Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00166291

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H7-5p:           PPP1R12B:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsv2-miR-H7-5p PPP1R12B
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0014351 4660
Organism Human alphaherpesvirus 2 (HSV2) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - MYPT2//PP1bp55

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR PPP1R12B
chr1:202443511(+) A-I      intronic
chr1:202512777(+) A-I      intronic
chr1:202341449(+) A-I      intronic
chr1:202341446(+) A-I      intronic
chr1:202408413(+) A-I      intronic
chr1:202408402(+) A-I      intronic
chr1:202408400(+) A-I      intronic
chr1:202408393(+) A-I      intronic
chr1:202408389(+) A-I      intronic
chr1:202554359(+) A-I      3'UTR
chr1:202554312(+) A-I      3'UTR
chr1:202554265(+) A-I      3'UTR
chr1:202554260(+) A-I      3'UTR
chr1:202554224(+) A-I      3'UTR
chr1:202554168(+) A-I      3'UTR
chr1:202551835(+) A-I      3'UTR
chr1:202551834(+) A-I      3'UTR
chr1:202319849(+) A-I      intronic
chr1:202323593(+) A-I      intronic
chr1:202323611(+) A-I      intronic
chr1:202325224(+) A-I      intronic
chr1:202443510(+) A-I      intronic
chr1:202533018(+) A-I      intronic
chr1:202533010(+) A-I      intronic
chr1:202517867(+) A-I      intronic
chr1:202517860(+) A-I      intronic
chr1:202517834(+) A-I      intronic
chr1:202517818(+) A-I      intronic
chr1:202517810(+) A-I      intronic
chr1:202455788(+) A-I      intronic
chr1:202455774(+) A-I      intronic
chr1:202455771(+) A-I      intronic
chr1:202455762(+) A-I      intronic
chr1:202455751(+) A-I      intronic
chr1:202455749(+) A-I      intronic
chr1:202455737(+) A-I      intronic
chr1:202455732(+) A-I      intronic
chr1:202455731(+) A-I      intronic
chr1:202455224(+) A-I      intronic
chr1:202455219(+) A-I      intronic
chr1:202455210(+) A-I      intronic
chr1:202455193(+) A-I      intronic
chr1:202455176(+) A-I      intronic
chr1:202364177(+) A-I      intronic
chr1:202364112(+) A-I      intronic
chr1:202364085(+) A-I      intronic
chr1:202364084(+) A-I      intronic
chr1:202364070(+) A-I      intronic
chr1:202364069(+) A-I      intronic
chr1:202351826(+) A-I      intronic
chr1:202351819(+) A-I      intronic
chr1:202351809(+) A-I      intronic
chr1:202351804(+) A-I      intronic
chr1:202351803(+) A-I      intronic
chr1:202351795(+) A-I      intronic
chr1:202341454(+) A-I      intronic
chr1:202341453(+) A-I      intronic
chr1:202341399(+) A-I      intronic
chr1:202532447(+) A-I      intronic
chr1:202551902(+) A-I      3'UTR
chr1:202551866(+) A-I      3'UTR
chr1:202551870(+) A-I      3'UTR
chr1:202554189(+) A-I      3'UTR
chr1:202355508(+) A-I      intronic
chr1:202334480(+) A-I      intronic
chr1:202363255(+) A-I      intronic
chr1:202551968(+) A-I      3'UTR
chr1:202355484(+) A-I      intronic
chr1:202323517(+) A-I      intronic
chr1:202323800(+) A-I      intronic
chr1:202334463(+) A-I      intronic
chr1:202507173(+) A-I      intronic
chr1:202363682(+) A-I      intronic
chr1:202551958(+) A-I      3'UTR
chr1:202351883(+) A-I      intronic
chr1:202460416(+) A-I      intronic
chr1:202473339(+) A-I      intronic
chr1:202473360(+) A-I      intronic
chr1:202533153(+) A-I      intronic
chr1:202473401(+) A-I      intronic
chr1:202517508(+) A-I      intronic
chr1:202362110(+) A-I      intronic
chr1:202390647(+) A-I      intronic
chr1:202323586(+) A-I      intronic
chr1:202329769(+) A-I      intronic
chr1:202342082(+) A-I      intronic
chr1:202329717(+) A-I      intronic
chr1:202364099(+) A-I      intronic
chr1:202363788(+) A-I      intronic
chr1:202363627(+) A-I      intronic
chr1:202507261(+) A-I      intronic
chr1:202551954(+) A-I      3'UTR
chr1:202342081(+) A-I      intronic
chr1:202507308(+) A-I      intronic
chr1:202551882(+) A-I      3'UTR
chr1:202473427(+) A-I      intronic
chr1:202473433(+) A-I      intronic
chr1:202363289(+) A-I      intronic
chr1:202473442(+) A-I      intronic
chr1:202512806(+) A-I      intronic
chr1:202328443(+) A-I      intronic
chr1:202328395(+) A-I      intronic
chr1:202328376(+) A-I      intronic
chr1:202415623(+) A-I      intronic
chr1:202533000(+) A-I      intronic
chr1:202323470(+) A-I      intronic
chr1:202554297(+) A-I      3'UTR
chr1:202554298(+) A-I      3'UTR
chr1:202321904(+) A-I      intronic
chr1:202473462(+) A-I      intronic
chr1:202341577(+) A-I      intronic
chr1:202321888(+) A-I      intronic
chr1:202321862(+) A-I      intronic
chr1:202517575(+) A-I      intronic
chr1:202517804(+) A-I      intronic
chr1:202517821(+) A-I      intronic
chr1:202517840(+) A-I      intronic
chr1:202341560(+) A-I      intronic
chr1:202390250(+) A-I      intronic
chr1:202341552(+) A-I      intronic
chr1:202378511(+) A-I      intronic
chr1:202532380(+) A-I      intronic
chr1:202364124(+) A-I      intronic
chr1:202473471(+) A-I      intronic
chr1:202430222(+) A-I      intronic
chr1:202438065(+) A-I      intronic
chr1:202517858(+) A-I      intronic
chr1:202325042(+) A-I      intronic
chr1:202518647(+) A-I      intronic
chr1:202532976(+) A-I      intronic
chr1:202518714(+) A-I      intronic
chr1:202445241(+) A-I      intronic
chr1:202518728(+) A-I      intronic
chr1:202341422(+) A-I      intronic
chr1:202363628(+) A-I      intronic
chr1:202341418(+) A-I      intronic
chr1:202518731(+) A-I      intronic
chr1:202445732(+) A-I      intronic
chr1:202390317(+) A-I      intronic
chr1:202445750(+) A-I      intronic
chr1:202455678(+) A-I      intronic
chr1:202455891(+) A-I      intronic
chr1:202363649(+) A-I      intronic
chr1:202551919(+) A-I      3'UTR
chr1:202455679(+) A-I      intronic
chr1:202532967(+) A-I      intronic
chr1:202455695(+) A-I      intronic
chr1:202339138(+) A-I      intronic
chr1:202518753(+) A-I      intronic
chr1:202551906(+) A-I      3'UTR
chr1:202518782(+) A-I      intronic
chr1:202339105(+) A-I      intronic
chr1:202473268(+) A-I      intronic
chr1:202551863(+) A-I      3'UTR
chr1:202532442(+) A-I      intronic
chr1:202532497(+) A-I      intronic
chr1:202480444(+) A-I      intronic
chr1:202362276(+) A-I      intronic
chr1:202355625(+) A-I      intronic
chr1:202362213(+) A-I      intronic
chr1:202339065(+) A-I      intronic
chr1:202357534(+) A-I      intronic
chr1:202358873(+) A-I      intronic
chr1:202358967(+) A-I      intronic
chr1:202517574(+) A-I      intronic
chr1:202360040(+) A-I      intronic
chr1:202361714(+) A-I      intronic
chr1:202517547(+) A-I      intronic
chr1:202480445(+) A-I      intronic
chr1:202473313(+) A-I      intronic
chr1:202551789(+) A-I      3'UTR
chr1:202339024(+) A-I      intronic
chr1:202473294(+) A-I      intronic
chr1:202473273(+) A-I      intronic
chr1:202364134(+) A-I      intronic
chr1:202551828(+) A-I      3'UTR
chr1:202551854(+) A-I      3'UTR
chr1:202339004(+) A-I      intronic
chr1:202337989(+) A-I      intronic
chr1:202390318(+) A-I      intronic
chr1:202460402(+) A-I      intronic
chr1:202551898(+) A-I      3'UTR
chr1:202551856(+) A-I      3'UTR
chr1:202493004(+) A-I      intronic
chr1:202551862(+) A-I      3'UTR
chr1:202551892(+) A-I      3'UTR
chr1:202334958(+) A-I      intronic
chr1:202334940(+) A-I      intronic
chr1:202506402(+) A-I      intronic
chr1:202532941(+) A-I      intronic
chr1:202328298(+) A-I      intronic
chr1:202457986(+) A-I      intronic
chr1:202507385(+) A-I      intronic
chr1:202517630(+) A-I      intronic
chr1:202328398(+) A-I      intronic
chr1:202334322(+) A-I      intronic
chr1:202341564(+) A-I      intronic
chr1:202515646(+) A-I      intronic
chr1:202507178(+) A-I      intronic
chr1:202551853(+) A-I      3'UTR
chr1:202551836(+) A-I      3'UTR
chr1:202363833(+) A-I      intronic
chr1:202551811(+) A-I      3'UTR
chr1:202533094(+) A-I      intronic
chr1:202418521(+) A-I      intronic
chr1:202358714(+) A-I      intronic
chr1:202341474(+) A-I      intronic
chr1:202390689(+) A-I      intronic
chr1:202554257(+) A-I      3'UTR
chr1:202360178(+) A-I      intronic
chr1:202323568(+) A-I      intronic
chr1:202324184(+) A-I      intronic
chr1:202351821(+) A-I      intronic
chr1:202532940(+) A-I      intronic
chr1:202321836(+) A-I      intronic
chr1:202512793(+) A-I      intronic
chr1:202363294(+) A-I      intronic
chr1:202554308(+) A-I      3'UTR
chr1:202533012(+) A-I      intronic
chr1:202473470(+) A-I      intronic
chr1:202341715(+) A-I      intronic
chr1:202322856(+) A-I      intronic
chr1:202358825(+) A-I      intronic
chr1:202364200(+) A-I      intronic
chr1:202543636(+) A-I      intronic
chr1:202328441(+) A-I      intronic
chr1:202507218(+) A-I      intronic
chr1:202517713(+) A-I      intronic
chr1:202373891(+) A-I      intronic
chr1:202341069(+) A-I      intronic
chr1:202532293(+) A-I      intronic
chr1:202456776(+) A-I      intronic
chr1:202554237(+) A-I      3'UTR
chr1:202328513(+) A-I      intronic
chr1:202554285(+) A-I      3'UTR
chr1:202330067(+) A-I      intronic
chr1:202335392(+) A-I      intronic
chr1:202458050(+) A-I      intronic
chr1:202341525(+) A-I      intronic
chr1:202532426(+) A-I      intronic
chr1:202533151(+) A-I      intronic
chr1:202390621(+) A-I      intronic
chr1:202506289(+) A-I      intronic
chr1:202342180(+) A-I      intronic
chr1:202458024(+) A-I      intronic
chr1:202373745(+) A-I      intronic
chr1:202373757(+) A-I      intronic
chr1:202363834(+) A-I      intronic
chr1:202341620(+) A-I      intronic
chr1:202533058(+) A-I      intronic
chr1:202341542(+) A-I      intronic
chr1:202335019(+) A-I      intronic
chr1:202321837(+) A-I      intronic
chr1:202342116(+) A-I      intronic
chr1:202551851(+) A-I      3'UTR
chr1:202418503(+) A-I      intronic
chr1:202554218(+) A-I      3'UTR
chr1:202390249(+) A-I      intronic
chr1:202532466(+) A-I      intronic
chr1:202551758(+) A-I      3'UTR
chr1:202554334(+) A-I      3'UTR
chr1:202364125(+) A-I      intronic
chr1:202473500(+) A-I      intronic
chr1:202473281(+) A-I      intronic
chr1:202457985(+) A-I      intronic
chr1:202339041(+) A-I      intronic
chr1:202324120(+) A-I      intronic
chr1:202473374(+) A-I      intronic
chr1:202554385(+) A-I      3'UTR
chr1:202337960(+) A-I      intronic
chr1:202480414(+) A-I      intronic
chr1:202422016(+) A-I      intronic
chr1:202358944(+) A-I      intronic
chr1:202328675(+) A-I      intronic
chr1:202328756(+) A-I      intronic
chr1:202339081(+) A-I      intronic
chr1:202532270(+) A-I      intronic
chr1:202480474(+) A-I      intronic
chr1:202337972(+) A-I      intronic
chr1:202443668(+) A-I      intronic
chr1:202319910(+) A-I      intronic
chr1:202480552(+) A-I      intronic
chr1:202455875(+) A-I      intronic
chr1:202455798(+) A-I      intronic
chr1:202517589(+) A-I      intronic
chr1:202335391(+) A-I      intronic
chr1:202460292(+) A-I      intronic
chr1:202357412(+) A-I      intronic
chr1:202373728(+) A-I      intronic
chr1:202554242(+) A-I      3'UTR
chr1:202512607(+) A-I      intronic
chr1:202368597(+) A-I      intronic
chr1:202532330(+) A-I      intronic
chr1:202342163(+) A-I      intronic
chr1:202554211(+) A-I      3'UTR
chr1:202351884(+) A-I      intronic
chr1:202554156(+) A-I      3'UTR
chr1:202473368(+) A-I      intronic
chr1:202507165(+) A-I      intronic
chr1:202334954(+) A-I      intronic
chr1:202390563(+) A-I      intronic
chr1:202533050(+) A-I      intronic
chr1:202333629(+) A-I      intronic
chr1:202554273(+) A-I      3'UTR
chr1:202554194(+) A-I      3'UTR
chr1:202373769(+) A-I      intronic
chr1:202455742(+) A-I      intronic
chr1:202330295(+) A-I      intronic
chr1:202390496(+) A-I      intronic
chr1:202480597(+) A-I      intronic
chr1:202325202(+) A-I      intronic
chr1:202554289(+) A-I      3'UTR
chr1:202554290(+) A-I      3'UTR
chr1:202533014(+) A-I      intronic
chr1:202360086(+) A-I      intronic
chr1:202554325(+) A-I      3'UTR
chr1:202334459(+) A-I      intronic
chr1:202554225(+) A-I      3'UTR
chr1:202337993(+) A-I      intronic
chr1:202418504(+) A-I      intronic
chr1:202390688(+) A-I      intronic
chr1:202554386(+) A-I      3'UTR
chr1:202515717(+) A-I      intronic
chr1:202325198(+) A-I      intronic
chr1:202357441(+) A-I      intronic
chr1:202426601(+) A-I      intronic
chr1:202532445(+) A-I      intronic
chr1:202554276(+) A-I      3'UTR
chr1:202342229(+) A-I      intronic
chr1:202532480(+) A-I      intronic
chr1:202551847(+) A-I      3'UTR
chr1:202358951(+) A-I      intronic
chr1:202507210(+) A-I      intronic
chr1:202341166(+) A-I      intronic
chr1:202368791(+) A-I      intronic
chr1:202426561(+) A-I      intronic
chr1:202364164(+) A-I      intronic
chr1:202517512(+) A-I      intronic
chr1:202554253(+) A-I      3'UTR
chr1:202554310(+) A-I      3'UTR
chr1:202532986(+) A-I      intronic
chr1:202551805(+) A-I      3'UTR
chr1:202533045(+) A-I      intronic
chr1:202363319(+) A-I      intronic
chr1:202551850(+) A-I      3'UTR
chr1:202540858(+) A-I      intronic
chr1:202554399(+) A-I      3'UTR
chr1:202341472(+) A-I      intronic
chr1:202554279(+) A-I      3'UTR
chr1:202328717(+) A-I      intronic
chr1:202381340(+) A-I      intronic
chr1:202446746(+) A-I      intronic
chr1:202359682(+) A-I      intronic
chr1:202328766(+) A-I      intronic
chr1:202543485(+) A-I      intronic
chr1:202532331(+) A-I      intronic
chr1:202532492(+) A-I      intronic
chr1:202532483(+) A-I      intronic
chr1:202473478(+) A-I      intronic
chr1:202351858(+) A-I      intronic
chr1:202358859(+) A-I      intronic
chr1:202332989(+) A-I      intronic
chr1:202426602(+) A-I      intronic
chr1:202543383(+) A-I      intronic
chr1:202355227(+) A-I      intronic
chr1:202390648(+) A-I      intronic
chr1:202344873(+) A-I      intronic
chr1:202532402(+) A-I      intronic
chr1:202543456(+) A-I      intronic
chr1:202363203(+) A-I      intronic
chr1:202533082(+) A-I      intronic
chr1:202543486(+) A-I      intronic
chr1:202456901(+) A-I      intronic
chr1:202455139(+) A-I      intronic
chr1:202517851(+) A-I      intronic
chr1:202390267(+) A-I      intronic
chr1:202507251(+) A-I      intronic
chr1:202323622(+) A-I      intronic
chr1:202554393(+) A-I      3'UTR
chr1:202517681(+) A-I      intronic
chr1:202363762(+) A-I      intronic
chr1:202551772(+) A-I      3'UTR
chr1:202358657(+) A-I      intronic
chr1:202321864(+) A-I      intronic
chr1:202554250(+) A-I      3'UTR
chr1:202346639(+) A-I      intronic
chr1:202532378(+) A-I      intronic
chr1:202507139(+) A-I      intronic
chr1:202473337(+) A-I      intronic
chr1:202341511(+) A-I      intronic
chr1:202551759(+) A-I      3'UTR
chr1:202540603(+) A-I      intronic
chr1:202554199(+) A-I      3'UTR
chr1:202425232(+) A-I      intronic
chr1:202357362(+) A-I      intronic
chr1:202551826(+) A-I      3'UTR
chr1:202473322(+) A-I      intronic
chr1:202484847(+) A-I      intronic
chr1:202551841(+) A-I      3'UTR
chr1:202480527(+) A-I      intronic
chr1:202422017(+) A-I      intronic
chr1:202532484(+) A-I      intronic
chr1:202423793(+) A-I      intronic
chr1:202554345(+) A-I      3'UTR
chr1:202506265(+) A-I      intronic
chr1:202334937(+) A-I      intronic
chr1:202362350(+) A-I      intronic
chr1:202328762(+) A-I      intronic
chr1:202455676(+) A-I      intronic
chr1:202506335(+) A-I      intronic
chr1:202341772(+) A-I      intronic
chr1:202551852(+) A-I      3'UTR
chr1:202341790(+) A-I      intronic
chr1:202551934(+) A-I      3'UTR
chr1:202321762(+) A-I      intronic
chr1:202360170(+) A-I      intronic
chr1:202517846(+) A-I      intronic
chr1:202323538(+) A-I      intronic
chr1:202532519(+) A-I      intronic
chr1:202323550(+) A-I      intronic
chr1:202445766(+) A-I      intronic
chr1:202532271(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED PPP1R12B
chr1:202551934(+) A-I exon 3'UTR    15342557
chr1:202554194(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr1:202554199(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr1:202554211(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr1:202554218(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr1:202554225(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr1:202554237(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr1:202554253(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr1:202554257(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr1:202554273(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr1:202554276(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr1:202554279(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr1:202554285(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr1:202554308(+) A-I exon 3'UTR    15342557
chr1:202554310(+) A-I exon 3'UTR    15342557
chr1:202554325(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //21960545
chr1:202554334(+) A-I exon 3'UTR    15342557
chr1:202554345(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //21960545
chr1:202554393(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr1:202554399(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596
chr1:202532378(+) A-I intron -    21960545
chr1:202532402(+) A-I intron -    21960545
chr1:202554156(+) A-I intron -    21960545
chr1:202328398(+) A-G intron -    22484847
chr1:202328441(+) A-G intron -    22484847
chr1:202328513(+) A-G intron -    22484847
chr1:202332989(+) A-G intron -    22484847
chr1:202334937(+) A-G intron -    22484847
chr1:202334954(+) A-G intron -    22484847
chr1:202337960(+) A-G intron -    22484847
chr1:202337972(+) A-G intron -    22484847
chr1:202337993(+) A-G intron -    22484847
chr1:202341542(+) A-G intron -    22484847
chr1:202358604(+) C-G intron -    22484847
chr1:202358657(+) A-G intron -    22484847
chr1:202364164(+) A-G intron -    22484847
chr1:202390648(+) A-G intron -    22484847
chr1:202390688(+) A-G intron -    22484847
chr1:202390689(+) A-G intron -    22484847
chr1:202425233(+) A-C intron -    22484847
chr1:202455742(+) A-G intron -    22484847
chr1:202455875(+) A-G intron -    22484847
chr1:202456776(+) A-G intron -    22484847
chr1:202456901(+) A-G intron -    22484847
chr1:202473281(+) A-G intron -    22484847
chr1:202473368(+) A-G intron -    22484847
chr1:202473374(+) A-G intron -    22484847
chr1:202473470(+) A-G intron -    22484847
chr1:202480414(+) A-G intron -    22484847
chr1:202480597(+) A-G intron -    22484847
chr1:202484847(+) A-G intron -    22484847
chr1:202494052(+) T-C intron -    22484847
chr1:202506289(+) A-G intron -    22484847
chr1:202506335(+) A-G intron -    22484847
chr1:202507139(+) A-G intron -    22484847
chr1:202507165(+) A-G intron -    22484847
chr1:202507178(+) A-G intron -    22484847
chr1:202507218(+) A-G intron -    22484847
chr1:202507385(+) A-G intron -    22484847
chr1:202512607(+) A-G intron -    22484847
chr1:202532271(+) A-G intron -    22484847
chr1:202532378(+) A-G intron -    22484847
chr1:202532426(+) A-G intron -    22484847
chr1:202532940(+) A-G intron -    22484847
chr1:202532941(+) A-G intron -    22484847
chr1:202551847(+) A-G intron -    22484847
chr1:202551850(+) A-G intron -    22484847
chr1:202554199(+) A-G intron -    22484847
chr1:202554218(+) A-G intron -    22484847
chr1:202554257(+) A-G intron -    22484847
chr1:202554325(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase PPP1R12B
chr1:202317987-202317988(+) m6A CDS       24284625//24209618
chr1:202399876-202399877(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863
chr1:202399887-202399888(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863
chr1:202399907-202399908(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863
chr1:202400635-202400636(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863
chr1:202407673-202407674(+) m6A exon//intron       22608085
chr1:202408072-202408073(+) m6A intron       22608085
chr1:202408165-202408166(+) m6A intron       24284625//22608085
chr1:202408206-202408207(+) m6A intron       24284625//22608085
chr1:202408231-202408232(+) m6A intron       22608085
chr1:202462277-202462278(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       -
chr1:202462338-202462339(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       -
chr1:202464457-202464458(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       24981863
chr1:202464494-202464495(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       24981863
chr1:202464528-202464529(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       24981863
chr1:202464567-202464568(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       24981863
chr1:202464577-202464578(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       24981863
chr1:202464601-202464602(+) m6A CDS//exon       24981863
chr1:202464801-202464802(+) m6A CDS//exon       24981863
chr1:202465917-202465918(+) m6A CDS//exon       24981863
chr1:202536607-202536608(+) m6A exon//intron       24981863
chr1:202536714-202536715(+) m6A exon//intron       24981863
chr1:202536910-202536911(+) m6A CDS//exon       24981863
chr1:202536920-202536921(+) m6A CDS//exon       24981863
chr1:202544146-202544147(+) m6A CDS//exon//intron       24981863
chr1:202544156-202544157(+) m6A CDS//exon//intron       24981863
chr1:202549796-202549797(+) m6A 3'UTR//exon       24981863
chr1:202549977-202549978(+) m6A 3'UTR       24981863
chr1:202550149-202550150(+) m6A 3'UTR       24981863
chr1:202550252-202550253(+) m6A 3'UTR       24981863
chr1:202553537-202553538(+) m6A 3'UTR       24981863
chr1:202553579-202553580(+) m6A 3'UTR       24981863
chr1:202553638-202553639(+) m6A 3'UTR       24981863
chr1:202553707-202553708(+) m6A 3'UTR       24981863
chr1:202553820-202553821(+) m6A 3'UTR       24981863
chr1:202555093-202555094(+) m6A 3'UTR       24981863
chr1:202555137-202555138(+) m6A 3'UTR       24981863
chr1:202555177-202555178(+) m6A 3'UTR       24981863
chr1:202555220-202555221(+) m6A 3'UTR       24981863
chr1:202555290-202555291(+) m6A 3'UTR       24981863
chr1:202555312-202555313(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863
chr1:202555343-202555344(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085
chr1:202555375-202555376(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863//22608085
chr1:202555405-202555406(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085
chr1:202555469-202555470(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//22608085
chr1:202555523-202555524(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863
chr1:202555646-202555647(+) m6A 3'UTR       24981863
chr1:202555658-202555659(+) m6A 3'UTR       24981863
chr1:202559793-202559794(+) m6A 3'UTR       27773535
chr1:202559799-202559800(+) m6A 3'UTR       27773535
chr1:202560093-202560094(+) m6A 3'UTR       27773535
chr1:202560135-202560136(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsv2-miR-H7-5p
Exosome K562 cells     24460325
PPP1R12B
Chromatin K562 cells     -
Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841
Nucleus HeLa-S3 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsv2-miR-H7-5p
Interactor2: PPP1R12B

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//PITA//Rep//Targetscan
Support Database RepTar//VmiReg

Starting a new search, please wait ...