Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00075815

  Virus:  

Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.2381

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

  Predicted Binding:

 

      hsv1-miR-H1-5p:           ARID1B:      

      *It may take a few minutes to display results.

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol hsv1-miR-H1-5p ARID1B
miRBase
Accession/Entrez ID
MIMAT0003744 57492
Organism Human alphaherpesvirus 1 (HSV-1) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - 6A3-5//BAF250B//BRIGHT//CSS1//DAN15//ELD/OSA1//MRD12//OSA2//P250R

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR ARID1B
chr6:157463633(+) A-I      intronic
chr6:157463639(+) A-I      intronic
chr6:157463640(+) A-I      intronic
chr6:157304368(+) A-I      intronic
chr6:157304371(+) A-I      intronic
chr6:157304408(+) A-I      intronic
chr6:157463653(+) A-I      intronic
chr6:157463679(+) A-I      intronic
chr6:157304409(+) A-I      intronic
chr6:157308155(+) A-I      intronic
chr6:157371603(+) A-I      intronic
chr6:157371623(+) A-I      intronic
chr6:157304364(+) A-I      intronic
chr6:157304345(+) A-I      intronic
chr6:157304343(+) A-I      intronic
chr6:157228869(+) A-I      intronic
chr6:157463680(+) A-I      intronic
chr6:157435456(+) A-I      intronic
chr6:157435467(+) A-I      intronic
chr6:157435471(+) A-I      intronic
chr6:157435495(+) A-I      intronic
chr6:157228860(+) A-I      intronic
chr6:157228845(+) A-I      intronic
chr6:157371633(+) A-I      intronic
chr6:157371635(+) A-I      intronic
chr6:157371638(+) A-I      intronic
chr6:157435501(+) A-I      intronic
chr6:157463626(+) A-I      intronic
chr6:157435496(+) A-I      intronic
chr6:157375254(+) A-I      intronic
chr6:157374953(+) A-I      intronic
chr6:157374375(+) A-I      intronic
chr6:157374323(+) A-I      intronic
chr6:157374126(+) A-I      intronic
chr6:157374037(+) A-I      intronic
chr6:157373934(+) A-I      intronic
chr6:157373917(+) A-I      intronic
chr6:157345837(+) A-I      intronic
chr6:157345812(+) A-I      intronic
chr6:157345632(+) A-I      intronic
chr6:157339559(+) A-I      intronic
chr6:157339530(+) A-I      intronic
chr6:157339431(+) A-I      intronic
chr6:157339057(+) A-I      intronic
chr6:157325085(+) A-I      intronic
chr6:157325067(+) A-I      intronic
chr6:157325054(+) A-I      intronic
chr6:157312409(+) A-I      intronic
chr6:157311720(+) A-I      intronic
chr6:157311687(+) A-I      intronic
chr6:157311660(+) A-I      intronic
chr6:157311625(+) A-I      intronic
chr6:157435447(+) A-I      intronic
chr6:157435396(+) A-I      intronic
chr6:157283270(+) A-I      intronic
chr6:157435384(+) A-I      intronic
chr6:157434277(+) A-I      intronic
chr6:157434201(+) A-I      intronic
chr6:157311565(+) A-I      intronic
chr6:157311560(+) A-I      intronic
chr6:157308726(+) A-I      intronic
chr6:157308671(+) A-I      intronic
chr6:157308058(+) A-I      intronic
chr6:157308663(+) A-I      intronic
chr6:157308649(+) A-I      intronic
chr6:157308520(+) A-I      intronic
chr6:157308127(+) A-I      intronic
chr6:157308103(+) A-I      intronic
chr6:157434195(+) A-I      intronic
chr6:157434190(+) A-I      intronic
chr6:157434185(+) A-I      intronic
chr6:157434181(+) A-I      intronic
chr6:157434156(+) A-I      intronic
chr6:157308063(+) A-I      intronic
chr6:157434155(+) A-I      intronic
chr6:157434117(+) A-I      intronic
chr6:157403705(+) A-I      intronic
chr6:157383496(+) A-I      intronic
chr6:157378352(+) A-I      intronic
chr6:157375308(+) A-I      intronic
chr6:157375278(+) A-I      intronic
chr6:157120847(+) A-I      intronic
chr6:157121474(+) A-I      intronic
chr6:157121545(+) A-I      intronic
chr6:157121572(+) A-I      intronic
chr6:157121576(+) A-I      intronic
chr6:157121580(+) A-I      intronic
chr6:157133395(+) A-I      intronic
chr6:157134342(+) A-I      intronic
chr6:157134367(+) A-I      intronic
chr6:157134379(+) A-I      intronic
chr6:157308097(+) A-I      intronic
chr6:157134385(+) A-I      intronic
chr6:157134481(+) A-I      intronic
chr6:157134485(+) A-I      intronic
chr6:157134515(+) A-I      intronic
chr6:157145644(+) A-I      intronic
chr6:157145649(+) A-I      intronic
chr6:157145675(+) A-I      intronic
chr6:157145715(+) A-I      intronic
chr6:157145721(+) A-I      intronic
chr6:157145778(+) A-I      intronic
chr6:157145788(+) A-I      intronic
chr6:157145814(+) A-I      intronic
chr6:157146196(+) A-I      intronic
chr6:157156259(+) A-I      intronic
chr6:157156271(+) A-I      intronic
chr6:157156979(+) A-I      intronic
chr6:157157012(+) A-I      intronic
chr6:157179796(+) A-I      intronic
chr6:157179809(+) A-I      intronic
chr6:157180271(+) A-I      intronic
chr6:157180273(+) A-I      intronic
chr6:157214318(+) A-I      intronic
chr6:157214322(+) A-I      intronic
chr6:157218574(+) A-I      intronic
chr6:157228899(+) A-I      intronic
chr6:157228974(+) A-I      intronic
chr6:157229270(+) A-I      intronic
chr6:157230446(+) A-I      intronic
chr6:157236463(+) A-I      intronic
chr6:157236627(+) A-I      intronic
chr6:157246514(+) A-I      intronic
chr6:157246516(+) A-I      intronic
chr6:157246568(+) A-I      intronic
chr6:157269401(+) A-I      intronic
chr6:157281158(+) A-I      intronic
chr6:157281182(+) A-I      intronic
chr6:157281239(+) A-I      intronic
chr6:157281248(+) A-I      intronic
chr6:157281269(+) A-I      intronic
chr6:157375267(+) A-I      intronic
chr6:157283271(+) A-I      intronic
chr6:157283276(+) A-I      intronic
chr6:157283279(+) A-I      intronic
chr6:157283281(+) A-I      intronic
chr6:157283286(+) A-I      intronic
chr6:157283374(+) A-I      intronic
chr6:157283413(+) A-I      intronic
chr6:157435537(+) A-I      intronic
chr6:157283756(+) A-I      intronic
chr6:157283799(+) A-I      intronic
chr6:157459395(+) A-I      intronic
chr6:157304311(+) A-I      intronic
chr6:157284017(+) A-I      intronic
chr6:157284057(+) A-I      intronic
chr6:157300772(+) A-I      intronic
chr6:157300785(+) A-I      intronic
chr6:157300791(+) A-I      intronic
chr6:157300809(+) A-I      intronic
chr6:157300866(+) A-I      intronic
chr6:157300875(+) A-I      intronic
chr6:157300952(+) A-I      intronic
chr6:157301355(+) A-I      intronic
chr6:157301367(+) A-I      intronic
chr6:157301439(+) A-I      intronic
chr6:157301458(+) A-I      intronic
chr6:157301464(+) A-I      intronic
chr6:157301465(+) A-I      intronic
chr6:157301558(+) A-I      intronic
chr6:157301619(+) A-I      intronic
chr6:157304319(+) A-I      intronic
chr6:157516142(+) A-I      intronic
chr6:157463629(+) A-I      intronic
chr6:157463550(+) A-I      intronic
chr6:157461559(+) A-I      intronic
chr6:157461510(+) A-I      intronic
chr6:157461483(+) A-I      intronic
chr6:157461405(+) A-I      intronic
chr6:157459482(+) A-I      intronic
chr6:157459469(+) A-I      intronic
chr6:157458083(+) A-I      intronic
chr6:157451074(+) A-I      intronic
chr6:157451048(+) A-I      intronic
chr6:157449071(+) A-I      intronic
chr6:157449046(+) A-I      intronic
chr6:157449045(+) A-I      intronic
chr6:157304492(+) A-I      intronic
chr6:157449037(+) A-I      intronic
chr6:157448989(+) A-I      intronic
chr6:157448975(+) A-I      intronic
chr6:157448953(+) A-I      intronic
chr6:157436768(+) A-I      intronic
chr6:157436700(+) A-I      intronic
chr6:157436690(+) A-I      intronic
chr6:157436625(+) A-I      intronic
chr6:157436624(+) A-I      intronic
chr6:157436584(+) A-I      intronic
chr6:157435678(+) A-I      intronic
chr6:157435676(+) A-I      intronic
chr6:157435578(+) A-I      intronic
chr6:157435551(+) A-I      intronic
chr6:157435547(+) A-I      intronic
chr6:157435519(+) A-I      intronic
chr6:157435515(+) A-I      intronic
chr6:157435512(+) A-I      intronic
chr6:157304327(+) A-I      intronic
chr6:157304328(+) A-I      intronic
chr6:157304333(+) A-I      intronic
chr6:157305844(+) A-I      intronic
chr6:157305906(+) A-I      intronic
chr6:157306080(+) A-I      intronic
chr6:157306093(+) A-I      intronic
chr6:157435511(+) A-I      intronic
chr6:157435481(+) A-I      intronic
chr6:157435473(+) A-I      intronic
chr6:157311894(+) A-I      intronic
chr6:157240890(+) A-I      intronic
chr6:157461489(+) A-I      intronic
chr6:157461038(+) A-I      intronic
chr6:157300894(+) A-I      intronic
chr6:157374294(+) A-I      intronic
chr6:157312420(+) A-I      intronic
chr6:157373993(+) A-I      intronic
chr6:157458102(+) A-I      intronic
chr6:157306038(+) A-I      intronic
chr6:157300821(+) A-I      intronic
chr6:157461422(+) A-I      intronic
chr6:157228816(+) A-I      intronic
chr6:157301529(+) A-I      intronic
chr6:157120711(+) A-I      intronic
chr6:157267130(+) A-I      intronic
chr6:157217760(+) A-I      intronic
chr6:157240845(+) A-I      intronic
chr6:157373957(+) A-I      intronic
chr6:157305872(+) A-I      intronic
chr6:157180267(+) A-I      intronic
chr6:157230409(+) A-I      intronic
chr6:157374034(+) A-I      intronic
chr6:157284034(+) A-I      intronic
chr6:157227521(+) A-I      intronic
chr6:157121926(+) A-I      intronic
chr6:157240906(+) A-I      intronic
chr6:157145679(+) A-I      intronic
chr6:157374944(+) A-I      intronic
chr6:157126983(+) A-I      intronic
chr6:157373954(+) A-I      intronic
chr6:157308157(+) A-I      intronic
chr6:157217857(+) A-I      intronic
chr6:157237019(+) A-I      intronic
chr6:157281287(+) A-I      intronic
chr6:157371658(+) A-I      intronic
chr6:157311515(+) A-I      intronic
chr6:157125342(+) A-I      intronic
chr6:157375307(+) A-I      intronic
chr6:157461354(+) A-I      intronic
chr6:157459401(+) A-I      intronic
chr6:157434238(+) A-I      intronic
chr6:157433224(+) A-I      intronic
chr6:157457905(+) A-I      intronic
chr6:157459586(+) A-I      intronic
chr6:157257719(+) A-I      intronic
chr6:157252070(+) A-I      intronic
chr6:157236555(+) A-I      intronic
chr6:157459582(+) A-I      intronic
chr6:157461388(+) A-I      intronic
chr6:157219930(+) A-I      intronic
chr6:157156950(+) A-I      intronic
chr6:157257321(+) A-I      intronic
chr6:157375340(+) A-I      intronic
chr6:157146233(+) A-I      intronic
chr6:157339552(+) A-I      intronic
chr6:157179848(+) A-I      intronic
chr6:157121859(+) A-I      intronic
chr6:157267413(+) A-I      intronic
chr6:157283746(+) A-I      intronic
chr6:157461068(+) A-I      intronic
chr6:157304450(+) A-I      intronic
chr6:157121592(+) A-I      intronic
chr6:157228903(+) A-I      intronic
chr6:157237018(+) A-I      intronic
chr6:157449562(+) A-I      intronic
chr6:157304109(+) A-I      intronic
chr6:157325274(+) A-I      intronic
chr6:157120750(+) A-I      intronic
chr6:157461326(+) A-I      intronic
chr6:157145627(+) A-I      intronic
chr6:157308152(+) A-I      intronic
chr6:157311599(+) A-I      intronic
chr6:157135330(+) A-I      intronic
chr6:157339622(+) A-I      intronic
chr6:157461032(+) A-I      intronic
chr6:157311406(+) A-I      intronic
chr6:157459468(+) A-I      intronic
chr6:157284100(+) A-I      intronic
chr6:157375345(+) A-I      intronic
chr6:157311624(+) A-I      intronic
chr6:157217855(+) A-I      intronic
chr6:157236514(+) A-I      intronic
chr6:157301362(+) A-I      intronic
chr6:157460920(+) A-I      intronic
chr6:157157015(+) A-I      intronic
chr6:157375237(+) A-I      intronic
chr6:157138367(+) A-I      intronic
chr6:157305921(+) A-I      intronic
chr6:157308160(+) A-I      intronic
chr6:157135286(+) A-I      intronic
chr6:157474957(+) A-I      intronic
chr6:157311407(+) A-I      intronic
chr6:157113482(+) A-I      intronic
chr6:157459515(+) A-I      intronic
chr6:157339003(+) A-I      intronic
chr6:157459499(+) A-I      intronic
chr6:157373980(+) A-I      intronic
chr6:157374113(+) A-I      intronic
chr6:157257700(+) A-I      intronic
chr6:157269595(+) A-I      intronic
chr6:157375238(+) A-I      intronic
chr6:157269596(+) A-I      intronic
chr6:157179782(+) A-I      intronic
chr6:157283729(+) A-I      intronic
chr6:157218537(+) A-I      intronic
chr6:157266966(+) A-I      intronic
chr6:157283782(+) A-I      intronic
chr6:157345785(+) A-I      intronic
chr6:157121468(+) A-I      intronic
chr6:157306105(+) A-I      intronic
chr6:157339119(+) A-I      intronic
chr6:157460960(+) A-I      intronic
chr6:157120821(+) A-I      intronic
chr6:157218477(+) A-I      intronic
chr6:157339444(+) A-I      intronic
chr6:157339004(+) A-I      intronic
chr6:157227585(+) A-I      intronic
chr6:157145643(+) A-I      intronic
chr6:157182634(+) A-I      intronic
chr6:157308057(+) A-I      intronic
chr6:157339005(+) A-I      intronic
chr6:157257365(+) A-I      intronic
chr6:157459450(+) A-I      intronic
chr6:157374015(+) A-I      intronic
chr6:157312421(+) A-I      intronic
chr6:157146242(+) A-I      intronic
chr6:157374337(+) A-I      intronic
chr6:157308159(+) A-I      intronic
chr6:157339507(+) A-I      intronic
chr6:157479050(+) A-I      intronic
chr6:157311681(+) A-I      intronic
chr6:157120812(+) A-I      intronic
chr6:157284055(+) A-I      intronic
chr6:157459640(+) A-I      intronic
chr6:157283643(+) A-I      intronic
chr6:157374359(+) A-I      intronic
chr6:157179852(+) A-I      intronic
chr6:157266112(+) A-I      intronic
chr6:157236581(+) A-I      intronic
chr6:157339425(+) A-I      intronic
chr6:157304314(+) A-I      intronic
chr6:157230443(+) A-I      intronic
chr6:157121469(+) A-I      intronic
chr6:157460961(+) A-I      intronic
chr6:157459562(+) A-I      intronic
chr6:157311690(+) A-I      intronic
chr6:157308590(+) A-I      intronic
chr6:157156185(+) A-I      intronic
chr6:157373953(+) A-I      intronic
chr6:157339468(+) A-I      intronic
chr6:157120864(+) A-I      intronic
chr6:157312549(+) A-I      intronic
chr6:157378337(+) A-I      intronic
chr6:157461462(+) A-I      intronic
chr6:157305951(+) A-I      intronic
chr6:157120809(+) A-I      intronic
chr6:157301555(+) A-I      intronic
chr6:157324922(+) A-I      intronic
chr6:157227529(+) A-I      intronic
chr6:157304092(+) A-I      intronic
chr6:157300853(+) A-I      intronic
chr6:157301497(+) A-I      intronic
chr6:157156988(+) A-I      intronic
chr6:157311339(+) A-I      intronic
chr6:157458153(+) A-I      intronic
chr6:157458147(+) A-I      intronic
chr6:157339127(+) A-I      intronic
chr6:157146164(+) A-I      intronic
chr6:157284190(+) A-I      intronic
chr6:157300901(+) A-I      intronic
chr6:157479072(+) A-I      intronic
chr6:157120704(+) A-I      intronic
chr6:157461389(+) A-I      intronic
chr6:157301441(+) A-I      intronic
chr6:157218591(+) A-I      intronic
chr6:157474887(+) A-I      intronic
chr6:157145670(+) A-I      intronic
chr6:157120886(+) A-I      intronic
chr6:157339191(+) A-I      intronic
chr6:157306102(+) A-I      intronic
chr6:157283728(+) A-I      intronic
chr6:157461525(+) A-I      intronic
chr6:157461524(+) A-I      intronic
chr6:157345786(+) A-I      intronic
chr6:157257199(+) A-I      intronic
chr6:157312546(+) A-I      intronic
chr6:157304358(+) A-I      intronic
chr6:157228866(+) A-I      intronic
chr6:157115453(+) A-I      intronic
chr6:157486782(+) A-I      intronic
chr6:157156980(+) A-I      intronic
chr6:157374129(+) A-I      intronic
chr6:157311664(+) A-I      intronic
chr6:157308582(+) A-I      intronic
chr6:157458097(+) A-I      intronic
chr6:157126939(+) A-I      intronic
chr6:157308134(+) A-I      intronic
chr6:157122473(+) A-I      intronic
chr6:157301470(+) A-I      intronic
chr6:157434247(+) A-I      intronic
chr6:157301407(+) A-I      intronic
chr6:157308738(+) A-I      intronic
chr6:157375346(+) A-I      intronic
chr6:157179742(+) A-I      intronic
chr6:157312640(+) A-I      intronic
chr6:157461055(+) A-I      intronic
chr6:157283353(+) A-I      intronic
chr6:157228762(+) A-I      intronic
chr6:157267213(+) A-I      intronic
chr6:157121603(+) A-I      intronic
chr6:157304373(+) A-I      intronic
chr6:157308205(+) A-I      intronic
chr6:157145747(+) A-I      intronic
chr6:157156900(+) A-I      intronic
chr6:157156941(+) A-I      intronic
chr6:157135340(+) A-I      intronic
chr6:157308153(+) A-I      intronic
chr6:157461519(+) A-I      intronic
chr6:157156113(+) A-I      intronic
chr6:157378270(+) A-I      intronic
chr6:157291265(+) A-I      intronic
chr6:157113515(+) A-I      intronic
chr6:157339180(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED ARID1B
chr6:157373953(+) A-I intron -    21960545
chr6:157373954(+) A-I intron -    21960545
chr6:157113515(+) A-G intron -    22484847
chr6:157120704(+) A-G intron -    22484847
chr6:157120711(+) A-G intron -    22484847
chr6:157120809(+) A-G intron -    22484847
chr6:157120812(+) A-G intron -    22484847
chr6:157120886(+) A-G intron -    22484847
chr6:157121469(+) A-G intron -    22484847
chr6:157121544(+) A-G intron -    22484847
chr6:157125231(+) A-G intron -    22484847
chr6:157125342(+) A-G intron -    22484847
chr6:157135286(+) A-G intron -    22484847
chr6:157135320(+) T-C intron -    22484847
chr6:157135330(+) A-G intron -    22484847
chr6:157135340(+) A-G intron -    22484847
chr6:157145627(+) A-G intron -    22484847
chr6:157145643(+) A-G intron -    22484847
chr6:157145670(+) A-G intron -    22484847
chr6:157145679(+) A-G intron -    22484847
chr6:157145716(+) A-G intron -    22484847
chr6:157145747(+) A-G intron -    22484847
chr6:157146233(+) A-G intron -    22484847
chr6:157146242(+) A-G intron -    22484847
chr6:157146251(+) A-G intron -    22484847
chr6:157156095(+) G-A intron -    22484847
chr6:157156113(+) A-G intron -    22484847
chr6:157156114(+) A-G intron -    22484847
chr6:157156280(+) A-G intron -    22484847
chr6:157156900(+) A-G intron -    22484847
chr6:157156941(+) A-G intron -    22484847
chr6:157156977(+) A-G intron -    22484847
chr6:157156980(+) A-G intron -    22484847
chr6:157156988(+) A-G intron -    22484847
chr6:157157015(+) A-G intron -    22484847
chr6:157179724(+) A-C intron -    22484847
chr6:157179828(+) A-G intron -    22484847
chr6:157218477(+) A-G intron -    22484847
chr6:157218582(+) A-G intron -    22484847
chr6:157218591(+) A-G intron -    22484847
chr6:157219930(+) A-G intron -    22484847
chr6:157228816(+) A-G intron -    22484847
chr6:157230409(+) A-G intron -    22484847
chr6:157266111(+) T-C intron -    22484847
chr6:157267213(+) A-G intron -    22484847
chr6:157281165(+) A-G intron -    22484847
chr6:157283353(+) A-G intron -    22484847
chr6:157283628(+) A-G intron -    22484847
chr6:157283728(+) A-G intron -    22484847
chr6:157283729(+) A-G intron -    22484847
chr6:157283949(+) A-G intron -    22484847
chr6:157284034(+) A-G intron -    22484847
chr6:157284045(+) A-G intron -    22484847
chr6:157284055(+) A-G intron -    22484847
chr6:157287530(+) T-C intron -    22484847
chr6:157291232(+) G-T intron -    22484847
chr6:157300761(+) A-G intron -    22484847
chr6:157300771(+) A-G intron -    22484847
chr6:157300804(+) A-G intron -    22484847
chr6:157300821(+) A-G intron -    22484847
chr6:157300853(+) A-G intron -    22484847
chr6:157300857(+) A-G intron -    22484847
chr6:157300858(+) A-G intron -    22484847
chr6:157300901(+) A-G intron -    22484847
chr6:157301361(+) A-G intron -    22484847
chr6:157301362(+) A-G intron -    22484847
chr6:157301407(+) A-G intron -    22484847
chr6:157301441(+) A-G intron -    22484847
chr6:157301466(+) A-G intron -    22484847
chr6:157301467(+) A-G intron -    22484847
chr6:157301470(+) A-G intron -    22484847
chr6:157301497(+) A-G intron -    22484847
chr6:157301524(+) A-G intron -    22484847
chr6:157301529(+) A-G intron -    22484847
chr6:157301555(+) A-G intron -    22484847
chr6:157301562(+) A-G intron -    22484847
chr6:157301623(+) C-A intron -    22484847
chr6:157301643(+) T-C intron -    22484847
chr6:157304092(+) A-G intron -    22484847
chr6:157304109(+) A-G intron -    22484847
chr6:157304358(+) A-G intron -    22484847
chr6:157305921(+) A-G intron -    22484847
chr6:157305934(+) A-G intron -    22484847
chr6:157306002(+) A-G intron -    22484847
chr6:157306038(+) A-G intron -    22484847
chr6:157306047(+) T-C intron -    22484847
chr6:157306102(+) A-G intron -    22484847
chr6:157308057(+) A-G intron -    22484847
chr6:157308064(+) A-G intron -    22484847
chr6:157308088(+) A-G intron -    22484847
chr6:157308134(+) A-G intron -    22484847
chr6:157308149(+) A-G intron -    22484847
chr6:157308152(+) A-G intron -    22484847
chr6:157308153(+) A-G intron -    22484847
chr6:157308157(+) A-G intron -    22484847
chr6:157308159(+) A-G intron -    22484847
chr6:157308167(+) A-G intron -    22484847
chr6:157308205(+) A-G intron -    22484847
chr6:157308582(+) A-G intron -    22484847
chr6:157308590(+) A-G intron -    22484847
chr6:157308654(+) T-C intron -    22484847
chr6:157311327(+) A-T intron -    22484847
chr6:157311328(+) A-T intron -    22484847
chr6:157311329(+) A-T intron -    22484847
chr6:157311339(+) A-G intron -    22484847
chr6:157311406(+) A-G intron -    22484847
chr6:157311407(+) A-G intron -    22484847
chr6:157311515(+) A-G intron -    22484847
chr6:157311610(+) A-G intron -    22484847
chr6:157311664(+) A-G intron -    22484847
chr6:157311681(+) A-G intron -    22484847
chr6:157311690(+) A-G intron -    22484847
chr6:157311727(+) A-G intron -    22484847
chr6:157311815(+) A-G intron -    22484847
chr6:157312421(+) A-G intron -    22484847
chr6:157325241(+) A-G intron -    22484847
chr6:157326050(+) T-G intron -    22484847
chr6:157328886(+) C-G intron -    22484847
chr6:157328888(+) G-C intron -    22484847
chr6:157339005(+) A-G intron -    22484847
chr6:157339097(+) C-A intron -    22484847
chr6:157339119(+) A-G intron -    22484847
chr6:157339167(+) A-G intron -    22484847
chr6:157339444(+) A-G intron -    22484847
chr6:157339489(+) A-G intron -    22484847
chr6:157339552(+) A-G intron -    22484847
chr6:157345686(+) A-G intron -    22484847
chr6:157373953(+) A-G intron -    22484847
chr6:157373954(+) A-G intron -    22484847
chr6:157373957(+) A-G intron -    22484847
chr6:157373993(+) A-G intron -    22484847
chr6:157374015(+) A-G intron -    22484847
chr6:157374034(+) A-G intron -    22484847
chr6:157374104(+) A-G intron -    22484847
chr6:157374337(+) A-G intron -    22484847
chr6:157374944(+) A-G intron -    22484847
chr6:157375237(+) A-G intron -    22484847
chr6:157375238(+) A-G intron -    22484847
chr6:157375307(+) A-G intron -    22484847
chr6:157375340(+) A-G intron -    22484847
chr6:157375345(+) A-G intron -    22484847
chr6:157378216(+) C-T intron -    22484847
chr6:157378270(+) A-G intron -    22484847
chr6:157378337(+) A-G intron -    22484847
chr6:157379492(+) G-A intron -    22484847
chr6:157449562(+) A-G intron -    22484847
chr6:157458102(+) A-G intron -    22484847
chr6:157459401(+) A-G intron -    22484847
chr6:157459582(+) A-G intron -    22484847
chr6:157459586(+) A-G intron -    22484847
chr6:157460920(+) A-G intron -    22484847
chr6:157460926(+) A-G intron -    22484847
chr6:157460960(+) A-G intron -    22484847
chr6:157460961(+) A-G intron -    22484847
chr6:157460990(+) A-G intron -    22484847
chr6:157461055(+) A-G intron -    22484847
chr6:157461058(+) A-G intron -    22484847
chr6:157461068(+) A-G intron -    22484847
chr6:157461326(+) A-G intron -    22484847
chr6:157461348(+) A-G intron -    22484847
chr6:157461354(+) A-G intron -    22484847
chr6:157461388(+) A-G intron -    22484847
chr6:157461389(+) A-G intron -    22484847
chr6:157461422(+) A-G intron -    22484847
chr6:157461462(+) A-G intron -    22484847
chr6:157461463(+) A-G intron -    22484847
chr6:157461489(+) A-G intron -    22484847
chr6:157461519(+) A-G intron -    22484847
chr6:157461524(+) A-G intron -    22484847
chr6:157461525(+) A-G intron -    22484847
chr6:157474847(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase ARID1B
chr6:157099266-157099267(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr6:157099273-157099274(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863
chr6:157099394-157099395(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863
chr6:157099553-157099554(+) m6A CDS       24209618//24981863//22575960
chr6:157099833-157099834(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960
chr6:157099904-157099905(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157099916-157099917(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157100288-157100289(+) m6A CDS       24209618
chr6:157100495-157100496(+) m6A CDS       24209618//25456834//24981863
chr6:157100583-157100584(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960
chr6:157150392-157150393(+) m6A CDS//exon       24284625
chr6:157150513-157150514(+) m6A CDS//exon       24284625
chr6:157191266-157191267(+) m6A exon//intron       24284625
chr6:157192774-157192775(+) m6A CDS//intron       24284625
chr6:157222526-157222527(+) m6A CDS       24284625
chr6:157256623-157256624(+) m6A CDS//exon       24284625
chr6:157256655-157256656(+) m6A CDS//exon       24284625
chr6:157256669-157256670(+) m6A CDS//exon       24284625
chr6:157256675-157256676(+) m6A CDS//exon       24284625
chr6:157256694-157256695(+) m6A CDS//exon       24284625
chr6:157298203-157298204(+) Y intron       25219674
chr6:157469857-157469858(+) m6A CDS//exon       -
chr6:157469922-157469923(+) m6A CDS//exon       -
chr6:157488307-157488308(+) m6A CDS       -
chr6:157495184-157495185(+) m6A CDS       -
chr6:157505530-157505531(+) m6A CDS       -
chr6:157511236-157511237(+) m6A CDS       -
chr6:157511320-157511321(+) m6A CDS       -
chr6:157517332-157517333(+) m6A CDS       24284625
chr6:157517358-157517359(+) m6A CDS       24284625
chr6:157519950-157519951(+) m6A CDS       24284625
chr6:157519992-157519993(+) m6A CDS       24284625
chr6:157521971-157521972(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22608085
chr6:157522045-157522046(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157522157-157522158(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085
chr6:157522208-157522209(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22575960//22608085
chr6:157522421-157522422(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863
chr6:157522590-157522591(+) m6A CDS       24284625
chr6:157525071-157525072(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085
chr6:157527317-157527318(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//22608085
chr6:157527388-157527389(+) m6A CDS       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085
chr6:157527526-157527527(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085
chr6:157527537-157527538(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22608085
chr6:157527592-157527593(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157527658-157527659(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157527768-157527769(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157527952-157527953(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157527966-157527967(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528018-157528019(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528059-157528060(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528090-157528091(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528175-157528176(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528254-157528255(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr6:157528279-157528280(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr6:157528318-157528319(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528381-157528382(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528487-157528488(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528514-157528515(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528527-157528528(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528538-157528539(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528552-157528553(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528564-157528565(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528645-157528646(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528684-157528685(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528747-157528748(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528838-157528839(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528852-157528853(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528906-157528907(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//22575960//22608085
chr6:157528969-157528970(+) m6A CDS       24284625//24209618//25456834//24981863//27773535//22575960//22608085
chr6:157529190-157529191(+) m6A 3'UTR       24209618//24981863//22608085
chr6:157529488-157529489(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr6:157529579-157529580(+) m6A 3'UTR       24209618//24981863//22608085
chr6:157529638-157529639(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr6:157529661-157529662(+) Y 3'UTR       26075521
chr6:157529685-157529686(+) m6A 3'UTR       24981863//22608085
chr6:157530003-157530004(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085
chr6:157530009-157530010(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085
chr6:157530199-157530200(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535//22608085
chr6:157530283-157530284(+) m6A 3'UTR       24981863//27773535
chr6:157531543-157531544(+) m6A 3'UTR       22608085
chr6:157531636-157531637(+) m6A 3'UTR       22608085
chr6:157531650-157531651(+) m6A 3'UTR       22608085

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate hsv1-miR-H1-5p
Exosome Jurkat-derived T cell line (J77cl20)     21505438
ARID1B
Chromatin K562 cells     -
Cytosol HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|HeLa-S3 cells|K562 cells     -
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: hsv1-miR-H1-5p
Interactor2: ARID1B

Evidence Support:


Prediction-Evidence cRep//miRanda//Targetscan
Support Database RepTar//VmiReg

Starting a new search, please wait ...