Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00115670

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H14-3p:  MIMAT0014692          DOCK2:  NR_156756     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H14-3p	DOCK2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014692	1794
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	IMD40

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	DOCK2	chr5:169280037(+) A-I      intronic chr5:169279962(+) A-I      intronic chr5:169278796(+) A-I      intronic chr5:169356600(+) A-I      intronic chr5:169236257(+) A-I      intronic chr5:169236195(+) A-I      intronic chr5:169236095(+) A-I      intronic chr5:169345823(+) A-I      intronic chr5:169236065(+) A-I      intronic chr5:169352490(+) A-I      intronic chr5:169352347(+) A-I      intronic chr5:169345901(+) A-I      intronic chr5:169345806(+) A-I      intronic chr5:169345797(+) A-I      intronic chr5:169335823(+) A-I      intronic chr5:169335822(+) A-I      intronic chr5:169335819(+) A-I      intronic chr5:169335818(+) A-I      intronic chr5:169335799(+) A-I      intronic chr5:169335788(+) A-I      intronic chr5:169333523(+) A-I      intronic chr5:169318941(+) A-I      intronic chr5:169285718(+) A-I      intronic chr5:169285702(+) A-I      intronic chr5:169318769(+) A-I      intronic chr5:169287070(+) A-I      intronic chr5:169287048(+) A-I      intronic chr5:169286000(+) A-I      intronic chr5:169270491(+) A-I      intronic chr5:169144819(+) A-I      intronic chr5:169136602(+) A-I      intronic chr5:169136521(+) A-I      intronic chr5:169136458(+) A-I      intronic chr5:169135724(+) A-I      intronic chr5:169318928(+) A-I      intronic chr5:169270447(+) A-I      intronic chr5:169270422(+) A-I      intronic chr5:169270367(+) A-I      intronic chr5:169270350(+) A-I      intronic chr5:169118960(+) A-I      intronic chr5:169085823(+) A-I      intronic chr5:169083498(+) A-I      intronic chr5:169083372(+) A-I      intronic chr5:169285699(+) A-I      intronic chr5:169368329(+) A-I      intronic chr5:169417381(+) A-I      intronic chr5:169475276(+) A-I      intronic chr5:169476293(+) A-I      intronic chr5:169318815(+) A-I      intronic chr5:169318777(+) A-I      intronic chr5:169318920(+) A-I      intronic chr5:169318836(+) A-I      intronic chr5:169135790(+) A-I      intronic chr5:169177844(+) A-I      intronic chr5:169233375(+) A-I      intronic chr5:169352509(+) A-I      intronic chr5:169280175(+) A-I      intronic chr5:169269593(+) A-I      intronic chr5:169178156(+) A-I      intronic chr5:169178183(+) A-I      intronic chr5:169178184(+) A-I      intronic chr5:169178186(+) A-I      intronic chr5:169269504(+) A-I      intronic chr5:169233283(+) A-I      intronic chr5:169178191(+) A-I      intronic chr5:169229292(+) A-I      intronic chr5:169280114(+) A-I      intronic chr5:169280086(+) A-I      intronic chr5:169193828(+) A-I      intronic chr5:169182046(+) A-I      intronic chr5:169157939(+) A-I      intronic chr5:169157935(+) A-I      intronic chr5:169144924(+) A-I      intronic chr5:169352463(+) A-I      intronic chr5:169352423(+) A-I      intronic chr5:169352422(+) A-I      intronic chr5:169352408(+) A-I      intronic chr5:169318921(+) A-I      intronic chr5:169318912(+) A-I      intronic chr5:169318879(+) A-I      intronic chr5:169318872(+) A-I      intronic chr5:169318772(+) A-I      intronic chr5:169318771(+) A-I      intronic chr5:169318755(+) A-I      intronic chr5:169352533(+) A-I      intronic chr5:169354750(+) A-I      intronic chr5:169354760(+) A-I      intronic chr5:169354762(+) A-I      intronic chr5:169354827(+) A-I      intronic chr5:169357124(+) A-I      intronic chr5:169287184(+) A-I      intronic chr5:169107604(+) A-I      intronic chr5:169085793(+) A-I      intronic chr5:169136433(+) A-I      intronic chr5:169136646(+) A-I      intronic chr5:169356626(+) A-I      intronic chr5:169107669(+) A-I      intronic chr5:169233336(+) A-I      intronic chr5:169269491(+) A-I      intronic chr5:169233374(+) A-I      intronic chr5:169287203(+) A-I      intronic chr5:169269415(+) A-I      intronic chr5:169333571(+) A-I      intronic chr5:169285733(+) A-I      intronic chr5:169132016(+) A-I      intronic chr5:169357022(+) A-I      intronic chr5:169269542(+) A-I      intronic chr5:169352464(+) A-I      intronic chr5:169083467(+) A-I      intronic chr5:169083407(+) A-I      intronic chr5:169135773(+) A-I      intronic chr5:169333556(+) A-I      intronic chr5:169269436(+) A-I      intronic chr5:169285871(+) A-I      intronic chr5:169135592(+) A-I      intronic chr5:169356666(+) A-I      intronic chr5:169232176(+) A-I      intronic chr5:169135711(+) A-I      intronic chr5:169083457(+) A-I      intronic chr5:169083470(+) A-I      intronic chr5:169270366(+) A-I      intronic chr5:169233353(+) A-I      intronic chr5:169285970(+) A-I      intronic chr5:169136700(+) A-I      intronic chr5:169135804(+) A-I      intronic chr5:169270365(+) A-I      intronic chr5:169135708(+) A-I      intronic chr5:169233338(+) A-I      intronic chr5:169287198(+) A-I      intronic chr5:169135789(+) A-I      intronic chr5:169135752(+) A-I      intronic chr5:169182041(+) A-I      intronic chr5:169287211(+) A-I      intronic chr5:169269385(+) A-I      intronic chr5:169476319(+) A-I      intronic chr5:169269479(+) A-I      intronic chr5:169236020(+) A-I      intronic chr5:169357134(+) A-I      intronic chr5:169269448(+) A-I      intronic chr5:169476219(+) A-I      intronic chr5:169135686(+) A-I      intronic chr5:169136450(+) A-I      intronic chr5:169083537(+) A-I      intronic chr5:169285967(+) A-I      intronic chr5:169270361(+) A-I      intronic chr5:169233285(+) A-I      intronic chr5:169107627(+) A-I      intronic chr5:169136519(+) A-I      intronic chr5:169270379(+) A-I      intronic chr5:169083445(+) A-I      intronic chr5:169233355(+) A-I      intronic chr5:169232173(+) A-I      intronic chr5:169476299(+) A-I      intronic chr5:169236027(+) A-I      intronic chr5:169270472(+) A-I      intronic chr5:169287186(+) A-I      intronic chr5:169356541(+) A-I      intronic chr5:169106183(+) A-I      intronic chr5:169287199(+) A-I      intronic chr5:169287164(+) A-I      intronic chr5:169083402(+) A-I      intronic chr5:169135803(+) A-I      intronic chr5:169107618(+) A-I      intronic chr5:169269461(+) A-I      intronic chr5:169236134(+) A-I      intronic chr5:169270405(+) A-I      intronic chr5:169287109(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	DOCK2	chr5:169136519(+) A-I intron -    22327324 chr5:169232145(+) A-I intron -    22327324 chr5:169278679(+) A-I intron -    22327324 chr5:169278750(+) A-I intron -    22327324 chr5:169278805(+) A-I intron -    22327324 chr5:169280030(+) A-I intron -    22327324 chr5:169280088(+) A-I intron -    22327324 chr5:169284502(+) A-I intron -    22327324 chr5:169285674(+) A-I intron -    22327324 chr5:169285675(+) A-I intron -    22327324 chr5:169135432(+) A-G intron -    22484847 chr5:169195140(+) A-C intron -    22484847 chr5:169278647(+) A-G intron -    22484847 chr5:169278679(+) A-G intron -    22484847 chr5:169278687(+) A-G intron -    22484847 chr5:169278794(+) A-G intron -    22484847 chr5:169279964(+) A-G intron -    22484847 chr5:169280157(+) A-G intron -    22484847 chr5:169280220(+) A-G intron -    22484847 chr5:169280221(+) A-G intron -    22484847 chr5:169280229(+) A-G intron -    22484847 chr5:169282863(+) A-G intron -    22484847 chr5:169283029(+) A-G intron -    22484847 chr5:169283039(+) A-G intron -    22484847 chr5:169283096(+) A-G intron -    22484847 chr5:169283114(+) A-G intron -    22484847 chr5:169283117(+) A-G intron -    22484847 chr5:169285638(+) A-G intron -    22484847 chr5:169285674(+) A-G intron -    22484847 chr5:169285675(+) A-G intron -    22484847 chr5:169285693(+) A-G intron -    22484847 chr5:169285706(+) A-G intron -    22484847 chr5:169285711(+) A-G intron -    22484847 chr5:169285714(+) A-G intron -    22484847 chr5:169408651(+) A-C intron -    22484847 chr5:169083402(+) A-G intron -    22484847 chr5:169083407(+) A-G intron -    22484847 chr5:169083457(+) A-G intron -    22484847 chr5:169083467(+) A-G intron -    22484847 chr5:169083470(+) A-G intron -    22484847 chr5:169083537(+) A-G intron -    22484847 chr5:169085256(+) G-A intron -    22484847 chr5:169085791(+) A-G intron -    22484847 chr5:169085793(+) A-G intron -    22484847 chr5:169099200(+) T-C intron -    22484847 chr5:169107604(+) A-G intron -    22484847 chr5:169107618(+) A-G intron -    22484847 chr5:169107627(+) A-G intron -    22484847 chr5:169107669(+) A-G intron -    22484847 chr5:169135587(+) G-T intron -    22484847 chr5:169135592(+) A-G intron -    22484847 chr5:169135600(+) A-G intron -    22484847 chr5:169135669(+) A-G intron -    22484847 chr5:169135686(+) A-G intron -    22484847 chr5:169135698(+) A-G intron -    22484847 chr5:169135708(+) A-G intron -    22484847 chr5:169135711(+) A-G intron -    22484847 chr5:169135752(+) A-G intron -    22484847 chr5:169135755(+) A-G intron -    22484847 chr5:169135773(+) A-G intron -    22484847 chr5:169135789(+) A-G intron -    22484847 chr5:169135803(+) A-G intron -    22484847 chr5:169135804(+) A-G intron -    22484847 chr5:169135834(+) A-G intron -    22484847 chr5:169135859(+) A-G intron -    22484847 chr5:169135865(+) A-G intron -    22484847 chr5:169136427(+) A-G intron -    22484847 chr5:169136433(+) A-G intron -    22484847 chr5:169136450(+) A-G intron -    22484847 chr5:169136476(+) A-G intron -    22484847 chr5:169136479(+) T-G intron -    22484847 chr5:169136490(+) A-G intron -    22484847 chr5:169136519(+) A-G intron -    22484847 chr5:169136645(+) A-G intron -    22484847 chr5:169136646(+) A-G intron -    22484847 chr5:169136700(+) A-G intron -    22484847 chr5:169167882(+) T-C intron -    22484847 chr5:169183694(+) T-C intron -    22484847 chr5:169197592(+) T-C intron -    22484847 chr5:169197593(+) T-C intron -    22484847 chr5:169228170(+) T-G intron -    22484847 chr5:169228175(+) T-G intron -    22484847 chr5:169233285(+) A-G intron -    22484847 chr5:169233338(+) A-G intron -    22484847 chr5:169233353(+) A-G intron -    22484847 chr5:169233355(+) A-G intron -    22484847 chr5:169233373(+) A-G intron -    22484847 chr5:169233374(+) A-G intron -    22484847 chr5:169246275(+) T-C intron -    22484847 chr5:169269385(+) A-G intron -    22484847 chr5:169269415(+) A-G intron -    22484847 chr5:169269436(+) A-G intron -    22484847 chr5:169269448(+) A-G intron -    22484847 chr5:169269462(+) A-G intron -    22484847 chr5:169269479(+) A-G intron -    22484847 chr5:169269491(+) A-G intron -    22484847 chr5:169269542(+) A-G intron -    22484847 chr5:169270361(+) A-G intron -    22484847 chr5:169270365(+) A-G intron -    22484847 chr5:169270366(+) A-G intron -    22484847 chr5:169270369(+) A-G intron -    22484847 chr5:169270379(+) A-G intron -    22484847 chr5:169270405(+) A-G intron -    22484847 chr5:169270472(+) A-G intron -    22484847 chr5:169270475(+) A-G intron -    22484847 chr5:169285733(+) A-G intron -    22484847 chr5:169285771(+) T-C intron -    22484847 chr5:169285871(+) A-G intron -    22484847 chr5:169287186(+) A-G intron -    22484847 chr5:169287198(+) A-G intron -    22484847 chr5:169287199(+) A-G intron -    22484847 chr5:169287203(+) A-G intron -    22484847 chr5:169287211(+) A-G intron -    22484847 chr5:169464507(+) A-T intron -    22484847 chr5:169476219(+) A-G intron -    22484847 chr5:169476299(+) A-G intron -    22484847 chr5:169476319(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	DOCK2	chr5:169461452-169461453(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr5:169461461-169461462(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr5:169461527-169461528(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr5:169461551-169461552(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr5:169467647-169467648(+) m6A exon//intron       - chr5:169468090-169468091(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr5:169469052-169469053(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr5:169469073-169469074(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr5:169469106-169469107(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr5:169472860-169472861(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr5:169472904-169472905(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr5:169474563-169474564(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr5:169474568-169474569(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr5:169503044-169503045(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr5:169504769-169504770(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr5:169506029-169506030(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr5:169506087-169506088(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr5:169506139-169506140(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       - chr5:169506217-169506218(+) m6A exon//intron       - chr5:169509933-169509934(+) m6A 3'UTR//exon       - chr5:169509958-169509959(+) m6A 3'UTR//exon       - chr5:169509991-169509992(+) m6A 3'UTR//exon       - chr5:169510093-169510094(+) m6A 3'UTR//exon       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	DOCK2	Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HeLa-S3 cells|K562 cells     - Exosome Blood     - Insoluble cytoplasm K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H14-3p
Interactor2: DOCK2

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg