Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00141387

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H3-5p:  MIMAT0015279          IL23R:  NM_144701     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H3-5p	IL23R
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0015279	149233
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	-

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	IL23R	chr1:67677752(+) A-I      intronic chr1:67677748(+) A-I      intronic chr1:67677733(+) A-I      intronic chr1:67676271(+) A-I      intronic chr1:67677723(+) A-I      intronic chr1:67677781(+) A-I      intronic chr1:67677755(+) A-I      intronic chr1:67702826(+) A-I      intronic chr1:67677070(+) A-I      intronic chr1:67677040(+) A-I      intronic chr1:67664553(+) A-I      intronic chr1:67649697(+) A-I      intronic chr1:67677186(+) A-I      intronic chr1:67652379(+) A-I      intronic chr1:67685620(+) A-I      intronic chr1:67651186(+) A-I      intronic chr1:67651188(+) A-I      intronic chr1:67651205(+) A-I      intronic chr1:67664373(+) A-I      intronic chr1:67664370(+) A-I      intronic chr1:67660797(+) A-I      intronic chr1:67652521(+) A-I      intronic chr1:67652401(+) A-I      intronic chr1:67721360(+) A-I      intronic chr1:67721239(+) A-I      intronic chr1:67721234(+) A-I      intronic chr1:67705168(+) A-I      intronic chr1:67705122(+) A-I      intronic chr1:67705088(+) A-I      intronic chr1:67705086(+) A-I      intronic chr1:67703910(+) A-I      intronic chr1:67703816(+) A-I      intronic chr1:67702976(+) A-I      intronic chr1:67702971(+) A-I      intronic chr1:67700593(+) A-I      intronic chr1:67700588(+) A-I      intronic chr1:67700491(+) A-I      intronic chr1:67700460(+) A-I      intronic chr1:67697653(+) A-I      intronic chr1:67697652(+) A-I      intronic chr1:67697596(+) A-I      intronic chr1:67697583(+) A-I      intronic chr1:67697569(+) A-I      intronic chr1:67697550(+) A-I      intronic chr1:67697493(+) A-I      intronic chr1:67691367(+) A-I      intronic chr1:67691332(+) A-I      intronic chr1:67691322(+) A-I      intronic chr1:67691319(+) A-I      intronic chr1:67691318(+) A-I      intronic chr1:67688738(+) A-I      intronic chr1:67686606(+) A-I      intronic chr1:67685493(+) A-I      intronic chr1:67684959(+) A-I      intronic chr1:67678580(+) A-I      intronic chr1:67691294(+) A-I      intronic chr1:67678332(+) A-I      intronic chr1:67678293(+) A-I      intronic chr1:67697552(+) A-I      intronic chr1:67688751(+) A-I      intronic chr1:67688791(+) A-I      intronic chr1:67688817(+) A-I      intronic chr1:67688826(+) A-I      intronic chr1:67688829(+) A-I      intronic chr1:67691293(+) A-I      intronic chr1:67705073(+) A-I      intronic chr1:67685674(+) A-I      intronic chr1:67691243(+) A-I      intronic chr1:67704972(+) A-I      intronic chr1:67688696(+) A-I      intronic chr1:67686296(+) A-I      intronic chr1:67703802(+) A-I      intronic chr1:67666831(+) A-I      intronic chr1:67685491(+) A-I      intronic chr1:67691263(+) A-I      intronic chr1:67677164(+) A-I      intronic chr1:67725579(+) A-I      3'UTR chr1:67700574(+) A-I      intronic chr1:67669772(+) A-I      intronic chr1:67694006(+) A-I      intronic chr1:67676245(+) A-I      intronic chr1:67678782(+) A-I      intronic chr1:67652538(+) A-I      intronic chr1:67651194(+) A-I      intronic chr1:67691382(+) A-I      intronic chr1:67677199(+) A-I      intronic chr1:67687853(+) A-I      intronic chr1:67725418(+) A-I      3'UTR chr1:67651189(+) A-I      intronic chr1:67688695(+) A-I      intronic chr1:67688659(+) A-I      intronic chr1:67685508(+) A-I      intronic chr1:67685651(+) A-I      intronic chr1:67725392(+) A-I      3'UTR chr1:67676263(+) A-I      intronic chr1:67723435(+) A-I      intronic chr1:67697599(+) A-I      intronic chr1:67678588(+) A-I      intronic chr1:67691220(+) A-I      intronic chr1:67705059(+) A-I      intronic chr1:67693968(+) A-I      intronic chr1:67725427(+) A-I      3'UTR chr1:67705076(+) A-I      intronic chr1:67700556(+) A-I      intronic chr1:67725485(+) A-I      3'UTR chr1:67725486(+) A-I      3'UTR chr1:67723516(+) A-I      intronic chr1:67678329(+) A-I      intronic chr1:67685703(+) A-I      intronic chr1:67705008(+) A-I      intronic chr1:67677213(+) A-I      intronic chr1:67666342(+) A-I      intronic chr1:67685850(+) A-I      intronic chr1:67663539(+) A-I      intronic chr1:67678740(+) A-I      intronic chr1:67687874(+) A-I      intronic chr1:67725562(+) A-I      3'UTR

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	IL23R	chr1:67663539(+) A-G intron -    22484847 chr1:67666831(+) A-G intron -    22484847 chr1:67676245(+) A-G intron -    22484847 chr1:67676263(+) A-G intron -    22484847 chr1:67677142(+) G-A intron -    22484847 chr1:67677199(+) A-G intron -    22484847 chr1:67678329(+) A-G intron -    22484847 chr1:67678588(+) A-G intron -    22484847 chr1:67685491(+) A-G intron -    22484847 chr1:67685508(+) A-G intron -    22484847 chr1:67685651(+) A-G intron -    22484847 chr1:67685898(+) G-A intron -    22484847 chr1:67686296(+) A-G intron -    22484847 chr1:67688659(+) A-G intron -    22484847 chr1:67688695(+) A-G intron -    22484847 chr1:67688696(+) A-G intron -    22484847 chr1:67691220(+) A-G intron -    22484847 chr1:67691243(+) A-G intron -    22484847 chr1:67691263(+) A-G intron -    22484847 chr1:67691382(+) A-G intron -    22484847 chr1:67693968(+) A-G intron -    22484847 chr1:67694006(+) A-G intron -    22484847 chr1:67694042(+) C-T intron -    22484847 chr1:67694045(+) C-T intron -    22484847 chr1:67694046(+) C-T intron -    22484847 chr1:67700556(+) A-G intron -    22484847 chr1:67700574(+) A-G intron -    22484847 chr1:67703802(+) A-G intron -    22484847 chr1:67704972(+) A-G intron -    22484847 chr1:67705059(+) A-G intron -    22484847 chr1:67705073(+) A-G intron -    22484847 chr1:67705076(+) A-G intron -    22484847 chr1:67716963(+) G-A intron -    22484847 chr1:67723418(+) G-A intron -    22484847 chr1:67723435(+) A-G intron -    22484847 chr1:67725392(+) A-G intron -    22484847 chr1:67725418(+) A-G intron -    22484847 chr1:67725427(+) A-G intron -    22484847 chr1:67725485(+) A-G intron -    22484847 chr1:67725486(+) A-G intron -    22484847 chr1:67725562(+) A-G intron -    22484847 chr1:67725579(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	IL23R	chr1:67632154-67632155(+) m6A 5'UTR       - chr1:67632212-67632213(+) m6A 5'UTR       - chr1:67633780-67633781(+) m6A 5'UTR       - chr1:67633801-67633802(+) m6A 5'UTR       - chr1:67635126-67635127(+) m6A CDS       - chr1:67635142-67635143(+) m6A CDS       - chr1:67635200-67635201(+) m6A CDS       - chr1:67635225-67635226(+) m6A CDS       - chr1:67635235-67635236(+) m6A CDS       - chr1:67635274-67635275(+) m6A CDS       - chr1:67635287-67635288(+) m6A CDS       - chr1:67635306-67635307(+) m6A CDS       - chr1:67724266-67724267(+) m6A 3'UTR//CDS       - chr1:67724288-67724289(+) m6A 3'UTR//CDS       - chr1:67724298-67724299(+) m6A 3'UTR//CDS       - chr1:67724305-67724306(+) m6A 3'UTR//CDS       - chr1:67724317-67724318(+) m6A 3'UTR//CDS       - chr1:67724375-67724376(+) m6A 3'UTR//CDS       - chr1:67724450-67724451(+) m6A 3'UTR//CDS       - chr1:67724470-67724471(+) m6A 3'UTR//CDS       - chr1:67724614-67724615(+) m6A 3'UTR//CDS       - chr1:67724631-67724632(+) m6A 3'UTR//CDS       - chr1:67724667-67724668(+) m6A 3'UTR//CDS       - chr1:67724678-67724679(+) m6A 3'UTR//CDS       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	IL23R	Cytosol K562 cells     - Exosome Blood     - Membrane K562 cells     - Nucleus K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H3-5p
Interactor2: IL23R

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	VmiReg