Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00117169

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H14-3p:  MIMAT0014692          SPATS2L:  NM_001100424     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H14-3p	SPATS2L
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014692	26010
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	DNAPTP6//SGNP

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	SPATS2L	chr2:201184168(+) A-I      intronic chr2:201327391(+) A-I      intronic chr2:201191514(+) A-I      intronic chr2:201339133(+) A-I      intronic chr2:201190157(+) A-I      intronic chr2:201327407(+) A-I      intronic chr2:201327406(+) A-I      intronic chr2:201325599(+) A-I      intronic chr2:201190219(+) A-I      intronic chr2:201197190(+) A-I      intronic chr2:201325567(+) A-I      intronic chr2:201192006(+) A-I      intronic chr2:201253136(+) A-I      intronic chr2:201327357(+) A-I      intronic chr2:201253142(+) A-I      intronic chr2:201327368(+) A-I      intronic chr2:201202982(+) A-I      intronic chr2:201339300(+) A-I      intronic chr2:201284577(+) A-I      intronic chr2:201284500(+) A-I      intronic chr2:201253168(+) A-I      intronic chr2:201253139(+) A-I      intronic chr2:201253132(+) A-I      intronic chr2:201202983(+) A-I      intronic chr2:201325677(+) A-I      intronic chr2:201202931(+) A-I      intronic chr2:201284537(+) A-I      intronic chr2:201325757(+) A-I      intronic chr2:201327401(+) A-I      intronic chr2:201327459(+) A-I      intronic chr2:201327604(+) A-I      intronic chr2:201325742(+) A-I      intronic chr2:201288936(+) A-I      intronic chr2:201325629(+) A-I      intronic chr2:201295567(+) A-I      intronic chr2:201330552(+) A-I      intronic chr2:201330567(+) A-I      intronic chr2:201330612(+) A-I      intronic chr2:201338580(+) A-I      intronic chr2:201338584(+) A-I      intronic chr2:201339115(+) A-I      intronic chr2:201339147(+) A-I      intronic chr2:201292715(+) A-I      intronic chr2:201292618(+) A-I      intronic chr2:201291437(+) A-I      intronic chr2:201291365(+) A-I      intronic chr2:201287185(+) A-I      intronic chr2:201338489(+) A-I      intronic chr2:201338503(+) A-I      intronic chr2:201191877(+) A-I      intronic chr2:201291292(+) A-I      intronic chr2:201290931(+) A-I      intronic chr2:201290914(+) A-I      intronic chr2:201339171(+) A-I      intronic chr2:201202929(+) A-I      intronic chr2:201191872(+) A-I      intronic chr2:201191704(+) A-I      intronic chr2:201289028(+) A-I      intronic chr2:201292609(+) A-I      intronic chr2:201345210(+) A-I      3'UTR chr2:201346614(+) A-I      3'UTR chr2:201346602(+) A-I      3'UTR chr2:201180557(+) A-I      intronic chr2:201191597(+) A-I      intronic chr2:201339265(+) A-I      intronic chr2:201315780(+) A-I      intronic chr2:201339196(+) A-I      intronic chr2:201184073(+) A-I      intronic chr2:201327431(+) A-I      intronic chr2:201338703(+) A-I      intronic chr2:201191587(+) A-I      intronic chr2:201338465(+) A-I      intronic chr2:201191871(+) A-I      intronic chr2:201339159(+) A-I      intronic chr2:201253112(+) A-I      intronic chr2:201339131(+) A-I      intronic chr2:201277731(+) A-I      intronic chr2:201345266(+) A-I      3'UTR chr2:201345294(+) A-I      3'UTR chr2:201343727(+) A-I      3'UTR chr2:201346610(+) A-I      3'UTR chr2:201345177(+) A-I      3'UTR chr2:201214240(+) A-I      intronic chr2:201191738(+) A-I      intronic chr2:201191558(+) A-I      intronic chr2:201287206(+) A-I      intronic chr2:201338490(+) A-I      intronic chr2:201295541(+) A-I      intronic chr2:201338644(+) A-I      intronic chr2:201197888(+) A-I      intronic chr2:201197991(+) A-I      intronic chr2:201339218(+) A-I      intronic chr2:201338619(+) A-I      intronic chr2:201190241(+) A-I      intronic chr2:201253174(+) A-I      intronic chr2:201339134(+) A-I      intronic chr2:201284560(+) A-I      intronic chr2:201339287(+) A-I      intronic chr2:201253250(+) A-I      intronic chr2:201219301(+) A-I      intronic chr2:201339195(+) A-I      intronic chr2:201253133(+) A-I      intronic chr2:201250555(+) A-I      intronic chr2:201339169(+) A-I      intronic chr2:201286996(+) A-I      intronic chr2:201291327(+) A-I      intronic chr2:201291394(+) A-I      intronic chr2:201295621(+) A-I      intronic chr2:201253184(+) A-I      intronic chr2:201339220(+) A-I      intronic chr2:201190231(+) A-I      intronic chr2:201191557(+) A-I      intronic chr2:201338547(+) A-I      intronic chr2:201284479(+) A-I      intronic chr2:201339278(+) A-I      intronic chr2:201190202(+) A-I      intronic chr2:201191917(+) A-I      intronic chr2:201191575(+) A-I      intronic chr2:201327389(+) A-I      intronic chr2:201191744(+) A-I      intronic chr2:201191977(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	SPATS2L	chr2:201339104(+) A-I intron -    15342557 chr2:201339116(+) A-I intron -    15342557 chr2:201339131(+) A-I intron -    15342557 chr2:201339134(+) A-I intron -    15342557 chr2:201339141(+) A-I intron -    15342557 chr2:201339159(+) A-I intron -    15342557 chr2:201339169(+) A-I intron -    15342557 chr2:201339175(+) A-I intron -    15342557 chr2:201339265(+) A-I intron -    15342557 chr2:201339269(+) A-I intron -    15342557 chr2:201339278(+) A-I intron -    15342557 chr2:201339287(+) A-I intron -    15342557 chr2:201339288(+) A-I intron -    15342557 chr2:201340484(+) A-I intron -    15342557 chr2:201341632(+) A-I intron -    15342557 chr2:201329400(+) A-I intron -    21960545 chr2:201191738(+) A-G intron -    22484847 chr2:201197888(+) A-G intron -    22484847 chr2:201197991(+) A-G intron -    22484847 chr2:201206620(+) A-G intron -    22484847 chr2:201253032(+) A-G intron -    22484847 chr2:201284479(+) A-G intron -    22484847 chr2:201284560(+) A-G intron -    22484847 chr2:201287206(+) A-G intron -    22484847 chr2:201338490(+) A-G intron -    22484847 chr2:201339159(+) A-G intron -    22484847 chr2:201339169(+) A-G intron -    22484847 chr2:201339269(+) A-G intron -    22484847 chr2:201339278(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	SPATS2L	chr2:201171251-201171252(+) m6A 5'UTR//intron       24981863 chr2:201284030-201284031(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr2:201284114-201284115(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr2:201284145-201284146(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr2:201284190-201284191(+) m6A CDS       27773535 chr2:201303854-201303855(+) m6A CDS//intron       27773535 chr2:201303869-201303870(+) m6A CDS//intron       27773535 chr2:201303886-201303887(+) m6A CDS//intron       27773535 chr2:201303893-201303894(+) m6A CDS//intron       27773535 chr2:201303906-201303907(+) m6A CDS//intron       27773535 chr2:201303978-201303979(+) m6A CDS//intron       27773535 chr2:201337569-201337570(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535 chr2:201337586-201337587(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535 chr2:201337642-201337643(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535 chr2:201337704-201337705(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535 chr2:201337754-201337755(+) m6A CDS//exon//intron       24981863//27773535 chr2:201342486-201342487(+) m6A CDS//exon       24981863//26404942//27773535 chr2:201342495-201342496(+) m6A CDS//exon       24981863//26404942//27773535 chr2:201342524-201342525(+) m6A CDS//exon       24981863 chr2:201342568-201342569(+) m6A CDS//exon       24981863 chr2:201342623-201342624(+) m6A CDS//exon       - chr2:201343132-201343133(+) m6A 3'UTR       27773535 chr2:201343152-201343153(+) m6A 3'UTR       27773535 chr2:201343228-201343229(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	SPATS2L	Chromatin K562 cells     - Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Cytosol HCC cell line (HepG2)     - Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Nucleus HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H14-3p
Interactor2: SPATS2L

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//Rep//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg