Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00172488

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H9-3p:  MIMAT0014352          ELMOD3:  NM_001329792     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv2-miR-H9-3p	ELMOD3
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014352	84173
Organism	Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	DFNB88//LST3//RBED1//RBM29

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	ELMOD3	chr2:85613612(+) A-I      intronic chr2:85611699(+) A-I      intronic chr2:85611703(+) A-I      intronic chr2:85613572(+) A-I      intronic chr2:85613569(+) A-I      intronic chr2:85611778(+) A-I      intronic chr2:85610418(+) A-I      intronic chr2:85610417(+) A-I      intronic chr2:85610401(+) A-I      intronic chr2:85610393(+) A-I      intronic chr2:85610391(+) A-I      intronic chr2:85609316(+) A-I      intronic chr2:85607814(+) A-I      intronic chr2:85607813(+) A-I      intronic chr2:85607793(+) A-I      intronic chr2:85611773(+) A-I      intronic chr2:85602078(+) A-I      intronic chr2:85613650(+) A-I      intronic chr2:85610587(+) A-I      intronic chr2:85602082(+) A-I      intronic chr2:85602073(+) A-I      intronic chr2:85602056(+) A-I      intronic chr2:85602087(+) A-I      intronic chr2:85602091(+) A-I      intronic chr2:85602095(+) A-I      intronic chr2:85611695(+) A-I      intronic chr2:85610596(+) A-I      intronic chr2:85610597(+) A-I      intronic chr2:85610615(+) A-I      intronic chr2:85610617(+) A-I      intronic chr2:85611702(+) A-I      intronic chr2:85611772(+) A-I      intronic chr2:85601626(+) A-I      intronic chr2:85611694(+) A-I      intronic chr2:85611693(+) A-I      intronic chr2:85610554(+) A-I      intronic chr2:85611692(+) A-I      intronic chr2:85607822(+) A-I      intronic chr2:85607749(+) A-I      intronic chr2:85613771(+) A-I      intronic chr2:85611689(+) A-I      intronic chr2:85611686(+) A-I      intronic chr2:85611685(+) A-I      intronic chr2:85610605(+) A-I      intronic chr2:85610604(+) A-I      intronic chr2:85610603(+) A-I      intronic chr2:85613755(+) A-I      intronic chr2:85613691(+) A-I      intronic chr2:85610602(+) A-I      intronic chr2:85601622(+) A-I      intronic chr2:85611788(+) A-I      intronic chr2:85611783(+) A-I      intronic chr2:85611734(+) A-I      intronic chr2:85610709(+) A-I      intronic chr2:85610439(+) A-I      intronic chr2:85609725(+) A-I      intronic chr2:85609678(+) A-I      intronic chr2:85609661(+) A-I      intronic chr2:85588939(+) A-I      intronic chr2:85589860(+) A-I      intronic chr2:85609473(+) A-I      intronic chr2:85589920(+) A-I      intronic chr2:85609346(+) A-I      intronic chr2:85609291(+) A-I      intronic chr2:85609223(+) A-I      intronic chr2:85609120(+) A-I      intronic chr2:85609119(+) A-I      intronic chr2:85602156(+) A-I      intronic chr2:85602155(+) A-I      intronic chr2:85601674(+) A-I      intronic chr2:85601648(+) A-I      intronic chr2:85601606(+) A-I      intronic chr2:85600786(+) A-I      intronic chr2:85595240(+) A-I      intronic chr2:85595170(+) A-I      intronic chr2:85595163(+) A-I      intronic chr2:85593315(+) A-I      intronic chr2:85593303(+) A-I      intronic chr2:85593294(+) A-I      intronic chr2:85593291(+) A-I      intronic chr2:85593283(+) A-I      intronic chr2:85592035(+) A-I      intronic chr2:85591984(+) A-I      intronic chr2:85591477(+) A-I      intronic chr2:85591437(+) A-I      intronic chr2:85591435(+) A-I      intronic chr2:85591415(+) A-I      intronic chr2:85591177(+) A-I      intronic chr2:85587291(+) A-I      intronic chr2:85602067(+) A-I      intronic chr2:85613869(+) A-I      intronic chr2:85591131(+) A-I      intronic chr2:85587166(+) A-I      intronic chr2:85587245(+) A-I      intronic chr2:85587282(+) A-I      intronic chr2:85614116(+) A-I      intronic chr2:85587304(+) A-I      intronic chr2:85587310(+) A-I      intronic chr2:85587739(+) A-I      intronic chr2:85587740(+) A-I      intronic chr2:85587752(+) A-I      intronic chr2:85588151(+) A-I      intronic chr2:85609093(+) A-I      intronic chr2:85609083(+) A-I      intronic chr2:85609063(+) A-I      intronic chr2:85609055(+) A-I      intronic chr2:85609012(+) A-I      intronic chr2:85607910(+) A-I      intronic chr2:85613965(+) A-I      intronic chr2:85613967(+) A-I      intronic chr2:85614015(+) A-I      intronic chr2:85614027(+) A-I      intronic chr2:85613863(+) A-I      intronic chr2:85614115(+) A-I      intronic chr2:85614038(+) A-I      intronic chr2:85611844(+) A-I      intronic chr2:85607831(+) A-I      intronic chr2:85588164(+) A-I      intronic chr2:85607789(+) A-I      intronic chr2:85588907(+) A-I      intronic chr2:85588923(+) A-I      intronic chr2:85588933(+) A-I      intronic chr2:85611842(+) A-I      intronic chr2:85588131(+) A-I      intronic chr2:85586815(+) A-I      intronic chr2:85613722(+) A-I      intronic chr2:85613962(+) A-I      intronic chr2:85614028(+) A-I      intronic chr2:85587658(+) A-I      intronic chr2:85610432(+) A-I      intronic chr2:85607900(+) A-I      intronic chr2:85611729(+) A-I      intronic chr2:85609900(+) A-I      intronic chr2:85609805(+) A-I      intronic chr2:85613941(+) A-I      intronic chr2:85610467(+) A-I      intronic chr2:85609506(+) A-I      intronic chr2:85587563(+) A-I      intronic chr2:85584015(+) A-I      intronic chr2:85609451(+) A-I      intronic chr2:85609375(+) A-I      intronic chr2:85614058(+) A-I      intronic chr2:85591115(+) A-I      intronic chr2:85609703(+) A-I      intronic chr2:85600949(+) A-I      intronic chr2:85607848(+) A-I      intronic chr2:85601390(+) A-I      intronic chr2:85592030(+) A-I      intronic chr2:85601645(+) A-I      intronic chr2:85607766(+) A-I      intronic chr2:85601978(+) A-I      intronic chr2:85607787(+) A-I      intronic chr2:85591352(+) A-I      intronic chr2:85610441(+) A-I      intronic chr2:85591480(+) A-I      intronic chr2:85587169(+) A-I      intronic chr2:85592320(+) A-I      intronic chr2:85610517(+) A-I      intronic chr2:85611760(+) A-I      intronic chr2:85598971(+) A-I      intronic chr2:85595055(+) A-I      intronic chr2:85613770(+) A-I      intronic chr2:85591102(+) A-I      intronic chr2:85592375(+) A-I      intronic chr2:85606602(+) A-I      intronic chr2:85609846(+) A-I      intronic chr2:85588194(+) A-I      intronic chr2:85592363(+) A-I      intronic chr2:85591992(+) A-I      intronic chr2:85610548(+) A-I      intronic chr2:85585147(+) A-I      intronic chr2:85608979(+) A-I      intronic chr2:85609913(+) A-I      intronic chr2:85591725(+) A-I      intronic chr2:85586966(+) A-I      intronic chr2:85609302(+) A-I      intronic chr2:85609739(+) A-I      intronic chr2:85611779(+) A-I      intronic chr2:85588204(+) A-I      intronic chr2:85609441(+) A-I      intronic chr2:85587606(+) A-I      intronic chr2:85609415(+) A-I      intronic chr2:85583883(+) A-I      intronic chr2:85593112(+) A-I      intronic chr2:85601582(+) A-I      intronic chr2:85613950(+) A-I      intronic chr2:85613625(+) A-I      intronic chr2:85613688(+) A-I      intronic chr2:85608986(+) A-I      intronic chr2:85591506(+) A-I      intronic chr2:85609321(+) A-I      intronic chr2:85613782(+) A-I      intronic chr2:85609482(+) A-I      intronic chr2:85591105(+) A-I      intronic chr2:85591587(+) A-I      intronic chr2:85595152(+) A-I      intronic chr2:85609904(+) A-I      intronic chr2:85609756(+) A-I      intronic chr2:85613588(+) A-I      intronic chr2:85610326(+) A-I      intronic chr2:85591787(+) A-I      intronic chr2:85601391(+) A-I      intronic chr2:85614507(+) A-I      intronic chr2:85610550(+) A-I      intronic chr2:85587339(+) A-I      intronic chr2:85591361(+) A-I      intronic chr2:85613899(+) A-I      intronic chr2:85601824(+) A-I      intronic chr2:85613673(+) A-I      intronic chr2:85601346(+) A-I      intronic chr2:85613979(+) A-I      intronic chr2:85593221(+) A-I      intronic chr2:85602111(+) A-I      intronic chr2:85613557(+) A-I      intronic chr2:85609053(+) A-I      intronic chr2:85592071(+) A-I      intronic chr2:85593386(+) A-I      intronic chr2:85610332(+) A-I      intronic chr2:85588203(+) A-I      intronic chr2:85587242(+) A-I      intronic chr2:85601739(+) A-I      intronic chr2:85613974(+) A-I      intronic chr2:85613743(+) A-I      intronic chr2:85592430(+) A-I      intronic chr2:85609922(+) A-I      intronic chr2:85595097(+) A-I      intronic chr2:85613633(+) A-I      intronic chr2:85613951(+) A-I      intronic chr2:85615305(+) A-I      intronic chr2:85613674(+) A-I      intronic chr2:85614054(+) A-I      intronic chr2:85592206(+) A-I      intronic chr2:85609061(+) A-I      intronic chr2:85607753(+) A-I      intronic chr2:85593182(+) A-I      intronic chr2:85606580(+) A-I      intronic chr2:85587616(+) A-I      intronic chr2:85611802(+) A-I      intronic chr2:85592193(+) A-I      intronic chr2:85607922(+) A-I      intronic chr2:85592179(+) A-I      intronic chr2:85607668(+) A-I      intronic chr2:85609408(+) A-I      intronic chr2:85613966(+) A-I      intronic chr2:85607777(+) A-I      intronic chr2:85609400(+) A-I      intronic chr2:85601727(+) A-I      intronic chr2:85592194(+) A-I      intronic chr2:85593181(+) A-I      intronic chr2:85610547(+) A-I      intronic chr2:85609549(+) A-I      intronic chr2:85591349(+) A-I      intronic chr2:85593176(+) A-I      intronic chr2:85595151(+) A-I      intronic chr2:85609819(+) A-I      intronic chr2:85592385(+) A-I      intronic chr2:85609540(+) A-I      intronic chr2:85613968(+) A-I      intronic chr2:85586965(+) A-I      intronic chr2:85609494(+) A-I      intronic chr2:85592394(+) A-I      intronic chr2:85592393(+) A-I      intronic chr2:85587546(+) A-I      intronic chr2:85600780(+) A-I      intronic chr2:85587295(+) A-I      intronic chr2:85609455(+) A-I      intronic chr2:85609470(+) A-I      intronic chr2:85609541(+) A-I      intronic chr2:85587238(+) A-I      intronic chr2:85607713(+) A-I      intronic chr2:85587150(+) A-I      intronic chr2:85614710(+) A-I      intronic chr2:85611740(+) A-I      intronic chr2:85591389(+) A-I      intronic chr2:85601369(+) A-I      intronic chr2:85614585(+) A-I      intronic chr2:85613529(+) A-I      intronic chr2:85609308(+) A-I      intronic chr2:85591453(+) A-I      intronic chr2:85613560(+) A-I      intronic chr2:85609385(+) A-I      intronic chr2:85610283(+) A-I      intronic chr2:85610316(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	ELMOD3	chr2:85585242(+) A-G intron -    22484847 chr2:85587150(+) A-G intron -    22484847 chr2:85587611(+) A-G intron -    22484847 chr2:85588798(+) A-G intron -    22484847 chr2:85591349(+) A-G intron -    22484847 chr2:85591352(+) A-G intron -    22484847 chr2:85591560(+) A-G intron -    22484847 chr2:85593138(+) A-G intron -    22484847 chr2:85593162(+) A-G intron -    22484847 chr2:85593176(+) A-G intron -    22484847 chr2:85593182(+) A-G intron -    22484847 chr2:85593221(+) A-G intron -    22484847 chr2:85601582(+) A-G intron -    22484847 chr2:85607713(+) A-G intron -    22484847 chr2:85607723(+) A-G intron -    22484847 chr2:85607742(+) A-G intron -    22484847 chr2:85607753(+) A-G intron -    22484847 chr2:85607787(+) A-G intron -    22484847 chr2:85607837(+) A-G intron -    22484847 chr2:85607848(+) A-G intron -    22484847 chr2:85607900(+) A-G intron -    22484847 chr2:85607922(+) A-G intron -    22484847 chr2:85608985(+) A-G intron -    22484847 chr2:85608986(+) A-G intron -    22484847 chr2:85609321(+) A-G intron -    22484847 chr2:85609756(+) A-G intron -    22484847 chr2:85609768(+) A-G intron -    22484847 chr2:85609805(+) A-G intron -    22484847 chr2:85609819(+) A-G intron -    22484847 chr2:85609904(+) A-G intron -    22484847 chr2:85609913(+) A-G intron -    22484847 chr2:85610547(+) A-G intron -    22484847 chr2:85611729(+) A-G intron -    22484847 chr2:85611740(+) A-G intron -    22484847 chr2:85611779(+) A-G intron -    22484847 chr2:85613557(+) A-G intron -    22484847 chr2:85613577(+) A-G intron -    22484847 chr2:85613588(+) A-G intron -    22484847 chr2:85613669(+) A-G intron -    22484847 chr2:85613688(+) A-G intron -    22484847 chr2:85613722(+) A-G intron -    22484847 chr2:85613743(+) A-G intron -    22484847 chr2:85613904(+) A-G intron -    22484847 chr2:85614028(+) A-G intron -    22484847 chr2:85614032(+) A-G intron -    22484847 chr2:85614507(+) A-G intron -    22484847 chr2:85614592(+) T-C intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	ELMOD3	chr2:85581571-85581572(+) m6A exon       24284625//24981863 chr2:85581658-85581659(+) m6A exon       24284625//24981863 chr2:85581686-85581687(+) m6A exon       24284625//24981863 chr2:85581923-85581924(+) m6A 5'UTR//exon       24981863 chr2:85584105-85584106(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24284625//22608085 chr2:85584115-85584116(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24284625//22608085 chr2:85584137-85584138(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr2:85584167-85584168(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24284625//24981863//22608085 chr2:85584259-85584260(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr2:85584289-85584290(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr2:85584304-85584305(+) m6A 5'UTR//exon//intron       24284625//25456834//24981863//22608085 chr2:85584371-85584372(+) m6A CDS//exon//intron       22608085 chr2:85595856-85595857(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24981863 chr2:85595873-85595874(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24981863 chr2:85596929-85596930(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625 chr2:85596936-85596937(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       24284625

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	ELMOD3	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv2-miR-H9-3p
Interactor2: ELMOD3

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//Rep//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg