Basic Information:

  VIRBase ID:  

VHID00088318

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H4-5p:  MIMAT0008401          EPB41L5:  NM_001184938     

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:

	Interactor1	Interactor2
Symbol	hsv1-miR-H4-5p	EPB41L5
miRBase Accession/Entrez ID	MIMAT0008401	57669
Organism	Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)	Homo sapiens
Category	miRNA	mRNA
Alias	-	BE37//LULU//LULU1//YMO1//YRT

RNA Editing:

Resource	Symbol	Editing Position	Change	Genetic Region
RADAR	EPB41L5	chr2:120873503(+) A-I      intronic chr2:120873576(+) A-I      intronic chr2:120918775(+) A-I      intronic chr2:120918758(+) A-I      intronic chr2:120918770(+) A-I      intronic chr2:120878531(+) A-I      intronic chr2:120878595(+) A-I      intronic chr2:120878613(+) A-I      intronic chr2:120873419(+) A-I      intronic chr2:120878605(+) A-I      intronic chr2:120851797(+) A-I      intronic chr2:120851798(+) A-I      intronic chr2:120851801(+) A-I      intronic chr2:120918753(+) A-I      intronic chr2:120873683(+) A-I      intronic chr2:120881443(+) A-I      intronic chr2:120851802(+) A-I      intronic chr2:120873496(+) A-I      intronic chr2:120784159(+) A-I      intronic chr2:120785518(+) A-I      intronic chr2:120785519(+) A-I      intronic chr2:120785538(+) A-I      intronic chr2:120785701(+) A-I      intronic chr2:120785839(+) A-I      intronic chr2:120785968(+) A-I      intronic chr2:120786037(+) A-I      intronic chr2:120788634(+) A-I      intronic chr2:120788642(+) A-I      intronic chr2:120789847(+) A-I      intronic chr2:120791613(+) A-I      intronic chr2:120791621(+) A-I      intronic chr2:120792888(+) A-I      intronic chr2:120878534(+) A-I      intronic chr2:120812582(+) A-I      intronic chr2:120812588(+) A-I      intronic chr2:120822917(+) A-I      intronic chr2:120826583(+) A-I      intronic chr2:120826584(+) A-I      intronic chr2:120851735(+) A-I      intronic chr2:120853338(+) A-I      intronic chr2:120853344(+) A-I      intronic chr2:120853345(+) A-I      intronic chr2:120853431(+) A-I      intronic chr2:120853507(+) A-I      intronic chr2:120853522(+) A-I      intronic chr2:120853529(+) A-I      intronic chr2:120854132(+) A-I      intronic chr2:120854141(+) A-I      intronic chr2:120854156(+) A-I      intronic chr2:120854246(+) A-I      intronic chr2:120854270(+) A-I      intronic chr2:120854277(+) A-I      intronic chr2:120873101(+) A-I      intronic chr2:120873165(+) A-I      intronic chr2:120873177(+) A-I      intronic chr2:120873227(+) A-I      intronic chr2:120873228(+) A-I      intronic chr2:120873240(+) A-I      intronic chr2:120874212(+) A-I      intronic chr2:120874252(+) A-I      intronic chr2:120874294(+) A-I      intronic chr2:120878477(+) A-I      intronic chr2:120878516(+) A-I      intronic chr2:120931282(+) A-I      intronic chr2:120918752(+) A-I      intronic chr2:120878527(+) A-I      intronic chr2:120918699(+) A-I      intronic chr2:120918698(+) A-I      intronic chr2:120918696(+) A-I      intronic chr2:120918692(+) A-I      intronic chr2:120853426(+) A-I      intronic chr2:120912387(+) A-I      intronic chr2:120912381(+) A-I      intronic chr2:120912379(+) A-I      intronic chr2:120911869(+) A-I      intronic chr2:120909402(+) A-I      intronic chr2:120908705(+) A-I      intronic chr2:120908129(+) A-I      intronic chr2:120908119(+) A-I      intronic chr2:120907702(+) A-I      intronic chr2:120907570(+) A-I      intronic chr2:120907562(+) A-I      intronic chr2:120907534(+) A-I      intronic chr2:120904819(+) A-I      intronic chr2:120904650(+) A-I      intronic chr2:120878634(+) A-I      intronic chr2:120878536(+) A-I      intronic chr2:120773907(+) A-I      intronic chr2:120775728(+) A-I      intronic chr2:120778731(+) A-I      intronic chr2:120783981(+) A-I      intronic chr2:120855911(+) A-I      intronic chr2:120773010(+) A-I      intronic chr2:120881508(+) A-I      intronic chr2:120853384(+) A-I      intronic chr2:120854348(+) A-I      intronic chr2:120877871(+) A-I      intronic chr2:120873649(+) A-I      intronic chr2:120908777(+) A-I      intronic chr2:120878530(+) A-I      intronic chr2:120814494(+) A-I      intronic chr2:120921740(+) A-I      intronic chr2:120855809(+) A-I      intronic chr2:120854287(+) A-I      intronic chr2:120922008(+) A-I      intronic chr2:120921990(+) A-I      intronic chr2:120801284(+) A-I      intronic chr2:120854219(+) A-I      intronic chr2:120874339(+) A-I      intronic chr2:120931904(+) A-I      intronic chr2:120911798(+) A-I      intronic chr2:120912225(+) A-I      intronic chr2:120921711(+) A-I      intronic chr2:120785956(+) A-I      intronic chr2:120877929(+) A-I      intronic chr2:120784086(+) A-I      intronic chr2:120878594(+) A-I      intronic chr2:120931822(+) A-I      intronic chr2:120877780(+) A-I      intronic chr2:120931902(+) A-I      intronic chr2:120930602(+) A-I      intronic chr2:120874121(+) A-I      intronic chr2:120854286(+) A-I      intronic chr2:120874191(+) A-I      intronic chr2:120873151(+) A-I      intronic chr2:120907598(+) A-I      intronic chr2:120920574(+) A-I      intronic chr2:120854117(+) A-I      intronic chr2:120773885(+) A-I      intronic chr2:120873609(+) A-I      intronic chr2:120908755(+) A-I      intronic chr2:120853374(+) A-I      intronic chr2:120851729(+) A-I      intronic chr2:120905097(+) A-I      intronic chr2:120908165(+) A-I      intronic chr2:120786954(+) A-I      intronic chr2:120855885(+) A-I      intronic chr2:120931407(+) A-I      intronic chr2:120931777(+) A-I      intronic chr2:120931328(+) A-I      intronic chr2:120878414(+) A-I      intronic chr2:120905011(+) A-I      intronic chr2:120874313(+) A-I      intronic chr2:120793237(+) A-I      intronic chr2:120877914(+) A-I      intronic chr2:120853520(+) A-I      intronic chr2:120911799(+) A-I      intronic chr2:120873485(+) A-I      intronic chr2:120931760(+) A-I      intronic chr2:120873567(+) A-I      intronic chr2:120785209(+) A-I      intronic chr2:120784084(+) A-I      intronic chr2:120854278(+) A-I      intronic chr2:120931986(+) A-I      intronic chr2:120881373(+) A-I      intronic chr2:120931976(+) A-I      intronic chr2:120873091(+) A-I      intronic chr2:120855971(+) A-I      intronic chr2:120851728(+) A-I      intronic chr2:120854146(+) A-I      intronic chr2:120873479(+) A-I      intronic chr2:120920554(+) A-I      intronic chr2:120878542(+) A-I      intronic chr2:120877887(+) A-I      intronic chr2:120853371(+) A-I      intronic chr2:120931405(+) A-I      intronic chr2:120873570(+) A-I      intronic chr2:120874234(+) A-I      intronic chr2:120874224(+) A-I      intronic chr2:120873515(+) A-I      intronic chr2:120874242(+) A-I      intronic chr2:120905103(+) A-I      intronic chr2:120854151(+) A-I      intronic chr2:120877877(+) A-I      intronic chr2:120908765(+) A-I      intronic chr2:120857202(+) A-I      intronic chr2:120775750(+) A-I      intronic chr2:120877928(+) A-I      intronic chr2:120874318(+) A-I      intronic chr2:120881313(+) A-I      intronic chr2:120814740(+) A-I      intronic chr2:120801465(+) A-I      intronic chr2:120930603(+) A-I      intronic chr2:120877743(+) A-I      intronic chr2:120854316(+) A-I      intronic chr2:120924073(+) A-I      intronic chr2:120853514(+) A-I      intronic chr2:120874221(+) A-I      intronic chr2:120923423(+) A-I      intronic chr2:120921972(+) A-I      intronic chr2:120921973(+) A-I      intronic chr2:120878676(+) A-I      intronic

Resource	Symbol	Editing Position	Change	SeqReg	exReg	PMID
DARNED	EPB41L5	chr2:120874221(+) A-I intron -    21960545 chr2:120878414(+) A-I intron -    21960545 chr2:120931282(+) A-I intron -    21960545 chr2:120821132(+) G-A intron -    22484847 chr2:120919425(+) A-G intron -    22484847 chr2:120773885(+) A-G intron -    22484847 chr2:120775750(+) A-G intron -    22484847 chr2:120784086(+) A-G intron -    22484847 chr2:120784145(+) A-G intron -    22484847 chr2:120801465(+) A-G intron -    22484847 chr2:120822906(+) A-G intron -    22484847 chr2:120853371(+) A-G intron -    22484847 chr2:120853374(+) A-G intron -    22484847 chr2:120853384(+) A-G intron -    22484847 chr2:120853410(+) A-G intron -    22484847 chr2:120868367(+) T-C intron -    22484847 chr2:120873091(+) A-G intron -    22484847 chr2:120873485(+) A-G intron -    22484847 chr2:120873498(+) A-G intron -    22484847 chr2:120874165(+) A-G intron -    22484847 chr2:120874191(+) A-G intron -    22484847 chr2:120874224(+) A-G intron -    22484847 chr2:120874228(+) A-G intron -    22484847 chr2:120874234(+) A-G intron -    22484847 chr2:120874242(+) A-G intron -    22484847 chr2:120874318(+) A-G intron -    22484847 chr2:120908730(+) T-C intron -    22484847 chr2:120911876(+) A-G intron -    22484847 chr2:120912225(+) A-G intron -    22484847 chr2:120912248(+) A-G intron -    22484847 chr2:120920645(+) T-C intron -    22484847 chr2:120920662(+) T-C intron -    22484847 chr2:120921972(+) A-G intron -    22484847 chr2:120921973(+) A-G intron -    22484847 chr2:120921990(+) A-G intron -    22484847 chr2:120922008(+) A-G intron -    22484847 chr2:120922038(+) T-C intron -    22484847 chr2:120923444(+) T-C intron -    22484847 chr2:120924193(+) T-C intron -    22484847 chr2:120924285(+) T-C intron -    22484847 chr2:120930602(+) A-G intron -    22484847 chr2:120930603(+) A-G intron -    22484847 chr2:120931822(+) A-G intron -    22484847 chr2:120931824(+) A-G intron -    22484847 chr2:120931902(+) A-G intron -    22484847 chr2:120931976(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:

Resource	Symbol	ModificationPosition	Type	Genomic Context	PMID
RMBase	EPB41L5	chr2:120861708-120861709(+) m6A CDS//intron       24981863 chr2:120861721-120861722(+) m6A CDS//intron       24981863 chr2:120861840-120861841(+) m6A 3'UTR//intron       24981863 chr2:120932625-120932626(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr2:120932701-120932702(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085 chr2:120934901-120934902(+) m6A 3'UTR       24981863 chr2:120936615-120936616(+) m6A 3'UTR       27773535 chr2:120936650-120936651(+) m6A 3'UTR       27773535 chr2:120936677-120936678(+) m6A 3'UTR       27773535 chr2:120936688-120936689(+) m6A 3'UTR       27773535

RNA Localization:

Resource	Symbol	Subcellular Localization	Tissue or Cell Line	PMID
RNALocate	EPB41L5	Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539 Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Exosome Blood     - Membrane HCC cell line (HepG2)     - Nucleolus K562 cells     - Nucleoplasm K562 cells     - Nucleus HCC cell line (HepG2)|K562 cells     - Ribosome HEK-293 cells     22199352 Ribosome Colon cancer cells     24393600

Related Drug Information:

Resource	Symbol	Drug Name	PubChem ID
RNAactDrug	hsv1-miR-H4-5p	Topotecan       60700

Interaction Network (The top 100 interactions):

Interactor1: hsv1-miR-H4-5p
Interactor2: EPB41L5

Evidence Support:

Prediction-Evidence	miRanda//PITA//Targetscan
Support Database	VmiReg