Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00155923

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H3:  MIMAT0010202          TMEM19:  NM_018279     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv2-miR-H3	TMEM19
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0010202	55266
Organism	Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	-

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	TMEM19	chr12:72096809(+) A-I      3'UTR chr12:72096390(+) A-I      3'UTR chr12:72096357(+) A-I      3'UTR chr12:72096891(+) A-I      3'UTR chr12:72096251(+) A-I      3'UTR chr12:72096372(+) A-I      3'UTR chr12:72096868(+) A-I      3'UTR chr12:72096810(+) A-I      3'UTR chr12:72096786(+) A-I      3'UTR chr12:72096235(+) A-I      3'UTR chr12:72096245(+) A-I      3'UTR chr12:72096799(+) A-I      3'UTR chr12:72096800(+) A-I      3'UTR chr12:72086732(+) A-I      intronic chr12:72086832(+) A-I      intronic chr12:72096331(+) A-I      3'UTR chr12:72096469(+) A-I      3'UTR chr12:72096759(+) A-I      3'UTR chr12:72096814(+) A-I      3'UTR chr12:72096773(+) A-I      3'UTR chr12:72096318(+) A-I      3'UTR chr12:72096761(+) A-I      3'UTR chr12:72096937(+) A-I      3'UTR chr12:72096842(+) A-I      3'UTR chr12:72096807(+) A-I      3'UTR chr12:72096753(+) A-I      3'UTR chr12:72096907(+) A-I      3'UTR chr12:72096276(+) A-I      3'UTR chr12:72096866(+) A-I      3'UTR chr12:72096853(+) A-I      3'UTR chr12:72096774(+) A-I      3'UTR chr12:72096764(+) A-I      3'UTR chr12:72096232(+) A-I      3'UTR chr12:72096906(+) A-I      3'UTR chr12:72096705(+) A-I      3'UTR chr12:72096296(+) A-I      3'UTR chr12:72096616(+) A-I      3'UTR chr12:72096576(+) A-I      3'UTR chr12:72096795(+) A-I      3'UTR chr12:72096305(+) A-I      3'UTR chr12:72096358(+) A-I      3'UTR chr12:72096367(+) A-I      3'UTR chr12:72096801(+) A-I      3'UTR chr12:72096859(+) A-I      3'UTR chr12:72096261(+) A-I      3'UTR chr12:72096410(+) A-I      3'UTR chr12:72096750(+) A-I      3'UTR chr12:72082072(+) A-I      intronic chr12:72085421(+) A-I      intronic chr12:72086855(+) A-I      intronic chr12:72086784(+) A-I      intronic chr12:72087080(+) A-I      intronic chr12:72085434(+) A-I      intronic chr12:72096270(+) A-I      3'UTR chr12:72096125(+) A-I      3'UTR chr12:72096225(+) A-I      3'UTR chr12:72096776(+) A-I      3'UTR chr12:72096200(+) A-I      3'UTR chr12:72096672(+) A-I      3'UTR chr12:72096330(+) A-I      3'UTR chr12:72096206(+) A-I      3'UTR chr12:72096377(+) A-I      3'UTR chr12:72096922(+) A-I      3'UTR chr12:72096285(+) A-I      3'UTR chr12:72096317(+) A-I      3'UTR chr12:72096348(+) A-I      3'UTR chr12:72096740(+) A-I      3'UTR chr12:72096325(+) A-I      3'UTR chr12:72096370(+) A-I      3'UTR chr12:72096863(+) A-I      3'UTR chr12:72096836(+) A-I      3'UTR chr12:72096237(+) A-I      3'UTR chr12:72096850(+) A-I      3'UTR chr12:72096804(+) A-I      3'UTR chr12:72096784(+) A-I      3'UTR chr12:72096221(+) A-I      3'UTR chr12:72096846(+) A-I      3'UTR chr12:72096971(+) A-I      3'UTR chr12:72096704(+) A-I      3'UTR chr12:72096782(+) A-I      3'UTR chr12:72096869(+) A-I      3'UTR chr12:72096802(+) A-I      3'UTR chr12:72096783(+) A-I      3'UTR chr12:72096133(+) A-I      3'UTR chr12:72096579(+) A-I      3'UTR chr12:72096568(+) A-I      3'UTR chr12:72096123(+) A-I      3'UTR chr12:72096798(+) A-I      3'UTR chr12:72096721(+) A-I      3'UTR chr12:72096176(+) A-I      3'UTR chr12:72096369(+) A-I      3'UTR chr12:72096213(+) A-I      3'UTR chr12:72096121(+) A-I      3'UTR chr12:72096727(+) A-I      3'UTR chr12:72096745(+) A-I      3'UTR chr12:72096222(+) A-I      3'UTR chr12:72096279(+) A-I      3'UTR

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	TMEM19	chr12:72096125(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //22327324 chr12:72096221(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596 chr12:72096222(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596   //22327324 chr12:72096225(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596   //22327324 chr12:72096237(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //22028664 chr12:72096330(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596   //22028664   //22327324 chr12:72096331(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596   //22028664   //22327324 chr12:72096348(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596   //22028664 chr12:72096672(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22028664 chr12:72096705(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22028664 chr12:72096727(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22028664 chr12:72096750(+) A-I exon 3'UTR    15258596   //22028664 chr12:72096764(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596   //22028664 chr12:72096776(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //22028664 chr12:72096784(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //22028664 chr12:72096802(+) A-I exon 3'UTR    15342557 chr12:72096836(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596   //22028664 chr12:72096842(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //22028664   //22327324 chr12:72096850(+) A-I exon 3'UTR    15342557   //15258596   //22028664 chr12:72096971(+) A-I exon 3'UTR    15258596 chr12:72096579(+) A-I intron -    22327324 chr12:72096279(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096285(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096296(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096317(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096318(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096358(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096367(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096370(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096410(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096469(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096568(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096576(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096616(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096774(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096782(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096795(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096798(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096804(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096814(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096863(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096869(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096922(+) A-I intron -    22028664 chr12:72096579(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096125(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096221(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096222(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096225(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096276(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096285(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096318(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096330(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096331(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096750(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096776(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096842(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096850(+) A-G intron -    22484847 chr12:72086784(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096123(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096200(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096206(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096213(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096279(+) A-G intron -    22484847 chr12:72096740(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	TMEM19	chr12:72079945-72079946(+) m6A 5'UTR       24981863 chr12:72080375-72080376(+) m6A 5'UTR//intron       24284625//24209618//24981863//22608085 chr12:72092787-72092788(+) m6A CDS       24981863//22608085 chr12:72092856-72092857(+) m6A CDS       24981863//22608085 chr12:72092895-72092896(+) m6A CDS//intron       24981863//22608085 chr12:72094678-72094679(+) m6A CDS//intron       24981863 chr12:72094775-72094776(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863 chr12:72094801-72094802(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863//22608085 chr12:72094979-72094980(+) m6A 3'UTR//intron       24284625//24981863//22608085 chr12:72095057-72095058(+) m6A 3'UTR//intron       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	TMEM19	Chromatin K562 cells     - Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv2-miR-H3
Interactor2: TMEM19

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//Rep//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg