Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00140345

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H3-5p:  MIMAT0015279          LAX1:  NM_001282878     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H3-5p	LAX1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0015279	54900
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	LAX

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	LAX1	chr1:203738413(+) A-I      intronic chr1:203735451(+) A-I      intronic chr1:203735466(+) A-I      intronic chr1:203738346(+) A-I      intronic chr1:203738307(+) A-I      intronic chr1:203745233(+) A-I      3'UTR chr1:203736601(+) A-I      intronic chr1:203736262(+) A-I      intronic chr1:203741916(+) A-I      intronic chr1:203742426(+) A-I      intronic chr1:203735595(+) A-I      intronic chr1:203736101(+) A-I      intronic chr1:203738288(+) A-I      intronic chr1:203737024(+) A-I      intronic chr1:203742096(+) A-I      intronic chr1:203738397(+) A-I      intronic chr1:203738399(+) A-I      intronic chr1:203735528(+) A-I      intronic chr1:203735426(+) A-I      intronic chr1:203736602(+) A-I      intronic chr1:203736197(+) A-I      intronic chr1:203735427(+) A-I      intronic chr1:203735411(+) A-I      intronic chr1:203742475(+) A-I      intronic chr1:203742462(+) A-I      intronic chr1:203736996(+) A-I      intronic chr1:203736113(+) A-I      intronic chr1:203738280(+) A-I      intronic chr1:203736618(+) A-I      intronic chr1:203735502(+) A-I      intronic chr1:203745238(+) A-I      3'UTR chr1:203745398(+) A-I      3'UTR chr1:203742415(+) A-I      intronic chr1:203745242(+) A-I      3'UTR chr1:203744256(+) A-I      3'UTR chr1:203742534(+) A-I      intronic chr1:203744402(+) A-I      3'UTR chr1:203738340(+) A-I      intronic chr1:203742418(+) A-I      intronic chr1:203745395(+) A-I      3'UTR chr1:203745420(+) A-I      3'UTR chr1:203737345(+) A-I      intronic chr1:203735479(+) A-I      intronic chr1:203735358(+) A-I      intronic chr1:203735492(+) A-I      intronic chr1:203737409(+) A-I      intronic chr1:203745385(+) A-I      3'UTR chr1:203737354(+) A-I      intronic chr1:203738373(+) A-I      intronic chr1:203736529(+) A-I      intronic chr1:203736077(+) A-I      intronic chr1:203745465(+) A-I      3'UTR chr1:203742527(+) A-I      intronic chr1:203745228(+) A-I      3'UTR chr1:203742006(+) A-I      intronic chr1:203745350(+) A-I      3'UTR chr1:203742461(+) A-I      intronic chr1:203736250(+) A-I      intronic chr1:203737389(+) A-I      intronic chr1:203745241(+) A-I      3'UTR chr1:203745411(+) A-I      3'UTR chr1:203736222(+) A-I      intronic chr1:203737435(+) A-I      intronic chr1:203736249(+) A-I      intronic chr1:203737364(+) A-I      intronic chr1:203745346(+) A-I      3'UTR chr1:203745417(+) A-I      3'UTR chr1:203745196(+) A-I      3'UTR chr1:203735542(+) A-I      intronic chr1:203736110(+) A-I      intronic chr1:203737043(+) A-I      intronic chr1:203735437(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	LAX1	chr1:203735437(+) A-I intron -    22327324 chr1:203735479(+) A-I intron -    22327324 chr1:203745385(+) A-I intron -    22327324 chr1:203745420(+) A-I intron -    22327324 chr1:203745398(+) A-G intron -    21725310   //22484847 chr1:203735358(+) A-G intron -    22484847 chr1:203735437(+) A-G intron -    22484847 chr1:203735479(+) A-G intron -    22484847 chr1:203735492(+) A-G intron -    22484847 chr1:203735502(+) A-G intron -    22484847 chr1:203736077(+) A-G intron -    22484847 chr1:203736529(+) A-G intron -    22484847 chr1:203737364(+) A-G intron -    22484847 chr1:203738280(+) A-G intron -    22484847 chr1:203744402(+) A-G intron -    22484847 chr1:203744528(+) A-C intron -    22484847 chr1:203744532(+) C-A intron -    22484847 chr1:203744533(+) A-C intron -    22484847 chr1:203745196(+) A-G intron -    22484847 chr1:203745238(+) A-G intron -    22484847 chr1:203745241(+) A-G intron -    22484847 chr1:203745385(+) A-G intron -    22484847 chr1:203745395(+) A-G intron -    22484847 chr1:203745411(+) A-G intron -    22484847 chr1:203745420(+) A-G intron -    22484847 chr1:203745465(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	LAX1	chr1:203743153-203743154(+) m6A CDS//exon       - chr1:203743224-203743225(+) m6A CDS//exon       26404942 chr1:203743363-203743364(+) m6A CDS//exon       26404942 chr1:203743489-203743490(+) m6A CDS//exon       26404942 chr1:203743561-203743562(+) m6A CDS//exon       26404942 chr1:203743579-203743580(+) m6A CDS//exon       26404942 chr1:203743584-203743585(+) m6A CDS//exon       26404942 chr1:203743599-203743600(+) m6A CDS//exon       26404942 chr1:203743623-203743624(+) m6A CDS//exon       26404942 chr1:203743651-203743652(+) m6A CDS//exon       26404942 chr1:203743678-203743679(+) m6A CDS//exon       26404942 chr1:203743691-203743692(+) m6A CDS//exon       26404942 chr1:203743717-203743718(+) m6A CDS//exon       26404942 chr1:203743765-203743766(+) m6A CDS//exon       26404942 chr1:203743811-203743812(+) m6A 3'UTR//exon       26404942 chr1:203743885-203743886(+) m6A 3'UTR//exon       26404942 chr1:203743954-203743955(+) m6A 3'UTR//exon       26404942 chr1:203744057-203744058(+) m6A 3'UTR//exon       26404942 chr1:203744070-203744071(+) m6A 3'UTR//exon       26404942

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	LAX1	Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H3-5p
Interactor2: LAX1

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	VmiReg