Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00149147

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H6-5p:  MIMAT0015281          CEP104:  NM_014704     

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Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H6-5p	CEP104
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0015281	9731
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	CFAP256//GlyBP//JBTS25//KIAA0562//ROC22

RNA Editing:

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RADAR	CEP104	chr1:3743935(-) A-I      intronic chr1:3730345(-) A-I      3'UTR chr1:3743987(-) A-I      intronic chr1:3743988(-) A-I      intronic chr1:3760162(-) A-I      intronic chr1:3743468(-) A-I      intronic chr1:3760166(-) A-I      intronic chr1:3760188(-) A-I      intronic chr1:3743907(-) A-I      intronic chr1:3752753(-) A-I      intronic chr1:3743577(-) A-I      intronic chr1:3729891(-) A-I      3'UTR chr1:3752775(-) A-I      intronic chr1:3729985(-) A-I      3'UTR chr1:3743911(-) A-I      intronic chr1:3730013(-) A-I      3'UTR chr1:3760928(-) A-I      intronic chr1:3760927(-) A-I      intronic chr1:3760508(-) A-I      intronic chr1:3760496(-) A-I      intronic chr1:3760486(-) A-I      intronic chr1:3760428(-) A-I      intronic chr1:3761215(-) A-I      intronic chr1:3760095(-) A-I      intronic chr1:3760092(-) A-I      intronic chr1:3760047(-) A-I      intronic chr1:3759490(-) A-I      intronic chr1:3759480(-) A-I      intronic chr1:3752499(-) A-I      intronic 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RNA Modification:

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RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	CEP104	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Membrane K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H6-5p
Interactor2: CEP104

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//Targetscan
Support Database	VmiReg