Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00159705

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H4-5p:           TRNAU1AP:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsv2-miR-H4-5p TRNAU1AP
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0010203 54952
Organism Human alphaherpesvirus 2 (HSV2) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - PRO1902//SECP43//TRSPAP1

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR TRNAU1AP
chr1:28900021(+) A-I      intronic
chr1:28900240(+) A-I      intronic
chr1:28900648(+) A-I      intronic
chr1:28903512(+) A-I      intronic
chr1:28896839(+) A-I      intronic
chr1:28900197(+) A-I      intronic
chr1:28900206(+) A-I      intronic
chr1:28890599(+) A-I      intronic
chr1:28896840(+) A-I      intronic
chr1:28899950(+) A-I      intronic
chr1:28898867(+) A-I      intronic
chr1:28890600(+) A-I      intronic
chr1:28894497(+) A-I      intronic
chr1:28894500(+) A-I      intronic
chr1:28894564(+) A-I      intronic
chr1:28900164(+) A-I      intronic
chr1:28900007(+) A-I      intronic
chr1:28900632(+) A-I      intronic
chr1:28900165(+) A-I      intronic
chr1:28894868(+) A-I      intronic
chr1:28894621(+) A-I      intronic
chr1:28894492(+) A-I      intronic
chr1:28890658(+) A-I      intronic
chr1:28890615(+) A-I      intronic
chr1:28903538(+) A-I      intronic
chr1:28903530(+) A-I      intronic
chr1:28903523(+) A-I      intronic
chr1:28901937(+) A-I      intronic
chr1:28901867(+) A-I      intronic
chr1:28901851(+) A-I      intronic
chr1:28901766(+) A-I      intronic
chr1:28901758(+) A-I      intronic
chr1:28901746(+) A-I      intronic
chr1:28901717(+) A-I      intronic
chr1:28901163(+) A-I      intronic
chr1:28901125(+) A-I      intronic
chr1:28901039(+) A-I      intronic
chr1:28900963(+) A-I      intronic
chr1:28900800(+) A-I      intronic
chr1:28900766(+) A-I      intronic
chr1:28900729(+) A-I      intronic
chr1:28880563(+) A-I      intronic
chr1:28883441(+) A-I      intronic
chr1:28883506(+) A-I      intronic
chr1:28883770(+) A-I      intronic
chr1:28883771(+) A-I      intronic
chr1:28883811(+) A-I      intronic
chr1:28884180(+) A-I      intronic
chr1:28884205(+) A-I      intronic
chr1:28884234(+) A-I      intronic
chr1:28884240(+) A-I      intronic
chr1:28900717(+) A-I      intronic
chr1:28900680(+) A-I      intronic
chr1:28900618(+) A-I      intronic
chr1:28900612(+) A-I      intronic
chr1:28900570(+) A-I      intronic
chr1:28900560(+) A-I      intronic
chr1:28900513(+) A-I      intronic
chr1:28900492(+) A-I      intronic
chr1:28900439(+) A-I      intronic
chr1:28900429(+) A-I      intronic
chr1:28900334(+) A-I      intronic
chr1:28900329(+) A-I      intronic
chr1:28900200(+) A-I      intronic
chr1:28900191(+) A-I      intronic
chr1:28900101(+) A-I      intronic
chr1:28899999(+) A-I      intronic
chr1:28899997(+) A-I      intronic
chr1:28899986(+) A-I      intronic
chr1:28899707(+) A-I      intronic
chr1:28899701(+) A-I      intronic
chr1:28899675(+) A-I      intronic
chr1:28899673(+) A-I      intronic
chr1:28899598(+) A-I      intronic
chr1:28899407(+) A-I      intronic
chr1:28899379(+) A-I      intronic
chr1:28899353(+) A-I      intronic
chr1:28899336(+) A-I      intronic
chr1:28898991(+) A-I      intronic
chr1:28898851(+) A-I      intronic
chr1:28898792(+) A-I      intronic
chr1:28898767(+) A-I      intronic
chr1:28898762(+) A-I      intronic
chr1:28898138(+) A-I      intronic
chr1:28898134(+) A-I      intronic
chr1:28898133(+) A-I      intronic
chr1:28897565(+) A-I      intronic
chr1:28897466(+) A-I      intronic
chr1:28897450(+) A-I      intronic
chr1:28897434(+) A-I      intronic
chr1:28897430(+) A-I      intronic
chr1:28897420(+) A-I      intronic
chr1:28897411(+) A-I      intronic
chr1:28897366(+) A-I      intronic
chr1:28896994(+) A-I      intronic
chr1:28896885(+) A-I      intronic
chr1:28896790(+) A-I      intronic
chr1:28896732(+) A-I      intronic
chr1:28896311(+) A-I      intronic
chr1:28895490(+) A-I      intronic
chr1:28885035(+) A-I      intronic
chr1:28885045(+) A-I      intronic
chr1:28885176(+) A-I      intronic
chr1:28885713(+) A-I      intronic
chr1:28885970(+) A-I      intronic
chr1:28886457(+) A-I      intronic
chr1:28886458(+) A-I      intronic
chr1:28886488(+) A-I      intronic
chr1:28886863(+) A-I      intronic
chr1:28886960(+) A-I      intronic
chr1:28889112(+) A-I      intronic
chr1:28889210(+) A-I      intronic
chr1:28889245(+) A-I      intronic
chr1:28889269(+) A-I      intronic
chr1:28889284(+) A-I      intronic
chr1:28889292(+) A-I      intronic
chr1:28889452(+) A-I      intronic
chr1:28889525(+) A-I      intronic
chr1:28889574(+) A-I      intronic
chr1:28889807(+) A-I      intronic
chr1:28889842(+) A-I      intronic
chr1:28889850(+) A-I      intronic
chr1:28889859(+) A-I      intronic
chr1:28889883(+) A-I      intronic
chr1:28889884(+) A-I      intronic
chr1:28889901(+) A-I      intronic
chr1:28890008(+) A-I      intronic
chr1:28890009(+) A-I      intronic
chr1:28890045(+) A-I      intronic
chr1:28890059(+) A-I      intronic
chr1:28890076(+) A-I      intronic
chr1:28890089(+) A-I      intronic
chr1:28890116(+) A-I      intronic
chr1:28890125(+) A-I      intronic
chr1:28890296(+) A-I      intronic
chr1:28890515(+) A-I      intronic
chr1:28890522(+) A-I      intronic
chr1:28890567(+) A-I      intronic
chr1:28895423(+) A-I      intronic
chr1:28895069(+) A-I      intronic
chr1:28895026(+) A-I      intronic
chr1:28895521(+) A-I      intronic
chr1:28898960(+) A-I      intronic
chr1:28895453(+) A-I      intronic
chr1:28898786(+) A-I      intronic
chr1:28896805(+) A-I      intronic
chr1:28899743(+) A-I      intronic
chr1:28894664(+) A-I      intronic
chr1:28894499(+) A-I      intronic
chr1:28899235(+) A-I      intronic
chr1:28890764(+) A-I      intronic
chr1:28897022(+) A-I      intronic
chr1:28889667(+) A-I      intronic
chr1:28888271(+) A-I      intronic
chr1:28885051(+) A-I      intronic
chr1:28880644(+) A-I      intronic
chr1:28894529(+) A-I      intronic
chr1:28895597(+) A-I      intronic
chr1:28889192(+) A-I      intronic
chr1:28886959(+) A-I      intronic
chr1:28900001(+) A-I      intronic
chr1:28903566(+) A-I      intronic
chr1:28899381(+) A-I      intronic
chr1:28889154(+) A-I      intronic
chr1:28882797(+) A-I      intronic
chr1:28901728(+) A-I      intronic
chr1:28900669(+) A-I      intronic
chr1:28900130(+) A-I      intronic
chr1:28900352(+) A-I      intronic
chr1:28889222(+) A-I      intronic
chr1:28900328(+) A-I      intronic
chr1:28903457(+) A-I      intronic
chr1:28880448(+) A-I      intronic
chr1:28889547(+) A-I      intronic
chr1:28894461(+) A-I      intronic
chr1:28901053(+) A-I      intronic
chr1:28898928(+) A-I      intronic
chr1:28880599(+) A-I      intronic
chr1:28899646(+) A-I      intronic
chr1:28895441(+) A-I      intronic
chr1:28882798(+) A-I      intronic
chr1:28901747(+) A-I      intronic
chr1:28900138(+) A-I      intronic
chr1:28897522(+) A-I      intronic
chr1:28900861(+) A-I      intronic
chr1:28898258(+) A-I      intronic
chr1:28898775(+) A-I      intronic
chr1:28900107(+) A-I      intronic
chr1:28898988(+) A-I      intronic
chr1:28900839(+) A-I      intronic
chr1:28895061(+) A-I      intronic
chr1:28886572(+) A-I      intronic
chr1:28898897(+) A-I      intronic
chr1:28882856(+) A-I      intronic
chr1:28883402(+) A-I      intronic
chr1:28899720(+) A-I      intronic
chr1:28886389(+) A-I      intronic
chr1:28898799(+) A-I      intronic
chr1:28895424(+) A-I      intronic
chr1:28900809(+) A-I      intronic
chr1:28900774(+) A-I      intronic
chr1:28903503(+) A-I      intronic
chr1:28899285(+) A-I      intronic
chr1:28895410(+) A-I      intronic
chr1:28900494(+) A-I      intronic
chr1:28899375(+) A-I      intronic
chr1:28899726(+) A-I      intronic
chr1:28884827(+) A-I      intronic
chr1:28897479(+) A-I      intronic
chr1:28890049(+) A-I      intronic
chr1:28895810(+) A-I      intronic
chr1:28881674(+) A-I      intronic
chr1:28894927(+) A-I      intronic
chr1:28883677(+) A-I      intronic
chr1:28899610(+) A-I      intronic
chr1:28889300(+) A-I      intronic
chr1:28895375(+) A-I      intronic
chr1:28900000(+) A-I      intronic
chr1:28901806(+) A-I      intronic
chr1:28890679(+) A-I      intronic
chr1:28883540(+) A-I      intronic
chr1:28900364(+) A-I      intronic
chr1:28899300(+) A-I      intronic
chr1:28894414(+) A-I      intronic
chr1:28903466(+) A-I      intronic
chr1:28900783(+) A-I      intronic
chr1:28894561(+) A-I      intronic
chr1:28896853(+) A-I      intronic
chr1:28885900(+) A-I      intronic
chr1:28899898(+) A-I      intronic
chr1:28899570(+) A-I      intronic
chr1:28899989(+) A-I      intronic
chr1:28886466(+) A-I      intronic
chr1:28902514(+) A-I      intronic
chr1:28891947(+) A-I      ncRNA
chr1:28891939(+) A-I      ncRNA
chr1:28901767(+) A-I      intronic
chr1:28886497(+) A-I      intronic
chr1:28901116(+) A-I      intronic
chr1:28898882(+) A-I      intronic
chr1:28900693(+) A-I      intronic
chr1:28894597(+) A-I      intronic
chr1:28884802(+) A-I      intronic
chr1:28901847(+) A-I      intronic
chr1:28882718(+) A-I      intronic
chr1:28896973(+) A-I      intronic
chr1:28898888(+) A-I      intronic
chr1:28896713(+) A-I      intronic
chr1:28890141(+) A-I      intronic
chr1:28899919(+) A-I      intronic
chr1:28895417(+) A-I      intronic
chr1:28902453(+) A-I      intronic
chr1:28894976(+) A-I      intronic
chr1:28903458(+) A-I      intronic
chr1:28896622(+) A-I      intronic
chr1:28900162(+) A-I      intronic
chr1:28897470(+) A-I      intronic
chr1:28888473(+) A-I      intronic
chr1:28899192(+) A-I      intronic
chr1:28886897(+) A-I      intronic
chr1:28885993(+) A-I      intronic
chr1:28889234(+) A-I      intronic
chr1:28896559(+) A-I      intronic
chr1:28900399(+) A-I      intronic
chr1:28903480(+) A-I      intronic
chr1:28900789(+) A-I      intronic
chr1:28897423(+) A-I      intronic
chr1:28900242(+) A-I      intronic
chr1:28903565(+) A-I      intronic
chr1:28900862(+) A-I      intronic
chr1:28885284(+) A-I      intronic
chr1:28899803(+) A-I      intronic
chr1:28899294(+) A-I      intronic
chr1:28894555(+) A-I      intronic
chr1:28900834(+) A-I      intronic
chr1:28900739(+) A-I      intronic
chr1:28896810(+) A-I      intronic
chr1:28897497(+) A-I      intronic
chr1:28889845(+) A-I      intronic
chr1:28898236(+) A-I      intronic
chr1:28899611(+) A-I      intronic
chr1:28900493(+) A-I      intronic
chr1:28895507(+) A-I      intronic
chr1:28899287(+) A-I      intronic
chr1:28900959(+) A-I      intronic
chr1:28882823(+) A-I      intronic
chr1:28899332(+) A-I      intronic
chr1:28903543(+) A-I      intronic
chr1:28903498(+) A-I      intronic
chr1:28890735(+) A-I      intronic
chr1:28898823(+) A-I      intronic
chr1:28883394(+) A-I      intronic
chr1:28882796(+) A-I      intronic
chr1:28883124(+) A-I      intronic
chr1:28897380(+) A-I      intronic
chr1:28896567(+) A-I      intronic
chr1:28889580(+) A-I      intronic
chr1:28889874(+) A-I      intronic
chr1:28901113(+) A-I      intronic
chr1:28895882(+) A-I      intronic
chr1:28900874(+) A-I      intronic
chr1:28888534(+) A-I      intronic
chr1:28890124(+) A-I      intronic
chr1:28899691(+) A-I      intronic
chr1:28896889(+) A-I      intronic
chr1:28900124(+) A-I      intronic
chr1:28882809(+) A-I      intronic
chr1:28894498(+) A-I      intronic
chr1:28883670(+) A-I      intronic
chr1:28896939(+) A-I      intronic
chr1:28899920(+) A-I      intronic
chr1:28900453(+) A-I      intronic
chr1:28890591(+) A-I      intronic
chr1:28898216(+) A-I      intronic
chr1:28883377(+) A-I      intronic
chr1:28900960(+) A-I      intronic
chr1:28896860(+) A-I      intronic
chr1:28883676(+) A-I      intronic
chr1:28900125(+) A-I      intronic
chr1:28900852(+) A-I      intronic
chr1:28899566(+) A-I      intronic
chr1:28898908(+) A-I      intronic
chr1:28899897(+) A-I      intronic
chr1:28899746(+) A-I      intronic
chr1:28901707(+) A-I      intronic
chr1:28903005(+) A-I      intronic
chr1:28902759(+) A-I      intronic
chr1:28892973(+) A-I      intronic
chr1:28899284(+) A-I      intronic
chr1:28882820(+) A-I      intronic
chr1:28900129(+) A-I      intronic
chr1:28896959(+) A-I      intronic
chr1:28883578(+) A-I      intronic
chr1:28901710(+) A-I      intronic
chr1:28898810(+) A-I      intronic
chr1:28896821(+) A-I      intronic
chr1:28898891(+) A-I      intronic
chr1:28901000(+) A-I      intronic
chr1:28900468(+) A-I      intronic
chr1:28897390(+) A-I      intronic
chr1:28890018(+) A-I      intronic
chr1:28901004(+) A-I      intronic
chr1:28894469(+) A-I      intronic
chr1:28899731(+) A-I      intronic
chr1:28901793(+) A-I      intronic
chr1:28899295(+) A-I      intronic
chr1:28880625(+) A-I      intronic
chr1:28899169(+) A-I      intronic
chr1:28900741(+) A-I      intronic
chr1:28884175(+) A-I      intronic
chr1:28890601(+) A-I      intronic
chr1:28885872(+) A-I      intronic
chr1:28889878(+) A-I      intronic
chr1:28903560(+) A-I      intronic
chr1:28900134(+) A-I      intronic
chr1:28889895(+) A-I      intronic
chr1:28896828(+) A-I      intronic
chr1:28889686(+) A-I      intronic
chr1:28903493(+) A-I      intronic
chr1:28886093(+) A-I      intronic
chr1:28900084(+) A-I      intronic
chr1:28899996(+) A-I      intronic
chr1:28900273(+) A-I      intronic
chr1:28889534(+) A-I      intronic
chr1:28886097(+) A-I      intronic
chr1:28895025(+) A-I      intronic
chr1:28889345(+) A-I      intronic
chr1:28897552(+) A-I      intronic
chr1:28895949(+) A-I      intronic
chr1:28889469(+) A-I      intronic
chr1:28889680(+) A-I      intronic
chr1:28880554(+) A-I      intronic
chr1:28896796(+) A-I      intronic
chr1:28901151(+) A-I      intronic
chr1:28884201(+) A-I      intronic
chr1:28886977(+) A-I      intronic
chr1:28900985(+) A-I      intronic
chr1:28881306(+) A-I      intronic
chr1:28900123(+) A-I      intronic
chr1:28889511(+) A-I      intronic
chr1:28903504(+) A-I      intronic
chr1:28902416(+) A-I      intronic
chr1:28901760(+) A-I      intronic
chr1:28883104(+) A-I      intronic
chr1:28880549(+) A-I      intronic
chr1:28899941(+) A-I      intronic
chr1:28889940(+) A-I      intronic
chr1:28903479(+) A-I      intronic
chr1:28899283(+) A-I      intronic
chr1:28894917(+) A-I      intronic
chr1:28899990(+) A-I      intronic
chr1:28899815(+) A-I      intronic
chr1:28897527(+) A-I      intronic
chr1:28901105(+) A-I      intronic
chr1:28896609(+) A-I      intronic
chr1:28894404(+) A-I      intronic
chr1:28898942(+) A-I      intronic
chr1:28900099(+) A-I      intronic
chr1:28882088(+) A-I      intronic
chr1:28895049(+) A-I      intronic
chr1:28883853(+) A-I      intronic
chr1:28901177(+) A-I      intronic
chr1:28897034(+) A-I      intronic
chr1:28894533(+) A-I      intronic
chr1:28889617(+) A-I      intronic
chr1:28900569(+) A-I      intronic
chr1:28890339(+) A-I      intronic
chr1:28895832(+) A-I      intronic
chr1:28896584(+) A-I      intronic
chr1:28900089(+) A-I      intronic
chr1:28898845(+) A-I      intronic
chr1:28900835(+) A-I      intronic
chr1:28898970(+) A-I      intronic
chr1:28900178(+) A-I      intronic
chr1:28890178(+) A-I      intronic
chr1:28882862(+) A-I      intronic
chr1:28890680(+) A-I      intronic
chr1:28899975(+) A-I      intronic
chr1:28894970(+) A-I      intronic
chr1:28896568(+) A-I      intronic
chr1:28896919(+) A-I      intronic
chr1:28895047(+) A-I      intronic
chr1:28899952(+) A-I      intronic
chr1:28884547(+) A-I      intronic
chr1:28889232(+) A-I      intronic
chr1:28899431(+) A-I      intronic
chr1:28894426(+) A-I      intronic
chr1:28890128(+) A-I      intronic
chr1:28888486(+) A-I      intronic
chr1:28890271(+) A-I      intronic
chr1:28894883(+) A-I      intronic
chr1:28899650(+) A-I      intronic
chr1:28900226(+) A-I      intronic
chr1:28895846(+) A-I      intronic
chr1:28900142(+) A-I      intronic
chr1:28881301(+) A-I      intronic
chr1:28898806(+) A-I      intronic
chr1:28886874(+) A-I      intronic
chr1:28899290(+) A-I      intronic
chr1:28895021(+) A-I      intronic
chr1:28903229(+) A-I      intronic
chr1:28894900(+) A-I      intronic
chr1:28896942(+) A-I      intronic
chr1:28882638(+) A-I      intronic
chr1:28894490(+) A-I      intronic
chr1:28890767(+) A-I      intronic
chr1:28899729(+) A-I      intronic
chr1:28899244(+) A-I      intronic
chr1:28896215(+) A-I      intronic
chr1:28900797(+) A-I      intronic
chr1:28899269(+) A-I      intronic
chr1:28883325(+) A-I      intronic
chr1:28883605(+) A-I      intronic
chr1:28895022(+) A-I      intronic
chr1:28899404(+) A-I      intronic
chr1:28885010(+) A-I      intronic
chr1:28899191(+) A-I      intronic
chr1:28886020(+) A-I      intronic
chr1:28886051(+) A-I      intronic
chr1:28899448(+) A-I      intronic
chr1:28901737(+) A-I      intronic
chr1:28900047(+) A-I      intronic
chr1:28899326(+) A-I      intronic
chr1:28889933(+) A-I      intronic
chr1:28898947(+) A-I      intronic
chr1:28899627(+) A-I      intronic
chr1:28896129(+) A-I      intronic
chr1:28896722(+) A-I      intronic
chr1:28902332(+) A-I      intronic
chr1:28885985(+) A-I      intronic
chr1:28896402(+) A-I      intronic
chr1:28896956(+) A-I      intronic
chr1:28900546(+) A-I      intronic
chr1:28901144(+) A-I      intronic
chr1:28882705(+) A-I      intronic
chr1:28885264(+) A-I      intronic
chr1:28899965(+) A-I      intronic
chr1:28898929(+) A-I      intronic
chr1:28886524(+) A-I      intronic
chr1:28887023(+) A-I      intronic
chr1:28900398(+) A-I      intronic
chr1:28896823(+) A-I      intronic
chr1:28899760(+) A-I      intronic
chr1:28886019(+) A-I      intronic
chr1:28901101(+) A-I      intronic
chr1:28895918(+) A-I      intronic
chr1:28896824(+) A-I      intronic
chr1:28900780(+) A-I      intronic
chr1:28890033(+) A-I      intronic
chr1:28886501(+) A-I      intronic
chr1:28901023(+) A-I      intronic
chr1:28902490(+) A-I      intronic
chr1:28901178(+) A-I      intronic
chr1:28894562(+) A-I      intronic
chr1:28889939(+) A-I      intronic
chr1:28900220(+) A-I      intronic
chr1:28894466(+) A-I      intronic
chr1:28896689(+) A-I      intronic
chr1:28889508(+) A-I      intronic
chr1:28896923(+) A-I      intronic
chr1:28886933(+) A-I      intronic
chr1:28900700(+) A-I      intronic
chr1:28900351(+) A-I      intronic
chr1:28894663(+) A-I      intronic
chr1:28898835(+) A-I      intronic
chr1:28897003(+) A-I      intronic
chr1:28882089(+) A-I      intronic
chr1:28900070(+) A-I      intronic
chr1:28899616(+) A-I      intronic
chr1:28890171(+) A-I      intronic
chr1:28899995(+) A-I      intronic
chr1:28881098(+) A-I      intronic
chr1:28901099(+) A-I      intronic
chr1:28899964(+) A-I      intronic
chr1:28894437(+) A-I      intronic
chr1:28896933(+) A-I      intronic
chr1:28886955(+) A-I      intronic
chr1:28885023(+) A-I      intronic
chr1:28903499(+) A-I      intronic
chr1:28898132(+) A-I      intronic
chr1:28888463(+) A-I      intronic
chr1:28899991(+) A-I      intronic
chr1:28896092(+) A-I      intronic
chr1:28883463(+) A-I      intronic
chr1:28899280(+) A-I      intronic
chr1:28898736(+) A-I      intronic
chr1:28883335(+) A-I      intronic
chr1:28900290(+) A-I      intronic
chr1:28900069(+) A-I      intronic
chr1:28886576(+) A-I      intronic
chr1:28890631(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED TRNAU1AP
chr1:28894917(+) A-I intron -    21960545
chr1:28882088(+) A-G intron -    22484847
chr1:28882089(+) A-G intron -    22484847
chr1:28882705(+) A-G intron -    22484847
chr1:28882856(+) A-G intron -    22484847
chr1:28882862(+) A-G intron -    22484847
chr1:28883325(+) A-G intron -    22484847
chr1:28883335(+) A-G intron -    22484847
chr1:28883377(+) A-G intron -    22484847
chr1:28883402(+) A-G intron -    22484847
chr1:28883578(+) A-G intron -    22484847
chr1:28883670(+) A-G intron -    22484847
chr1:28883676(+) A-G intron -    22484847
chr1:28883677(+) A-G intron -    22484847
chr1:28884201(+) A-G intron -    22484847
chr1:28884802(+) A-G intron -    22484847
chr1:28885051(+) A-G intron -    22484847
chr1:28885264(+) A-G intron -    22484847
chr1:28885284(+) A-G intron -    22484847
chr1:28885872(+) A-G intron -    22484847
chr1:28885900(+) A-G intron -    22484847
chr1:28885985(+) A-G intron -    22484847
chr1:28885993(+) A-G intron -    22484847
chr1:28886020(+) A-G intron -    22484847
chr1:28886497(+) A-G intron -    22484847
chr1:28886501(+) A-G intron -    22484847
chr1:28886955(+) A-G intron -    22484847
chr1:28886959(+) A-G intron -    22484847
chr1:28888473(+) A-G intron -    22484847
chr1:28889154(+) A-G intron -    22484847
chr1:28889192(+) A-G intron -    22484847
chr1:28889222(+) A-G intron -    22484847
chr1:28889232(+) A-G intron -    22484847
chr1:28889234(+) A-G intron -    22484847
chr1:28889345(+) A-G intron -    22484847
chr1:28889511(+) A-G intron -    22484847
chr1:28889845(+) A-G intron -    22484847
chr1:28889878(+) A-G intron -    22484847
chr1:28889895(+) A-G intron -    22484847
chr1:28889933(+) A-G intron -    22484847
chr1:28889939(+) A-G intron -    22484847
chr1:28889940(+) A-G intron -    22484847
chr1:28890128(+) A-G intron -    22484847
chr1:28890141(+) A-G intron -    22484847
chr1:28890171(+) A-G intron -    22484847
chr1:28892744(+) T-C intron -    22484847
chr1:28894404(+) A-G intron -    22484847
chr1:28894461(+) A-G intron -    22484847
chr1:28894466(+) A-G intron -    22484847
chr1:28894469(+) A-G intron -    22484847
chr1:28894490(+) A-G intron -    22484847
chr1:28894498(+) A-G intron -    22484847
chr1:28894499(+) A-G intron -    22484847
chr1:28894529(+) A-G intron -    22484847
chr1:28894533(+) A-G intron -    22484847
chr1:28894561(+) A-G intron -    22484847
chr1:28894562(+) A-G intron -    22484847
chr1:28894917(+) A-G intron -    22484847
chr1:28894976(+) A-G intron -    22484847
chr1:28895375(+) A-G intron -    22484847
chr1:28895410(+) A-G intron -    22484847
chr1:28895417(+) A-G intron -    22484847
chr1:28895424(+) A-G intron -    22484847
chr1:28895441(+) A-G intron -    22484847
chr1:28895453(+) A-G intron -    22484847
chr1:28895949(+) A-G intron -    22484847
chr1:28896129(+) A-G intron -    22484847
chr1:28896722(+) A-G intron -    22484847
chr1:28896823(+) A-G intron -    22484847
chr1:28896824(+) A-G intron -    22484847
chr1:28896828(+) A-G intron -    22484847
chr1:28896853(+) A-G intron -    22484847
chr1:28896860(+) A-G intron -    22484847
chr1:28896889(+) A-G intron -    22484847
chr1:28896919(+) A-G intron -    22484847
chr1:28896939(+) A-G intron -    22484847
chr1:28896942(+) A-G intron -    22484847
chr1:28896959(+) A-G intron -    22484847
chr1:28896973(+) A-G intron -    22484847
chr1:28897022(+) A-G intron -    22484847
chr1:28897034(+) A-G intron -    22484847
chr1:28897390(+) A-G intron -    22484847
chr1:28897423(+) A-G intron -    22484847
chr1:28897470(+) A-G intron -    22484847
chr1:28897522(+) A-G intron -    22484847
chr1:28897527(+) A-G intron -    22484847
chr1:28897552(+) A-G intron -    22484847
chr1:28898799(+) A-G intron -    22484847
chr1:28898806(+) A-G intron -    22484847
chr1:28898810(+) A-G intron -    22484847
chr1:28898888(+) A-G intron -    22484847
chr1:28898897(+) A-G intron -    22484847
chr1:28898908(+) A-G intron -    22484847
chr1:28899192(+) A-G intron -    22484847
chr1:28899283(+) A-G intron -    22484847
chr1:28899290(+) A-G intron -    22484847
chr1:28899326(+) A-G intron -    22484847
chr1:28899566(+) A-G intron -    22484847
chr1:28899726(+) A-G intron -    22484847
chr1:28899729(+) A-G intron -    22484847
chr1:28899897(+) A-G intron -    22484847
chr1:28899898(+) A-G intron -    22484847
chr1:28899919(+) A-G intron -    22484847
chr1:28899952(+) A-G intron -    22484847
chr1:28900130(+) A-G intron -    22484847
chr1:28900138(+) A-G intron -    22484847
chr1:28900178(+) A-G intron -    22484847
chr1:28900398(+) A-G intron -    22484847
chr1:28900399(+) A-G intron -    22484847
chr1:28900700(+) A-G intron -    22484847
chr1:28900789(+) A-G intron -    22484847
chr1:28900985(+) A-G intron -    22484847
chr1:28901144(+) A-G intron -    22484847
chr1:28901178(+) A-G intron -    22484847
chr1:28901747(+) A-G intron -    22484847
chr1:28901760(+) A-G intron -    22484847
chr1:28902453(+) A-G intron -    22484847
chr1:28902514(+) A-G intron -    22484847
chr1:28902759(+) A-G intron -    22484847
chr1:28903479(+) A-G intron -    22484847
chr1:28903493(+) A-G intron -    22484847
chr1:28903504(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase TRNAU1AP
chr1:28879680-28879681(+) m6A exon//intron       24981863
chr1:28893835-28893836(+) m6A CDS//exon       -
chr1:28893841-28893842(+) m6A CDS//exon       -
chr1:28893880-28893881(+) m6A CDS//exon       -
chr1:28904060-28904061(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085
chr1:28904092-28904093(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085
chr1:28904113-28904114(+) m6A CDS//exon       24981863//22608085
chr1:28904160-28904161(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863//22608085
chr1:28904195-28904196(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//24981863//22608085
chr1:28904217-28904218(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085
chr1:28904322-28904323(+) m6A 3'UTR       22608085
chr1:28904331-28904332(+) m6A 3'UTR       22608085

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate TRNAU1AP
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleus HeLa-S3 cells     -
Ribosome HEK-293 cells     22199352
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsv2-miR-H4-5p
Interactor2: TRNAU1AP

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//PITA//Rep//Targetscan
Support Database RepTar//VmiReg

Starting a new search, please wait ...