Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00178204

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H11-5p:  MIMAT0014697          UBN2:  NM_173569     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv2-miR-H11-5p	UBN2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014697	254048
Organism	Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	-

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	UBN2	chr7:138970921(+) A-I      intronic chr7:138970982(+) A-I      intronic chr7:138920233(+) A-I      intronic chr7:138920232(+) A-I      intronic chr7:138920221(+) A-I      intronic chr7:138976070(+) A-I      intronic chr7:138935646(+) A-I      intronic chr7:138970993(+) A-I      intronic chr7:138934583(+) A-I      intronic chr7:138971030(+) A-I      intronic chr7:138935595(+) A-I      intronic chr7:138970000(+) A-I      intronic chr7:138971045(+) A-I      intronic chr7:138935651(+) A-I      intronic chr7:138926642(+) A-I      intronic chr7:138956244(+) A-I      intronic chr7:138974769(+) A-I      intronic chr7:138956243(+) A-I      intronic chr7:138975868(+) A-I      intronic chr7:138971010(+) A-I      intronic chr7:138956217(+) A-I      intronic chr7:138935667(+) A-I      intronic chr7:138956155(+) A-I      intronic chr7:138955762(+) A-I      intronic chr7:138955132(+) A-I      intronic chr7:138955118(+) A-I      intronic chr7:138955084(+) A-I      intronic chr7:138934569(+) A-I      intronic chr7:138973577(+) A-I      intronic chr7:138935652(+) A-I      intronic chr7:138935645(+) A-I      intronic chr7:138935002(+) A-I      intronic chr7:138920270(+) A-I      intronic chr7:138975860(+) A-I      intronic chr7:138920253(+) A-I      intronic chr7:138975878(+) A-I      intronic chr7:138920252(+) A-I      intronic chr7:138973586(+) A-I      intronic chr7:138973587(+) A-I      intronic chr7:138974776(+) A-I      intronic chr7:138973609(+) A-I      intronic chr7:138973650(+) A-I      intronic chr7:138974238(+) A-I      intronic chr7:138974305(+) A-I      intronic chr7:138974358(+) A-I      intronic chr7:138974418(+) A-I      intronic chr7:138975895(+) A-I      intronic chr7:138975923(+) A-I      intronic chr7:138946790(+) A-I      intronic chr7:138975930(+) A-I      intronic chr7:138975945(+) A-I      intronic chr7:138975948(+) A-I      intronic chr7:138975986(+) A-I      intronic chr7:138976032(+) A-I      intronic chr7:138946898(+) A-I      intronic chr7:138922136(+) A-I      intronic chr7:138976579(+) A-I      intronic chr7:138973538(+) A-I      intronic chr7:138976787(+) A-I      intronic chr7:138976064(+) A-I      intronic chr7:138976056(+) A-I      intronic chr7:138946946(+) A-I      intronic chr7:138920427(+) A-I      intronic chr7:138947026(+) A-I      intronic chr7:138948329(+) A-I      intronic chr7:138976869(+) A-I      intronic chr7:138948432(+) A-I      intronic chr7:138974956(+) A-I      intronic chr7:138970883(+) A-I      intronic chr7:138948441(+) A-I      intronic chr7:138922063(+) A-I      intronic chr7:138922143(+) A-I      intronic chr7:138926669(+) A-I      intronic chr7:138920429(+) A-I      intronic chr7:138949980(+) A-I      intronic chr7:138949987(+) A-I      intronic chr7:138970815(+) A-I      intronic chr7:138974701(+) A-I      intronic chr7:138974733(+) A-I      intronic chr7:138920415(+) A-I      intronic chr7:138974739(+) A-I      intronic chr7:138920400(+) A-I      intronic chr7:138926579(+) A-I      intronic chr7:138974740(+) A-I      intronic chr7:138970033(+) A-I      intronic chr7:138974665(+) A-I      intronic chr7:138970069(+) A-I      intronic chr7:138934939(+) A-I      intronic chr7:138974233(+) A-I      intronic chr7:138974927(+) A-I      intronic chr7:138974856(+) A-I      intronic chr7:138950067(+) A-I      intronic chr7:138956174(+) A-I      intronic chr7:138935096(+) A-I      intronic chr7:138926591(+) A-I      intronic chr7:138976920(+) A-I      intronic chr7:138973693(+) A-I      intronic chr7:138974853(+) A-I      intronic chr7:138970694(+) A-I      intronic chr7:138976889(+) A-I      intronic chr7:138974420(+) A-I      intronic chr7:138975852(+) A-I      intronic chr7:138971031(+) A-I      intronic chr7:138973522(+) A-I      intronic chr7:138970813(+) A-I      intronic chr7:138955193(+) A-I      intronic chr7:138973627(+) A-I      intronic chr7:138974431(+) A-I      intronic chr7:138956281(+) A-I      intronic chr7:138949576(+) A-I      intronic chr7:138976515(+) A-I      intronic chr7:138976972(+) A-I      intronic chr7:138949435(+) A-I      intronic chr7:138960487(+) A-I      intronic chr7:138947201(+) A-I      intronic chr7:138973583(+) A-I      intronic chr7:138976959(+) A-I      intronic chr7:138974259(+) A-I      intronic chr7:138974919(+) A-I      intronic chr7:138935254(+) A-I      intronic chr7:138974410(+) A-I      intronic chr7:138970630(+) A-I      intronic chr7:138970839(+) A-I      intronic chr7:138976342(+) A-I      intronic chr7:138956211(+) A-I      intronic chr7:138974338(+) A-I      intronic chr7:138974954(+) A-I      intronic chr7:138970810(+) A-I      intronic chr7:138970835(+) A-I      intronic chr7:138949434(+) A-I      intronic chr7:138973597(+) A-I      intronic chr7:138949439(+) A-I      intronic chr7:138974323(+) A-I      intronic chr7:138976502(+) A-I      intronic chr7:138970854(+) A-I      intronic chr7:138973533(+) A-I      intronic chr7:138924397(+) A-I      intronic chr7:138976915(+) A-I      intronic chr7:138971038(+) A-I      intronic chr7:138934661(+) A-I      intronic chr7:138976879(+) A-I      intronic chr7:138950073(+) A-I      intronic chr7:138971032(+) A-I      intronic chr7:138974785(+) A-I      intronic chr7:138970020(+) A-I      intronic chr7:138970606(+) A-I      intronic chr7:138935079(+) A-I      intronic chr7:138976347(+) A-I      intronic chr7:138974916(+) A-I      intronic chr7:138973705(+) A-I      intronic chr7:138975897(+) A-I      intronic chr7:138935591(+) A-I      intronic chr7:138974432(+) A-I      intronic chr7:138950139(+) A-I      intronic chr7:138934853(+) A-I      intronic chr7:138974276(+) A-I      intronic chr7:138974688(+) A-I      intronic chr7:138973689(+) A-I      intronic chr7:138974779(+) A-I      intronic chr7:138970863(+) A-I      intronic chr7:138976796(+) A-I      intronic chr7:138969979(+) A-I      intronic chr7:138976863(+) A-I      intronic chr7:138976790(+) A-I      intronic chr7:138974303(+) A-I      intronic chr7:138970024(+) A-I      intronic chr7:138973668(+) A-I      intronic chr7:138926676(+) A-I      intronic chr7:138947281(+) A-I      intronic chr7:138947081(+) A-I      intronic chr7:138976738(+) A-I      intronic chr7:138956176(+) A-I      intronic chr7:138976479(+) A-I      intronic chr7:138974434(+) A-I      intronic chr7:138955197(+) A-I      intronic chr7:138959903(+) A-I      intronic chr7:138949387(+) A-I      intronic chr7:138974262(+) A-I      intronic chr7:138976341(+) A-I      intronic chr7:138973541(+) A-I      intronic chr7:138970057(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	UBN2	chr7:138934866(+) A-I intron -    15545495 chr7:138931014(+) G-T intron -    22484847 chr7:138935079(+) A-G intron -    22484847 chr7:138946791(+) A-G intron -    22484847 chr7:138949387(+) A-G intron -    22484847 chr7:138949434(+) A-G intron -    22484847 chr7:138949435(+) A-G intron -    22484847 chr7:138949439(+) A-G intron -    22484847 chr7:138949536(+) A-G intron -    22484847 chr7:138969979(+) A-G intron -    22484847 chr7:138970024(+) A-G intron -    22484847 chr7:138970694(+) A-G intron -    22484847 chr7:138973522(+) A-G intron -    22484847 chr7:138973693(+) A-G intron -    22484847 chr7:138973705(+) A-G intron -    22484847 chr7:138974223(+) A-G intron -    22484847 chr7:138974259(+) A-G intron -    22484847 chr7:138974262(+) A-G intron -    22484847 chr7:138974276(+) A-G intron -    22484847 chr7:138974297(+) A-G intron -    22484847 chr7:138974341(+) A-G intron -    22484847 chr7:138974410(+) A-G intron -    22484847 chr7:138974779(+) A-G intron -    22484847 chr7:138974856(+) A-G intron -    22484847 chr7:138974916(+) A-G intron -    22484847 chr7:138974919(+) A-G intron -    22484847 chr7:138974954(+) A-G intron -    22484847 chr7:138976515(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	UBN2	chr7:138915187-138915188(+) m6A 5'UTR       - chr7:138916633-138916634(+) m6A CDS//intron       24284625 chr7:138943345-138943346(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr7:138944107-138944108(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr7:138946162-138946163(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr7:138946203-138946204(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr7:138946230-138946231(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr7:138946258-138946259(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr7:138958049-138958050(+) m6A CDS       24981863 chr7:138958099-138958100(+) m6A CDS       24981863 chr7:138958120-138958121(+) m6A CDS       24981863 chr7:138967926-138967927(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr7:138967992-138967993(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr7:138968050-138968051(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr7:138968110-138968111(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr7:138968126-138968127(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr7:138968179-138968180(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr7:138968241-138968242(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr7:138968260-138968261(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr7:138968290-138968291(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr7:138968333-138968334(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr7:138968390-138968391(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr7:138968463-138968464(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr7:138968504-138968505(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085 chr7:138968567-138968568(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085 chr7:138968657-138968658(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085 chr7:138968764-138968765(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr7:138968800-138968801(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr7:138968872-138968873(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr7:138968986-138968987(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr7:138969003-138969004(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr7:138969013-138969014(+) m6A CDS       24284625//24981863//22608085 chr7:138969102-138969103(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr7:138969119-138969120(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr7:138969132-138969133(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr7:138969206-138969207(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr7:138969224-138969225(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr7:138969236-138969237(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr7:138969253-138969254(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22575960//22608085 chr7:138969274-138969275(+) m6A CDS       24284625//25456834//24981863//22608085 chr7:138978143-138978144(+) m6A CDS       24284625//24981863 chr7:138982553-138982554(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085 chr7:138982733-138982734(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085 chr7:138982836-138982837(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//27773535//22608085 chr7:138982847-138982848(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//27773535//22608085 chr7:138982860-138982861(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//27773535//22608085 chr7:138982926-138982927(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//27773535//22608085 chr7:138982955-138982956(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//27773535//22608085 chr7:138982965-138982966(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//27773535//22608085 chr7:138982993-138982994(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//27773535//22608085 chr7:138983044-138983045(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//27773535//22608085 chr7:138983098-138983099(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085 chr7:138983133-138983134(+) m6A 3'UTR//exon       22608085 chr7:138983181-138983182(+) m6A 3'UTR//exon       22608085 chr7:138987351-138987352(+) m6A 3'UTR       24981863 chr7:138987420-138987421(+) m6A 3'UTR       24981863 chr7:138992330-138992331(+) m6A 3'UTR       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	UBN2	Chromatin K562 cells     - Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv2-miR-H11-5p
Interactor2: UBN2

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg