Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00178200

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H11-5p:  MIMAT0014697          SLC25A43:  NM_145305     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv2-miR-H11-5p	SLC25A43
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014697	203427
Organism	Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	-

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	SLC25A43	chrX:118579995(+) A-I      intronic chrX:118583201(+) A-I      intronic chrX:118583215(+) A-I      intronic chrX:118566596(+) A-I      intronic chrX:118583218(+) A-I      intronic chrX:118583431(+) A-I      intronic chrX:118583511(+) A-I      intronic chrX:118583594(+) A-I      intronic chrX:118566870(+) A-I      intronic chrX:118583608(+) A-I      intronic chrX:118566872(+) A-I      intronic chrX:118579996(+) A-I      intronic chrX:118568906(+) A-I      intronic chrX:118584892(+) A-I      intronic chrX:118584955(+) A-I      intronic chrX:118584964(+) A-I      intronic chrX:118584965(+) A-I      intronic chrX:118580022(+) A-I      intronic chrX:118568938(+) A-I      intronic chrX:118581322(+) A-I      intronic chrX:118568985(+) A-I      intronic chrX:118569004(+) A-I      intronic chrX:118569011(+) A-I      intronic chrX:118585081(+) A-I      intronic chrX:118548856(+) A-I      intronic chrX:118569022(+) A-I      intronic chrX:118548860(+) A-I      intronic chrX:118550287(+) A-I      intronic chrX:118569030(+) A-I      intronic chrX:118550312(+) A-I      intronic chrX:118550276(+) A-I      intronic chrX:118550252(+) A-I      intronic chrX:118549844(+) A-I      intronic chrX:118549781(+) A-I      intronic chrX:118549856(+) A-I      intronic chrX:118581386(+) A-I      intronic chrX:118569078(+) A-I      intronic chrX:118577109(+) A-I      intronic chrX:118549645(+) A-I      intronic chrX:118581395(+) A-I      intronic chrX:118581442(+) A-I      intronic chrX:118583121(+) A-I      intronic chrX:118560706(+) A-I      intronic chrX:118560711(+) A-I      intronic chrX:118560718(+) A-I      intronic chrX:118560725(+) A-I      intronic chrX:118565916(+) A-I      intronic chrX:118565940(+) A-I      intronic chrX:118565952(+) A-I      intronic chrX:118565959(+) A-I      intronic chrX:118577146(+) A-I      intronic chrX:118577157(+) A-I      intronic chrX:118577169(+) A-I      intronic chrX:118577182(+) A-I      intronic chrX:118565968(+) A-I      intronic chrX:118578891(+) A-I      intronic chrX:118577345(+) A-I      intronic chrX:118577729(+) A-I      intronic chrX:118577732(+) A-I      intronic chrX:118585038(+) A-I      intronic chrX:118585019(+) A-I      intronic chrX:118584983(+) A-I      intronic chrX:118584976(+) A-I      intronic chrX:118583541(+) A-I      intronic chrX:118583517(+) A-I      intronic chrX:118583509(+) A-I      intronic chrX:118581411(+) A-I      intronic chrX:118581400(+) A-I      intronic chrX:118581360(+) A-I      intronic chrX:118581355(+) A-I      intronic chrX:118581354(+) A-I      intronic chrX:118581348(+) A-I      intronic chrX:118581330(+) A-I      intronic chrX:118578906(+) A-I      intronic chrX:118577927(+) A-I      intronic chrX:118578822(+) A-I      intronic chrX:118578851(+) A-I      intronic chrX:118578883(+) A-I      intronic chrX:118579896(+) A-I      intronic chrX:118579906(+) A-I      intronic chrX:118579907(+) A-I      intronic chrX:118549579(+) A-I      intronic chrX:118549217(+) A-I      intronic chrX:118550283(+) A-I      intronic chrX:118579951(+) A-I      intronic chrX:118549200(+) A-I      intronic chrX:118549068(+) A-I      intronic chrX:118549000(+) A-I      intronic chrX:118548982(+) A-I      intronic chrX:118548850(+) A-I      intronic chrX:118548847(+) A-I      intronic chrX:118548840(+) A-I      intronic chrX:118548828(+) A-I      intronic chrX:118548823(+) A-I      intronic chrX:118548392(+) A-I      intronic chrX:118547414(+) A-I      intronic chrX:118537382(+) A-I      intronic chrX:118537418(+) A-I      intronic chrX:118538198(+) A-I      intronic chrX:118538199(+) A-I      intronic chrX:118539785(+) A-I      intronic chrX:118539848(+) A-I      intronic chrX:118544731(+) A-I      intronic chrX:118545316(+) A-I      intronic chrX:118547010(+) A-I      intronic chrX:118547007(+) A-I      intronic chrX:118550281(+) A-I      intronic chrX:118546988(+) A-I      intronic chrX:118579920(+) A-I      intronic chrX:118546971(+) A-I      intronic chrX:118546955(+) A-I      intronic chrX:118546850(+) A-I      intronic chrX:118546494(+) A-I      intronic chrX:118546407(+) A-I      intronic chrX:118566556(+) A-I      intronic chrX:118554347(+) A-I      intronic chrX:118550456(+) A-I      intronic chrX:118550442(+) A-I      intronic chrX:118554386(+) A-I      intronic chrX:118554304(+) A-I      intronic chrX:118554430(+) A-I      intronic chrX:118554471(+) A-I      intronic chrX:118554533(+) A-I      intronic chrX:118554860(+) A-I      intronic chrX:118554888(+) A-I      intronic chrX:118579940(+) A-I      intronic chrX:118579969(+) A-I      intronic chrX:118554889(+) A-I      intronic chrX:118583175(+) A-I      intronic chrX:118554911(+) A-I      intronic chrX:118562298(+) A-I      intronic chrX:118554390(+) A-I      intronic chrX:118562338(+) A-I      intronic chrX:118562350(+) A-I      intronic chrX:118562373(+) A-I      intronic chrX:118565931(+) A-I      intronic chrX:118565933(+) A-I      intronic chrX:118565939(+) A-I      intronic chrX:118550364(+) A-I      intronic chrX:118545357(+) A-I      intronic chrX:118545364(+) A-I      intronic chrX:118545395(+) A-I      intronic chrX:118545412(+) A-I      intronic chrX:118545415(+) A-I      intronic chrX:118545420(+) A-I      intronic chrX:118565946(+) A-I      intronic chrX:118587559(+) A-I      3'UTR chrX:118587646(+) A-I      3'UTR chrX:118587554(+) A-I      3'UTR chrX:118587517(+) A-I      3'UTR chrX:118587519(+) A-I      3'UTR chrX:118581399(+) A-I      intronic chrX:118578481(+) A-I      intronic chrX:118577183(+) A-I      intronic chrX:118563078(+) A-I      intronic chrX:118549309(+) A-I      intronic chrX:118557328(+) A-I      intronic chrX:118554322(+) A-I      intronic chrX:118577795(+) A-I      intronic chrX:118562333(+) A-I      intronic chrX:118577873(+) A-I      intronic chrX:118578812(+) A-I      intronic chrX:118557331(+) A-I      intronic chrX:118537370(+) A-I      intronic chrX:118548508(+) A-I      intronic chrX:118580037(+) A-I      intronic chrX:118585047(+) A-I      intronic chrX:118578833(+) A-I      intronic chrX:118568830(+) A-I      intronic chrX:118550204(+) A-I      intronic chrX:118565319(+) A-I      intronic chrX:118581453(+) A-I      intronic chrX:118562291(+) A-I      intronic chrX:118546363(+) A-I      intronic chrX:118548454(+) A-I      intronic chrX:118550282(+) A-I      intronic chrX:118581381(+) A-I      intronic chrX:118556058(+) A-I      intronic chrX:118544737(+) A-I      intronic chrX:118546455(+) A-I      intronic chrX:118554832(+) A-I      intronic chrX:118562256(+) A-I      intronic chrX:118563160(+) A-I      intronic chrX:118584961(+) A-I      intronic chrX:118566941(+) A-I      intronic chrX:118549934(+) A-I      intronic chrX:118554554(+) A-I      intronic chrX:118549736(+) A-I      intronic chrX:118581178(+) A-I      intronic chrX:118554324(+) A-I      intronic chrX:118549646(+) A-I      intronic chrX:118581373(+) A-I      intronic chrX:118566035(+) A-I      intronic chrX:118539884(+) A-I      intronic chrX:118580028(+) A-I      intronic chrX:118587551(+) A-I      3'UTR chrX:118587723(+) A-I      3'UTR chrX:118587758(+) A-I      3'UTR chrX:118587521(+) A-I      3'UTR chrX:118587567(+) A-I      3'UTR chrX:118587515(+) A-I      3'UTR chrX:118587752(+) A-I      3'UTR chrX:118587562(+) A-I      3'UTR chrX:118580048(+) A-I      intronic chrX:118568901(+) A-I      intronic chrX:118546924(+) A-I      intronic chrX:118568842(+) A-I      intronic chrX:118546918(+) A-I      intronic chrX:118563115(+) A-I      intronic chrX:118580036(+) A-I      intronic chrX:118555025(+) A-I      intronic chrX:118548377(+) A-I      intronic chrX:118577200(+) A-I      intronic chrX:118581185(+) A-I      intronic chrX:118581056(+) A-I      intronic chrX:118566576(+) A-I      intronic chrX:118578594(+) A-I      intronic chrX:118539930(+) A-I      intronic chrX:118584906(+) A-I      intronic chrX:118549891(+) A-I      intronic chrX:118554325(+) A-I      intronic chrX:118554909(+) A-I      intronic chrX:118566494(+) A-I      intronic chrX:118554361(+) A-I      intronic chrX:118537392(+) A-I      intronic chrX:118548425(+) A-I      intronic chrX:118548983(+) A-I      intronic chrX:118566942(+) A-I      intronic chrX:118549402(+) A-I      intronic chrX:118554491(+) A-I      intronic chrX:118563287(+) A-I      intronic chrX:118584979(+) A-I      intronic chrX:118581191(+) A-I      intronic chrX:118544583(+) A-I      intronic chrX:118577980(+) A-I      intronic chrX:118554373(+) A-I      intronic chrX:118565994(+) A-I      intronic chrX:118549903(+) A-I      intronic chrX:118549886(+) A-I      intronic chrX:118565420(+) A-I      intronic chrX:118549850(+) A-I      intronic chrX:118549024(+) A-I      intronic chrX:118546905(+) A-I      intronic chrX:118546997(+) A-I      intronic chrX:118554815(+) A-I      intronic chrX:118549860(+) A-I      intronic chrX:118548442(+) A-I      intronic chrX:118577863(+) A-I      intronic chrX:118577222(+) A-I      intronic chrX:118548451(+) A-I      intronic chrX:118565203(+) A-I      intronic chrX:118538100(+) A-I      intronic chrX:118550367(+) A-I      intronic chrX:118549511(+) A-I      intronic chrX:118554855(+) A-I      intronic chrX:118569064(+) A-I      intronic chrX:118563144(+) A-I      intronic chrX:118568843(+) A-I      intronic chrX:118546901(+) A-I      intronic chrX:118546863(+) A-I      intronic chrX:118550443(+) A-I      intronic chrX:118538062(+) A-I      intronic chrX:118554869(+) A-I      intronic chrX:118578546(+) A-I      intronic chrX:118549254(+) A-I      intronic chrX:118577970(+) A-I      intronic chrX:118562253(+) A-I      intronic chrX:118557371(+) A-I      intronic chrX:118581179(+) A-I      intronic chrX:118544705(+) A-I      intronic chrX:118565853(+) A-I      intronic chrX:118554868(+) A-I      intronic chrX:118563079(+) A-I      intronic chrX:118554330(+) A-I      intronic chrX:118581300(+) A-I      intronic chrX:118585005(+) A-I      intronic chrX:118554944(+) A-I      intronic chrX:118547523(+) A-I      intronic chrX:118563084(+) A-I      intronic chrX:118545413(+) A-I      intronic chrX:118550444(+) A-I      intronic chrX:118578726(+) A-I      intronic chrX:118549269(+) A-I      intronic chrX:118578878(+) A-I      intronic chrX:118562311(+) A-I      intronic chrX:118551103(+) A-I      intronic chrX:118548522(+) A-I      intronic chrX:118577901(+) A-I      intronic chrX:118546893(+) A-I      intronic chrX:118560679(+) A-I      intronic chrX:118583322(+) A-I      intronic chrX:118550374(+) A-I      intronic chrX:118538090(+) A-I      intronic chrX:118563198(+) A-I      intronic chrX:118578838(+) A-I      intronic chrX:118549297(+) A-I      intronic chrX:118569037(+) A-I      intronic chrX:118549958(+) A-I      intronic chrX:118568878(+) A-I      intronic chrX:118565907(+) A-I      intronic chrX:118577857(+) A-I      intronic chrX:118568811(+) A-I      intronic chrX:118550203(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	SLC25A43	chrX:118584313(+) A-I intron -    22327324 chrX:118584356(+) A-I intron -    22327324 chrX:118568489(+) A-I intron -    21960545 chrX:118584438(+) A-I intron -    21960545 chrX:118584475(+) A-I intron -    21960545 chrX:118584477(+) A-I intron -    21960545 chrX:118582706(+) A-G intron -    22484847 chrX:118584313(+) A-G intron -    22484847 chrX:118584356(+) A-G intron -    22484847 chrX:118584438(+) A-G intron -    22484847 chrX:118584442(+) A-G intron -    22484847 chrX:118546893(+) A-G intron -    22484847 chrX:118546918(+) A-G intron -    22484847 chrX:118547008(+) A-G intron -    22484847 chrX:118554330(+) A-G intron -    22484847 chrX:118554814(+) A-G intron -    22484847 chrX:118581305(+) A-G intron -    22484847 chrX:118584999(+) A-G intron -    22484847 chrX:118587521(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	SLC25A43	chrX:118540524-118540525(+) Y CDS//exon//intron       26075521 chrX:118587000-118587001(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//24981863//26404942//22575960//22608085 chrX:118587015-118587016(+) m6A CDS//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chrX:118587039-118587040(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//26404942//22575960//22608085 chrX:118587185-118587186(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chrX:118587201-118587202(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chrX:118587315-118587316(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//22608085 chrX:118588151-118588152(+) m6A 3'UTR//exon       26404942 chrX:118588192-118588193(+) m6A 3'UTR//exon       26404942 chrX:118588219-118588220(+) m6A 3'UTR//exon       26404942

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	SLC25A43	Exosome Blood     - Nucleus HeLa-S3 cells|K562 cells     - Ribosome-free cytosol Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv2-miR-H11-5p
Interactor2: SLC25A43

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//RNAHybrid
Support Database	VmiReg