Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00115274

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H14-5p:  MIMAT0014691          UBAC2:  NM_001144072     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H14-5p	UBAC2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014691	337867
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	PHGDHL1

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	UBAC2	chr13:100027068(+) A-I      intronic chr13:99975676(+) A-I      intronic chr13:99944413(+) A-I      intronic chr13:99897939(+) A-I      intronic chr13:100034610(+) A-I      intronic chr13:100035497(+) A-I      intronic chr13:100034686(+) A-I      intronic chr13:100034684(+) A-I      intronic chr13:100034680(+) A-I      intronic chr13:100034662(+) A-I      intronic chr13:100034654(+) A-I      intronic chr13:100034649(+) A-I      intronic chr13:100034630(+) A-I      intronic chr13:100034627(+) A-I      intronic chr13:100034611(+) A-I      intronic chr13:100034598(+) A-I      intronic chr13:100034574(+) A-I      intronic chr13:100034636(+) A-I      intronic chr13:100034547(+) A-I      intronic chr13:100034545(+) A-I      intronic chr13:100034541(+) A-I      intronic chr13:100035585(+) A-I      intronic chr13:100035569(+) A-I      intronic chr13:100035534(+) A-I      intronic chr13:100035533(+) A-I      intronic chr13:100035532(+) A-I      intronic chr13:100035508(+) A-I      intronic chr13:100035507(+) A-I      intronic chr13:100035470(+) A-I      intronic chr13:100035469(+) A-I      intronic chr13:100035440(+) A-I      intronic chr13:100034675(+) A-I      intronic chr13:100034674(+) A-I      intronic chr13:100034670(+) A-I      intronic chr13:100034642(+) A-I      intronic chr13:100034641(+) A-I      intronic chr13:100034603(+) A-I      intronic chr13:100034562(+) A-I      intronic chr13:100029474(+) A-I      intronic chr13:99965331(+) A-I      ncRNA chr13:99962339(+) A-I      intronic chr13:99961935(+) A-I      intronic chr13:99958424(+) A-I      intronic chr13:99958389(+) A-I      intronic chr13:99958384(+) A-I      intronic chr13:99958198(+) A-I      intronic chr13:99942904(+) A-I      intronic chr13:99942885(+) A-I      intronic chr13:99942864(+) A-I      intronic chr13:99962352(+) A-I      intronic chr13:100025213(+) A-I      intronic chr13:100025209(+) A-I      intronic chr13:99942804(+) A-I      intronic chr13:100025208(+) A-I      intronic chr13:99942803(+) A-I      intronic chr13:100025207(+) A-I      intronic chr13:99942796(+) A-I      intronic chr13:99942770(+) A-I      intronic chr13:99942751(+) A-I      intronic chr13:99942730(+) A-I      intronic chr13:99866083(+) A-I      intronic chr13:99933413(+) A-I      intronic chr13:99933336(+) A-I      intronic chr13:99927234(+) A-I      intronic chr13:99927207(+) A-I      intronic chr13:99927206(+) A-I      intronic chr13:99927172(+) A-I      intronic chr13:99927162(+) A-I      intronic chr13:99927155(+) A-I      intronic chr13:99927121(+) A-I      intronic chr13:99927071(+) A-I      intronic chr13:99914836(+) A-I      intronic chr13:99910281(+) A-I      intronic chr13:99898034(+) A-I      intronic chr13:99898021(+) A-I      intronic chr13:99898001(+) A-I      intronic chr13:99897998(+) A-I      intronic chr13:99897995(+) A-I      intronic chr13:99897991(+) A-I      intronic chr13:99897948(+) A-I      intronic chr13:99897945(+) A-I      intronic chr13:99897919(+) A-I      intronic chr13:99897918(+) A-I      intronic chr13:99897909(+) A-I      intronic chr13:99897908(+) A-I      intronic chr13:99897894(+) A-I      intronic chr13:99897893(+) A-I      intronic chr13:99897885(+) A-I      intronic chr13:99897271(+) A-I      intronic chr13:99897261(+) A-I      intronic chr13:99897253(+) A-I      intronic chr13:99897239(+) A-I      intronic chr13:99897164(+) A-I      intronic chr13:99897106(+) A-I      intronic chr13:99890062(+) A-I      intronic chr13:99889976(+) A-I      intronic chr13:99888832(+) A-I      intronic chr13:99885564(+) A-I      intronic chr13:99885467(+) A-I      intronic chr13:99884921(+) A-I      intronic chr13:99884898(+) A-I      intronic chr13:99862750(+) A-I      intronic chr13:99862116(+) A-I      intronic chr13:99862112(+) A-I      intronic chr13:99862107(+) A-I      intronic chr13:99862106(+) A-I      intronic chr13:99862081(+) A-I      intronic chr13:99862074(+) A-I      intronic chr13:99862067(+) A-I      intronic chr13:99862066(+) A-I      intronic chr13:99855490(+) A-I      intronic chr13:99855470(+) A-I      intronic chr13:99855464(+) A-I      intronic chr13:99855417(+) A-I      intronic chr13:99855416(+) A-I      intronic chr13:99986450(+) A-I      intronic chr13:99862063(+) A-I      intronic chr13:99900552(+) A-I      intronic chr13:99970601(+) A-I      intronic chr13:99897877(+) A-I      intronic chr13:99927133(+) A-I      intronic chr13:99985254(+) A-I      intronic chr13:99927192(+) A-I      intronic chr13:99897108(+) A-I      intronic chr13:99942725(+) A-I      intronic chr13:99962380(+) A-I      intronic chr13:99970695(+) A-I      intronic chr13:99942724(+) A-I      intronic chr13:99920747(+) A-I      intronic chr13:99942859(+) A-I      intronic chr13:99898004(+) A-I      intronic chr13:99982730(+) A-I      intronic chr13:99927146(+) A-I      intronic chr13:99998269(+) A-I      intronic chr13:99927111(+) A-I      intronic chr13:99986362(+) A-I      intronic chr13:99985320(+) A-I      intronic chr13:99985302(+) A-I      intronic chr13:99855420(+) A-I      intronic chr13:99977396(+) A-I      intronic chr13:99975678(+) A-I      intronic chr13:99998197(+) A-I      intronic chr13:99975668(+) A-I      intronic chr13:99975646(+) A-I      intronic chr13:99975577(+) A-I      intronic chr13:99970825(+) A-I      intronic chr13:99962460(+) A-I      intronic chr13:99962421(+) A-I      intronic chr13:99962394(+) A-I      intronic chr13:99962355(+) A-I      intronic chr13:99970797(+) A-I      intronic chr13:99900581(+) A-I      intronic chr13:100034560(+) A-I      intronic chr13:100034559(+) A-I      intronic chr13:100029441(+) A-I      intronic chr13:99986475(+) A-I      intronic chr13:99862149(+) A-I      intronic chr13:99970819(+) A-I      intronic chr13:99866167(+) A-I      intronic chr13:99942991(+) A-I      intronic chr13:99898071(+) A-I      intronic chr13:100027055(+) A-I      intronic chr13:99937926(+) A-I      intronic chr13:99868621(+) A-I      intronic chr13:99879289(+) A-I      intronic chr13:99977564(+) A-I      intronic chr13:99962399(+) A-I      intronic chr13:99975669(+) A-I      intronic chr13:99986588(+) A-I      intronic chr13:100035552(+) A-I      intronic chr13:99944454(+) A-I      intronic chr13:99897933(+) A-I      intronic chr13:99961625(+) A-I      intronic chr13:99885076(+) A-I      intronic chr13:100034512(+) A-I      intronic chr13:99929525(+) A-I      intronic chr13:99975583(+) A-I      intronic chr13:99985291(+) A-I      intronic chr13:99961878(+) A-I      intronic chr13:100035551(+) A-I      intronic chr13:99944529(+) A-I      intronic chr13:99942793(+) A-I      intronic chr13:100034480(+) A-I      intronic chr13:99927084(+) A-I      intronic chr13:99986340(+) A-I      intronic chr13:99985261(+) A-I      intronic chr13:100035441(+) A-I      intronic chr13:99977556(+) A-I      intronic chr13:99929524(+) A-I      intronic chr13:99962501(+) A-I      intronic chr13:99900866(+) A-I      intronic chr13:99986327(+) A-I      intronic chr13:99944603(+) A-I      intronic chr13:99914683(+) A-I      intronic chr13:99942794(+) A-I      intronic chr13:99999277(+) A-I      intronic chr13:99939753(+) A-I      intronic chr13:99970897(+) A-I      intronic chr13:99885099(+) A-I      intronic chr13:99942994(+) A-I      intronic chr13:99986424(+) A-I      intronic chr13:99897297(+) A-I      intronic chr13:100035396(+) A-I      intronic chr13:100035578(+) A-I      intronic chr13:99962056(+) A-I      intronic chr13:100029392(+) A-I      intronic chr13:99968747(+) A-I      intronic chr13:99962066(+) A-I      intronic chr13:100035510(+) A-I      intronic chr13:99884878(+) A-I      intronic chr13:100029382(+) A-I      intronic chr13:99855448(+) A-I      intronic chr13:99863640(+) A-I      intronic chr13:100035399(+) A-I      intronic chr13:99990438(+) A-I      intronic chr13:99926995(+) A-I      intronic chr13:100034514(+) A-I      intronic chr13:99897277(+) A-I      intronic chr13:99962513(+) A-I      intronic chr13:99886572(+) A-I      intronic chr13:100029393(+) A-I      intronic chr13:99970551(+) A-I      intronic chr13:99986728(+) A-I      intronic chr13:99970820(+) A-I      intronic chr13:99962520(+) A-I      intronic chr13:99961637(+) A-I      intronic chr13:99898030(+) A-I      intronic chr13:99862153(+) A-I      intronic chr13:99936053(+) A-I      intronic chr13:100035523(+) A-I      intronic chr13:99897924(+) A-I      intronic chr13:99942858(+) A-I      intronic chr13:99986397(+) A-I      intronic chr13:99868633(+) A-I      intronic chr13:100035465(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	UBAC2	chr13:99867816(+) A-I intron -    22327324 chr13:99986778(+) A-I intron -    21960545 chr13:99986794(+) A-I intron -    21960545 chr13:100035551(+) A-G intron -    22484847 chr13:100035552(+) A-G intron -    22484847 chr13:99962501(+) A-G intron -    22484847 chr13:100035399(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	UBAC2	chr13:100020098-100020099(+) m6A CDS//exon       - chr13:100037545-100037546(+) m6A CDS//exon       24981863 chr13:100037610-100037611(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr13:100037615-100037616(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr13:100037666-100037667(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr13:100037739-100037740(+) m6A 3'UTR//exon       24981863 chr13:100037992-100037993(+) m6A 3'UTR//exon       24284625 chr13:100038015-100038016(+) m6A 3'UTR//exon       24284625 chr13:100038044-100038045(+) m6A 3'UTR//exon       24284625 chr13:100038078-100038079(+) m6A 3'UTR//exon       24284625 chr13:100038494-100038495(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//22575960 chr13:100038504-100038505(+) m6A 3'UTR//exon       25456834//22575960 chr13:100038541-100038542(+) m6A 3'UTR//exon       25456834 chr13:100038561-100038562(+) m6A 3'UTR//exon       25456834 chr13:99853159-99853160(+) m6A 5'UTR//exon       24981863 chr13:99858132-99858133(+) m6A intron       24284625 chr13:99992660-99992661(+) m6A CDS//exon       - chr13:99992668-99992669(+) m6A CDS//exon       - chr13:99992689-99992690(+) m6A CDS//exon       - chr13:99992730-99992731(+) m6A CDS//exon       - chr13:99992740-99992741(+) m6A CDS//exon       - chr13:99992763-99992764(+) m6A CDS//exon       - chr13:99992809-99992810(+) m6A CDS//exon       24981863

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	UBAC2	Chromatin K562 cells     - Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H14-5p
Interactor2: UBAC2

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//RNAHybrid
Support Database	VmiReg