Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00168049

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H7-5p:  MIMAT0014351          TDRD10:  NM_001098475     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv2-miR-H7-5p	TDRD10
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014351	126668
Organism	Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	-

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	TDRD10	chr1:154501793(+) A-I      intronic chr1:154495066(+) A-I      intronic chr1:154495020(+) A-I      intronic chr1:154477383(+) A-I      intronic chr1:154475970(+) A-I      intronic chr1:154475903(+) A-I      intronic chr1:154475899(+) A-I      intronic chr1:154501620(+) A-I      intronic chr1:154511841(+) A-I      intronic chr1:154511878(+) A-I      intronic chr1:154511883(+) A-I      intronic chr1:154511896(+) A-I      intronic chr1:154510842(+) A-I      intronic chr1:154510849(+) A-I      intronic chr1:154514773(+) A-I      intronic chr1:154495571(+) A-I      intronic chr1:154499661(+) A-I      intronic chr1:154498168(+) A-I      intronic chr1:154510873(+) A-I      intronic chr1:154486489(+) A-I      intronic chr1:154486490(+) A-I      intronic chr1:154486510(+) A-I      intronic chr1:154486519(+) A-I      intronic chr1:154498115(+) A-I      intronic chr1:154511945(+) A-I      intronic chr1:154511965(+) A-I      intronic chr1:154511985(+) A-I      intronic chr1:154512010(+) A-I      intronic chr1:154486523(+) A-I      intronic chr1:154498136(+) A-I      intronic chr1:154501962(+) A-I      intronic chr1:154511918(+) A-I      intronic chr1:154498179(+) A-I      intronic chr1:154498160(+) A-I      intronic chr1:154500902(+) A-I      intronic chr1:154500885(+) A-I      intronic chr1:154499626(+) A-I      intronic chr1:154499576(+) A-I      intronic chr1:154499032(+) A-I      intronic chr1:154499031(+) A-I      intronic chr1:154498591(+) A-I      intronic chr1:154498570(+) A-I      intronic chr1:154498425(+) A-I      intronic chr1:154498199(+) A-I      intronic chr1:154498145(+) A-I      intronic chr1:154498128(+) A-I      intronic chr1:154496878(+) A-I      intronic chr1:154496666(+) A-I      intronic chr1:154495591(+) A-I      intronic chr1:154495053(+) A-I      intronic chr1:154484398(+) A-I      intronic chr1:154484378(+) A-I      intronic chr1:154483443(+) A-I      intronic chr1:154479126(+) A-I      intronic chr1:154478952(+) A-I      intronic chr1:154478921(+) A-I      intronic chr1:154478916(+) A-I      intronic chr1:154478915(+) A-I      intronic chr1:154478907(+) A-I      intronic chr1:154477428(+) A-I      intronic chr1:154477420(+) A-I      intronic chr1:154477408(+) A-I      intronic chr1:154477375(+) A-I      intronic chr1:154476020(+) A-I      intronic chr1:154476019(+) A-I      intronic chr1:154475906(+) A-I      intronic chr1:154475839(+) A-I      intronic chr1:154475814(+) A-I      intronic chr1:154475808(+) A-I      intronic chr1:154498416(+) A-I      intronic chr1:154500887(+) A-I      intronic chr1:154515716(+) A-I      intronic chr1:154515671(+) A-I      intronic chr1:154515630(+) A-I      intronic chr1:154515566(+) A-I      intronic chr1:154515484(+) A-I      intronic chr1:154514956(+) A-I      intronic chr1:154514804(+) A-I      intronic chr1:154514723(+) A-I      intronic chr1:154512050(+) A-I      intronic chr1:154512023(+) A-I      intronic chr1:154512011(+) A-I      intronic chr1:154511980(+) A-I      intronic chr1:154511842(+) A-I      intronic chr1:154511235(+) A-I      intronic chr1:154511182(+) A-I      intronic chr1:154511163(+) A-I      intronic chr1:154511157(+) A-I      intronic chr1:154510887(+) A-I      intronic chr1:154510879(+) A-I      intronic chr1:154510865(+) A-I      intronic chr1:154510805(+) A-I      intronic chr1:154508784(+) A-I      intronic chr1:154508773(+) A-I      intronic chr1:154508732(+) A-I      intronic chr1:154508731(+) A-I      intronic chr1:154508705(+) A-I      intronic chr1:154508696(+) A-I      intronic chr1:154508691(+) A-I      intronic chr1:154508687(+) A-I      intronic chr1:154508676(+) A-I      intronic chr1:154508615(+) A-I      intronic chr1:154508082(+) A-I      intronic chr1:154508029(+) A-I      intronic chr1:154507938(+) A-I      intronic chr1:154507798(+) A-I      intronic chr1:154507788(+) A-I      intronic chr1:154507642(+) A-I      intronic chr1:154506260(+) A-I      intronic chr1:154503444(+) A-I      intronic chr1:154503440(+) A-I      intronic chr1:154515636(+) A-I      intronic chr1:154512918(+) A-I      intronic chr1:154499606(+) A-I      intronic chr1:154508599(+) A-I      intronic chr1:154502078(+) A-I      intronic chr1:154511944(+) A-I      intronic chr1:154507722(+) A-I      intronic chr1:154484203(+) A-I      intronic chr1:154477413(+) A-I      intronic chr1:154499190(+) A-I      intronic chr1:154500613(+) A-I      intronic chr1:154495656(+) A-I      intronic chr1:154500829(+) A-I      intronic chr1:154515672(+) A-I      intronic chr1:154510915(+) A-I      intronic chr1:154500612(+) A-I      intronic chr1:154506240(+) A-I      intronic chr1:154510810(+) A-I      intronic chr1:154506435(+) A-I      intronic chr1:154511882(+) A-I      intronic chr1:154511809(+) A-I      intronic chr1:154499140(+) A-I      intronic chr1:154508138(+) A-I      intronic chr1:154512051(+) A-I      intronic chr1:154511166(+) A-I      intronic chr1:154514845(+) A-I      intronic chr1:154499191(+) A-I      intronic chr1:154515006(+) A-I      intronic chr1:154477415(+) A-I      intronic chr1:154495100(+) A-I      intronic chr1:154499203(+) A-I      intronic chr1:154512946(+) A-I      intronic chr1:154501061(+) A-I      intronic chr1:154500889(+) A-I      intronic chr1:154476133(+) A-I      intronic chr1:154506250(+) A-I      intronic chr1:154514924(+) A-I      intronic chr1:154511954(+) A-I      intronic chr1:154510947(+) A-I      intronic chr1:154499033(+) A-I      intronic chr1:154514843(+) A-I      intronic chr1:154506423(+) A-I      intronic chr1:154479013(+) A-I      intronic chr1:154511963(+) A-I      intronic chr1:154511249(+) A-I      intronic chr1:154477299(+) A-I      intronic chr1:154499071(+) A-I      intronic chr1:154500648(+) A-I      intronic chr1:154475855(+) A-I      intronic chr1:154498114(+) A-I      intronic chr1:154510876(+) A-I      intronic chr1:154511261(+) A-I      intronic chr1:154495027(+) A-I      intronic chr1:154510946(+) A-I      intronic chr1:154484070(+) A-I      intronic chr1:154508035(+) A-I      intronic chr1:154510875(+) A-I      intronic chr1:154515604(+) A-I      intronic chr1:154511834(+) A-I      intronic chr1:154499239(+) A-I      intronic chr1:154500604(+) A-I      intronic chr1:154477293(+) A-I      intronic chr1:154512063(+) A-I      intronic chr1:154512085(+) A-I      intronic chr1:154511905(+) A-I      intronic chr1:154511218(+) A-I      intronic chr1:154508745(+) A-I      intronic chr1:154495026(+) A-I      intronic chr1:154514925(+) A-I      intronic chr1:154511202(+) A-I      intronic chr1:154511998(+) A-I      intronic chr1:154506200(+) A-I      intronic chr1:154511208(+) A-I      intronic chr1:154483658(+) A-I      intronic chr1:154498463(+) A-I      intronic chr1:154499649(+) A-I      intronic chr1:154475865(+) A-I      intronic chr1:154507723(+) A-I      intronic chr1:154475908(+) A-I      intronic chr1:154511908(+) A-I      intronic chr1:154515480(+) A-I      intronic chr1:154495634(+) A-I      intronic chr1:154515520(+) A-I      intronic chr1:154511969(+) A-I      intronic chr1:154498169(+) A-I      intronic chr1:154514837(+) A-I      intronic chr1:154485080(+) A-I      intronic chr1:154499542(+) A-I      intronic chr1:154512028(+) A-I      intronic chr1:154484914(+) A-I      intronic chr1:154477342(+) A-I      intronic chr1:154489954(+) A-I      intronic chr1:154512040(+) A-I      intronic chr1:154511879(+) A-I      intronic chr1:154501062(+) A-I      intronic chr1:154507657(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	TDRD10	chr1:154478998(+) C-T intron -    22484847 chr1:154479013(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	TDRD10	chr1:154474835-154474836(+) m6A 5'UTR       - chr1:154474845-154474846(+) m6A 5'UTR       - chr1:154520298-154520299(+) m6A 3'UTR//exon       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsv2-miR-H7-5p	Exosome K562 cells     24460325
	TDRD10	Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv2-miR-H7-5p
Interactor2: TDRD10

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//Rep//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg