Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00115042

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H14-5p:  MIMAT0014691          WTIP:  NM_001080436     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H14-5p	WTIP
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014691	126374
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	-

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	WTIP	chr19:34987209(+) A-I      intronic chr19:34987250(+) A-I      intronic chr19:34983463(+) A-I      intronic chr19:34987297(+) A-I      intronic chr19:34983483(+) A-I      intronic chr19:34987315(+) A-I      intronic chr19:34976573(+) A-I      intronic chr19:34987205(+) A-I      intronic chr19:34983503(+) A-I      intronic chr19:34987063(+) A-I      intronic chr19:34987082(+) A-I      intronic chr19:34990183(+) A-I      intronic chr19:34989556(+) A-I      intronic chr19:34989943(+) A-I      intronic chr19:34983429(+) A-I      intronic chr19:34990289(+) A-I      intronic chr19:34990302(+) A-I      intronic chr19:34990746(+) A-I      intronic chr19:34990750(+) A-I      intronic chr19:34983422(+) A-I      intronic chr19:34990757(+) A-I      intronic chr19:34990787(+) A-I      intronic chr19:34978105(+) A-I      intronic chr19:34978084(+) A-I      intronic chr19:34983435(+) A-I      intronic chr19:34990126(+) A-I      intronic chr19:34990279(+) A-I      intronic chr19:34990253(+) A-I      intronic chr19:34978122(+) A-I      intronic chr19:34987103(+) A-I      intronic chr19:34990262(+) A-I      intronic chr19:34978140(+) A-I      intronic chr19:34979506(+) A-I      intronic chr19:34987105(+) A-I      intronic chr19:34979552(+) A-I      intronic chr19:34979993(+) A-I      intronic chr19:34990133(+) A-I      intronic chr19:34989936(+) A-I      intronic chr19:34989559(+) A-I      intronic chr19:34990263(+) A-I      intronic chr19:34990250(+) A-I      intronic chr19:34980075(+) A-I      intronic chr19:34980056(+) A-I      intronic chr19:34980049(+) A-I      intronic chr19:34980016(+) A-I      intronic chr19:34980013(+) A-I      intronic chr19:34979957(+) A-I      intronic chr19:34979954(+) A-I      intronic chr19:34979944(+) A-I      intronic chr19:34979941(+) A-I      intronic chr19:34979548(+) A-I      intronic chr19:34979546(+) A-I      intronic chr19:34977951(+) A-I      intronic chr19:34988039(+) A-I      intronic chr19:34983500(+) A-I      intronic chr19:34983506(+) A-I      intronic chr19:34983514(+) A-I      intronic chr19:34983543(+) A-I      intronic chr19:34989707(+) A-I      intronic chr19:34983396(+) A-I      intronic chr19:34987007(+) A-I      intronic chr19:34980735(+) A-I      intronic chr19:34986968(+) A-I      intronic chr19:34986951(+) A-I      intronic chr19:34986915(+) A-I      intronic chr19:34986912(+) A-I      intronic chr19:34987096(+) A-I      intronic chr19:34987156(+) A-I      intronic chr19:34987202(+) A-I      intronic chr19:34980945(+) A-I      intronic chr19:34987251(+) A-I      intronic chr19:34980948(+) A-I      intronic chr19:34986901(+) A-I      intronic chr19:34986900(+) A-I      intronic chr19:34983544(+) A-I      intronic chr19:34981826(+) A-I      intronic chr19:34981827(+) A-I      intronic chr19:34983254(+) A-I      intronic chr19:34983515(+) A-I      intronic chr19:34990882(+) A-I      intronic chr19:34990849(+) A-I      intronic chr19:34990744(+) A-I      intronic chr19:34990734(+) A-I      intronic chr19:34990666(+) A-I      intronic chr19:34990623(+) A-I      intronic chr19:34990354(+) A-I      intronic chr19:34990229(+) A-I      intronic chr19:34990214(+) A-I      intronic chr19:34987907(+) A-I      intronic chr19:34990166(+) A-I      intronic chr19:34990152(+) A-I      intronic chr19:34987041(+) A-I      intronic chr19:34989694(+) A-I      intronic chr19:34989690(+) A-I      intronic chr19:34989684(+) A-I      intronic chr19:34989618(+) A-I      intronic chr19:34989594(+) A-I      intronic chr19:34988042(+) A-I      intronic chr19:34990077(+) A-I      intronic chr19:34989991(+) A-I      intronic chr19:34987276(+) A-I      intronic chr19:34987337(+) A-I      intronic chr19:34987353(+) A-I      intronic chr19:34975756(+) A-I      intronic chr19:34987913(+) A-I      intronic chr19:34989857(+) A-I      intronic chr19:34989800(+) A-I      intronic chr19:34989750(+) A-I      intronic chr19:34989746(+) A-I      intronic chr19:34989726(+) A-I      intronic chr19:34989725(+) A-I      intronic chr19:34989717(+) A-I      intronic chr19:34989714(+) A-I      intronic chr19:34989711(+) A-I      intronic chr19:34987948(+) A-I      intronic chr19:34988003(+) A-I      intronic chr19:34988029(+) A-I      intronic chr19:34987897(+) A-I      intronic chr19:34990868(+) A-I      intronic chr19:34989646(+) A-I      intronic chr19:34982612(+) A-I      intronic chr19:34990205(+) A-I      intronic chr19:34990022(+) A-I      intronic chr19:34987151(+) A-I      intronic chr19:34979671(+) A-I      intronic chr19:34986941(+) A-I      intronic chr19:34979364(+) A-I      intronic chr19:34989912(+) A-I      intronic chr19:34989801(+) A-I      intronic chr19:34979098(+) A-I      intronic chr19:34982734(+) A-I      intronic chr19:34987045(+) A-I      intronic chr19:34989644(+) A-I      intronic chr19:34990241(+) A-I      intronic chr19:34989858(+) A-I      intronic chr19:34977960(+) A-I      intronic chr19:34990399(+) A-I      intronic chr19:34990778(+) A-I      intronic chr19:34987012(+) A-I      intronic chr19:34987176(+) A-I      intronic chr19:34990328(+) A-I      intronic chr19:34987069(+) A-I      intronic chr19:34990225(+) A-I      intronic chr19:34981916(+) A-I      intronic chr19:34987194(+) A-I      intronic chr19:34990684(+) A-I      intronic chr19:34987298(+) A-I      intronic chr19:34975714(+) A-I      intronic chr19:34979146(+) A-I      intronic chr19:34987259(+) A-I      intronic chr19:34986983(+) A-I      intronic chr19:34987256(+) A-I      intronic chr19:34987338(+) A-I      intronic chr19:34990656(+) A-I      intronic chr19:34983118(+) A-I      intronic chr19:34989849(+) A-I      intronic chr19:34989900(+) A-I      intronic chr19:34983370(+) A-I      intronic chr19:34987175(+) A-I      intronic chr19:34990359(+) A-I      intronic chr19:34990867(+) A-I      intronic chr19:34990716(+) A-I      intronic chr19:34981856(+) A-I      intronic chr19:34990160(+) A-I      intronic chr19:34987285(+) A-I      intronic chr19:34990252(+) A-I      intronic chr19:34986284(+) A-I      intronic chr19:34981788(+) A-I      intronic chr19:34990200(+) A-I      intronic chr19:34990685(+) A-I      intronic chr19:34989658(+) A-I      intronic chr19:34989918(+) A-I      intronic chr19:34988030(+) A-I      intronic chr19:34981844(+) A-I      intronic chr19:34987872(+) A-I      intronic chr19:34990236(+) A-I      intronic chr19:34979848(+) A-I      intronic chr19:34978172(+) A-I      intronic chr19:34979507(+) A-I      intronic chr19:34990793(+) A-I      intronic chr19:34990306(+) A-I      intronic chr19:34990858(+) A-I      intronic chr19:34990731(+) A-I      intronic chr19:34983082(+) A-I      intronic chr19:34990333(+) A-I      intronic chr19:34986982(+) A-I      intronic chr19:34987968(+) A-I      intronic chr19:34990138(+) A-I      intronic chr19:34989642(+) A-I      intronic chr19:34986842(+) A-I      intronic chr19:34989755(+) A-I      intronic chr19:34986807(+) A-I      intronic chr19:34990804(+) A-I      intronic chr19:34987311(+) A-I      intronic chr19:34980656(+) A-I      intronic chr19:34980718(+) A-I      intronic chr19:34990705(+) A-I      intronic chr19:34989802(+) A-I      intronic chr19:34990045(+) A-I      intronic chr19:34990104(+) A-I      intronic chr19:34990880(+) A-I      intronic chr19:34989550(+) A-I      intronic chr19:34987788(+) A-I      intronic chr19:34989932(+) A-I      intronic chr19:34981748(+) A-I      intronic chr19:34987241(+) A-I      intronic chr19:34990219(+) A-I      intronic chr19:34987193(+) A-I      intronic chr19:34987215(+) A-I      intronic chr19:34980610(+) A-I      intronic chr19:34990784(+) A-I      intronic chr19:34989643(+) A-I      intronic chr19:34989648(+) A-I      intronic chr19:34987217(+) A-I      intronic

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	WTIP	chr19:34973073-34973074(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863//27773536 chr19:34973258-34973259(+) m6A CDS       24209618 chr19:34996606-34996607(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:34996626-34996627(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:34996741-34996742(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:34996849-34996850(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:34996900-34996901(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:34996917-34996918(+) m6A 3'UTR       25456834 chr19:34996952-34996953(+) m6A 3'UTR       24284625//25456834 chr19:34997161-34997162(+) m6A 3'UTR       - chr19:34997219-34997220(+) m6A 3'UTR       - chr19:34997235-34997236(+) m6A 3'UTR       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	WTIP	Exosome Blood     - Nucleus HCC cell line (HepG2)     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H14-5p
Interactor2: WTIP

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//RNAHybrid
Support Database	RepTar//VmiReg