronic
chrX:19950887(-) A-I      intronic
chrX:19950916(-) A-I      intronic
chrX:19938790(-) A-I      intronic
chrX:19938799(-) A-I      intronic
chrX:19938827(-) A-I      intronic
chrX:19940250(-) A-I      intronic
chrX:19940259(-) A-I      intronic
chrX:19940264(-) A-I      intronic
chrX:19942225(-) A-I      intronic
chrX:19953122(-) A-I      intronic
chrX:19953130(-) A-I      intronic
chrX:19953139(-) A-I      intronic
chrX:19942217(-) A-I      intronic
chrX:19946176(-) A-I      intronic
chrX:19940935(-) A-I      intronic
chrX:19950922(-) A-I      intronic
chrX:19942155(-) A-I      intronic
chrX:19936719(-) A-I      intronic
chrX:19952090(-) A-I      intronic
chrX:19952121(-) A-I      intronic
chrX:19953180(-) A-I      intronic
chrX:19936727(-) A-I      intronic
chrX:19936751(-) A-I      intronic
chrX:19936755(-) A-I      intronic
chrX:19977674(-) A-I      intronic
chrX:19948734(-) A-I      Syn:Thr->Thr
chrX:19977849(-) A-I      intronic
chrX:19936764(-) A-I      intronic
chrX:19980333(-) A-I      intronic
chrX:19980368(-) A-I      intronic
chrX:19936770(-) A-I      intronic
chrX:19942190(-) A-I      intronic
chrX:19936783(-) A-I      intronic
chrX:19942199(-) A-I      intronic
chrX:19946614(-) A-I      intronic
chrX:19936827(-) A-I      intronic
chrX:19936885(-) A-I      intronic
chrX:19937809(-) A-I      intronic
chrX:19957847(-) A-I      intronic
chrX:19937875(-) A-I      intronic
chrX:19957836(-) A-I      intronic
chrX:19937892(-) A-I      intronic
chrX:19957834(-) A-I      intronic
chrX:19937923(-) A-I      intronic
chrX:19938889(-) A-I      intronic
chrX:19939744(-) A-I      intronic
chrX:19948669(-) A-I      NonSyn:Stp->Trp
chrX:19948693(-) A-I      NonSyn:Tyr->Cys
chrX:19980476(-) A-I      intronic
chrX:19980998(-) A-I      intronic
chrX:19950923(-) A-I      intronic
chrX:19948347(-) A-I      3'UTR
chrX:19931396(-) A-I      3'UTR
chrX:19948317(-) A-I      3'UTR
chrX:19948272(-) A-I      3'UTR
chrX:19931386(-) A-I      3'UTR
chrX:19948246(-) A-I      3'UTR
chrX:19931473(-) A-I      3'UTR
chrX:19931429(-) A-I      3'UTR
chrX:19931356(-) A-I      3'UTR
chrX:19931405(-) A-I      3'UTR
chrX:19931373(-) A-I      3'UTR
chrX:19931370(-) A-I      3'UTR
chrX:19950746(-) A-I      intronic
chrX:19940910(-) A-I      intronic
chrX:19942057(-) A-I      intronic
chrX:19981395(-) A-I      intronic
chrX:19942100(-) A-I      intronic
chrX:19938720(-) A-I      intronic
chrX:19936947(-) A-I      intronic
chrX:19940012(-) A-I      intronic
chrX:19946638(-) A-I      intronic
chrX:19945898(-) A-I      intronic
chrX:19945282(-) A-I      intronic
chrX:19953099(-) A-I      intronic
chrX:19969565(-) A-I      intronic
chrX:19978038(-) A-I      intronic
chrX:19946497(-) A-I      intronic
chrX:19980448(-) A-I      intronic
chrX:19946698(-) A-I      intronic
chrX:19946115(-) A-I      intronic
chrX:19938772(-) A-I      intronic
chrX:19942056(-) A-I      intronic
chrX:19938830(-) A-I      intronic
chrX:19945792(-) A-I      intronic
chrX:19982135(-) A-I      intronic
chrX:19981327(-) A-I      intronic
chrX:19946696(-) A-I      intronic
chrX:19969531(-) A-I      intronic
chrX:19940277(-) A-I      intronic
chrX:19948733(-) A-I      NonSyn:Ile->Val
chrX:19952071(-) A-I      intronic
chrX:19952062(-) A-I      intronic
chrX:19948711(-) A-I      NonSyn:Tyr->Cys
chrX:19940759(-) A-I      intronic
chrX:19946056(-) A-I      intronic
chrX:19978058(-) A-I      intronic
chrX:19952109(-) A-I      intronic
chrX:19952010(-) A-I      intronic
chrX:19952070(-) A-I      intronic
chrX:19952072(-) A-I      intronic
chrX:19952076(-) A-I      intronic
chrX:19952064(-) A-I      intronic
chrX:19951972(-) A-I      intronic
chrX:19980952(-) A-I      intronic
chrX:19952069(-) A-I      intronic
chrX:19942121(-) A-I      intronic
chrX:19940238(-) A-I      intronic
chrX:19946592(-) A-I      intronic
chrX:19946509(-) A-I      intronic
chrX:19946649(-) A-I      intronic
chrX:19980468(-) A-I      intronic
chrX:19936744(-) A-I      intronic
chrX:19951974(-) A-I      intronic
chrX:19977669(-) A-I      intronic
chrX:19982090(-) A-I      intronic
chrX:19938694(-) A-I      intronic
chrX:19946257(-) A-I      intronic
chrX:19945262(-) A-I      intronic
chrX:19946538(-) A-I      intronic
chrX:19931290(-) A-I      3'UTR
chrX:19931365(-) A-I      3'UTR
chrX:19931289(-) A-I      3'UTR
chrX:19948162(-) A-I      3'UTR
chrX:19931297(-) A-I      3'UTR
chrX:19948263(-) A-I      3'UTR
chrX:19931288(-) A-I      3'UTR
chrX:19931343(-) A-I      3'UTR
chrX:19948346(-) A-I      3'UTR
chrX:19948237(-) A-I      3'UTR
chrX:19931329(-) A-I      3'UTR
chrX:19948224(-) A-I      3'UTR
chrX:19948353(-) A-I      3'UTR
chrX:19931320(-) A-I      3'UTR
chrX:19948342(-) A-I      3'UTR
chrX:19936895(-) A-I      intronic
chrX:19945088(-) A-I      intronic
chrX:19948697(-) A-I      NonSyn:Ser->Gly
chrX:19953110(-) A-I      intronic
chrX:19936930(-) A-I      intronic
chrX:19941974(-) A-I      intronic
chrX:19937582(-) A-I      intronic
chrX:19981000(-) A-I      intronic
chrX:19952027(-) A-I      intronic
chrX:19952131(-) A-I      intronic
chrX:19938716(-) A-I      intronic
chrX:19945914(-) A-I      intronic
chrX:19936841(-) A-I      intronic
chrX:19980482(-) A-I      intronic
chrX:19980428(-) A-I      intronic
chrX:19946202(-) A-I      intronic
chrX:19980478(-) A-I      intronic
chrX:19945123(-) A-I      intronic
chrX:19945824(-) A-I      intronic
chrX:19951996(-) A-I      intronic
chrX:19948889(-) A-I      intronic
chrX:19942191(-) A-I      intronic
chrX:19940906(-) A-I      intronic
chrX:19948903(-) A-I      intronic
chrX:19946122(-) A-I      intronic
chrX:19946251(-) A-I      intronic
chrX:19980389(-) A-I      intronic
chrX:19955266(-) A-I      intronic
chrX:19945233(-) A-I      intronic
chrX:19946200(-) A-I      intronic
chrX:19950814(-) A-I      intronic
chrX:19942052(-) A-I      intronic
chrX:19978042(-) A-I      intronic
chrX:19978107(-) A-I      intronic
chrX:19982074(-) A-I      intronic
chrX:19977976(-) A-I      intronic
chrX:19939709(-) A-I      intronic
chrX:19946518(-) A-I      intronic
chrX:19938877(-) A-I      intronic
chrX:19942084(-) A-I      intronic
chrX:19942068(-) A-I      intronic
chrX:19938721(-) A-I      intronic
chrX:19953255(-) A-I      intronic
chrX:19945351(-) A-I      intronic
chrX:19982017(-) A-I      intronic
chrX:19978117(-) A-I      intronic
chrX:19938831(-) A-I      intronic
chrX:19938681(-) A-I      intronic
chrX:19953047(-) A-I      intronic
chrX:19938887(-) A-I      intronic
chrX:19981181(-) A-I      intronic
chrX:19952180(-) A-I      intronic
chrX:19937912(-) A-I      intronic
chrX:19937899(-) A-I      intronic
chrX:19938870(-) A-I      intronic
chrX:19969566(-) A-I      intronic
chrX:19946589(-) A-I      intronic
chrX:19942039(-) A-I      intronic
chrX:19946665(-) A-I      intronic
chrX:19977796(-) A-I      intronic
chrX:19981191(-) A-I      intronic
chrX:19946062(-) A-I      intronic
chrX:19946579(-) A-I      intronic
chrX:19940949(-) A-I      intronic
chrX:19946078(-) A-I      intronic
chrX:19981153(-) A-I      intronic
chrX:19978186(-) A-I      intronic
chrX:19936797(-) A-I      intronic
chrX:19936852(-) A-I      intronic
chrX:19946484(-) A-I      intronic
chrX:19980440(-) A-I      intronic
chrX:19937863(-) A-I      intronic
chrX:19981032(-) A-I      intronic
chrX:19940862(-) A-I      intronic
chrX:19946132(-) A-I      intronic
chrX:19945101(-) A-I      intronic
chrX:19981309(-) A-I      intronic
chrX:19946644(-) A-I      intronic
chrX:19946096(-) A-I      intronic
chrX:19948686(-) A-I      Syn:Pro->Pro
chrX:19977728(-) A-I      intronic
chrX:19980596(-) A-I      intronic

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate BCLAF3
Cytosol K562 cells     -
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsv2-miR-H11-5p
Interactor2: BCLAF3

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda//Targetscan
Support Database VmiReg

Starting a new search, please wait ...