Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00096116

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H5-3p:  MIMAT0008403          NSUN4:  NM_001387266     

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Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H5-3p	NSUN4
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0008403	387338
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	SHTAP

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	NSUN4	chr1:46813055(+) A-I      intronic chr1:46822977(+) A-I      intronic chr1:46824731(+) A-I      intronic chr1:46824765(+) A-I      intronic chr1:46825964(+) A-I      intronic chr1:46812900(+) A-I      intronic chr1:46814232(+) A-I      intronic chr1:46826000(+) A-I      intronic chr1:46812914(+) A-I      intronic chr1:46812926(+) A-I      intronic chr1:46829681(+) A-I      3'UTR chr1:46830265(+) A-I      3'UTR chr1:46830256(+) A-I      3'UTR chr1:46830208(+) A-I      3'UTR chr1:46830156(+) A-I      3'UTR chr1:46829726(+) A-I      3'UTR chr1:46829720(+) A-I      3'UTR chr1:46812934(+) A-I      intronic chr1:46814270(+) A-I      intronic chr1:46822005(+) A-I      intronic chr1:46822008(+) A-I      intronic chr1:46817476(+) A-I      intronic chr1:46817388(+) A-I      intronic chr1:46817316(+) A-I      intronic chr1:46817288(+) A-I      intronic chr1:46822030(+) A-I      intronic chr1:46817274(+) A-I      intronic chr1:46817248(+) A-I      intronic chr1:46817236(+) A-I 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RNA Localization:

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Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H5-3p
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Evidence Support:

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Support Database	RepTar//VmiReg