Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00153284

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv2-miR-H3:  MIMAT0010202          E2F5:  NM_001083589     

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Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv2-miR-H3	E2F5
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0010202	1875
Organism	Human alphaherpesvirus 2 (HSV2)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	E2F-5

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	E2F5	chr8:86125656(+) A-I      ncRNA chr8:86125650(+) A-I      ncRNA chr8:86125646(+) A-I      ncRNA chr8:86125589(+) A-I      ncRNA chr8:86125546(+) A-I      ncRNA chr8:86125385(+) A-I      ncRNA chr8:86125278(+) A-I      ncRNA chr8:86125274(+) A-I      ncRNA chr8:86125269(+) A-I      ncRNA chr8:86124060(+) A-I      intronic chr8:86123930(+) A-I      intronic chr8:86123366(+) A-I      intronic chr8:86117762(+) A-I      intronic chr8:86117757(+) A-I      intronic chr8:86117655(+) A-I      intronic chr8:86117653(+) A-I      intronic chr8:86117650(+) A-I      intronic chr8:86117637(+) A-I      intronic chr8:86092484(+) A-I      intronic chr8:86092491(+) A-I      intronic chr8:86092492(+) A-I      intronic chr8:86117636(+) A-I      intronic chr8:86117551(+) A-I      intronic chr8:86117201(+) A-I      intronic chr8:86117183(+) A-I      intronic chr8:86112437(+) A-I      intronic chr8:86112432(+) A-I      intronic chr8:86112431(+) A-I      intronic chr8:86112427(+) A-I      intronic chr8:86112281(+) A-I      intronic chr8:86112280(+) A-I      intronic chr8:86108004(+) A-I      intronic chr8:86107874(+) A-I      intronic chr8:86107805(+) A-I      intronic chr8:86107756(+) A-I      intronic chr8:86107631(+) A-I      intronic chr8:86107567(+) A-I      intronic chr8:86107543(+) A-I      intronic chr8:86107511(+) A-I      intronic chr8:86107507(+) A-I      intronic chr8:86107503(+) A-I      intronic chr8:86107497(+) A-I      intronic chr8:86107471(+) A-I      intronic chr8:86107453(+) A-I      intronic chr8:86107441(+) A-I      intronic chr8:86107440(+) A-I      intronic chr8:86107436(+) A-I      intronic chr8:86092508(+) A-I      intronic chr8:86092530(+) A-I      intronic chr8:86107365(+) A-I      intronic chr8:86107364(+) A-I      intronic chr8:86107348(+) A-I      intronic chr8:86105651(+) A-I      intronic chr8:86105643(+) A-I      intronic chr8:86105630(+) A-I      intronic chr8:86105565(+) A-I      intronic chr8:86105564(+) A-I      intronic chr8:86101787(+) A-I      intronic chr8:86094122(+) A-I      intronic chr8:86094009(+) A-I      intronic chr8:86093705(+) A-I      intronic chr8:86093695(+) A-I      intronic chr8:86093315(+) A-I      intronic chr8:86093199(+) A-I      intronic chr8:86093182(+) A-I      intronic chr8:86117784(+) A-I      intronic chr8:86093174(+) A-I      intronic chr8:86092456(+) A-I      intronic chr8:86092385(+) A-I      intronic chr8:86092356(+) A-I      intronic chr8:86092102(+) A-I      intronic chr8:86092086(+) A-I      intronic chr8:86093605(+) A-I      intronic chr8:86125623(+) A-I      ncRNA chr8:86125621(+) A-I      ncRNA chr8:86125395(+) A-I      ncRNA chr8:86125394(+) A-I      ncRNA chr8:86125376(+) A-I      ncRNA chr8:86125666(+) A-I      ncRNA chr8:86125662(+) A-I      ncRNA chr8:86125697(+) A-I      ncRNA chr8:86094075(+) A-I      intronic chr8:86117550(+) A-I      intronic chr8:86094050(+) A-I      intronic chr8:86125547(+) A-I      ncRNA chr8:86124146(+) A-I      intronic chr8:86093597(+) A-I      intronic chr8:86117368(+) A-I      intronic chr8:86117557(+) A-I      intronic chr8:86125272(+) A-I      ncRNA chr8:86123520(+) A-I      intronic chr8:86125524(+) A-I      ncRNA chr8:86123365(+) A-I      intronic chr8:86123524(+) A-I      intronic chr8:86094092(+) A-I      intronic chr8:86107870(+) A-I      intronic chr8:86117353(+) A-I      intronic chr8:86125574(+) A-I      ncRNA chr8:86107563(+) A-I      intronic chr8:86125698(+) A-I      ncRNA chr8:86123999(+) A-I      intronic chr8:86112211(+) A-I      intronic chr8:86124075(+) A-I      intronic chr8:86107568(+) A-I      intronic chr8:86117373(+) A-I      intronic chr8:86092056(+) A-I      intronic chr8:86117270(+) A-I      intronic chr8:86101788(+) A-I      intronic chr8:86125525(+) A-I      ncRNA chr8:86125407(+) A-I      ncRNA chr8:86107773(+) A-I      intronic chr8:86122899(+) A-I      intronic chr8:86105599(+) A-I      intronic chr8:86092453(+) A-I      intronic chr8:86125719(+) A-I      ncRNA chr8:86112259(+) A-I      intronic chr8:86122693(+) A-I      intronic chr8:86093285(+) A-I      intronic chr8:86124002(+) A-I      intronic chr8:86093610(+) A-I      intronic chr8:86107982(+) A-I      intronic chr8:86094153(+) A-I      intronic chr8:86123372(+) A-I      intronic chr8:86095474(+) A-I      intronic chr8:86102868(+) A-I      intronic chr8:86117805(+) A-I      intronic chr8:86093591(+) A-I      intronic chr8:86125137(+) A-I      ncRNA chr8:86117288(+) A-I      intronic chr8:86124084(+) A-I      intronic chr8:86123918(+) A-I      intronic chr8:86094186(+) A-I      intronic chr8:86123990(+) A-I      intronic chr8:86125620(+) A-I      ncRNA chr8:86093091(+) A-I      intronic chr8:86123541(+) A-I      intronic chr8:86124140(+) A-I      intronic chr8:86123488(+) A-I      intronic chr8:86125138(+) A-I      ncRNA chr8:86122755(+) A-I      intronic chr8:86094054(+) A-I      intronic chr8:86125624(+) A-I      ncRNA

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	E2F5	chr8:86117288(+) A-I intron -    22327324 chr8:86117373(+) A-I intron -    22327324 chr8:86117758(+) A-I intron -    22327324 chr8:86117766(+) A-I intron -    22327324

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	E2F5	chr8:86089488-86089489(+) m6A 5'UTR       - chr8:86126745-86126746(+) m6A 3'UTR//intron       27773535 chr8:86126888-86126889(+) m6A 3'UTR//intron       27773535 chr8:86126894-86126895(+) m6A 3'UTR//intron       27773535 chr8:86126907-86126908(+) m6A 3'UTR//intron       27773535 chr8:86126969-86126970(+) m6A 3'UTR//intron       27773535 chr8:86127359-86127360(+) m6A 3'UTR//intron       27773535 chr8:86128466-86128467(+) m6A 3'UTR       27773535 chr8:86128487-86128488(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	E2F5	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Nucleus K562 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv2-miR-H3
Interactor2: E2F5

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg