Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00096318

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H6-3p:  MIMAT0008404          AK4:  NM_001005353     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H6-3p	AK4
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0008404	205
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	AK 4//AK3//AK3L1//AK3L2

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	AK4	chr1:65666660(+) A-I      intronic chr1:65626468(+) A-I      intronic chr1:65666619(+) A-I      intronic chr1:65666617(+) A-I      intronic chr1:65666607(+) A-I      intronic chr1:65666603(+) A-I      intronic chr1:65666623(+) A-I      intronic chr1:65620663(+) A-I      intronic chr1:65620675(+) A-I      intronic chr1:65622421(+) A-I      intronic chr1:65622428(+) A-I      intronic chr1:65622443(+) A-I      intronic chr1:65622445(+) A-I      intronic chr1:65622446(+) A-I      intronic chr1:65622453(+) A-I      intronic chr1:65622458(+) A-I      intronic chr1:65623302(+) A-I      intronic chr1:65623308(+) A-I      intronic chr1:65623397(+) A-I      intronic chr1:65623398(+) A-I      intronic chr1:65624387(+) A-I      intronic chr1:65624464(+) A-I      intronic chr1:65625495(+) A-I      intronic chr1:65620638(+) A-I      intronic chr1:65620651(+) A-I      intronic chr1:65689431(+) A-I      intronic chr1:65689422(+) A-I      intronic chr1:65689655(+) A-I      intronic chr1:65625497(+) A-I      intronic chr1:65632721(+) A-I      intronic chr1:65625498(+) A-I      intronic chr1:65625500(+) A-I      intronic chr1:65625501(+) A-I      intronic chr1:65625563(+) A-I      intronic chr1:65626407(+) A-I      intronic chr1:65626480(+) A-I      intronic chr1:65628254(+) A-I      intronic chr1:65628301(+) A-I      intronic chr1:65616717(+) A-I      intronic chr1:65616736(+) A-I      intronic chr1:65632309(+) A-I      intronic chr1:65632730(+) A-I      intronic chr1:65634156(+) A-I      intronic chr1:65634780(+) A-I      intronic chr1:65636684(+) A-I      intronic chr1:65636708(+) A-I      intronic chr1:65637013(+) A-I      intronic chr1:65637072(+) A-I      intronic chr1:65637493(+) A-I      intronic chr1:65637495(+) A-I      intronic chr1:65637678(+) A-I      intronic chr1:65637688(+) A-I      intronic chr1:65637689(+) A-I      intronic chr1:65637694(+) A-I      intronic chr1:65637715(+) A-I      intronic chr1:65647199(+) A-I      intronic chr1:65647209(+) A-I      intronic chr1:65647622(+) A-I      intronic chr1:65647738(+) A-I      intronic chr1:65647779(+) A-I      intronic chr1:65651455(+) A-I      intronic chr1:65654242(+) A-I      intronic chr1:65654346(+) A-I      intronic chr1:65654368(+) A-I      intronic chr1:65654413(+) A-I      intronic chr1:65659775(+) A-I      intronic chr1:65660219(+) A-I      intronic chr1:65660284(+) A-I      intronic chr1:65660334(+) A-I      intronic chr1:65660379(+) A-I      intronic chr1:65660407(+) A-I      intronic chr1:65660419(+) A-I      intronic chr1:65665045(+) A-I      intronic chr1:65665054(+) A-I      intronic chr1:65665060(+) A-I      intronic chr1:65665853(+) A-I      intronic chr1:65665926(+) A-I      intronic chr1:65665933(+) A-I      intronic chr1:65665995(+) A-I      intronic chr1:65668697(+) A-I      intronic chr1:65669288(+) A-I      intronic chr1:65669311(+) A-I      intronic chr1:65669366(+) A-I      intronic chr1:65669390(+) A-I      intronic chr1:65669948(+) A-I      intronic chr1:65669957(+) A-I      intronic chr1:65669970(+) A-I      intronic chr1:65670105(+) A-I      intronic chr1:65670106(+) A-I      intronic chr1:65670144(+) A-I      intronic chr1:65678241(+) A-I      intronic chr1:65681952(+) A-I      intronic chr1:65616737(+) A-I      intronic chr1:65689107(+) A-I      intronic chr1:65689143(+) A-I      intronic chr1:65620613(+) A-I      intronic chr1:65651433(+) A-I      intronic chr1:65634603(+) A-I      intronic chr1:65660248(+) A-I      intronic chr1:65660249(+) A-I      intronic chr1:65627844(+) A-I      intronic chr1:65653839(+) A-I      intronic chr1:65632741(+) A-I      intronic chr1:65676830(+) A-I      intronic chr1:65689029(+) A-I      intronic chr1:65623387(+) A-I      intronic chr1:65670048(+) A-I      intronic chr1:65669360(+) A-I      intronic chr1:65637683(+) A-I      intronic chr1:65626143(+) A-I      intronic chr1:65639288(+) A-I      intronic chr1:65668695(+) A-I      intronic chr1:65666595(+) A-I      intronic chr1:65632736(+) A-I      intronic chr1:65634681(+) A-I      intronic chr1:65668742(+) A-I      intronic chr1:65634180(+) A-I      intronic chr1:65689549(+) A-I      intronic chr1:65645473(+) A-I      intronic chr1:65622530(+) A-I      intronic chr1:65634586(+) A-I      intronic chr1:65660286(+) A-I      intronic chr1:65622352(+) A-I      intronic chr1:65620634(+) A-I      intronic chr1:65689471(+) A-I      intronic chr1:65667825(+) A-I      intronic chr1:65689423(+) A-I      intronic chr1:65623212(+) A-I      intronic chr1:65665085(+) A-I      intronic chr1:65688901(+) A-I      intronic chr1:65670028(+) A-I      intronic chr1:65622521(+) A-I      intronic chr1:65660245(+) A-I      intronic chr1:65652073(+) A-I      intronic chr1:65634602(+) A-I      intronic chr1:65637212(+) A-I      intronic chr1:65620941(+) A-I      intronic chr1:65620637(+) A-I      intronic chr1:65637473(+) A-I      intronic chr1:65689533(+) A-I      intronic chr1:65667959(+) A-I      intronic chr1:65660274(+) A-I      intronic chr1:65634158(+) A-I      intronic chr1:65645501(+) A-I      intronic chr1:65678235(+) A-I      intronic chr1:65619183(+) A-I      intronic chr1:65632224(+) A-I      intronic chr1:65655222(+) A-I      intronic chr1:65651478(+) A-I      intronic chr1:65634874(+) A-I      intronic chr1:65625295(+) A-I      intronic chr1:65689449(+) A-I      intronic chr1:65634808(+) A-I      intronic chr1:65632225(+) A-I      intronic chr1:65669340(+) A-I      intronic chr1:65664505(+) A-I      intronic chr1:65667826(+) A-I      intronic chr1:65667923(+) A-I      intronic chr1:65619092(+) A-I      intronic chr1:65621394(+) A-I      intronic chr1:65626475(+) A-I      intronic chr1:65618984(+) A-I      intronic chr1:65637496(+) A-I      intronic chr1:65653823(+) A-I      intronic chr1:65659528(+) A-I      intronic chr1:65670073(+) A-I      intronic chr1:65632559(+) A-I      intronic chr1:65660225(+) A-I      intronic chr1:65632743(+) A-I      intronic chr1:65659654(+) A-I      intronic chr1:65622485(+) A-I      intronic chr1:65621479(+) A-I      intronic chr1:65688972(+) A-I      intronic chr1:65660214(+) A-I      intronic chr1:65689588(+) A-I      intronic chr1:65625530(+) A-I      intronic chr1:65689541(+) A-I      intronic chr1:65654647(+) A-I      intronic chr1:65632239(+) A-I      intronic chr1:65626539(+) A-I      intronic chr1:65634157(+) A-I      intronic chr1:65669947(+) A-I      intronic chr1:65669367(+) A-I      intronic chr1:65670104(+) A-I      intronic chr1:65621555(+) A-I      intronic chr1:65689092(+) A-I      intronic chr1:65670067(+) A-I      intronic chr1:65654633(+) A-I      intronic chr1:65669983(+) A-I      intronic chr1:65654010(+) A-I      intronic chr1:65659689(+) A-I      intronic chr1:65624301(+) A-I      intronic chr1:65668770(+) A-I      intronic chr1:65670022(+) A-I      intronic chr1:65659552(+) A-I      intronic chr1:65620994(+) A-I      intronic chr1:65622520(+) A-I      intronic chr1:65626540(+) A-I      intronic chr1:65626417(+) A-I      intronic chr1:65659700(+) A-I      intronic chr1:65621049(+) A-I      intronic chr1:65623322(+) A-I      intronic chr1:65689559(+) A-I      intronic chr1:65626326(+) A-I      intronic chr1:65659655(+) A-I      intronic chr1:65668808(+) A-I      intronic chr1:65639458(+) A-I      intronic chr1:65626602(+) A-I      intronic chr1:65667933(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	AK4	chr1:65626602(+) A-G intron -    22484847 chr1:65620634(+) A-G intron -    22484847 chr1:65620637(+) A-G intron -    22484847 chr1:65620941(+) A-G intron -    22484847 chr1:65621479(+) A-G intron -    22484847 chr1:65622352(+) A-G intron -    22484847 chr1:65622485(+) A-G intron -    22484847 chr1:65623387(+) A-G intron -    22484847 chr1:65624301(+) A-G intron -    22484847 chr1:65626326(+) A-G intron -    22484847 chr1:65626475(+) A-G intron -    22484847 chr1:65626539(+) A-G intron -    22484847 chr1:65632224(+) A-G intron -    22484847 chr1:65632225(+) A-G intron -    22484847 chr1:65632736(+) A-G intron -    22484847 chr1:65636005(+) C-G intron -    22484847 chr1:65637473(+) A-G intron -    22484847 chr1:65637683(+) A-G intron -    22484847 chr1:65659528(+) A-G intron -    22484847 chr1:65659552(+) A-G intron -    22484847 chr1:65659655(+) A-G intron -    22484847 chr1:65659689(+) A-G intron -    22484847 chr1:65659700(+) A-G intron -    22484847 chr1:65660214(+) A-G intron -    22484847 chr1:65660245(+) A-G intron -    22484847 chr1:65660248(+) A-G intron -    22484847 chr1:65660249(+) A-G intron -    22484847 chr1:65660274(+) A-G intron -    22484847 chr1:65660286(+) A-G intron -    22484847 chr1:65666595(+) A-G intron -    22484847 chr1:65667959(+) A-G intron -    22484847 chr1:65668695(+) A-G intron -    22484847 chr1:65668808(+) A-G intron -    22484847 chr1:65669340(+) A-G intron -    22484847 chr1:65669360(+) A-G intron -    22484847 chr1:65669367(+) A-G intron -    22484847 chr1:65669947(+) A-G intron -    22484847 chr1:65669983(+) A-G intron -    22484847 chr1:65670022(+) A-G intron -    22484847 chr1:65670028(+) A-G intron -    22484847 chr1:65670067(+) A-G intron -    22484847 chr1:65670073(+) A-G intron -    22484847 chr1:65670104(+) A-G intron -    22484847 chr1:65672994(+) G-T intron -    22484847 chr1:65678235(+) A-G intron -    22484847 chr1:65688901(+) A-G intron -    22484847 chr1:65689029(+) A-G intron -    22484847 chr1:65689092(+) A-G intron -    22484847 chr1:65689449(+) A-G intron -    22484847 chr1:65689533(+) A-G intron -    22484847 chr1:65689541(+) A-G intron -    22484847 chr1:65695103(+) G-A intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	AK4	chr1:65656443-65656444(+) m6A CDS//exon       - chr1:65656482-65656483(+) m6A CDS//exon       - chr1:65684447-65684448(+) m6A CDS//exon       - chr1:65684455-65684456(+) m6A CDS//exon       - chr1:65684472-65684473(+) m6A CDS//exon       - chr1:65692622-65692623(+) m6A 3'UTR       24981863 chr1:65692649-65692650(+) m6A 3'UTR       24981863 chr1:65695852-65695853(+) m6A 3'UTR       - chr1:65695991-65695992(+) m6A 3'UTR       - chr1:65696022-65696023(+) m6A 3'UTR       -

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	AK4	Chromatin K562 cells     - Exosome Blood     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H6-3p
Interactor2: AK4

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//Targetscan
Support Database	VmiReg