Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00117038

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H14-3p:  MIMAT0014692          SYT11:  NM_152280     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H14-3p	SYT11
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014692	23208
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	SYT12//sytXI

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	SYT11	chr1:155853099(+) A-I      3'UTR chr1:155851594(+) A-I      3'UTR chr1:155851599(+) A-I      3'UTR chr1:155851575(+) A-I      3'UTR chr1:155845312(+) A-I      intronic chr1:155839118(+) A-I      intronic chr1:155843008(+) A-I      intronic chr1:155851538(+) A-I      3'UTR chr1:155845269(+) A-I      intronic chr1:155853307(+) A-I      3'UTR chr1:155853305(+) A-I      3'UTR chr1:155839092(+) A-I      intronic chr1:155853266(+) A-I      3'UTR chr1:155853173(+) A-I      3'UTR chr1:155853172(+) A-I      3'UTR chr1:155853169(+) A-I      3'UTR chr1:155853165(+) A-I      3'UTR chr1:155853148(+) A-I      3'UTR chr1:155853075(+) A-I      3'UTR chr1:155851796(+) A-I      3'UTR chr1:155843203(+) A-I      intronic chr1:155835268(+) A-I      intronic chr1:155833105(+) A-I      intronic chr1:155835298(+) A-I      intronic chr1:155851717(+) A-I      3'UTR chr1:155839243(+) A-I      intronic chr1:155846966(+) A-I      intronic chr1:155851686(+) A-I      3'UTR chr1:155843031(+) A-I      intronic chr1:155849868(+) A-I      intronic chr1:155842990(+) A-I      intronic chr1:155839277(+) A-I      intronic chr1:155847959(+) A-I      intronic chr1:155843990(+) A-I      intronic chr1:155846299(+) A-I      intronic chr1:155848958(+) A-I      intronic chr1:155845415(+) A-I      intronic chr1:155847425(+) A-I      intronic chr1:155845360(+) A-I      intronic chr1:155844669(+) A-I      intronic chr1:155847033(+) A-I      intronic chr1:155853070(+) A-I      3'UTR chr1:155844306(+) A-I      intronic chr1:155853123(+) A-I      3'UTR chr1:155853241(+) A-I      3'UTR chr1:155853053(+) A-I      3'UTR chr1:155844166(+) A-I      intronic chr1:155846716(+) A-I      intronic chr1:155845461(+) A-I      intronic chr1:155843834(+) A-I      intronic chr1:155844879(+) A-I      intronic chr1:155847471(+) A-I      intronic chr1:155847852(+) A-I      intronic chr1:155844129(+) A-I      intronic chr1:155844884(+) A-I      intronic chr1:155835164(+) A-I      intronic chr1:155844988(+) A-I      intronic chr1:155853149(+) A-I      3'UTR chr1:155835608(+) A-I      intronic chr1:155851782(+) A-I      3'UTR chr1:155847621(+) A-I      intronic chr1:155835555(+) A-I      intronic chr1:155835263(+) A-I      intronic chr1:155851600(+) A-I      3'UTR chr1:155853147(+) A-I      3'UTR chr1:155853179(+) A-I      3'UTR chr1:155845403(+) A-I      intronic chr1:155835209(+) A-I      intronic chr1:155847554(+) A-I      intronic chr1:155839291(+) A-I      intronic chr1:155853180(+) A-I      3'UTR chr1:155839246(+) A-I      intronic chr1:155853257(+) A-I      3'UTR chr1:155835656(+) A-I      intronic chr1:155833886(+) A-I      intronic chr1:155851669(+) A-I      3'UTR chr1:155846663(+) A-I      intronic chr1:155853219(+) A-I      3'UTR chr1:155851646(+) A-I      3'UTR chr1:155845467(+) A-I      intronic chr1:155851704(+) A-I      3'UTR chr1:155843967(+) A-I      intronic chr1:155844036(+) A-I      intronic chr1:155835340(+) A-I      intronic chr1:155843055(+) A-I      intronic chr1:155844004(+) A-I      intronic chr1:155844791(+) A-I      intronic chr1:155844965(+) A-I      intronic chr1:155853246(+) A-I      3'UTR chr1:155853197(+) A-I      3'UTR chr1:155846268(+) A-I      intronic chr1:155853174(+) A-I      3'UTR chr1:155845379(+) A-I      intronic chr1:155847913(+) A-I      intronic chr1:155845376(+) A-I      intronic chr1:155834606(+) A-I      intronic chr1:155853251(+) A-I      3'UTR chr1:155853126(+) A-I      3'UTR chr1:155853154(+) A-I      3'UTR chr1:155847828(+) A-I      intronic chr1:155853100(+) A-I      3'UTR chr1:155851781(+) A-I      3'UTR chr1:155833899(+) A-I      intronic chr1:155851619(+) A-I      3'UTR chr1:155848401(+) A-I      intronic chr1:155853228(+) A-I      3'UTR chr1:155846802(+) A-I      intronic chr1:155844882(+) A-I      intronic chr1:155851706(+) A-I      3'UTR chr1:155846311(+) A-I      intronic chr1:155851613(+) A-I      3'UTR chr1:155848004(+) A-I      intronic chr1:155844821(+) A-I      intronic chr1:155834631(+) A-I      intronic chr1:155853280(+) A-I      3'UTR chr1:155835530(+) A-I      intronic chr1:155846677(+) A-I      intronic chr1:155853183(+) A-I      3'UTR chr1:155846694(+) A-I      intronic chr1:155847800(+) A-I      intronic chr1:155844868(+) A-I      intronic chr1:155845485(+) A-I      intronic chr1:155843850(+) A-I      intronic chr1:155846298(+) A-I      intronic chr1:155835299(+) A-I      intronic chr1:155851620(+) A-I      3'UTR chr1:155833347(+) A-I      intronic chr1:155851701(+) A-I      3'UTR chr1:155851803(+) A-I      3'UTR chr1:155853163(+) A-I      3'UTR chr1:155851685(+) A-I      3'UTR chr1:155845226(+) A-I      intronic chr1:155844923(+) A-I      intronic chr1:155851576(+) A-I      3'UTR chr1:155853160(+) A-I      3'UTR chr1:155853061(+) A-I      3'UTR chr1:155839328(+) A-I      intronic chr1:155834641(+) A-I      intronic chr1:155851645(+) A-I      3'UTR chr1:155853110(+) A-I      3'UTR chr1:155847848(+) A-I      intronic chr1:155839131(+) A-I      intronic chr1:155853175(+) A-I      3'UTR chr1:155835581(+) A-I      intronic chr1:155849784(+) A-I      intronic chr1:155851729(+) A-I      3'UTR chr1:155848621(+) A-I      intronic chr1:155849153(+) A-I      intronic chr1:155844946(+) A-I      intronic chr1:155853176(+) A-I      3'UTR chr1:155847615(+) A-I      intronic chr1:155848410(+) A-I      intronic chr1:155846176(+) A-I      intronic chr1:155851637(+) A-I      3'UTR chr1:155848983(+) A-I      intronic chr1:155843842(+) A-I      intronic chr1:155853124(+) A-I      3'UTR chr1:155846244(+) A-I      intronic chr1:155847872(+) A-I      intronic chr1:155851754(+) A-I      3'UTR chr1:155847978(+) A-I      intronic chr1:155833107(+) A-I      intronic chr1:155844885(+) A-I      intronic chr1:155851794(+) A-I      3'UTR chr1:155833664(+) A-I      intronic chr1:155839268(+) A-I      intronic chr1:155853069(+) A-I      3'UTR chr1:155842941(+) A-I      intronic chr1:155851624(+) A-I      3'UTR chr1:155846608(+) A-I      intronic chr1:155853164(+) A-I      3'UTR chr1:155845361(+) A-I      intronic chr1:155833123(+) A-I      intronic chr1:155853115(+) A-I      3'UTR chr1:155833305(+) A-I      intronic chr1:155843052(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	SYT11	chr1:155851576(+) A-I intron -    22327324 chr1:155851620(+) A-I intron -    22327324 chr1:155851637(+) A-I intron -    22327324 chr1:155853246(+) A-I intron -    22327324 chr1:155851620(+) A-G intron -    21725310   //22484847 chr1:155853061(+) A-G intron -    21725310   //22484847 chr1:155853219(+) A-G intron -    21725310   //22484847 chr1:155839246(+) A-G intron -    22484847 chr1:155839268(+) A-G intron -    22484847 chr1:155839277(+) A-G intron -    22484847 chr1:155843967(+) A-G intron -    22484847 chr1:155843990(+) A-G intron -    22484847 chr1:155844004(+) A-G intron -    22484847 chr1:155844036(+) A-G intron -    22484847 chr1:155844129(+) A-G intron -    22484847 chr1:155844166(+) A-G intron -    22484847 chr1:155846244(+) A-G intron -    22484847 chr1:155846299(+) A-G intron -    22484847 chr1:155847554(+) A-G intron -    22484847 chr1:155847978(+) A-G intron -    22484847 chr1:155851563(+) G-A intron -    22484847 chr1:155851576(+) A-G intron -    22484847 chr1:155851613(+) A-G intron -    22484847 chr1:155851619(+) A-G intron -    22484847 chr1:155851637(+) A-G intron -    22484847 chr1:155851645(+) A-G intron -    22484847 chr1:155851646(+) A-G intron -    22484847 chr1:155851685(+) A-G intron -    22484847 chr1:155851754(+) A-G intron -    22484847 chr1:155851782(+) A-G intron -    22484847 chr1:155851794(+) A-G intron -    22484847 chr1:155853069(+) A-G intron -    22484847 chr1:155853100(+) A-G intron -    22484847 chr1:155853115(+) A-G intron -    22484847 chr1:155853123(+) A-G intron -    22484847 chr1:155853126(+) A-G intron -    22484847 chr1:155853154(+) A-G intron -    22484847 chr1:155853163(+) A-G intron -    22484847 chr1:155853228(+) A-G intron -    22484847 chr1:155853246(+) A-G intron -    22484847 chr1:155853251(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	SYT11	chr1:155829326-155829327(+) m6A 5'UTR       24981863 chr1:155829411-155829412(+) m6A 5'UTR       24981863 chr1:155837869-155837870(+) m6A CDS       24209618//24981863//22608085 chr1:155837922-155837923(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr1:155837962-155837963(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr1:155837998-155837999(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr1:155838040-155838041(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr1:155838079-155838080(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr1:155838100-155838101(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr1:155838113-155838114(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr1:155838156-155838157(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr1:155838217-155838218(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr1:155838291-155838292(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//22608085 chr1:155838354-155838355(+) m6A CDS       24209618 chr1:155838372-155838373(+) m6A CDS       24209618 chr1:155838379-155838380(+) m6A CDS       24209618 chr1:155838396-155838397(+) m6A CDS       - chr1:155851854-155851855(+) m6A 3'UTR       24981863 chr1:155851871-155851872(+) m6A 3'UTR       24981863 chr1:155852317-155852318(+) m6A 3'UTR       24981863 chr1:155852346-155852347(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr1:155852361-155852362(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr1:155852369-155852370(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr1:155852385-155852386(+) m6A 3'UTR       24981863 chr1:155852417-155852418(+) m6A 3'UTR       24981863 chr1:155852450-155852451(+) m6A 3'UTR       24981863 chr1:155852491-155852492(+) m6A 3'UTR       24981863 chr1:155854517-155854518(+) m6A 3'UTR       - chr1:155854600-155854601(+) m6A 3'UTR       25456834 chr1:155854612-155854613(+) m6A 3'UTR       25456834 chr1:155854632-155854633(+) m6A 3'UTR       25456834 chr1:155854641-155854642(+) m6A 3'UTR       25456834 chr1:155854654-155854655(+) m6A 3'UTR       25456834

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	SYT11	Cytoplasm Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841 Exosome Blood     - Nucleus Nasopharyngeal carcinoma cells     20498841

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H14-3p
Interactor2: SYT11

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//PITA//Rep//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg