Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00139469

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H3-5p:  MIMAT0015279          EIF3I:  NM_003757     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H3-5p	EIF3I
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0015279	8668
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	eIF3-beta//eIF3-p36//EIF3S2//PRO2242//TRIP-1//TRIP1

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	EIF3I	chr1:32696912(+) A-I      3'UTR chr1:32696902(+) A-I      3'UTR chr1:32690324(+) A-I      intronic chr1:32691160(+) A-I      intronic chr1:32691184(+) A-I      intronic chr1:32696906(+) A-I      3'UTR chr1:32696916(+) A-I      3'UTR chr1:32696882(+) A-I      3'UTR chr1:32696915(+) A-I      3'UTR chr1:32692268(+) A-I      intronic chr1:32692267(+) A-I      intronic chr1:32692186(+) A-I      intronic chr1:32691581(+) A-I      intronic chr1:32691528(+) A-I      intronic chr1:32691444(+) A-I      intronic chr1:32691148(+) A-I      intronic chr1:32691142(+) A-I      intronic chr1:32691134(+) A-I      intronic chr1:32691115(+) A-I      intronic chr1:32691097(+) A-I      intronic chr1:32690811(+) A-I      intronic chr1:32690697(+) A-I      intronic chr1:32690682(+) A-I      intronic chr1:32690624(+) A-I      intronic chr1:32690618(+) A-I      intronic chr1:32690615(+) A-I      intronic chr1:32690601(+) A-I      intronic chr1:32690322(+) A-I      intronic chr1:32689160(+) A-I      intronic chr1:32689120(+) A-I      intronic chr1:32692307(+) A-I      intronic chr1:32692780(+) A-I      intronic chr1:32692389(+) A-I      intronic chr1:32692334(+) A-I      intronic chr1:32691124(+) A-I      intronic chr1:32688512(+) A-I      intronic chr1:32688516(+) A-I      intronic chr1:32692333(+) A-I      intronic chr1:32696327(+) A-I      intronic chr1:32695847(+) A-I      intronic chr1:32691166(+) A-I      intronic chr1:32695948(+) A-I      intronic chr1:32693269(+) A-I      intronic chr1:32692285(+) A-I      intronic chr1:32693321(+) A-I      intronic chr1:32696186(+) A-I      intronic chr1:32693285(+) A-I      intronic chr1:32696185(+) A-I      intronic chr1:32696331(+) A-I      intronic chr1:32689095(+) A-I      intronic chr1:32690798(+) A-I      intronic chr1:32696891(+) A-I      3'UTR chr1:32690499(+) A-I      intronic chr1:32690838(+) A-I      intronic chr1:32695964(+) A-I      intronic chr1:32690402(+) A-I      intronic chr1:32690315(+) A-I      intronic chr1:32696084(+) A-I      intronic chr1:32690399(+) A-I      intronic chr1:32690757(+) A-I      intronic chr1:32694936(+) A-I      intronic chr1:32692758(+) A-I      intronic chr1:32696969(+) A-I      3'UTR chr1:32693219(+) A-I      intronic chr1:32690673(+) A-I      intronic chr1:32690774(+) A-I      intronic chr1:32695252(+) A-I      intronic chr1:32689154(+) A-I      intronic chr1:32697044(+) A-I      3'UTR chr1:32695892(+) A-I      intronic chr1:32691168(+) A-I      intronic chr1:32690574(+) A-I      intronic chr1:32697017(+) A-I      3'UTR chr1:32693261(+) A-I      intronic chr1:32688547(+) A-I      intronic chr1:32691181(+) A-I      intronic chr1:32695865(+) A-I      intronic chr1:32693121(+) A-I      intronic chr1:32696949(+) A-I      3'UTR chr1:32693122(+) A-I      intronic chr1:32692781(+) A-I      intronic chr1:32690528(+) A-I      intronic chr1:32693195(+) A-I      intronic chr1:32688508(+) A-I      intronic chr1:32695259(+) A-I      intronic chr1:32688520(+) A-I      intronic chr1:32692785(+) A-I      intronic chr1:32696083(+) A-I      intronic chr1:32695426(+) A-I      intronic chr1:32690333(+) A-I      intronic chr1:32691235(+) A-I      intronic chr1:32690766(+) A-I      intronic chr1:32693128(+) A-I      intronic chr1:32692759(+) A-I      intronic chr1:32691167(+) A-I      intronic chr1:32690328(+) A-I      intronic chr1:32696981(+) A-I      3'UTR chr1:32691143(+) A-I      intronic chr1:32693296(+) A-I      intronic chr1:32696311(+) A-I      intronic chr1:32690777(+) A-I      intronic chr1:32691222(+) A-I      intronic chr1:32692617(+) A-I      intronic chr1:32688598(+) A-I      intronic chr1:32690336(+) A-I      intronic chr1:32690709(+) A-I      intronic chr1:32692360(+) A-I      intronic chr1:32696890(+) A-I      3'UTR chr1:32695697(+) A-I      intronic chr1:32696930(+) A-I      3'UTR chr1:32693336(+) A-I      intronic chr1:32696085(+) A-I      intronic chr1:32690635(+) A-I      intronic chr1:32691339(+) A-I      intronic chr1:32696222(+) A-I      intronic chr1:32691569(+) A-I      intronic chr1:32696415(+) A-I      intronic chr1:32696908(+) A-I      3'UTR chr1:32696044(+) A-I      intronic chr1:32692895(+) A-I      intronic chr1:32688519(+) A-I      intronic chr1:32691145(+) A-I      intronic chr1:32690490(+) A-I      intronic chr1:32693192(+) A-I      intronic chr1:32696097(+) A-I      intronic chr1:32696927(+) A-I      3'UTR chr1:32695251(+) A-I      intronic chr1:32691186(+) A-I      intronic chr1:32690311(+) A-I      intronic chr1:32695953(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	EIF3I	chr1:32689095(+) A-G intron -    22484847 chr1:32689154(+) A-G intron -    22484847 chr1:32690283(+) C-T intron -    22484847 chr1:32690402(+) A-G intron -    22484847 chr1:32690499(+) A-G intron -    22484847 chr1:32690635(+) A-G intron -    22484847 chr1:32690766(+) A-G intron -    22484847 chr1:32690774(+) A-G intron -    22484847 chr1:32690777(+) A-G intron -    22484847 chr1:32691118(+) T-G intron -    22484847 chr1:32691168(+) A-G intron -    22484847 chr1:32692285(+) A-G intron -    22484847 chr1:32692360(+) A-G intron -    22484847 chr1:32693195(+) A-G intron -    22484847 chr1:32695697(+) A-G intron -    22484847 chr1:32695847(+) A-G intron -    22484847 chr1:32695894(+) T-C intron -    22484847 chr1:32695948(+) A-G intron -    22484847 chr1:32695951(+) T-C intron -    22484847 chr1:32695953(+) A-G intron -    22484847 chr1:32695956(+) T-C intron -    22484847 chr1:32696085(+) A-G intron -    22484847 chr1:32696095(+) T-C intron -    22484847 chr1:32696096(+) T-C intron -    22484847 chr1:32696097(+) A-G intron -    22484847 chr1:32696222(+) A-G intron -    22484847 chr1:32696311(+) A-G intron -    22484847 chr1:32696325(+) T-C intron -    22484847 chr1:32696327(+) A-G intron -    22484847 chr1:32696331(+) A-G intron -    22484847 chr1:32696342(+) T-C intron -    22484847 chr1:32696389(+) T-C intron -    22484847 chr1:32696440(+) T-C intron -    22484847 chr1:32696814(+) C-T intron -    22484847 chr1:32696890(+) A-G intron -    22484847 chr1:32696891(+) A-G intron -    22484847 chr1:32696908(+) A-G intron -    22484847 chr1:32696927(+) A-G intron -    22484847 chr1:32696930(+) A-G intron -    22484847 chr1:32696949(+) A-G intron -    22484847 chr1:32696981(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	EIF3I	chr1:32687966-32687967(+) m6A 5'UTR       24981863 chr1:32687992-32687993(+) m6A 5'UTR       24284625//24981863 chr1:32688202-32688203(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863 chr1:32688226-32688227(+) m6A CDS//exon       24981863 chr1:32690013-32690014(+) m6A CDS//exon//intron       22575960 chr1:32690064-32690065(+) m6A CDS//exon//intron       22575960 chr1:32690072-32690073(+) m6A CDS//exon//intron       22575960 chr1:32691754-32691755(+) m6A exon//intron       22575960 chr1:32691794-32691795(+) m6A CDS//exon//intron       22575960 chr1:32691812-32691813(+) m6A CDS//exon//intron       22575960 chr1:32691858-32691859(+) m6A CDS//exon//intron       22575960 chr1:32692067-32692068(+) m6A CDS//exon//intron       26404942//22575960 chr1:32697012-32697013(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//27773535//22608085 chr1:32697082-32697083(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//27773535//22608085 chr1:32697157-32697158(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834//24981863//27773535//22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	EIF3I	Chromatin K562 cells     - Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Ribosome HEK-293 cells     22199352 Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H3-5p
Interactor2: EIF3I

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	VmiReg