Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00116871

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H14-3p:  MIMAT0014692          POP1:  NM_001145860     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H14-3p	POP1
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014692	10940
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	ANXD2

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	POP1	chr8:99151155(+) A-I      intronic chr8:99137597(+) A-I      intronic chr8:99156670(+) A-I      intronic chr8:99156298(+) A-I      intronic chr8:99148121(+) A-I      intronic chr8:99151104(+) A-I      intronic chr8:99148402(+) A-I      intronic chr8:99148172(+) A-I      intronic chr8:99158003(+) A-I      intronic chr8:99156724(+) A-I      intronic chr8:99149716(+) A-I      intronic chr8:99156669(+) A-I      intronic chr8:99156280(+) A-I      intronic chr8:99158435(+) A-I      intronic chr8:99147359(+) A-I      intronic chr8:99147363(+) A-I      intronic chr8:99156567(+) A-I      intronic chr8:99151767(+) A-I      intronic chr8:99151161(+) A-I      intronic chr8:99158118(+) A-I      intronic chr8:99156631(+) A-I      intronic chr8:99157355(+) A-I      intronic chr8:99151865(+) A-I      intronic chr8:99156293(+) A-I      intronic chr8:99156645(+) A-I      intronic chr8:99151359(+) A-I      intronic chr8:99137514(+) A-I      intronic chr8:99149556(+) A-I      intronic chr8:99156738(+) A-I      intronic chr8:99158433(+) A-I      intronic chr8:99156583(+) A-I      intronic chr8:99156771(+) A-I      intronic chr8:99151743(+) A-I      intronic chr8:99138339(+) A-I      intronic chr8:99157317(+) A-I      intronic chr8:99149660(+) A-I      intronic chr8:99157326(+) A-I      intronic chr8:99156616(+) A-I      intronic chr8:99151181(+) A-I      intronic chr8:99151220(+) A-I      intronic chr8:99151816(+) A-I      intronic chr8:99156206(+) A-I      intronic chr8:99147274(+) A-I      intronic chr8:99149631(+) A-I      intronic chr8:99157876(+) A-I      intronic chr8:99156764(+) A-I      intronic chr8:99156237(+) A-I      intronic chr8:99156127(+) A-I      intronic chr8:99151788(+) A-I      intronic chr8:99156755(+) A-I      intronic chr8:99156347(+) A-I      intronic chr8:99151877(+) A-I      intronic chr8:99151106(+) A-I      intronic chr8:99151808(+) A-I      intronic chr8:99135796(+) A-I      intronic chr8:99147395(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	POP1	chr8:99134059(+) C-T intron -    22484847 chr8:99135796(+) A-G intron -    22484847 chr8:99137514(+) A-G intron -    22484847 chr8:99137543(+) A-G intron -    22484847 chr8:99147274(+) A-G intron -    22484847 chr8:99151161(+) A-G intron -    22484847 chr8:99151181(+) A-G intron -    22484847 chr8:99151184(+) A-G intron -    22484847 chr8:99151185(+) A-G intron -    22484847 chr8:99151220(+) A-G intron -    22484847 chr8:99151743(+) A-G intron -    22484847 chr8:99151808(+) A-G intron -    22484847 chr8:99151816(+) A-G intron -    22484847 chr8:99156237(+) A-G intron -    22484847 chr8:99156261(+) A-G intron -    22484847 chr8:99156280(+) A-G intron -    22484847 chr8:99156290(+) A-G intron -    22484847 chr8:99156559(+) A-G intron -    22484847 chr8:99156567(+) A-G intron -    22484847 chr8:99156583(+) A-G intron -    22484847 chr8:99156616(+) A-G intron -    22484847 chr8:99156631(+) A-G intron -    22484847 chr8:99156645(+) A-G intron -    22484847 chr8:99156723(+) A-G intron -    22484847 chr8:99156738(+) A-G intron -    22484847 chr8:99156755(+) A-G intron -    22484847 chr8:99156764(+) A-G intron -    22484847 chr8:99156765(+) A-G intron -    22484847 chr8:99156771(+) A-G intron -    22484847 chr8:99157317(+) A-G intron -    22484847 chr8:99157326(+) A-G intron -    22484847 chr8:99157355(+) A-G intron -    22484847 chr8:99158013(+) A-G intron -    22484847 chr8:99158019(+) A-G intron -    22484847 chr8:99167970(+) G-A intron -    22484847 chr8:99168033(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	POP1	chr8:99135588-99135589(+) m6A CDS       24981863 chr8:99135608-99135609(+) m6A CDS       24981863 chr8:99140681-99140682(+) m6A CDS       24981863 chr8:99142234-99142235(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535 chr8:99142278-99142279(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535 chr8:99142303-99142304(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535 chr8:99142314-99142315(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535 chr8:99142328-99142329(+) m6A CDS       24284625//24981863 chr8:99142437-99142438(+) m6A CDS       24284625 chr8:99148750-99148751(+) m6A CDS       24981863 chr8:99148814-99148815(+) m6A CDS       24981863 chr8:99148879-99148880(+) m6A CDS       24981863 chr8:99148907-99148908(+) m6A CDS       24981863 chr8:99168600-99168601(+) m6A CDS//exon       24981863 chr8:99170068-99170069(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr8:99170089-99170090(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr8:99170120-99170121(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr8:99170153-99170154(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085 chr8:99170307-99170308(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085 chr8:99170956-99170957(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr8:99170992-99170993(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr8:99171023-99171024(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr8:99171996-99171997(+) m6A 3'UTR       27773535 chr8:99172011-99172012(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	POP1	Chromatin K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleoplasm K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H14-3p
Interactor2: POP1

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg