Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00091812

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2455

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H4-3p:           ZNF626:      

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Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsv1-miR-H4-3p ZNF626
miRBase
Accession/Entrez ID		 MIMAT0008402 199777
Organism Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - -

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR ZNF626
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chr19:20804169(-) A-I exon 3'UTR    15342557
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chr19:20843499(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase ZNF626
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chr19:20806272-20806273(-) m6A 3'UTR       24981863
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chr19:20806910-20806911(-) m6A 3'UTR//CDS       27773535
chr19:20807413-20807414(-) m6A CDS       27773535
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chr19:20808361-20808362(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr19:20808431-20808432(-) m6A CDS       24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate ZNF626
Exosome Blood     -
Nucleoplasm K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsv1-miR-H4-3p
Interactor2: ZNF626

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//Rep//Targetscan
Support Database RepTar//VmiReg

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