Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00095463

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2202

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H5-3p:  MIMAT0008403          FMNL2:  NM_052905     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H5-3p	FMNL2
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0008403	114793
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	FHOD2

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	FMNL2	chr2:153447624(+) A-I      intronic chr2:153489633(+) A-I      intronic chr2:153481143(+) A-I      intronic chr2:153499451(+) A-I      intronic chr2:153332030(+) A-I      intronic chr2:153336999(+) A-I      intronic chr2:153203444(+) A-I      intronic chr2:153203525(+) A-I      intronic chr2:153202736(+) A-I      intronic chr2:153203526(+) A-I      intronic chr2:153203534(+) A-I      intronic chr2:153296704(+) A-I      intronic chr2:153196579(+) A-I      intronic chr2:153312346(+) A-I      intronic chr2:153469209(+) A-I      intronic chr2:153221347(+) A-I      intronic chr2:153499384(+) A-I      intronic chr2:153207836(+) A-I      intronic chr2:153469275(+) A-I      intronic chr2:153279304(+) A-I      intronic chr2:153279307(+) A-I      intronic chr2:153288279(+) A-I      intronic chr2:153223641(+) A-I      intronic chr2:153223693(+) A-I      intronic chr2:153223751(+) A-I      intronic chr2:153223756(+) A-I      intronic chr2:153336873(+) A-I      intronic chr2:153223775(+) A-I      intronic chr2:153223787(+) A-I      intronic chr2:153234571(+) A-I      intronic chr2:153256872(+) A-I      intronic chr2:153312403(+) A-I      intronic chr2:153312414(+) A-I      intronic chr2:153330518(+) A-I      intronic chr2:153330522(+) A-I      intronic chr2:153330665(+) A-I      intronic chr2:153330966(+) A-I      intronic chr2:153330970(+) A-I      intronic chr2:153331023(+) A-I      intronic chr2:153332913(+) A-I      intronic chr2:153332929(+) A-I      intronic chr2:153332951(+) A-I      intronic chr2:153332952(+) A-I      intronic chr2:153333090(+) A-I      intronic chr2:153333161(+) A-I      intronic chr2:153256891(+) A-I      intronic chr2:153336944(+) A-I      intronic chr2:153337018(+) A-I      intronic chr2:153337028(+) A-I      intronic chr2:153337051(+) A-I      intronic chr2:153256895(+) A-I      intronic chr2:153499408(+) A-I      intronic chr2:153499335(+) A-I      intronic chr2:153499265(+) A-I      intronic chr2:153498715(+) A-I      intronic chr2:153498653(+) A-I      intronic chr2:153498636(+) A-I      intronic chr2:153498556(+) A-I      intronic chr2:153481189(+) A-I      intronic chr2:153481138(+) A-I      intronic chr2:153481128(+) A-I      intronic chr2:153337060(+) A-I      intronic chr2:153480906(+) A-I      intronic chr2:153480830(+) A-I      intronic chr2:153469229(+) A-I      intronic chr2:153469210(+) A-I      intronic chr2:153469204(+) A-I      intronic chr2:153469173(+) A-I      intronic chr2:153469153(+) A-I      intronic chr2:153468975(+) A-I      intronic chr2:153468869(+) A-I      intronic chr2:153468780(+) A-I      intronic chr2:153468779(+) A-I      intronic chr2:153461907(+) A-I      intronic chr2:153452016(+) A-I      intronic chr2:153448430(+) A-I      intronic chr2:153448042(+) A-I      intronic chr2:153447736(+) A-I      intronic chr2:153447030(+) A-I      intronic chr2:153446882(+) A-I      intronic chr2:153446877(+) A-I      intronic chr2:153446876(+) A-I      intronic chr2:153446668(+) A-I      intronic chr2:153430799(+) A-I      intronic chr2:153430785(+) A-I      intronic chr2:153430702(+) A-I      intronic chr2:153430678(+) A-I      intronic chr2:153426129(+) A-I      intronic chr2:153426116(+) A-I      intronic chr2:153256900(+) A-I      intronic chr2:153422531(+) A-I      intronic chr2:153422517(+) A-I      intronic chr2:153288298(+) A-I      intronic chr2:153288347(+) A-I      intronic chr2:153288363(+) A-I      intronic chr2:153288404(+) A-I      intronic chr2:153298243(+) A-I      intronic chr2:153298331(+) A-I      intronic chr2:153300312(+) A-I      intronic chr2:153310671(+) A-I      intronic chr2:153418339(+) A-I      intronic chr2:153418301(+) A-I      intronic chr2:153403596(+) A-I      intronic chr2:153403589(+) A-I      intronic chr2:153400757(+) A-I      intronic chr2:153397812(+) A-I      intronic chr2:153360861(+) A-I      intronic chr2:153360626(+) A-I      intronic chr2:153360584(+) A-I      intronic chr2:153360525(+) A-I      intronic chr2:153341866(+) A-I      intronic chr2:153340972(+) A-I      intronic chr2:153200053(+) A-I      intronic chr2:153196462(+) A-I      intronic chr2:153199909(+) A-I      intronic chr2:153199990(+) A-I      intronic chr2:153200000(+) A-I      intronic chr2:153200438(+) A-I      intronic chr2:153200441(+) A-I      intronic chr2:153200466(+) A-I      intronic chr2:153200484(+) A-I      intronic chr2:153200522(+) A-I      intronic chr2:153312268(+) A-I      intronic chr2:153312341(+) A-I      intronic chr2:153200536(+) A-I      intronic chr2:153200631(+) A-I      intronic chr2:153312368(+) A-I      intronic chr2:153312374(+) A-I      intronic chr2:153312386(+) A-I      intronic chr2:153202705(+) A-I      intronic chr2:153202713(+) A-I      intronic chr2:153202748(+) A-I      intronic chr2:153202768(+) A-I      intronic chr2:153202800(+) A-I      intronic chr2:153215018(+) A-I      intronic chr2:153215044(+) A-I      intronic chr2:153337094(+) A-I      intronic chr2:153344327(+) A-I      intronic chr2:153300210(+) A-I      intronic chr2:153258561(+) A-I      intronic chr2:153337061(+) A-I      intronic chr2:153498639(+) A-I      intronic chr2:153296652(+) A-I      intronic chr2:153481187(+) A-I      intronic chr2:153337029(+) A-I      intronic chr2:153258678(+) A-I      intronic chr2:153468976(+) A-I      intronic chr2:153202704(+) A-I      intronic chr2:153298235(+) A-I      intronic chr2:153288357(+) A-I      intronic chr2:153481199(+) A-I      intronic chr2:153480789(+) A-I      intronic chr2:153481237(+) A-I      intronic chr2:153426289(+) A-I      intronic chr2:153234601(+) A-I      intronic chr2:153298195(+) A-I      intronic chr2:153207349(+) A-I      intronic chr2:153223729(+) A-I      intronic chr2:153448341(+) A-I      intronic chr2:153421234(+) A-I      intronic chr2:153228036(+) A-I      intronic chr2:153421035(+) A-I      intronic chr2:153335853(+) A-I      intronic chr2:153403637(+) A-I      intronic chr2:153360549(+) A-I      intronic chr2:153298299(+) A-I      intronic chr2:153499343(+) A-I      intronic chr2:153207304(+) A-I      intronic chr2:153337070(+) A-I      intronic chr2:153499402(+) A-I      intronic chr2:153345430(+) A-I      intronic chr2:153448124(+) A-I      intronic chr2:153298985(+) A-I      intronic chr2:153300206(+) A-I      intronic chr2:153481146(+) A-I      intronic chr2:153481175(+) A-I      intronic chr2:153468843(+) A-I      intronic chr2:153312358(+) A-I      intronic chr2:153499293(+) A-I      intronic chr2:153335724(+) A-I      intronic chr2:153203156(+) A-I      intronic chr2:153202686(+) A-I      intronic chr2:153196437(+) A-I      intronic chr2:153310529(+) A-I      intronic chr2:153345431(+) A-I      intronic chr2:153223337(+) A-I      intronic chr2:153202813(+) A-I      intronic chr2:153196594(+) A-I      intronic chr2:153469337(+) A-I      intronic chr2:153254558(+) A-I      intronic chr2:153313216(+) A-I      intronic chr2:153447754(+) A-I      intronic chr2:153463002(+) A-I      intronic chr2:153481285(+) A-I      intronic chr2:153234576(+) A-I      intronic chr2:153430788(+) A-I      intronic chr2:153202904(+) A-I      intronic chr2:153223276(+) A-I      intronic chr2:153421159(+) A-I      intronic chr2:153341884(+) A-I      intronic chr2:153199863(+) A-I      intronic chr2:153207303(+) A-I      intronic chr2:153297930(+) A-I      intronic chr2:153421022(+) A-I      intronic chr2:153298946(+) A-I      intronic chr2:153296703(+) A-I      intronic chr2:153498594(+) A-I      intronic chr2:153447641(+) A-I      intronic chr2:153232651(+) A-I      intronic chr2:153490797(+) A-I      intronic chr2:153360546(+) A-I      intronic chr2:153424918(+) A-I      intronic chr2:153480772(+) A-I      intronic chr2:153446674(+) A-I      intronic chr2:153203093(+) A-I      intronic chr2:153200586(+) A-I      intronic chr2:153421167(+) A-I      intronic chr2:153499380(+) A-I      intronic chr2:153200594(+) A-I      intronic chr2:153468937(+) A-I      intronic chr2:153469306(+) A-I      intronic chr2:153258489(+) A-I      intronic chr2:153447115(+) A-I      intronic chr2:153279182(+) A-I      intronic chr2:153481157(+) A-I      intronic chr2:153448213(+) A-I      intronic chr2:153336998(+) A-I      intronic chr2:153468986(+) A-I      intronic chr2:153298822(+) A-I      intronic chr2:153447116(+) A-I      intronic chr2:153223281(+) A-I      intronic chr2:153499359(+) A-I      intronic chr2:153310697(+) A-I      intronic chr2:153344441(+) A-I      intronic chr2:153303891(+) A-I      intronic chr2:153223790(+) A-I      intronic chr2:153420964(+) A-I      intronic chr2:153403679(+) A-I      intronic chr2:153426446(+) A-I      intronic chr2:153232482(+) A-I      intronic chr2:153499403(+) A-I      intronic chr2:153333040(+) A-I      intronic chr2:153430723(+) A-I      intronic chr2:153430687(+) A-I      intronic chr2:153202905(+) A-I      intronic chr2:153499540(+) A-I      intronic chr2:153287240(+) A-I      intronic chr2:153196513(+) A-I      intronic chr2:153254437(+) A-I      intronic chr2:153418113(+) A-I      intronic chr2:153303689(+) A-I      intronic chr2:153312277(+) A-I      intronic chr2:153422556(+) A-I      intronic chr2:153223459(+) A-I      intronic chr2:153256836(+) A-I      intronic chr2:153234475(+) A-I      intronic chr2:153499443(+) A-I      intronic chr2:153279155(+) A-I      intronic chr2:153499444(+) A-I      intronic chr2:153232488(+) A-I      intronic chr2:153481190(+) A-I      intronic chr2:153498716(+) A-I      intronic chr2:153468838(+) A-I      intronic chr2:153337002(+) A-I      intronic chr2:153489703(+) A-I      intronic chr2:153234505(+) A-I      intronic chr2:153400693(+) A-I      intronic chr2:153313189(+) A-I      intronic chr2:153303708(+) A-I      intronic chr2:153298189(+) A-I      intronic chr2:153446396(+) A-I      intronic chr2:153500614(+) A-I      intronic chr2:153499322(+) A-I      intronic chr2:153256791(+) A-I      intronic chr2:153200654(+) A-I      intronic chr2:153447034(+) A-I      intronic chr2:153200486(+) A-I      intronic chr2:153498728(+) A-I      intronic chr2:153332293(+) A-I      intronic chr2:153489711(+) A-I      intronic chr2:153345334(+) A-I      intronic chr2:153223359(+) A-I      intronic chr2:153269047(+) A-I      intronic chr2:153223774(+) A-I      intronic chr2:153360574(+) A-I      intronic chr2:153422433(+) A-I      intronic chr2:153300099(+) A-I      intronic chr2:153447664(+) A-I      intronic chr2:153499412(+) A-I      intronic chr2:153480933(+) A-I      intronic chr2:153203458(+) A-I      intronic chr2:153292845(+) A-I      intronic chr2:153422423(+) A-I      intronic chr2:153200555(+) A-I      intronic chr2:153298905(+) A-I      intronic chr2:153418227(+) A-I      intronic chr2:153462975(+) A-I      intronic chr2:153298304(+) A-I      intronic chr2:153318522(+) A-I      intronic chr2:153332994(+) A-I      intronic chr2:153300254(+) A-I      intronic chr2:153360540(+) A-I      intronic chr2:153426404(+) A-I      intronic chr2:153499468(+) A-I      intronic chr2:153313358(+) A-I      intronic chr2:153200084(+) A-I      intronic chr2:153200615(+) A-I      intronic chr2:153196620(+) A-I      intronic chr2:153397810(+) A-I      intronic chr2:153447007(+) A-I      intronic chr2:153481296(+) A-I      intronic chr2:153300156(+) A-I      intronic chr2:153447552(+) A-I      intronic chr2:153480837(+) A-I      intronic chr2:153447103(+) A-I      intronic chr2:153203085(+) A-I      intronic chr2:153300236(+) A-I      intronic chr2:153298096(+) A-I      intronic chr2:153200544(+) A-I      intronic chr2:153303718(+) A-I      intronic chr2:153345438(+) A-I      intronic chr2:153490692(+) A-I      intronic chr2:153480838(+) A-I      intronic chr2:153481338(+) A-I      intronic chr2:153222005(+) A-I      intronic chr2:153480805(+) A-I      intronic chr2:153202638(+) A-I      intronic chr2:153424872(+) A-I      intronic chr2:153469161(+) A-I      intronic chr2:153256709(+) A-I      intronic chr2:153448275(+) A-I      intronic chr2:153468796(+) A-I      intronic chr2:153481241(+) A-I      intronic chr2:153312978(+) A-I      intronic chr2:153318510(+) A-I      intronic chr2:153360594(+) A-I      intronic chr2:153360900(+) A-I      intronic chr2:153223648(+) A-I      intronic chr2:153200519(+) A-I      intronic chr2:153202719(+) A-I      intronic chr2:153480940(+) A-I      intronic chr2:153426405(+) A-I      intronic chr2:153447649(+) A-I      intronic chr2:153400698(+) A-I      intronic chr2:153447652(+) A-I      intronic chr2:153490867(+) A-I      intronic chr2:153312298(+) A-I      intronic chr2:153202558(+) A-I      intronic chr2:153318509(+) A-I      intronic chr2:153310676(+) A-I      intronic chr2:153481202(+) A-I      intronic chr2:153199890(+) A-I      intronic chr2:153498535(+) A-I      intronic chr2:153360927(+) A-I      intronic chr2:153446413(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	FMNL2	chr2:153246720(+) A-I intron -    22327324 chr2:153246864(+) A-I intron -    22327324 chr2:153502814(+) A-I intron -    21960545 chr2:153275896(+) A-G intron -    22484847 chr2:153275900(+) A-G intron -    22484847 chr2:153200654(+) A-G intron -    22484847 chr2:153202558(+) A-G intron -    22484847 chr2:153202639(+) A-G intron -    22484847 chr2:153202749(+) A-G intron -    22484847 chr2:153202773(+) A-G intron -    22484847 chr2:153202801(+) A-G intron -    22484847 chr2:153212692(+) C-T intron -    22484847 chr2:153223279(+) A-G intron -    22484847 chr2:153223281(+) A-G intron -    22484847 chr2:153223648(+) A-G intron -    22484847 chr2:153291764(+) A-G intron -    22484847 chr2:153300254(+) A-G intron -    22484847 chr2:153448070(+) A-G intron -    22484847 chr2:153448124(+) A-G intron -    22484847 chr2:153467771(+) T-C intron -    22484847 chr2:153469161(+) A-G intron -    22484847 chr2:153480771(+) A-G intron -    22484847 chr2:153480772(+) A-G intron -    22484847 chr2:153480789(+) A-G intron -    22484847 chr2:153480805(+) A-G intron -    22484847 chr2:153480837(+) A-G intron -    22484847 chr2:153480933(+) A-G intron -    22484847 chr2:153481190(+) A-G intron -    22484847 chr2:153498572(+) A-G intron -    22484847 chr2:153498584(+) A-G intron -    22484847 chr2:153498594(+) A-G intron -    22484847 chr2:153499338(+) T-C intron -    22484847 chr2:153499341(+) T-C intron -    22484847 chr2:153499402(+) A-G intron -    22484847 chr2:153499411(+) T-C intron -    22484847 chr2:153499447(+) T-C intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	FMNL2	chr2:153191786-153191787(+) m6A 5'UTR       24981863 chr2:153246491-153246492(+) m6A intron       - chr2:153246616-153246617(+) m6A intron       - chr2:153471492-153471493(+) m6A CDS       27773535 chr2:153471503-153471504(+) m6A CDS       27773535 chr2:153473615-153473616(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr2:153473623-153473624(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr2:153473657-153473658(+) m6A CDS       24981863//27773535 chr2:153473683-153473684(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr2:153475436-153475437(+) m6A CDS       24284625//24981863//27773535//22608085 chr2:153475475-153475476(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr2:153475482-153475483(+) m6A CDS       24981863//27773535//22608085 chr2:153475589-153475590(+) m6A CDS       24981863//26404942//22608085 chr2:153475616-153475617(+) m6A CDS       24981863 chr2:153483074-153483075(+) m6A CDS//exon       26404942 chr2:153483088-153483089(+) m6A CDS//exon       26404942 chr2:153483115-153483116(+) m6A CDS//exon       26404942 chr2:153483141-153483142(+) m6A CDS//exon       24981863//26404942 chr2:153483165-153483166(+) m6A CDS//exon       24981863//26404942 chr2:153483209-153483210(+) m6A CDS//exon       24981863//26404942 chr2:153484825-153484826(+) m6A CDS       26404942 chr2:153484838-153484839(+) m6A CDS       26404942 chr2:153492991-153492992(+) m6A CDS       26404942 chr2:153496509-153496510(+) m6A CDS       24981863 chr2:153496527-153496528(+) m6A CDS       24981863 chr2:153497381-153497382(+) m6A CDS       24981863 chr2:153499940-153499941(+) m6A CDS//intron       24981863 chr2:153504318-153504319(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//22608085 chr2:153504381-153504382(+) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863//26404942//22575960//22608085 chr2:153504419-153504420(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22575960//22608085 chr2:153504426-153504427(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22575960//22608085 chr2:153504462-153504463(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22575960//22608085 chr2:153504475-153504476(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22575960//22608085 chr2:153504508-153504509(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22575960//22608085 chr2:153504547-153504548(+) m6A 3'UTR       24284625//24981863//26404942//22575960//22608085 chr2:153506198-153506199(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	FMNL2	Cytosol HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     - Endoplasmic reticulum Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Exosome Blood     - Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)     - Membrane HCC cell line (HepG2)     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H5-3p
Interactor2: FMNL2

Evidence Support:

Prediction-Evidence	cRep//miRanda
Support Database	RepTar//VmiReg