Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00115372

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H14-5p:  MIMAT0014691          MUC5B:  NM_002458     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H14-5p	MUC5B
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014691	727897
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	MG1//MUC-5B//MUC5//MUC9

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	MUC5B	chr11:1259005(+) A-I      intronic

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	MUC5B	chr11:1258254-1258255(+) m6A CDS//exon       - chr11:1258302-1258303(+) m6A CDS//exon       - chr11:1262179-1262180(+) m6A CDS       24981863 chr11:1262197-1262198(+) m6A CDS       24981863 chr11:1262302-1262303(+) m6A CDS       24981863 chr11:1262487-1262488(+) m6A CDS       24981863 chr11:1262505-1262506(+) m6A CDS       24981863 chr11:1262559-1262560(+) m6A CDS       24981863 chr11:1262637-1262638(+) m6A CDS       24981863//22575960 chr11:1262656-1262657(+) m6A CDS       24981863//22575960 chr11:1262672-1262673(+) m6A CDS       24981863//22575960 chr11:1262746-1262747(+) m6A CDS       24981863//22575960 chr11:1262781-1262782(+) m6A CDS       24981863//22575960 chr11:1262842-1262843(+) m6A CDS       24981863 chr11:1263077-1263078(+) m6A CDS       24981863 chr11:1263155-1263156(+) m6A CDS       24981863 chr11:1263387-1263388(+) m6A CDS       24981863 chr11:1263402-1263403(+) m6A CDS       24981863 chr11:1263480-1263481(+) m6A CDS       24981863 chr11:1263499-1263500(+) m6A CDS       24981863 chr11:1263529-1263530(+) m6A CDS       24981863 chr11:1263537-1263538(+) m6A CDS       24981863 chr11:1263547-1263548(+) m6A CDS       24981863 chr11:1263610-1263611(+) m6A CDS       24981863 chr11:1263691-1263692(+) m6A CDS       24981863 chr11:1263696-1263697(+) m6A CDS       24981863 chr11:1263903-1263904(+) m6A CDS       24981863 chr11:1263990-1263991(+) m6A CDS       24981863 chr11:1264086-1264087(+) m6A CDS       24981863 chr11:1264101-1264102(+) m6A CDS       24981863 chr11:1264155-1264156(+) m6A CDS       24981863 chr11:1264242-1264243(+) m6A CDS       24981863 chr11:1264401-1264402(+) m6A CDS       24981863 chr11:1264485-1264486(+) m6A CDS       24981863 chr11:1264572-1264573(+) m6A CDS       24981863 chr11:1264659-1264660(+) m6A CDS       24981863 chr11:1264684-1264685(+) m6A CDS       24981863 chr11:1264752-1264753(+) m6A CDS       24981863 chr11:1264890-1264891(+) m6A CDS       24981863 chr11:1264953-1264954(+) m6A CDS       24981863 chr11:1264980-1264981(+) m6A CDS       24981863 chr11:1265757-1265758(+) m6A CDS       24981863 chr11:1265772-1265773(+) m6A CDS       24981863 chr11:1265826-1265827(+) m6A CDS       24981863 chr11:1265913-1265914(+) m6A CDS       24981863 chr11:1266072-1266073(+) m6A CDS       24981863 chr11:1266423-1266424(+) m6A CDS       24981863 chr11:1266480-1266481(+) m6A CDS       24981863 chr11:1266561-1266562(+) m6A CDS       24981863 chr11:1266624-1266625(+) m6A CDS       24981863 chr11:1266651-1266652(+) m6A CDS       24981863 chr11:1266754-1266755(+) m6A CDS       24981863 chr11:1267098-1267099(+) m6A CDS       - chr11:1267161-1267162(+) m6A CDS       24981863 chr11:1267248-1267249(+) m6A CDS       24981863 chr11:1267335-1267336(+) m6A CDS       24981863 chr11:1267344-1267345(+) m6A CDS       24981863 chr11:1267355-1267356(+) m6A CDS       24981863 chr11:1267413-1267414(+) m6A CDS       24981863 chr11:1267587-1267588(+) m6A CDS       24981863 chr11:1267761-1267762(+) m6A CDS       24981863 chr11:1267857-1267858(+) m6A CDS       24981863 chr11:1267872-1267873(+) m6A CDS       24981863 chr11:1267926-1267927(+) m6A CDS       24981863 chr11:1268013-1268014(+) m6A CDS       24981863 chr11:1268343-1268344(+) m6A CDS       24981863 chr11:1268430-1268431(+) m6A CDS       24981863 chr11:1268455-1268456(+) m6A CDS       24981863 chr11:1268523-1268524(+) m6A CDS       24981863 chr11:1268661-1268662(+) m6A CDS       24981863 chr11:1268724-1268725(+) m6A CDS       24981863 chr11:1268751-1268752(+) m6A CDS       24981863 chr11:1268854-1268855(+) m6A CDS       24981863 chr11:1268890-1268891(+) m6A CDS       24981863 chr11:1269528-1269529(+) m6A CDS       24981863 chr11:1269543-1269544(+) m6A CDS       24981863 chr11:1269597-1269598(+) m6A CDS       24981863 chr11:1269684-1269685(+) m6A CDS       24981863 chr11:1269843-1269844(+) m6A CDS       - chr11:1269927-1269928(+) m6A CDS       24981863 chr11:1270014-1270015(+) m6A CDS       24981863 chr11:1270101-1270102(+) m6A CDS       24981863 chr11:1270126-1270127(+) m6A CDS       24981863 chr11:1270332-1270333(+) m6A CDS       24981863 chr11:1270395-1270396(+) m6A CDS       24981863 chr11:1270422-1270423(+) m6A CDS       24981863 chr11:1270525-1270526(+) m6A CDS       24981863 chr11:1270561-1270562(+) m6A CDS       24981863 chr11:1270696-1270697(+) m6A CDS       24981863 chr11:1270717-1270718(+) m6A CDS       24981863 chr11:1270932-1270933(+) m6A CDS       24981863 chr11:1271019-1271020(+) m6A CDS       24981863 chr11:1271106-1271107(+) m6A CDS       24981863 chr11:1271115-1271116(+) m6A CDS       24981863 chr11:1271126-1271127(+) m6A CDS       24981863 chr11:1271184-1271185(+) m6A CDS       24981863 chr11:1271616-1271617(+) m6A CDS       24981863 chr11:1271712-1271713(+) m6A CDS       24981863 chr11:1271727-1271728(+) m6A CDS       24981863 chr11:1271781-1271782(+) m6A CDS       24981863 chr11:1271868-1271869(+) m6A CDS       24981863 chr11:1272042-1272043(+) m6A CDS       24981863 chr11:1272126-1272127(+) m6A CDS       24981863 chr11:1272213-1272214(+) m6A CDS       24981863 chr11:1272300-1272301(+) m6A CDS       24981863 chr11:1272387-1272388(+) m6A CDS       24981863 chr11:1272396-1272397(+) m6A CDS       24981863 chr11:1272411-1272412(+) m6A CDS       24981863 chr11:1272465-1272466(+) m6A CDS       24981863 chr11:1272639-1272640(+) m6A CDS       24981863 chr11:1272726-1272727(+) m6A CDS       24981863 chr11:1272813-1272814(+) m6A CDS       24981863 chr11:1272899-1272900(+) m6A CDS       24981863 chr11:1272956-1272957(+) m6A CDS       24981863 chr11:1273592-1273593(+) m6A CDS       24981863 chr11:1274047-1274048(+) m6A CDS       24981863 chr11:1274053-1274054(+) m6A CDS       24981863 chr11:1275453-1275454(+) m6A CDS       24981863 chr11:1283020-1283021(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr11:1283118-1283119(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr11:1283213-1283214(+) m6A 3'UTR//intron       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	MUC5B	Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H14-5p
Interactor2: MUC5B

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	VmiReg