Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00163567

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H2:  MIMAT0010205          TBC1D22A:  NR_104292     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv2-miR-H2	TBC1D22A
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0010205	25771
Organism	Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	C22orf4//HSC79E021

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	TBC1D22A	chr22:47377574(+) A-I      intronic chr22:47356642(+) A-I      intronic chr22:47316177(+) A-I      intronic chr22:47482196(+) A-I      intronic chr22:47482114(+) A-I      intronic chr22:47476763(+) A-I      intronic chr22:47475212(+) A-I      intronic chr22:47475163(+) A-I      intronic chr22:47475122(+) A-I      intronic chr22:47475086(+) A-I      intronic chr22:47356272(+) A-I      intronic chr22:47356297(+) A-I      intronic chr22:47356303(+) A-I      intronic chr22:47356307(+) A-I      intronic chr22:47356319(+) A-I      intronic chr22:47356419(+) A-I      intronic chr22:47356579(+) A-I      intronic chr22:47475083(+) A-I      intronic chr22:47475082(+) A-I      intronic chr22:47475076(+) A-I      intronic chr22:47475069(+) A-I      intronic chr22:47461091(+) A-I      intronic chr22:47461031(+) A-I      intronic chr22:47356764(+) A-I      intronic chr22:47356749(+) A-I      intronic chr22:47356631(+) A-I      intronic chr22:47356732(+) A-I      intronic chr22:47356728(+) A-I      intronic chr22:47356722(+) A-I      intronic chr22:47356700(+) A-I      intronic chr22:47356690(+) A-I      intronic chr22:47356683(+) A-I      intronic chr22:47162300(+) A-I      intronic chr22:47162316(+) A-I      intronic chr22:47162478(+) A-I      intronic chr22:47162501(+) A-I      intronic chr22:47162562(+) A-I      intronic chr22:47162574(+) A-I      intronic chr22:47167511(+) A-I      intronic chr22:47177217(+) A-I      intronic chr22:47185100(+) A-I      intronic chr22:47187719(+) A-I      intronic chr22:47187847(+) A-I      intronic chr22:47167513(+) A-I      intronic chr22:47167672(+) A-I      intronic chr22:47167675(+) A-I      intronic chr22:47167689(+) A-I      intronic chr22:47174734(+) A-I      intronic chr22:47174742(+) A-I      intronic chr22:47174755(+) A-I      intronic chr22:47204068(+) A-I      intronic chr22:47204077(+) A-I      intronic chr22:47204140(+) A-I      intronic chr22:47204657(+) A-I      intronic chr22:47204658(+) A-I      intronic chr22:47204698(+) A-I      intronic chr22:47286088(+) A-I      intronic chr22:47286216(+) A-I      intronic chr22:47295249(+) A-I      intronic chr22:47307747(+) A-I      intronic chr22:47316000(+) A-I      intronic chr22:47356232(+) A-I      intronic chr22:47356257(+) A-I      intronic chr22:47356258(+) A-I      intronic chr22:47356176(+) A-I      intronic chr22:47525048(+) A-I      intronic chr22:47177212(+) A-I      intronic chr22:47175430(+) A-I      intronic chr22:47175418(+) A-I      intronic chr22:47175395(+) A-I      intronic chr22:47175322(+) A-I      intronic chr22:47175321(+) A-I      intronic chr22:47175295(+) A-I      intronic chr22:47174896(+) A-I      intronic chr22:47174862(+) A-I      intronic chr22:47174794(+) A-I      intronic chr22:47174791(+) A-I      intronic chr22:47174789(+) A-I      intronic chr22:47525035(+) A-I      intronic chr22:47525016(+) A-I      intronic chr22:47525000(+) A-I      intronic chr22:47524959(+) A-I      intronic chr22:47524955(+) A-I      intronic chr22:47515654(+) A-I      intronic chr22:47515652(+) A-I      intronic chr22:47185103(+) A-I      intronic chr22:47515578(+) A-I      intronic chr22:47515573(+) A-I      intronic chr22:47515567(+) A-I      intronic chr22:47515545(+) A-I      intronic chr22:47515538(+) A-I      intronic chr22:47515492(+) A-I      intronic chr22:47515479(+) A-I      intronic chr22:47515432(+) A-I      intronic chr22:47514883(+) A-I      intronic chr22:47514880(+) A-I      intronic chr22:47513940(+) A-I      intronic chr22:47513939(+) A-I      intronic chr22:47513931(+) A-I      intronic chr22:47513926(+) A-I      intronic chr22:47513916(+) A-I      intronic chr22:47506338(+) A-I      intronic chr22:47504790(+) A-I      intronic chr22:47504721(+) A-I      intronic chr22:47504685(+) A-I      intronic chr22:47495442(+) A-I      intronic chr22:47495441(+) A-I      intronic chr22:47482377(+) A-I      intronic chr22:47482201(+) A-I      intronic chr22:47482200(+) A-I      intronic chr22:47359058(+) A-I      intronic chr22:47174781(+) A-I      intronic chr22:47204667(+) A-I      intronic chr22:47182727(+) A-I      intronic chr22:47475124(+) A-I      intronic chr22:47326481(+) A-I      intronic chr22:47164127(+) A-I      intronic chr22:47204676(+) A-I      intronic chr22:47475100(+) A-I      intronic chr22:47513843(+) A-I      intronic chr22:47514808(+) A-I      intronic chr22:47174779(+) A-I      intronic chr22:47174820(+) A-I      intronic chr22:47174741(+) A-I      intronic chr22:47504853(+) A-I      intronic chr22:47514977(+) A-I      intronic chr22:47167631(+) A-I      intronic chr22:47162594(+) A-I      intronic chr22:47175313(+) A-I      intronic chr22:47162168(+) A-I      intronic chr22:47316088(+) A-I      intronic chr22:47174686(+) A-I      intronic chr22:47515558(+) A-I      intronic chr22:47167618(+) A-I      intronic chr22:47356420(+) A-I      intronic chr22:47204633(+) A-I      intronic chr22:47515522(+) A-I      intronic chr22:47513859(+) A-I      intronic chr22:47175336(+) A-I      intronic chr22:47514874(+) A-I      intronic chr22:47513858(+) A-I      intronic chr22:47320520(+) A-I      intronic chr22:47476852(+) A-I      intronic chr22:47513854(+) A-I      intronic chr22:47286030(+) A-I      intronic chr22:47174707(+) A-I      intronic chr22:47204099(+) A-I      intronic chr22:47515457(+) A-I      intronic chr22:47476833(+) A-I      intronic chr22:47162211(+) A-I      intronic chr22:47374785(+) A-I      intronic chr22:47295081(+) A-I      intronic chr22:47164303(+) A-I      intronic chr22:47203784(+) A-I      intronic chr22:47515665(+) A-I      intronic chr22:47167609(+) A-I      intronic chr22:47514934(+) A-I      intronic chr22:47506254(+) A-I      intronic chr22:47182819(+) A-I      intronic chr22:47475144(+) A-I      intronic chr22:47356814(+) A-I      intronic chr22:47286082(+) A-I      intronic chr22:47162101(+) A-I      intronic chr22:47175417(+) A-I      intronic chr22:47167591(+) A-I      intronic chr22:47175353(+) A-I      intronic chr22:47204767(+) A-I      intronic chr22:47204069(+) A-I      intronic chr22:47204596(+) A-I      intronic chr22:47204076(+) A-I      intronic chr22:47356763(+) A-I      intronic chr22:47356588(+) A-I      intronic chr22:47356587(+) A-I      intronic chr22:47515493(+) A-I      intronic chr22:47475245(+) A-I      intronic chr22:47203789(+) A-I      intronic chr22:47204108(+) A-I      intronic chr22:47175390(+) A-I      intronic chr22:47162445(+) A-I      intronic chr22:47204000(+) A-I      intronic chr22:47174708(+) A-I      intronic chr22:47177245(+) A-I      intronic chr22:47164305(+) A-I      intronic chr22:47356275(+) A-I      intronic chr22:47513764(+) A-I      intronic chr22:47513915(+) A-I      intronic chr22:47493477(+) A-I      intronic chr22:47185087(+) A-I      intronic chr22:47356696(+) A-I      intronic chr22:47320454(+) A-I      intronic chr22:47446175(+) A-I      intronic chr22:47162572(+) A-I      intronic chr22:47286115(+) A-I      intronic chr22:47320395(+) A-I      intronic chr22:47475192(+) A-I      intronic chr22:47515532(+) A-I      intronic chr22:47502706(+) A-I      intronic chr22:47515593(+) A-I      intronic chr22:47433348(+) A-I      intronic chr22:47514966(+) A-I      intronic chr22:47175339(+) A-I      intronic chr22:47162563(+) A-I      intronic chr22:47228423(+) A-I      intronic chr22:47204631(+) A-I      intronic chr22:47482204(+) A-I      intronic chr22:47515643(+) A-I      intronic chr22:47203722(+) A-I      intronic chr22:47182773(+) A-I      intronic chr22:47482341(+) A-I      intronic chr22:47515510(+) A-I      intronic chr22:47461033(+) A-I      intronic chr22:47320591(+) A-I      intronic chr22:47476918(+) A-I      intronic chr22:47524867(+) A-I      intronic chr22:47514925(+) A-I      intronic chr22:47286114(+) A-I      intronic chr22:47175297(+) A-I      intronic chr22:47174790(+) A-I      intronic chr22:47477007(+) A-I      intronic chr22:47514902(+) A-I      intronic chr22:47181694(+) A-I      intronic chr22:47187677(+) A-I      intronic chr22:47307742(+) A-I      intronic chr22:47203731(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	TBC1D22A	chr22:47316013(+) A-I intron -    21960545 chr22:47174712(+) A-G intron -    22484847 chr22:47203722(+) A-G intron -    22484847 chr22:47204108(+) A-G intron -    22484847 chr22:47204135(+) A-G intron -    22484847 chr22:47204261(+) T-A intron -    22484847 chr22:47204270(+) A-T intron -    22484847 chr22:47204271(+) T-A intron -    22484847 chr22:47475185(+) A-G intron -    22484847 chr22:47475192(+) A-G intron -    22484847 chr22:47476918(+) A-G intron -    22484847 chr22:47513858(+) A-G intron -    22484847 chr22:47513859(+) A-G intron -    22484847 chr22:47514784(+) A-G intron -    22484847 chr22:47514966(+) A-G intron -    22484847 chr22:47514977(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	TBC1D22A	chr22:47569421-47569422(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863 chr22:47569443-47569444(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863 chr22:47569449-47569450(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863 chr22:47570135-47570136(+) m6A 3'UTR       25456834 chr22:47570185-47570186(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr22:47570195-47570196(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr22:47570255-47570256(+) m6A 3'UTR       25456834 chr22:47570271-47570272(+) m6A 3'UTR       25456834 chr22:47570287-47570288(+) m6A 3'UTR       25456834 chr22:47570303-47570304(+) m6A 3'UTR       25456834 chr22:47570319-47570320(+) m6A 3'UTR       25456834 chr22:47570335-47570336(+) m6A 3'UTR       25456834 chr22:47570351-47570352(+) m6A 3'UTR       25456834 chr22:47570367-47570368(+) m6A 3'UTR       25456834 chr22:47570529-47570530(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863 chr22:47570627-47570628(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863 chr22:47570671-47570672(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863 chr22:47570720-47570721(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863 chr22:47570732-47570733(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863 chr22:47570740-47570741(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863 chr22:47571120-47571121(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863 chr22:47571159-47571160(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863 chr22:47571218-47571219(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863 chr22:47571311-47571312(+) m6A 3'UTR       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	TBC1D22A	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv2-miR-H2
Interactor2: TBC1D22A

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg