Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00166847

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H7-5p:  MIMAT0014351          ACTR3:  NR_102318     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv2-miR-H7-5p	ACTR3
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014351	10096
Organism	Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	ARP3

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	ACTR3	chr2:114706014(+) A-I      intronic chr2:114707361(+) A-I      intronic chr2:114694846(+) A-I      intronic chr2:114705966(+) A-I      intronic chr2:114707362(+) A-I      intronic chr2:114709042(+) A-I      intronic chr2:114707226(+) A-I      intronic chr2:114694847(+) A-I      intronic chr2:114707265(+) A-I      intronic chr2:114694857(+) A-I      intronic chr2:114707238(+) A-I      intronic chr2:114705962(+) A-I      intronic chr2:114707256(+) A-I      intronic chr2:114693636(+) A-I      intronic chr2:114693668(+) A-I      intronic chr2:114707416(+) A-I      intronic chr2:114707405(+) A-I      intronic chr2:114707340(+) A-I      intronic chr2:114707305(+) A-I      intronic chr2:114707242(+) A-I      intronic chr2:114693706(+) A-I      intronic chr2:114694866(+) A-I      intronic chr2:114694883(+) A-I      intronic chr2:114694926(+) A-I      intronic chr2:114696656(+) A-I      intronic chr2:114707239(+) A-I      intronic chr2:114706982(+) A-I      intronic chr2:114706972(+) A-I      intronic chr2:114706808(+) A-I      intronic chr2:114706779(+) A-I      intronic chr2:114706778(+) A-I      intronic chr2:114706769(+) A-I      intronic chr2:114706754(+) A-I      intronic chr2:114706745(+) A-I      intronic chr2:114706705(+) A-I      intronic chr2:114706007(+) A-I      intronic chr2:114705989(+) A-I      intronic chr2:114705987(+) A-I      intronic chr2:114705914(+) A-I      intronic chr2:114705093(+) A-I      intronic chr2:114705009(+) A-I      intronic chr2:114704991(+) A-I      intronic chr2:114704982(+) A-I      intronic chr2:114696838(+) A-I      intronic chr2:114696718(+) A-I      intronic chr2:114696705(+) A-I      intronic chr2:114696681(+) A-I      intronic chr2:114669569(+) A-I      intronic chr2:114690816(+) A-I      intronic chr2:114690884(+) A-I      intronic chr2:114658748(+) A-I      intronic chr2:114658774(+) A-I      intronic chr2:114658784(+) A-I      intronic chr2:114661648(+) A-I      intronic chr2:114662895(+) A-I      intronic chr2:114696675(+) A-I      intronic chr2:114662962(+) A-I      intronic chr2:114662963(+) A-I      intronic chr2:114693615(+) A-I      intronic chr2:114707206(+) A-I      intronic chr2:114691050(+) A-I      intronic chr2:114690935(+) A-I      intronic chr2:114662974(+) A-I      intronic chr2:114663029(+) A-I      intronic chr2:114665286(+) A-I      intronic chr2:114665309(+) A-I      intronic chr2:114665366(+) A-I      intronic chr2:114665385(+) A-I      intronic chr2:114665392(+) A-I      intronic chr2:114669555(+) A-I      intronic chr2:114669556(+) A-I      intronic chr2:114690992(+) A-I      intronic chr2:114690975(+) A-I      intronic chr2:114690971(+) A-I      intronic chr2:114658647(+) A-I      intronic chr2:114662931(+) A-I      intronic chr2:114707349(+) A-I      intronic chr2:114691011(+) A-I      intronic chr2:114693620(+) A-I      intronic chr2:114705913(+) A-I      intronic chr2:114705218(+) A-I      intronic chr2:114690930(+) A-I      intronic chr2:114706904(+) A-I      intronic chr2:114707269(+) A-I      intronic chr2:114693819(+) A-I      intronic chr2:114693645(+) A-I      intronic chr2:114706905(+) A-I      intronic chr2:114693669(+) A-I      intronic chr2:114690868(+) A-I      intronic chr2:114690934(+) A-I      intronic chr2:114653711(+) A-I      intronic chr2:114706790(+) A-I      intronic chr2:114680963(+) A-I      intronic chr2:114706834(+) A-I      intronic chr2:114691310(+) A-I      intronic chr2:114693671(+) A-I      intronic chr2:114691010(+) A-I      intronic chr2:114693811(+) A-I      intronic chr2:114661573(+) A-I      intronic chr2:114660200(+) A-I      intronic chr2:114693614(+) A-I      intronic chr2:114664990(+) A-I      intronic chr2:114662856(+) A-I      intronic chr2:114707360(+) A-I      intronic chr2:114705965(+) A-I      intronic chr2:114662880(+) A-I      intronic chr2:114702329(+) A-I      intronic chr2:114707219(+) A-I      intronic chr2:114706844(+) A-I      intronic chr2:114658914(+) A-I      intronic chr2:114691442(+) A-I      intronic chr2:114690965(+) A-I      intronic chr2:114707402(+) A-I      intronic chr2:114691035(+) A-I      intronic chr2:114707208(+) A-I      intronic chr2:114706693(+) A-I      intronic chr2:114693748(+) A-I      intronic chr2:114707323(+) A-I      intronic chr2:114693783(+) A-I      intronic chr2:114705826(+) A-I      intronic chr2:114665335(+) A-I      intronic chr2:114661644(+) A-I      intronic chr2:114707312(+) A-I      intronic chr2:114690933(+) A-I      intronic chr2:114691092(+) A-I      intronic chr2:114662877(+) A-I      intronic chr2:114694820(+) A-I      intronic chr2:114690959(+) A-I      intronic chr2:114705138(+) A-I      intronic chr2:114665092(+) A-I      intronic chr2:114705110(+) A-I      intronic chr2:114691037(+) A-I      intronic chr2:114682603(+) A-I      intronic chr2:114690870(+) A-I      intronic chr2:114690966(+) A-I      intronic chr2:114707276(+) A-I      intronic chr2:114707329(+) A-I      intronic chr2:114671935(+) A-I      intronic chr2:114705013(+) A-I      intronic chr2:114707414(+) A-I      intronic chr2:114658775(+) A-I      intronic chr2:114691396(+) A-I      intronic chr2:114706699(+) A-I      intronic chr2:114707232(+) A-I      intronic chr2:114706003(+) A-I      intronic chr2:114702228(+) A-I      intronic chr2:114665288(+) A-I      intronic chr2:114669414(+) A-I      intronic chr2:114705853(+) A-I      intronic chr2:114706700(+) A-I      intronic chr2:114706708(+) A-I      intronic chr2:114665065(+) A-I      intronic chr2:114705852(+) A-I      intronic chr2:114707213(+) A-I      intronic chr2:114705970(+) A-I      intronic chr2:114658710(+) A-I      intronic chr2:114705916(+) A-I      intronic chr2:114691030(+) A-I      intronic chr2:114665001(+) A-I      intronic chr2:114693704(+) A-I      intronic chr2:114691070(+) A-I      intronic chr2:114705856(+) A-I      intronic chr2:114693728(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	ACTR3	chr2:114707232(+) A-I intron -    21960545 chr2:114707279(+) A-I intron -    21960545 chr2:114707402(+) A-I intron -    21960545 chr2:114687708(+) T-C intron -    22484847 chr2:114658709(+) A-G intron -    22484847 chr2:114658710(+) A-G intron -    22484847 chr2:114658775(+) A-G intron -    22484847 chr2:114660200(+) A-G intron -    22484847 chr2:114660218(+) T-C intron -    22484847 chr2:114660343(+) G-A intron -    22484847 chr2:114661644(+) A-G intron -    22484847 chr2:114662856(+) A-G intron -    22484847 chr2:114662877(+) A-G intron -    22484847 chr2:114662880(+) A-G intron -    22484847 chr2:114663017(+) A-G intron -    22484847 chr2:114663056(+) A-T intron -    22484847 chr2:114665065(+) A-G intron -    22484847 chr2:114665288(+) A-G intron -    22484847 chr2:114665335(+) A-G intron -    22484847 chr2:114665388(+) G-A intron -    22484847 chr2:114669015(+) G-T intron -    22484847 chr2:114669016(+) A-T intron -    22484847 chr2:114677625(+) T-C intron -    22484847 chr2:114680963(+) A-G intron -    22484847 chr2:114681629(+) C-T intron -    22484847 chr2:114681631(+) C-T intron -    22484847 chr2:114681632(+) T-C intron -    22484847 chr2:114681835(+) G-T intron -    22484847 chr2:114681899(+) T-C intron -    22484847 chr2:114681905(+) T-C intron -    22484847 chr2:114686976(+) T-C intron -    22484847 chr2:114690830(+) A-G intron -    22484847 chr2:114690859(+) A-G intron -    22484847 chr2:114690868(+) A-G intron -    22484847 chr2:114690870(+) A-G intron -    22484847 chr2:114690930(+) A-G intron -    22484847 chr2:114690934(+) A-G intron -    22484847 chr2:114690939(+) A-G intron -    22484847 chr2:114690959(+) A-G intron -    22484847 chr2:114690966(+) A-G intron -    22484847 chr2:114691010(+) A-G intron -    22484847 chr2:114691011(+) A-G intron -    22484847 chr2:114691030(+) A-G intron -    22484847 chr2:114691035(+) A-G intron -    22484847 chr2:114691037(+) A-G intron -    22484847 chr2:114691096(+) G-A intron -    22484847 chr2:114691310(+) A-G intron -    22484847 chr2:114691386(+) A-G intron -    22484847 chr2:114691432(+) A-G intron -    22484847 chr2:114691442(+) A-G intron -    22484847 chr2:114693614(+) A-G intron -    22484847 chr2:114693620(+) A-G intron -    22484847 chr2:114693645(+) A-G intron -    22484847 chr2:114693704(+) A-G intron -    22484847 chr2:114693706(+) A-T intron -    22484847 chr2:114693711(+) A-G intron -    22484847 chr2:114693728(+) A-G intron -    22484847 chr2:114693748(+) A-G intron -    22484847 chr2:114693784(+) A-G intron -    22484847 chr2:114694750(+) A-G intron -    22484847 chr2:114694820(+) A-G intron -    22484847 chr2:114694863(+) A-G intron -    22484847 chr2:114705218(+) A-G intron -    22484847 chr2:114705852(+) A-G intron -    22484847 chr2:114705901(+) A-G intron -    22484847 chr2:114705913(+) A-G intron -    22484847 chr2:114705916(+) A-G intron -    22484847 chr2:114705965(+) A-G intron -    22484847 chr2:114705970(+) A-G intron -    22484847 chr2:114706693(+) A-G intron -    22484847 chr2:114706697(+) A-G intron -    22484847 chr2:114706699(+) A-G intron -    22484847 chr2:114706700(+) A-G intron -    22484847 chr2:114706790(+) A-G intron -    22484847 chr2:114706804(+) A-G intron -    22484847 chr2:114706860(+) T-C intron -    22484847 chr2:114706869(+) T-C intron -    22484847 chr2:114707208(+) A-G intron -    22484847 chr2:114707232(+) A-G intron -    22484847 chr2:114707279(+) A-G intron -    22484847 chr2:114707360(+) A-G intron -    22484847 chr2:114707414(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	ACTR3	chr2:114647573-114647574(+) m1A 5'UTR       26863196//26863410 chr2:114647648-114647649(+) m6A 5'UTR       24284625//25456834//24981863 chr2:114647887-114647888(+) m6A 5'UTR//CDS       24284625//24981863//22575960 chr2:114670757-114670758(+) m6A 5'UTR//CDS//intron       26404942//22575960 chr2:114670781-114670782(+) m6A 5'UTR//CDS//intron       26404942//22575960 chr2:114674535-114674536(+) m6A CDS//intron       26404942 chr2:114674566-114674567(+) m6A CDS//intron       26404942//22575960 chr2:114684955-114684956(+) m6A 3'UTR//CDS//exon//intron       26404942 chr2:114697567-114697568(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942 chr2:114697623-114697624(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       26404942 chr2:114715126-114715127(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr2:114715151-114715152(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr2:114715471-114715472(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr2:114715515-114715516(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr2:114715614-114715615(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr2:114715703-114715704(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr2:114715716-114715717(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr2:114715755-114715756(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr2:114715760-114715761(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr2:114715893-114715894(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr2:114715970-114715971(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr2:114716079-114716080(+) m6A 3'UTR//exon       27773535 chr2:114718953-114718954(+) m6A 3'UTR       27773535 chr2:114718997-114718998(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	hsv2-miR-H7-5p	Exosome K562 cells     24460325
	ACTR3	Chromatin K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv2-miR-H7-5p
Interactor2: ACTR3

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Rep//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg