Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00161377

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H4-3p:  MIMAT0010204          SLITRK1:  NM_001281503     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv2-miR-H4-3p	SLITRK1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0010204	114798
Organism	Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	LRRC12//TTM

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	SLITRK1	chr13:84451624-84451625(-) m6A 3'UTR       27773535 chr13:84451669-84451670(-) m6A 3'UTR       27773535 chr13:84451696-84451697(-) m6A 3'UTR       27773535 chr13:84451847-84451848(-) m6A 3'UTR       27773535 chr13:84451916-84451917(-) m6A 3'UTR       27773535 chr13:84451957-84451958(-) m6A 3'UTR       27773535 chr13:84452165-84452166(-) m6A 3'UTR       27773535 chr13:84452805-84452806(-) m6A 3'UTR       27773535 chr13:84452911-84452912(-) m6A 3'UTR       25456834//24981863//27773535 chr13:84452922-84452923(-) m6A 3'UTR       25456834//24981863//27773535 chr13:84453002-84453003(-) m6A 3'UTR       25456834//24981863//27773535 chr13:84453047-84453048(-) m6A 3'UTR       25456834//24981863//27773535 chr13:84453264-84453265(-) m6A 3'UTR       25456834//24981863//27773535 chr13:84453351-84453352(-) m6A 3'UTR       25456834//24981863//27773535 chr13:84453362-84453363(-) m6A 3'UTR       25456834//24981863//27773535 chr13:84453549-84453550(-) m6A 3'UTR       25456834//24981863//27773535 chr13:84453555-84453556(-) m6A CDS       25456834//24981863//27773535 chr13:84453646-84453647(-) m6A CDS       25456834//24981863//27773535//22575960 chr13:84453708-84453709(-) m6A CDS       25456834//24981863//27773535//22575960 chr13:84453773-84453774(-) m6A CDS       25456834//27773535 chr13:84453810-84453811(-) m6A CDS       25456834 chr13:84453838-84453839(-) m6A CDS       25456834 chr13:84453858-84453859(-) m6A CDS       25456834 chr13:84454148-84454149(-) m6A CDS       27773535 chr13:84454226-84454227(-) m6A CDS       27773535 chr13:84454299-84454300(-) m6A CDS       27773535 chr13:84454335-84454336(-) m6A CDS       27773535 chr13:84454371-84454372(-) m6A CDS       27773535 chr13:84454380-84454381(-) m6A CDS       27773535 chr13:84454395-84454396(-) m6A CDS       27773535 chr13:84454443-84454444(-) m6A CDS       27773535 chr13:84454569-84454570(-) m6A CDS       24981863//27773535 chr13:84454647-84454648(-) m6A CDS       27773535 chr13:84454682-84454683(-) m6A CDS       27773535 chr13:84454768-84454769(-) m6A CDS       27773535 chr13:84454790-84454791(-) m6A CDS       27773535 chr13:84454804-84454805(-) m6A CDS       27773535 chr13:84454848-84454849(-) m6A CDS       27773535 chr13:84454866-84454867(-) m6A CDS       25456834//27773535 chr13:84454871-84454872(-) m6A CDS       25456834//27773535 chr13:84454879-84454880(-) m6A CDS       25456834//27773535 chr13:84454890-84454891(-) m6A CDS       25456834//27773535 chr13:84454904-84454905(-) m6A CDS       25456834//27773535 chr13:84454956-84454957(-) m6A CDS       25456834//27773535 chr13:84454998-84454999(-) m6A CDS       25456834//24981863//27773535 chr13:84455181-84455182(-) m6A CDS       25456834//24981863//27773535 chr13:84455187-84455188(-) m6A CDS       25456834//24981863//27773535 chr13:84455205-84455206(-) m6A CDS       25456834//24981863//27773535 chr13:84455269-84455270(-) m6A CDS       25456834//24981863//27773535 chr13:84455370-84455371(-) m6A CDS       27773535 chr13:84455520-84455521(-) m6A CDS       25456834//24981863//27773535 chr13:84455532-84455533(-) m6A CDS       25456834//24981863//27773535 chr13:84455720-84455721(-) m6A 5'UTR       25456834//24981863//27773535 chr13:84455739-84455740(-) m6A 5'UTR       25456834//24981863//27773535 chr13:84455768-84455769(-) m6A 5'UTR       25456834//24981863//27773535 chr13:84456085-84456086(-) m6A 5'UTR       27773535 chr13:84456163-84456164(-) m6A 5'UTR       25456834//24981863 chr13:84456200-84456201(-) m6A 5'UTR       25456834//24981863//27773535 chr13:84456230-84456231(-) m6A 5'UTR       25456834//24981863//27773535//22608085 chr13:84456246-84456247(-) m6A 5'UTR       25456834//24981863//27773535//22608085 chr13:84456251-84456252(-) m6A 5'UTR       25456834//24981863//27773535//22608085 chr13:84456345-84456346(-) m6A 5'UTR       25456834//24981863//27773535 chr13:84456373-84456374(-) m6A 5'UTR       25456834//24981863//27773535 chr13:84456439-84456440(-) m6A 5'UTR       25456834//27773535 chr13:84456506-84456507(-) m6A 5'UTR       27773535

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv2-miR-H4-3p
Interactor2: SLITRK1

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg