Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00114055

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H14-5p:  MIMAT0014691          MRC2:  NM_006039     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H14-5p	MRC2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0014691	9902
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	CD280//CLEC13E//ENDO180//UPARAP

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	MRC2	chr17:60763086(+) A-I      intronic chr17:60750949(+) A-I      intronic chr17:60726809(+) A-I      intronic chr17:60763066(+) A-I      intronic chr17:60750931(+) A-I      intronic chr17:60726805(+) A-I      intronic chr17:60720069(+) A-I      intronic chr17:60726813(+) A-I      intronic chr17:60761078(+) A-I      intronic chr17:60763088(+) A-I      intronic chr17:60720060(+) A-I      intronic chr17:60714849(+) A-I      intronic chr17:60761075(+) A-I      intronic chr17:60761067(+) A-I      intronic chr17:60763062(+) A-I      intronic chr17:60726841(+) A-I      intronic chr17:60726832(+) A-I      intronic chr17:60718637(+) A-I      intronic chr17:60718139(+) A-I      intronic chr17:60760969(+) A-I      intronic chr17:60718126(+) A-I      intronic chr17:60718107(+) A-I      intronic chr17:60717055(+) A-I      intronic chr17:60717047(+) A-I      intronic chr17:60728525(+) A-I      intronic chr17:60728503(+) A-I      intronic chr17:60727518(+) A-I      intronic chr17:60727456(+) A-I      intronic chr17:60725644(+) A-I      intronic chr17:60725600(+) A-I      intronic chr17:60724674(+) A-I      intronic chr17:60720681(+) A-I      intronic chr17:60716637(+) A-I      intronic chr17:60716630(+) A-I      intronic chr17:60762980(+) A-I      intronic chr17:60716020(+) A-I      intronic chr17:60716011(+) A-I      intronic chr17:60715325(+) A-I      intronic chr17:60720008(+) A-I      intronic chr17:60718701(+) A-I      intronic chr17:60714852(+) A-I      intronic chr17:60714838(+) A-I      intronic chr17:60714642(+) A-I      intronic chr17:60713521(+) A-I      intronic chr17:60713508(+) A-I      intronic chr17:60713422(+) A-I      intronic chr17:60712309(+) A-I      intronic chr17:60761015(+) A-I      intronic chr17:60711862(+) A-I      intronic chr17:60711742(+) A-I      intronic chr17:60729196(+) A-I      intronic chr17:60739543(+) A-I      intronic chr17:60745567(+) A-I      intronic chr17:60745570(+) A-I      intronic chr17:60745571(+) A-I      intronic chr17:60711718(+) A-I      intronic chr17:60711159(+) A-I      intronic chr17:60760669(+) A-I      intronic chr17:60732743(+) A-I      intronic chr17:60712278(+) A-I      intronic chr17:60732792(+) A-I      intronic chr17:60733408(+) A-I      intronic chr17:60710753(+) A-I      intronic chr17:60733549(+) A-I      intronic chr17:60760764(+) A-I      intronic chr17:60720611(+) A-I      intronic chr17:60720604(+) A-I      intronic chr17:60720586(+) A-I      intronic chr17:60720513(+) A-I      intronic chr17:60720017(+) A-I      intronic chr17:60761082(+) A-I      intronic chr17:60761089(+) A-I      intronic chr17:60762423(+) A-I      intronic chr17:60762994(+) A-I      intronic chr17:60763001(+) A-I      intronic chr17:60763137(+) A-I      intronic chr17:60763558(+) A-I      intronic chr17:60763559(+) A-I      intronic chr17:60763638(+) A-I      intronic chr17:60763652(+) A-I      intronic chr17:60763656(+) A-I      intronic chr17:60763658(+) A-I      intronic chr17:60763693(+) A-I      intronic chr17:60763703(+) A-I      intronic chr17:60763720(+) A-I      intronic chr17:60765078(+) A-I      intronic chr17:60765084(+) A-I      intronic chr17:60711143(+) A-I      intronic chr17:60718571(+) A-I      intronic chr17:60711091(+) A-I      intronic chr17:60716620(+) A-I      intronic chr17:60763089(+) A-I      intronic chr17:60733328(+) A-I      intronic chr17:60719933(+) A-I      intronic chr17:60719834(+) A-I      intronic chr17:60765067(+) A-I      intronic chr17:60714842(+) A-I      intronic chr17:60717050(+) A-I      intronic chr17:60716566(+) A-I      intronic chr17:60745574(+) A-I      intronic chr17:60761060(+) A-I      intronic chr17:60739519(+) A-I      intronic chr17:60732346(+) A-I      intronic chr17:60720698(+) A-I      intronic chr17:60761104(+) A-I      intronic chr17:60745569(+) A-I      intronic chr17:60732246(+) A-I      intronic chr17:60711147(+) A-I      intronic chr17:60745592(+) A-I      intronic chr17:60720077(+) A-I      intronic chr17:60719835(+) A-I      intronic chr17:60718478(+) A-I      intronic chr17:60716424(+) A-I      intronic chr17:60719988(+) A-I      intronic chr17:60711127(+) A-I      intronic chr17:60715992(+) A-I      intronic chr17:60745511(+) A-I      intronic chr17:60720531(+) A-I      intronic chr17:60717506(+) A-I      intronic chr17:60720609(+) A-I      intronic chr17:60745622(+) A-I      intronic chr17:60719829(+) A-I      intronic chr17:60716607(+) A-I      intronic chr17:60715843(+) A-I      intronic chr17:60711681(+) A-I      intronic chr17:60714094(+) A-I      intronic chr17:60745485(+) A-I      intronic chr17:60720042(+) A-I      intronic chr17:60733320(+) A-I      intronic chr17:60721565(+) A-I      intronic chr17:60763040(+) A-I      intronic chr17:60732959(+) A-I      intronic chr17:60748684(+) A-I      intronic chr17:60717961(+) A-I      intronic chr17:60764544(+) A-I      intronic chr17:60716511(+) A-I      intronic chr17:60717086(+) A-I      intronic chr17:60720649(+) A-I      intronic chr17:60721560(+) A-I      intronic chr17:60714468(+) A-I      intronic chr17:60722995(+) A-I      intronic chr17:60746991(+) A-I      intronic chr17:60733029(+) A-I      intronic chr17:60713530(+) A-I      intronic chr17:60716158(+) A-I      intronic chr17:60714601(+) A-I      intronic chr17:60716263(+) A-I      intronic chr17:60714541(+) A-I      intronic chr17:60715845(+) A-I      intronic chr17:60763138(+) A-I      intronic chr17:60720456(+) A-I      intronic chr17:60721669(+) A-I      intronic chr17:60710676(+) A-I      intronic chr17:60717063(+) A-I      intronic chr17:60713969(+) A-I      intronic chr17:60732957(+) A-I      intronic chr17:60733461(+) A-I      intronic chr17:60720568(+) A-I      intronic chr17:60720082(+) A-I      intronic chr17:60721871(+) A-I      intronic chr17:60713494(+) A-I      intronic chr17:60733396(+) A-I      intronic chr17:60733302(+) A-I      intronic chr17:60745456(+) A-I      intronic chr17:60714542(+) A-I      intronic chr17:60718343(+) A-I      intronic chr17:60738459(+) A-I      intronic chr17:60712357(+) A-I      intronic chr17:60763556(+) A-I      intronic chr17:60711190(+) A-I      intronic chr17:60732359(+) A-I      intronic chr17:60760615(+) A-I      intronic chr17:60715476(+) A-I      intronic chr17:60720539(+) A-I      intronic chr17:60729195(+) A-I      intronic chr17:60720680(+) A-I      intronic chr17:60747043(+) A-I      intronic chr17:60716577(+) A-I      intronic chr17:60732678(+) A-I      intronic chr17:60745633(+) A-I      intronic chr17:60711912(+) A-I      intronic chr17:60720610(+) A-I      intronic chr17:60729194(+) A-I      intronic chr17:60710757(+) A-I      intronic chr17:60715434(+) A-I      intronic chr17:60720029(+) A-I      intronic chr17:60720043(+) A-I      intronic chr17:60718565(+) A-I      intronic chr17:60714809(+) A-I      intronic chr17:60719991(+) A-I      intronic chr17:60713468(+) A-I      intronic chr17:60713081(+) A-I      intronic chr17:60748457(+) A-I      intronic chr17:60716005(+) A-I      intronic chr17:60761065(+) A-I      intronic chr17:60745460(+) A-I      intronic chr17:60733390(+) A-I      intronic chr17:60727439(+) A-I      intronic chr17:60718566(+) A-I      intronic chr17:60721552(+) A-I      intronic chr17:60714710(+) A-I      intronic chr17:60746656(+) A-I      intronic chr17:60719934(+) A-I      intronic chr17:60715255(+) A-I      intronic chr17:60712331(+) A-I      intronic chr17:60763030(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	MRC2	chr17:60718478(+) A-G intron -    22484847 chr17:60740142(+) G-A intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	MRC2	chr17:60704780-60704781(+) m6A 5'UTR       24284625//24981863 chr17:60704788-60704789(+) m6A 5'UTR       24284625//24981863 chr17:60704830-60704831(+) m6A 5'UTR       24284625//25456834//24981863 chr17:60704889-60704890(+) m6A 5'UTR       24284625//25456834//24981863 chr17:60704950-60704951(+) m6A 5'UTR       24981863 chr17:60741939-60741940(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//22575960 chr17:60742037-60742038(+) m6A CDS//exon       24284625 chr17:60742246-60742247(+) m6A CDS//exon       24284625 chr17:60742286-60742287(+) m6A CDS//exon       24284625//22575960 chr17:60743475-60743476(+) m6A CDS//exon       24284625//22575960 chr17:60743586-60743587(+) m6A CDS//exon       24284625//22575960 chr17:60743829-60743830(+) m6A CDS//exon       22575960 chr17:60743839-60743840(+) m6A CDS//exon       22575960 chr17:60743845-60743846(+) m6A CDS//exon       22575960 chr17:60743967-60743968(+) m6A CDS//exon       22575960 chr17:60744168-60744169(+) m6A CDS//exon       22575960 chr17:60744195-60744196(+) m6A CDS//exon       24284625//22575960 chr17:60744759-60744760(+) m6A CDS//exon       24284625//22575960 chr17:60744777-60744778(+) m6A CDS//exon       24284625//22575960 chr17:60744819-60744820(+) m6A CDS//exon       24284625//22575960 chr17:60744860-60744861(+) m1A CDS//exon       26863196 chr17:60749185-60749186(+) Cm CDS//exon       - chr17:60749395-60749396(+) m6A CDS//exon       24284625//22575960 chr17:60749490-60749491(+) m6A CDS//exon       24284625 chr17:60751514-60751515(+) m6A CDS//exon       24284625//22575960 chr17:60753193-60753194(+) m6A CDS//exon       24284625//22575960 chr17:60754695-60754696(+) m6A CDS       - chr17:60754821-60754822(+) m6A CDS       22575960 chr17:60754828-60754829(+) m6A CDS       22575960 chr17:60755889-60755890(+) m6A CDS       - chr17:60757597-60757598(+) m6A CDS       22575960 chr17:60757645-60757646(+) m6A CDS       22575960 chr17:60758993-60758994(+) m6A 5'UTR//intron       - chr17:60759083-60759084(+) m6A 5'UTR//intron       - chr17:60759679-60759680(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       24284625 chr17:60765672-60765673(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       24284625 chr17:60765717-60765718(+) m6A 5'UTR//CDS//exon       24284625 chr17:60766021-60766022(+) m6A CDS//exon       - chr17:60766290-60766291(+) m6A CDS//exon       - chr17:60766782-60766783(+) m6A exon//intron       - chr17:60767294-60767295(+) m6A CDS//exon       24284625 chr17:60767565-60767566(+) m6A CDS//exon       22575960 chr17:60767573-60767574(+) m6A CDS//exon       22575960 chr17:60768107-60768108(+) m6A CDS//exon       - chr17:60768330-60768331(+) m6A CDS//exon       - chr17:60768345-60768346(+) m6A CDS//exon       - chr17:60769768-60769769(+) m6A CDS//exon       - chr17:60769783-60769784(+) m6A CDS//exon       - chr17:60770001-60770002(+) m6A 3'UTR//exon       - chr17:60770080-60770081(+) m6A 3'UTR//exon       - chr17:60770162-60770163(+) m6A 3'UTR//exon       - chr17:60770440-60770441(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863 chr17:60770480-60770481(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863 chr17:60770491-60770492(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//25456834//24981863 chr17:60770588-60770589(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618 chr17:60770786-60770787(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863 chr17:60770823-60770824(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//22608085 chr17:60770832-60770833(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//22608085 chr17:60770838-60770839(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//22608085 chr17:60770846-60770847(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24209618//24981863//22608085 chr17:60770923-60770924(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085 chr17:60770932-60770933(+) m6A 3'UTR       24284625//24209618//24981863//22608085

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	MRC2	Chromatin K562 cells     - Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HeLa-S3 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleus HeLa-S3 cells|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H14-5p
Interactor2: MRC2

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda//RNAHybrid//Targetscan
Support Database	RepTar//VmiReg