Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00121246

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H15:  MIMAT0014693          BCAS4:  NM_198799     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H15	BCAS4
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014693	55653
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	CNOL

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	BCAS4	chr20:49492568(+) A-I      NonSyn:Asn->Ser chr20:49456192(+) A-I      intronic chr20:49477352(+) A-I      intronic chr20:49477366(+) A-I      intronic chr20:49477392(+) A-I      intronic chr20:49492557(+) A-I      Syn:Pro->Pro chr20:49456185(+) A-I      intronic chr20:49464418(+) A-I      intronic chr20:49464381(+) A-I      intronic chr20:49464316(+) A-I      intronic chr20:49463858(+) A-I      intronic chr20:49463846(+) A-I      intronic chr20:49463826(+) A-I      intronic chr20:49463723(+) A-I      intronic chr20:49463698(+) A-I      intronic chr20:49463693(+) A-I      intronic chr20:49463682(+) A-I      intronic chr20:49462893(+) A-I      intronic chr20:49460754(+) A-I      intronic chr20:49460753(+) A-I      intronic chr20:49460542(+) A-I      intronic chr20:49444344(+) A-I      intronic chr20:49447123(+) A-I      intronic chr20:49447352(+) A-I      intronic chr20:49460521(+) A-I      intronic chr20:49459770(+) A-I      intronic chr20:49459763(+) A-I      intronic chr20:49459550(+) A-I      intronic chr20:49456609(+) A-I      intronic chr20:49463886(+) A-I      intronic chr20:49456263(+) A-I      intronic chr20:49456243(+) A-I      intronic chr20:49456120(+) A-I      intronic chr20:49456114(+) A-I      intronic chr20:49456060(+) A-I      intronic chr20:49455260(+) A-I      intronic chr20:49455234(+) A-I      intronic chr20:49455206(+) A-I      intronic chr20:49453852(+) A-I      intronic chr20:49452655(+) A-I      intronic chr20:49451983(+) A-I      intronic chr20:49451970(+) A-I      intronic chr20:49451957(+) A-I      intronic chr20:49451899(+) A-I      intronic chr20:49419428(+) A-I      intronic chr20:49451029(+) A-I      intronic chr20:49451006(+) A-I      intronic chr20:49450937(+) A-I      intronic chr20:49450913(+) A-I      intronic chr20:49449056(+) A-I      intronic chr20:49448950(+) A-I      intronic chr20:49447871(+) A-I      intronic chr20:49448814(+) A-I      intronic chr20:49447899(+) A-I      intronic chr20:49447884(+) A-I      intronic chr20:49447870(+) A-I      intronic chr20:49447808(+) A-I      intronic chr20:49447806(+) A-I      intronic chr20:49414012(+) A-I      intronic chr20:49414977(+) A-I      intronic chr20:49416338(+) A-I      intronic chr20:49416407(+) A-I      intronic chr20:49416414(+) A-I      intronic chr20:49412641(+) A-I      intronic chr20:49416437(+) A-I      intronic chr20:49451881(+) A-I      intronic chr20:49417708(+) A-I      intronic chr20:49417816(+) A-I      intronic chr20:49417842(+) A-I      intronic chr20:49418078(+) A-I      intronic chr20:49418113(+) A-I      intronic chr20:49418130(+) A-I      intronic chr20:49418603(+) A-I      intronic chr20:49419258(+) A-I      intronic chr20:49420632(+) A-I      intronic chr20:49420733(+) A-I      intronic chr20:49431387(+) A-I      intronic chr20:49431463(+) A-I      intronic chr20:49435573(+) A-I      intronic chr20:49469821(+) A-I      intronic chr20:49469871(+) A-I      intronic chr20:49469921(+) A-I      intronic chr20:49469934(+) A-I      intronic chr20:49469951(+) A-I      intronic chr20:49412742(+) A-I      intronic chr20:49412791(+) A-I      intronic chr20:49413431(+) A-I      intronic chr20:49477227(+) A-I      intronic chr20:49436413(+) A-I      intronic chr20:49477361(+) A-I      intronic chr20:49479428(+) A-I      intronic chr20:49479441(+) A-I      intronic chr20:49479501(+) A-I      intronic chr20:49481069(+) A-I      intronic chr20:49481105(+) A-I      intronic chr20:49481189(+) A-I      intronic chr20:49481214(+) A-I      intronic chr20:49481402(+) A-I      intronic chr20:49481403(+) A-I      intronic chr20:49481445(+) A-I      intronic chr20:49481515(+) A-I      intronic chr20:49483934(+) A-I      intronic chr20:49484023(+) A-I      intronic chr20:49484080(+) A-I      intronic chr20:49484218(+) A-I      intronic chr20:49484395(+) A-I      intronic chr20:49492750(+) A-I      intronic chr20:49436488(+) A-I      intronic chr20:49436505(+) A-I      intronic chr20:49460461(+) A-I      intronic chr20:49439361(+) A-I      intronic chr20:49439608(+) A-I      intronic chr20:49439756(+) A-I      intronic chr20:49439812(+) A-I      intronic chr20:49442176(+) A-I      intronic chr20:49444444(+) A-I      intronic chr20:49444499(+) A-I      intronic chr20:49445039(+) A-I      intronic chr20:49469807(+) A-I      intronic chr20:49469119(+) A-I      intronic chr20:49469048(+) A-I      intronic chr20:49466430(+) A-I      intronic chr20:49445165(+) A-I      intronic chr20:49445166(+) A-I      intronic chr20:49445255(+) A-I      intronic chr20:49466424(+) A-I      intronic chr20:49464555(+) A-I      intronic chr20:49413432(+) A-I      intronic chr20:49464424(+) A-I      intronic chr20:49413468(+) A-I      intronic chr20:49477360(+) A-I      intronic chr20:49492627(+) A-I      NonSyn:Thr->Ala chr20:49493281(+) A-I      3'UTR chr20:49493278(+) A-I      3'UTR chr20:49492617(+) A-I      Syn:Val->Val chr20:49453854(+) A-I      intronic chr20:49456104(+) A-I      intronic chr20:49483958(+) A-I      intronic chr20:49476570(+) A-I      intronic chr20:49455333(+) A-I      intronic chr20:49436452(+) A-I      intronic chr20:49453468(+) A-I      intronic chr20:49453922(+) A-I      intronic chr20:49457506(+) A-I      intronic chr20:49453362(+) A-I      intronic chr20:49484336(+) A-I      intronic chr20:49460718(+) A-I      intronic chr20:49459729(+) A-I      intronic chr20:49412895(+) A-I      intronic chr20:49452584(+) A-I      intronic chr20:49469751(+) A-I      intronic chr20:49417799(+) A-I      intronic chr20:49460660(+) A-I      intronic chr20:49448969(+) A-I      intronic chr20:49492195(+) A-I      intronic chr20:49473835(+) A-I      intronic chr20:49422405(+) A-I      intronic chr20:49449047(+) A-I      intronic chr20:49450998(+) A-I      intronic chr20:49451013(+) A-I      intronic chr20:49447710(+) A-I      intronic chr20:49412856(+) A-I      intronic chr20:49447289(+) A-I      intronic chr20:49413501(+) A-I      intronic chr20:49431003(+) A-I      intronic chr20:49477306(+) A-I      intronic chr20:49412851(+) A-I      intronic chr20:49481115(+) A-I      intronic chr20:49449057(+) A-I      intronic chr20:49475045(+) A-I      intronic chr20:49459747(+) A-I      intronic chr20:49492239(+) A-I      intronic chr20:49447819(+) A-I      intronic chr20:49456157(+) A-I      intronic chr20:49436619(+) A-I      intronic chr20:49464659(+) A-I      intronic chr20:49447326(+) A-I      intronic chr20:49456541(+) A-I      intronic chr20:49455025(+) A-I      intronic chr20:49455229(+) A-I      intronic chr20:49455196(+) A-I      intronic chr20:49456177(+) A-I      intronic chr20:49456181(+) A-I      intronic chr20:49447711(+) A-I      intronic chr20:49460534(+) A-I      intronic chr20:49453923(+) A-I      intronic chr20:49420594(+) A-I      intronic chr20:49453875(+) A-I      intronic chr20:49447810(+) A-I      intronic chr20:49459677(+) A-I      intronic chr20:49436602(+) A-I      intronic chr20:49447938(+) A-I      intronic chr20:49456095(+) A-I      intronic chr20:49456688(+) A-I      intronic chr20:49412826(+) A-I      intronic chr20:49460523(+) A-I      intronic chr20:49463900(+) A-I      intronic chr20:49447216(+) A-I      intronic chr20:49460522(+) A-I      intronic chr20:49447790(+) A-I      intronic chr20:49448995(+) A-I      intronic chr20:49460729(+) A-I      intronic chr20:49481045(+) A-I      intronic chr20:49452594(+) A-I      intronic chr20:49464496(+) A-I      intronic chr20:49459683(+) A-I      intronic chr20:49456061(+) A-I      intronic chr20:49427781(+) A-I      intronic chr20:49493301(+) A-I      3'UTR chr20:49453870(+) A-I      intronic chr20:49463833(+) A-I      intronic chr20:49432730(+) A-I      intronic chr20:49414577(+) A-I      intronic chr20:49448984(+) A-I      intronic chr20:49455274(+) A-I      intronic chr20:49460829(+) A-I      intronic chr20:49448843(+) A-I      intronic chr20:49460732(+) A-I      intronic chr20:49443146(+) A-I      intronic chr20:49452727(+) A-I      intronic chr20:49418616(+) A-I      intronic chr20:49464426(+) A-I      intronic chr20:49451021(+) A-I      intronic chr20:49463834(+) A-I      intronic chr20:49455070(+) A-I      intronic chr20:49463704(+) A-I      intronic chr20:49453386(+) A-I      intronic chr20:49484348(+) A-I      intronic chr20:49452714(+) A-I      intronic chr20:49418152(+) A-I      intronic chr20:49445160(+) A-I      intronic chr20:49453483(+) A-I      intronic chr20:49455283(+) A-I      intronic chr20:49413990(+) A-I      intronic chr20:49477371(+) A-I      intronic chr20:49455167(+) A-I      intronic chr20:49484396(+) A-I      intronic chr20:49453904(+) A-I      intronic chr20:49463765(+) A-I      intronic chr20:49417763(+) A-I      intronic chr20:49412580(+) A-I      intronic chr20:49447807(+) A-I      intronic chr20:49459522(+) A-I      intronic chr20:49412755(+) A-I      intronic chr20:49475322(+) A-I      intronic chr20:49414478(+) A-I      intronic chr20:49445782(+) A-I      intronic chr20:49413575(+) A-I      intronic chr20:49481536(+) A-I      intronic chr20:49460570(+) A-I      intronic chr20:49475403(+) A-I      intronic chr20:49459566(+) A-I      intronic chr20:49475065(+) A-I      intronic chr20:49456621(+) A-I      intronic chr20:49459756(+) A-I      intronic chr20:49463703(+) A-I      intronic chr20:49447266(+) A-I      intronic chr20:49456169(+) A-I      intronic chr20:49455336(+) A-I      intronic chr20:49414476(+) A-I      intronic chr20:49455282(+) A-I      intronic chr20:49481169(+) A-I      intronic chr20:49443277(+) A-I      intronic chr20:49451966(+) A-I      intronic chr20:49481078(+) A-I      intronic chr20:49459768(+) A-I      intronic chr20:49456551(+) A-I      intronic chr20:49432737(+) A-I      intronic chr20:49451067(+) A-I      intronic chr20:49453438(+) A-I      intronic chr20:49448960(+) A-I      intronic chr20:49477309(+) A-I      intronic chr20:49427859(+) A-I      intronic chr20:49481440(+) A-I      intronic chr20:49424600(+) A-I      intronic chr20:49444479(+) A-I      intronic chr20:49460856(+) A-I      intronic chr20:49456633(+) A-I      intronic chr20:49464394(+) A-I      intronic chr20:49455331(+) A-I      intronic chr20:49447813(+) A-I      intronic chr20:49484025(+) A-I      intronic chr20:49459622(+) A-I      intronic chr20:49412664(+) A-I      intronic chr20:49483907(+) A-I      intronic chr20:49484401(+) A-I      intronic chr20:49464396(+) A-I      intronic chr20:49453519(+) A-I      intronic chr20:49464384(+) A-I      intronic chr20:49455223(+) A-I      intronic chr20:49452652(+) A-I      intronic chr20:49447801(+) A-I      intronic chr20:49428340(+) A-I      intronic chr20:49456278(+) A-I      intronic chr20:49448997(+) A-I      intronic chr20:49459626(+) A-I      intronic chr20:49473942(+) A-I      intronic chr20:49412517(+) A-I      intronic chr20:49455110(+) A-I      intronic chr20:49413994(+) A-I      intronic chr20:49475333(+) A-I      intronic chr20:49452635(+) A-I      intronic chr20:49447882(+) A-I      intronic chr20:49473848(+) A-I      intronic chr20:49448894(+) A-I      intronic chr20:49460793(+) A-I      intronic chr20:49413216(+) A-I      intronic chr20:49468988(+) A-I      intronic chr20:49445201(+) A-I      intronic chr20:49456632(+) A-I      intronic chr20:49452043(+) A-I      intronic chr20:49417803(+) A-I      intronic chr20:49447957(+) A-I      intronic chr20:49452660(+) A-I      intronic chr20:49481076(+) A-I      intronic chr20:49477315(+) A-I      intronic chr20:49481133(+) A-I      intronic chr20:49455126(+) A-I      intronic chr20:49456676(+) A-I      intronic chr20:49455200(+) A-I      intronic chr20:49453513(+) A-I      intronic chr20:49454992(+) A-I      intronic chr20:49483946(+) A-I      intronic chr20:49460796(+) A-I      intronic chr20:49477158(+) A-I      intronic chr20:49469808(+) A-I      intronic chr20:49424611(+) A-I      intronic chr20:49450972(+) A-I      intronic chr20:49460479(+) A-I      intronic chr20:49436568(+) A-I      intronic chr20:49479551(+) A-I      intronic chr20:49454991(+) A-I      intronic chr20:49455018(+) A-I      intronic chr20:49460448(+) A-I      intronic chr20:49469887(+) A-I      intronic chr20:49414571(+) A-I      intronic chr20:49453446(+) A-I      intronic chr20:49448961(+) A-I      intronic chr20:49477292(+) A-I      intronic chr20:49476614(+) A-I      intronic chr20:49419290(+) A-I      intronic chr20:49460860(+) A-I      intronic chr20:49448899(+) A-I      intronic chr20:49417802(+) A-I      intronic chr20:49456612(+) A-I      intronic chr20:49414604(+) A-I      intronic chr20:49484331(+) A-I      intronic chr20:49469917(+) A-I      intronic chr20:49492115(+) A-I      intronic chr20:49417282(+) A-I      intronic chr20:49433735(+) A-I      intronic chr20:49453891(+) A-I      intronic chr20:49412786(+) A-I      intronic chr20:49481509(+) A-I      intronic chr20:49456109(+) A-I      intronic chr20:49451882(+) A-I      intronic chr20:49459597(+) A-I      intronic chr20:49492096(+) A-I      intronic chr20:49464491(+) A-I      intronic chr20:49484017(+) A-I      intronic chr20:49475614(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	BCAS4	chr20:49452660(+) A-I intron -    22327324 chr20:49456825(+) A-I intron -    22327324 chr20:49417802(+) A-G intron -    22484847 chr20:49417803(+) A-G intron -    22484847 chr20:49427781(+) A-G intron -    22484847 chr20:49433741(+) T-C intron -    22484847 chr20:49433747(+) T-C intron -    22484847 chr20:49433748(+) T-C intron -    22484847 chr20:49452660(+) A-G intron -    22484847 chr20:49455167(+) A-G intron -    22484847 chr20:49455200(+) A-G intron -    22484847 chr20:49455223(+) A-G intron -    22484847 chr20:49456061(+) A-G intron -    22484847 chr20:49460448(+) A-G intron -    22484847 chr20:49460574(+) A-G intron -    22484847 chr20:49460856(+) A-G intron -    22484847 chr20:49460860(+) A-G intron -    22484847 chr20:49460864(+) A-G intron -    22484847 chr20:49460896(+) A-G intron -    22484847 chr20:49464396(+) A-G intron -    22484847 chr20:49475706(+) T-C intron -    22484847 chr20:49475716(+) T-C intron -    22484847 chr20:49477306(+) A-G intron -    22484847 chr20:49477315(+) A-G intron -    22484847 chr20:49492269(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	BCAS4	chr20:49411539-49411540(+) m6A CDS       24981863 chr20:49411603-49411604(+) m6A 5'UTR//CDS       24981863 chr20:49493504-49493505(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr20:49493528-49493529(+) m6A 3'UTR       25456834//24981863 chr20:49493537-49493538(+) m6A 3'UTR       25456834

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	BCAS4	Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H15
Interactor2: BCAS4

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//Rep//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg