Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00116190

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2483

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H14-3p:  MIMAT0014692          RALA:  NM_005402     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H14-3p	RALA
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014692	5898
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	RAL

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	RALA	chr7:39715759(+) A-I      intronic chr7:39715866(+) A-I      intronic chr7:39719366(+) A-I      intronic chr7:39719519(+) A-I      intronic chr7:39719720(+) A-I      intronic chr7:39726932(+) A-I      intronic chr7:39726947(+) A-I      intronic chr7:39726967(+) A-I      intronic chr7:39727814(+) A-I      intronic chr7:39728872(+) A-I      intronic chr7:39734386(+) A-I      intronic chr7:39734410(+) A-I      intronic chr7:39734413(+) A-I      intronic chr7:39734441(+) A-I      intronic chr7:39734503(+) A-I      intronic chr7:39734645(+) A-I      intronic chr7:39741038(+) A-I      intronic chr7:39744021(+) A-I      intronic chr7:39744046(+) A-I      intronic chr7:39744053(+) A-I      intronic chr7:39744164(+) A-I      intronic chr7:39744169(+) A-I      intronic chr7:39744458(+) A-I      intronic chr7:39744472(+) A-I      intronic chr7:39744475(+) A-I      intronic chr7:39744489(+) A-I      intronic chr7:39668320(+) A-I      intronic chr7:39714540(+) A-I      intronic chr7:39727932(+) A-I      intronic chr7:39743618(+) A-I      intronic chr7:39743697(+) A-I      intronic chr7:39672357(+) A-I      intronic chr7:39672365(+) A-I      intronic chr7:39672370(+) A-I      intronic chr7:39734465(+) A-I      intronic chr7:39691691(+) A-I      intronic chr7:39691703(+) A-I      intronic chr7:39668248(+) A-I      intronic chr7:39668255(+) A-I      intronic chr7:39672153(+) A-I      intronic chr7:39672161(+) A-I      intronic chr7:39672162(+) A-I      intronic chr7:39672309(+) A-I      intronic chr7:39672331(+) A-I      intronic chr7:39672336(+) A-I      intronic chr7:39672341(+) A-I      intronic chr7:39674671(+) A-I      intronic chr7:39674711(+) A-I      intronic chr7:39674755(+) A-I      intronic chr7:39674812(+) A-I      intronic chr7:39674814(+) A-I      intronic chr7:39674823(+) A-I      intronic chr7:39674863(+) A-I      intronic chr7:39677754(+) A-I      intronic chr7:39685847(+) A-I      intronic chr7:39685879(+) A-I      intronic chr7:39686116(+) A-I      intronic chr7:39686903(+) A-I      intronic chr7:39686916(+) A-I      intronic chr7:39688431(+) A-I      intronic chr7:39692514(+) A-I      intronic chr7:39692522(+) A-I      intronic chr7:39694429(+) A-I      intronic chr7:39694443(+) A-I      intronic chr7:39694545(+) A-I      intronic chr7:39696711(+) A-I      intronic chr7:39709225(+) A-I      intronic chr7:39709762(+) A-I      intronic chr7:39709793(+) A-I      intronic chr7:39709795(+) A-I      intronic chr7:39709884(+) A-I      intronic chr7:39710009(+) A-I      intronic chr7:39712640(+) A-I      intronic chr7:39714476(+) A-I      intronic chr7:39714523(+) A-I      intronic chr7:39715064(+) A-I      intronic chr7:39734531(+) A-I      intronic chr7:39709929(+) A-I      intronic chr7:39698365(+) A-I      intronic chr7:39735042(+) A-I      intronic chr7:39720055(+) A-I      intronic chr7:39734507(+) A-I      intronic chr7:39744056(+) A-I      intronic chr7:39685769(+) A-I      intronic chr7:39744082(+) A-I      intronic chr7:39743763(+) A-I      intronic chr7:39709857(+) A-I      intronic chr7:39720157(+) A-I      intronic chr7:39719490(+) A-I      intronic chr7:39685834(+) A-I      intronic chr7:39674715(+) A-I      intronic chr7:39696644(+) A-I      intronic chr7:39714562(+) A-I      intronic chr7:39709173(+) A-I      intronic chr7:39709981(+) A-I      intronic chr7:39677767(+) A-I      intronic chr7:39715244(+) A-I      intronic chr7:39719373(+) A-I      intronic chr7:39712608(+) A-I      intronic chr7:39709781(+) A-I      intronic chr7:39674784(+) A-I      intronic chr7:39719705(+) A-I      intronic chr7:39727894(+) A-I      intronic chr7:39685825(+) A-I      intronic chr7:39743555(+) A-I      intronic chr7:39728299(+) A-I      intronic chr7:39735059(+) A-I      intronic chr7:39715181(+) A-I      intronic chr7:39735139(+) A-I      intronic chr7:39715850(+) A-I      intronic chr7:39712609(+) A-I      intronic chr7:39715704(+) A-I      intronic chr7:39685972(+) A-I      intronic chr7:39744034(+) A-I      intronic chr7:39719427(+) A-I      intronic chr7:39719410(+) A-I      intronic chr7:39715129(+) A-I      intronic chr7:39715781(+) A-I      intronic chr7:39709210(+) A-I      intronic chr7:39744016(+) A-I      intronic chr7:39709201(+) A-I      intronic chr7:39719713(+) A-I      intronic chr7:39714647(+) A-I      intronic chr7:39727793(+) A-I      intronic chr7:39715204(+) A-I      intronic chr7:39685771(+) A-I      intronic chr7:39728273(+) A-I      intronic chr7:39735225(+) A-I      intronic chr7:39728228(+) A-I      intronic chr7:39734456(+) A-I      intronic chr7:39709845(+) A-I      intronic chr7:39734646(+) A-I      intronic chr7:39709936(+) A-I      intronic chr7:39715165(+) A-I      intronic chr7:39725684(+) A-I      intronic chr7:39715169(+) A-I      intronic chr7:39709980(+) A-I      intronic chr7:39709998(+) A-I      intronic chr7:39714527(+) A-I      intronic chr7:39744294(+) A-I      intronic chr7:39734504(+) A-I      intronic chr7:39715214(+) A-I      intronic chr7:39712625(+) A-I      intronic chr7:39744015(+) A-I      intronic chr7:39715218(+) A-I      intronic chr7:39668281(+) A-I      intronic chr7:39743536(+) A-I      intronic chr7:39725619(+) A-I      intronic chr7:39696861(+) A-I      intronic chr7:39715062(+) A-I      intronic chr7:39672152(+) A-I      intronic chr7:39686709(+) A-I      intronic chr7:39712793(+) A-I      intronic chr7:39734578(+) A-I      intronic chr7:39709966(+) A-I      intronic chr7:39719493(+) A-I      intronic chr7:39714492(+) A-I      intronic chr7:39729267(+) A-I      intronic chr7:39686665(+) A-I      intronic chr7:39709338(+) A-I      intronic chr7:39686768(+) A-I      intronic chr7:39719853(+) A-I      intronic chr7:39743550(+) A-I      intronic chr7:39686746(+) A-I      intronic chr7:39715288(+) A-I      intronic chr7:39735075(+) A-I      intronic chr7:39709209(+) A-I      intronic chr7:39735242(+) A-I      intronic chr7:39686721(+) A-I      intronic chr7:39686745(+) A-I      intronic chr7:39743982(+) A-I      intronic chr7:39743990(+) A-I      intronic chr7:39744414(+) A-I      intronic chr7:39727783(+) A-I      intronic chr7:39688498(+) A-I      intronic chr7:39668258(+) A-I      intronic chr7:39734665(+) A-I      intronic chr7:39685778(+) A-I      intronic chr7:39725744(+) A-I      intronic chr7:39709798(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	RALA	chr7:39677815(+) A-I intron -    21960545 chr7:39691619(+) A-G intron -    22484847 chr7:39724617(+) A-G intron -    22484847 chr7:39668258(+) A-G intron -    22484847 chr7:39668281(+) A-G intron -    22484847 chr7:39668284(+) A-G intron -    22484847 chr7:39668336(+) A-G intron -    22484847 chr7:39669062(+) G-A intron -    22484847 chr7:39669287(+) T-C intron -    22484847 chr7:39669808(+) A-T intron -    22484847 chr7:39669809(+) A-T intron -    22484847 chr7:39674715(+) A-G intron -    22484847 chr7:39674716(+) A-G intron -    22484847 chr7:39674720(+) A-G intron -    22484847 chr7:39674724(+) A-G intron -    22484847 chr7:39674784(+) A-G intron -    22484847 chr7:39685769(+) A-G intron -    22484847 chr7:39685771(+) A-G intron -    22484847 chr7:39685778(+) A-G intron -    22484847 chr7:39685807(+) A-G intron -    22484847 chr7:39685825(+) A-G intron -    22484847 chr7:39685834(+) A-G intron -    22484847 chr7:39685844(+) A-G intron -    22484847 chr7:39685972(+) A-G intron -    22484847 chr7:39686673(+) A-G intron -    22484847 chr7:39686709(+) A-G intron -    22484847 chr7:39686721(+) A-G intron -    22484847 chr7:39686745(+) A-G intron -    22484847 chr7:39686746(+) A-G intron -    22484847 chr7:39686768(+) A-G intron -    22484847 chr7:39686775(+) A-G intron -    22484847 chr7:39688498(+) A-G intron -    22484847 chr7:39698365(+) A-G intron -    22484847 chr7:39698441(+) T-C intron -    22484847 chr7:39698442(+) G-A intron -    22484847 chr7:39709173(+) A-G intron -    22484847 chr7:39709201(+) A-G intron -    22484847 chr7:39709209(+) A-G intron -    22484847 chr7:39709210(+) A-G intron -    22484847 chr7:39709291(+) A-G intron -    22484847 chr7:39709781(+) A-G intron -    22484847 chr7:39709794(+) A-G intron -    22484847 chr7:39709798(+) A-G intron -    22484847 chr7:39709845(+) A-G intron -    22484847 chr7:39709857(+) A-G intron -    22484847 chr7:39709878(+) A-G intron -    22484847 chr7:39709966(+) A-G intron -    22484847 chr7:39709980(+) A-G intron -    22484847 chr7:39709981(+) A-G intron -    22484847 chr7:39709998(+) A-G intron -    22484847 chr7:39712608(+) A-G intron -    22484847 chr7:39712609(+) A-G intron -    22484847 chr7:39712625(+) A-G intron -    22484847 chr7:39714492(+) A-G intron -    22484847 chr7:39714527(+) A-G intron -    22484847 chr7:39715704(+) A-G intron -    22484847 chr7:39715781(+) A-G intron -    22484847 chr7:39719373(+) A-G intron -    22484847 chr7:39719410(+) A-G intron -    22484847 chr7:39719427(+) A-G intron -    22484847 chr7:39719490(+) A-G intron -    22484847 chr7:39719493(+) A-G intron -    22484847 chr7:39727890(+) A-G intron -    22484847 chr7:39727894(+) A-G intron -    22484847 chr7:39728228(+) A-G intron -    22484847 chr7:39728232(+) A-G intron -    22484847 chr7:39728242(+) A-G intron -    22484847 chr7:39728273(+) A-G intron -    22484847 chr7:39728299(+) A-G intron -    22484847 chr7:39728302(+) A-G intron -    22484847 chr7:39728827(+) A-G intron -    22484847 chr7:39728844(+) A-G intron -    22484847 chr7:39734507(+) A-G intron -    22484847 chr7:39734646(+) A-G intron -    22484847 chr7:39735042(+) A-G intron -    22484847 chr7:39735139(+) A-G intron -    22484847 chr7:39735183(+) A-G intron -    22484847 chr7:39735242(+) A-G intron -    22484847 chr7:39743982(+) A-G intron -    22484847 chr7:39743990(+) A-G intron -    22484847 chr7:39744034(+) A-G intron -    22484847 chr7:39744056(+) A-G intron -    22484847 chr7:39744082(+) A-G intron -    22484847 chr7:39744494(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	RALA	chr7:39663113-39663114(+) m6A 5'UTR       24981863 chr7:39663300-39663301(+) m6A 5'UTR//exon       24284625//25456834//24981863 chr7:39663347-39663348(+) m6A 5'UTR//exon       24284625//25456834//24981863 chr7:39663407-39663408(+) m6A 5'UTR//exon       24981863 chr7:39729990-39729991(+) m6A CDS//intron       22575960 chr7:39730011-39730012(+) m6A CDS//intron       22575960 chr7:39730035-39730036(+) Tm CDS//intron       - chr7:39736364-39736365(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535 chr7:39736390-39736391(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535 chr7:39736425-39736426(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535 chr7:39736437-39736438(+) m6A CDS//exon       24981863//27773535 chr7:39737023-39737024(+) m6A 3'UTR//intron       24981863//27773535 chr7:39737035-39737036(+) m6A 3'UTR//intron       24981863//27773535 chr7:39737069-39737070(+) m6A 3'UTR//intron       27773535 chr7:39737091-39737092(+) m6A 3'UTR//intron       27773535 chr7:39745767-39745768(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535//22608085 chr7:39745855-39745856(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//27773535//22608085 chr7:39745980-39745981(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//27773535//22608085 chr7:39747580-39747581(+) m6A 3'UTR       24284625

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	RALA	Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HeLa-S3 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)     - Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H14-3p
Interactor2: RALA

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//Rep//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg