Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00173960

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H10:  MIMAT0014353          ARHGAP6:  NR_109776     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv2-miR-H10	ARHGAP6
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014353	395
Organism	Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	RHOGAP6//RHOGAPX-1

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	ARHGAP6	chrX:11634574(-) A-I      intronic chrX:11634449(-) A-I      intronic chrX:11634446(-) A-I      intronic chrX:11617110(-) A-I      intronic chrX:11617095(-) A-I      intronic chrX:11617092(-) A-I      intronic chrX:11558252(-) A-I      intronic chrX:11560517(-) A-I      intronic chrX:11617070(-) A-I      intronic chrX:11558211(-) A-I      intronic chrX:11558157(-) A-I      intronic chrX:11558101(-) A-I      intronic chrX:11532170(-) A-I      intronic chrX:11532125(-) A-I      intronic chrX:11532116(-) A-I      intronic chrX:11530227(-) A-I      intronic chrX:11530218(-) A-I      intronic chrX:11530213(-) A-I      intronic chrX:11530197(-) A-I      intronic chrX:11530188(-) A-I      intronic chrX:11530141(-) A-I      intronic chrX:11560454(-) A-I      intronic chrX:11560435(-) A-I      intronic chrX:11560426(-) A-I      intronic chrX:11558368(-) A-I      intronic chrX:11558327(-) A-I      intronic chrX:11530127(-) A-I      intronic chrX:11530126(-) A-I      intronic chrX:11530125(-) A-I      intronic chrX:11530124(-) A-I      intronic chrX:11530121(-) A-I      intronic chrX:11530116(-) A-I      intronic chrX:11530085(-) A-I      intronic chrX:11530071(-) A-I      intronic chrX:11530058(-) A-I      intronic chrX:11323071(-) A-I      intronic chrX:11530036(-) A-I      intronic chrX:11530009(-) A-I      intronic chrX:11521288(-) A-I      intronic chrX:11616994(-) A-I      intronic chrX:11616932(-) A-I      intronic chrX:11609309(-) A-I      intronic chrX:11521280(-) A-I      intronic chrX:11521144(-) A-I      intronic chrX:11323045(-) A-I      intronic chrX:11323031(-) A-I      intronic chrX:11521030(-) A-I      intronic chrX:11519487(-) A-I      intronic chrX:11519483(-) A-I      intronic chrX:11519454(-) A-I      intronic chrX:11519336(-) A-I      intronic chrX:11519314(-) A-I      intronic chrX:11486017(-) A-I      intronic chrX:11486000(-) A-I      intronic chrX:11485976(-) A-I      intronic chrX:11485404(-) A-I      intronic chrX:11485403(-) A-I      intronic chrX:11485400(-) A-I      intronic chrX:11323018(-) A-I      intronic chrX:11323012(-) A-I      intronic chrX:11484891(-) A-I      intronic chrX:11484889(-) A-I      intronic chrX:11484864(-) A-I      intronic chrX:11484804(-) A-I      intronic chrX:11484792(-) A-I      intronic chrX:11484789(-) A-I      intronic chrX:11484749(-) A-I      intronic chrX:11484733(-) A-I      intronic chrX:11484717(-) A-I      intronic chrX:11484690(-) A-I      intronic chrX:11484654(-) A-I      intronic chrX:11558311(-) A-I      intronic chrX:11558292(-) A-I      intronic chrX:11481742(-) A-I      intronic chrX:11481719(-) A-I      intronic chrX:11481628(-) A-I      intronic chrX:11481627(-) A-I      intronic chrX:11481597(-) A-I      intronic chrX:11461859(-) A-I      intronic chrX:11461801(-) A-I      intronic chrX:11424164(-) A-I      intronic chrX:11424156(-) A-I      intronic chrX:11424152(-) A-I      intronic chrX:11424148(-) A-I      intronic chrX:11376715(-) A-I      intronic chrX:11364802(-) A-I      intronic chrX:11364782(-) A-I      intronic chrX:11364767(-) A-I      intronic chrX:11364734(-) A-I      intronic chrX:11344354(-) A-I      intronic chrX:11341985(-) A-I      intronic chrX:11341984(-) A-I      intronic chrX:11341903(-) A-I      intronic chrX:11341902(-) A-I      intronic chrX:11341873(-) A-I      intronic chrX:11341863(-) A-I      intronic chrX:11341822(-) A-I      intronic chrX:11341819(-) A-I      intronic chrX:11341813(-) A-I      intronic chrX:11341805(-) A-I      intronic chrX:11341793(-) A-I      intronic chrX:11341782(-) A-I      intronic chrX:11340736(-) A-I      intronic chrX:11340731(-) A-I      intronic chrX:11340730(-) A-I      intronic chrX:11340699(-) A-I      intronic chrX:11340697(-) A-I      intronic chrX:11340683(-) A-I      intronic chrX:11340616(-) A-I      intronic chrX:11558291(-) A-I      intronic chrX:11558262(-) A-I      intronic chrX:11520676(-) A-I      intronic chrX:11328172(-) A-I      intronic chrX:11259115(-) A-I      intronic chrX:11234548(-) A-I      intronic chrX:11520679(-) A-I      intronic chrX:11520687(-) A-I      intronic chrX:11520692(-) A-I      intronic chrX:11536003(-) A-I      intronic chrX:11536010(-) A-I      intronic chrX:11536015(-) A-I      intronic chrX:11678645(-) A-I      intronic chrX:11678430(-) A-I      intronic chrX:11668167(-) A-I      intronic chrX:11668162(-) A-I      intronic chrX:11668110(-) A-I      intronic chrX:11668109(-) A-I      intronic chrX:11642810(-) A-I      intronic chrX:11642724(-) A-I      intronic chrX:11641813(-) A-I      intronic chrX:11641803(-) A-I      intronic chrX:11520966(-) A-I      intronic chrX:11641705(-) A-I      intronic chrX:11641695(-) A-I      intronic chrX:11634721(-) A-I      intronic chrX:11634590(-) A-I      intronic chrX:11234523(-) A-I      intronic chrX:11171601(-) A-I      intronic chrX:11171598(-) A-I      intronic chrX:11171576(-) A-I      intronic chrX:11566975(-) A-I      intronic chrX:11609274(-) A-I      intronic chrX:11609265(-) A-I      intronic chrX:11609236(-) A-I      intronic chrX:11608882(-) A-I      intronic chrX:11608786(-) A-I      intronic chrX:11607340(-) A-I      intronic chrX:11607339(-) A-I      intronic chrX:11607338(-) A-I      intronic chrX:11607286(-) A-I      intronic chrX:11607282(-) A-I      intronic chrX:11607199(-) A-I      intronic chrX:11585652(-) A-I      intronic chrX:11573782(-) A-I      intronic chrX:11573743(-) A-I      intronic chrX:11573710(-) A-I      intronic chrX:11573704(-) A-I      intronic chrX:11573690(-) A-I      intronic chrX:11573669(-) A-I      intronic chrX:11573656(-) A-I      intronic chrX:11571635(-) A-I      intronic chrX:11571538(-) A-I      intronic chrX:11567010(-) A-I      intronic chrX:11567002(-) A-I      intronic chrX:11566996(-) A-I      intronic chrX:11566902(-) A-I      intronic chrX:11566866(-) A-I      intronic chrX:11566840(-) A-I      intronic chrX:11560593(-) A-I      intronic chrX:11519349(-) A-I      intronic chrX:11521258(-) A-I      intronic chrX:11607344(-) A-I      intronic chrX:11519475(-) A-I      intronic chrX:11341898(-) A-I      intronic chrX:11558305(-) A-I      intronic chrX:11518615(-) A-I      intronic chrX:11642787(-) A-I      intronic chrX:11641630(-) A-I      intronic chrX:11364747(-) A-I      intronic chrX:11158374(-) A-I      intronic chrX:11481740(-) A-I      intronic chrX:11668316(-) A-I      intronic chrX:11521153(-) A-I      intronic chrX:11585849(-) A-I      intronic chrX:11586808(-) A-I      intronic chrX:11607435(-) A-I      intronic chrX:11485442(-) A-I      intronic chrX:11652278(-) A-I      intronic chrX:11481574(-) A-I      intronic chrX:11678570(-) A-I      intronic chrX:11545559(-) A-I      intronic chrX:11364823(-) A-I      intronic chrX:11484703(-) A-I      intronic chrX:11642772(-) A-I      intronic chrX:11521210(-) A-I      intronic chrX:11364746(-) A-I      intronic chrX:11521006(-) A-I      intronic chrX:11532099(-) A-I      intronic chrX:11607290(-) A-I      intronic chrX:11171562(-) A-I      intronic chrX:11586025(-) A-I      intronic chrX:11519326(-) A-I      intronic chrX:11608888(-) A-I      intronic chrX:11571535(-) A-I      intronic chrX:11481580(-) A-I      intronic chrX:11424305(-) A-I      intronic chrX:11678515(-) A-I      intronic chrX:11529982(-) A-I      intronic chrX:11518694(-) A-I      intronic chrX:11518695(-) A-I      intronic chrX:11557249(-) A-I      intronic chrX:11484763(-) A-I      intronic chrX:11641593(-) A-I      intronic chrX:11609146(-) A-I      intronic chrX:11485455(-) A-I      intronic chrX:11484867(-) A-I      intronic chrX:11343001(-) A-I      intronic chrX:11585927(-) A-I      intronic chrX:11560511(-) A-I      intronic chrX:11521154(-) A-I      intronic chrX:11532251(-) A-I      intronic chrX:11376737(-) A-I      intronic chrX:11573791(-) A-I      intronic chrX:11642777(-) A-I      intronic chrX:11573784(-) A-I      intronic chrX:11340513(-) A-I      intronic chrX:11678616(-) A-I      intronic chrX:11649551(-) A-I      intronic chrX:11428062(-) A-I      intronic chrX:11530130(-) A-I      intronic chrX:11586794(-) A-I      intronic chrX:11158400(-) A-I      intronic chrX:11169584(-) A-I      intronic chrX:11484843(-) A-I      intronic chrX:11341750(-) A-I      intronic chrX:11649497(-) A-I      intronic chrX:11485390(-) A-I      intronic chrX:11649529(-) A-I      intronic chrX:11557250(-) A-I      intronic chrX:11484740(-) A-I      intronic chrX:11573707(-) A-I      intronic chrX:11530043(-) A-I      intronic chrX:11589908(-) A-I      intronic chrX:11484657(-) A-I      intronic chrX:11532199(-) A-I      intronic chrX:11641590(-) A-I      intronic chrX:11536270(-) A-I      intronic chrX:11571537(-) A-I      intronic chrX:11642754(-) A-I      intronic chrX:11634727(-) A-I      intronic chrX:11521127(-) A-I      intronic chrX:11364650(-) A-I      intronic chrX:11607335(-) A-I      intronic chrX:11532195(-) A-I      intronic chrX:11481587(-) A-I      intronic chrX:11481537(-) A-I      intronic chrX:11642900(-) A-I      intronic chrX:11521209(-) A-I      intronic chrX:11481619(-) A-I      intronic chrX:11609286(-) A-I      intronic chrX:11234594(-) A-I      intronic chrX:11484827(-) A-I      intronic chrX:11485341(-) A-I      intronic chrX:11571581(-) A-I      intronic chrX:11227466(-) A-I      intronic chrX:11617172(-) A-I      intronic chrX:11485342(-) A-I      intronic chrX:11519462(-) A-I      intronic chrX:11634664(-) A-I      intronic chrX:11428060(-) A-I      intronic chrX:11519461(-) A-I      intronic chrX:11323152(-) A-I      intronic chrX:11634584(-) A-I      intronic chrX:11585565(-) A-I      intronic chrX:11585552(-) A-I      intronic chrX:11322978(-) A-I      intronic chrX:11585913(-) A-I      intronic chrX:11573671(-) A-I      intronic chrX:11642832(-) A-I      intronic chrX:11607197(-) A-I      intronic chrX:11529976(-) A-I      intronic chrX:11485355(-) A-I      intronic chrX:11557060(-) A-I      intronic chrX:11484842(-) A-I      intronic chrX:11571454(-) A-I      intronic chrX:11571459(-) A-I      intronic chrX:11607434(-) A-I      intronic chrX:11668349(-) A-I      intronic chrX:11634442(-) A-I      intronic chrX:11536399(-) A-I      intronic chrX:11512022(-) A-I      intronic chrX:11589820(-) A-I      intronic chrX:11557113(-) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	ARHGAP6	chrX:11642754(-) A-I intron -    15342557 chrX:11642772(-) A-I intron -    15342557 chrX:11642777(-) A-I intron -    15342557 chrX:11642783(-) A-I intron -    15342557 chrX:11642787(-) A-I intron -    15342557 chrX:11642800(-) A-I intron -    15342557 chrX:11642832(-) A-I intron -    15342557 chrX:11642876(-) A-I intron -    15342557 chrX:11642886(-) A-I intron -    15342557 chrX:11642900(-) A-I intron -    15342557 chrX:11450183(-) A-I intron -    22327324 chrX:11520780(-) A-I intron -    22327324 chrX:11520973(-) A-I intron -    22327324 chrX:11521000(-) A-I intron -    22327324 chrX:11616690(-) A-I intron -    22327324 chrX:11674553(-) A-I intron -    22327324 chrX:11305051(-) A-G intron -    22484847 chrX:11305167(-) A-G intron -    22484847 chrX:11305168(-) A-G intron -    22484847 chrX:11306734(-) A-G intron -    22484847 chrX:11409477(-) A-G intron -    22484847 chrX:11412561(-) A-G intron -    22484847 chrX:11425495(-) A-G intron -    22484847 chrX:11425497(-) A-G intron -    22484847 chrX:11428166(-) A-G intron -    22484847 chrX:11428167(-) A-G intron -    22484847 chrX:11430026(-) A-G intron -    22484847 chrX:11430102(-) A-G intron -    22484847 chrX:11430110(-) A-G intron -    22484847 chrX:11430114(-) A-G intron -    22484847 chrX:11430120(-) A-G intron -    22484847 chrX:11450106(-) A-G intron -    22484847 chrX:11450120(-) A-G intron -    22484847 chrX:11450179(-) A-G intron -    22484847 chrX:11450183(-) A-G intron -    22484847 chrX:11450185(-) A-G intron -    22484847 chrX:11452258(-) A-G intron -    22484847 chrX:11452267(-) A-G intron -    22484847 chrX:11462372(-) A-G intron -    22484847 chrX:11465596(-) A-G intron -    22484847 chrX:11506787(-) A-G intron -    22484847 chrX:11519697(-) A-G intron -    22484847 chrX:11519731(-) A-G intron -    22484847 chrX:11519732(-) A-G intron -    22484847 chrX:11519793(-) A-G intron -    22484847 chrX:11519796(-) A-G intron -    22484847 chrX:11519798(-) A-G intron -    22484847 chrX:11519838(-) A-G intron -    22484847 chrX:11519908(-) A-G intron -    22484847 chrX:11519912(-) A-G intron -    22484847 chrX:11520059(-) A-G intron -    22484847 chrX:11520702(-) A-G intron -    22484847 chrX:11520773(-) A-G intron -    22484847 chrX:11520779(-) A-G intron -    22484847 chrX:11520780(-) A-G intron -    22484847 chrX:11520790(-) A-G intron -    22484847 chrX:11520793(-) A-G intron -    22484847 chrX:11520796(-) A-G intron -    22484847 chrX:11520852(-) A-G intron -    22484847 chrX:11520858(-) A-G intron -    22484847 chrX:11520862(-) A-G intron -    22484847 chrX:11520902(-) A-G intron -    22484847 chrX:11520928(-) A-G intron -    22484847 chrX:11520973(-) A-G intron -    22484847 chrX:11521000(-) A-G intron -    22484847 chrX:11523498(-) A-G intron -    22484847 chrX:11523660(-) A-G intron -    22484847 chrX:11524104(-) A-G intron -    22484847 chrX:11524154(-) A-G intron -    22484847 chrX:11524166(-) A-G intron -    22484847 chrX:11535815(-) A-G intron -    22484847 chrX:11535980(-) A-G intron -    22484847 chrX:11547467(-) T-A intron -    22484847 chrX:11555478(-) A-G intron -    22484847 chrX:11557319(-) A-G intron -    22484847 chrX:11561593(-) A-G intron -    22484847 chrX:11561652(-) A-G intron -    22484847 chrX:11566495(-) A-G intron -    22484847 chrX:11567706(-) A-G intron -    22484847 chrX:11568480(-) A-G intron -    22484847 chrX:11568514(-) A-G intron -    22484847 chrX:11579173(-) A-C intron -    22484847 chrX:11616690(-) A-G intron -    22484847 chrX:11616751(-) A-G intron -    22484847 chrX:11616752(-) A-G intron -    22484847 chrX:11616758(-) A-G intron -    22484847 chrX:11616779(-) A-G intron -    22484847 chrX:11616838(-) A-G intron -    22484847 chrX:11616840(-) A-G intron -    22484847 chrX:11617304(-) A-G intron -    22484847 chrX:11626991(-) A-G intron -    22484847 chrX:11632751(-) A-G intron -    22484847 chrX:11634164(-) A-G intron -    22484847 chrX:11674553(-) A-G intron -    22484847 chrX:11674969(-) A-G intron -    22484847 chrX:11677018(-) A-G intron -    22484847 chrX:11677091(-) A-G intron -    22484847 chrX:11677629(-) A-G intron -    22484847 chrX:11678017(-) A-G intron -    22484847 chrX:11678027(-) A-G intron -    22484847 chrX:11678050(-) A-G intron -    22484847 chrX:11680066(-) A-G intron -    22484847 chrX:11484843(-) A-G intron -    22484847 chrX:11607254(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	ARHGAP6	chrX:11156923-11156924(-) m6A 3'UTR//exon       - chrX:11157094-11157095(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       25456834//28052920//27773536 chrX:11157132-11157133(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       25456834//28052920//27773536 chrX:11157181-11157182(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       25456834//27773536 chrX:11157191-11157192(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       25456834//27773536 chrX:11157300-11157301(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chrX:11157509-11157510(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773536 chrX:11157535-11157536(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773536 chrX:11157583-11157584(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773536 chrX:11157637-11157638(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chrX:11160366-11160367(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chrX:11160400-11160401(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chrX:11683269-11683270(-) m6A 5'UTR       27773536 chrX:11683396-11683397(-) m6A 5'UTR       27773536 chrX:11683606-11683607(-) m6A 5'UTR       27773536 chrX:11683620-11683621(-) m6A 5'UTR       27773536 chrX:11683631-11683632(-) m6A 5'UTR       27773536 chrX:11683637-11683638(-) m6A 5'UTR       27773536

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsv2-miR-H10	Exosome K562 cells     24460325
	ARHGAP6	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv2-miR-H10
Interactor2: ARHGAP6

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//Rep//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg