Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00069563

  Virus:  

Zika virus (ZIKV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.1828

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol zikv-mir-9 GVINP1
miRBase
Accession/Entrez ID		 zikv-mir-9 387751
Organism Zika virus (ZIKV) Homo sapiens
Category miRNA pseudo
Alias - GVIN1//GVIN1P//VLIG-1//VLIG1

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED GVINP1
chr11:6734503(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chr11:6734504(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chr11:6734559(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chr11:6734875(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chr11:6735207(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //22327324
chr11:6735208(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chr11:6735234(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //22327324
chr11:6735278(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //22327324
chr11:6735281(-) A-I exon 3'UTR    15342557   //22327324
chr11:6735343(-) A-I exon 3'UTR    15342557
chr11:6735272(-) A-I intron -    22327324
chr11:6734383(-) G-A intron -    22484847
chr11:6734480(-) A-G intron -    22484847
chr11:6734554(-) A-G intron -    22484847
chr11:6734559(-) A-G intron -    22484847
chr11:6734560(-) A-G intron -    22484847
chr11:6734561(-) A-G intron -    22484847
chr11:6734603(-) A-G intron -    22484847
chr11:6735207(-) A-G intron -    22484847
chr11:6735208(-) A-G intron -    22484847
chr11:6735234(-) A-G intron -    22484847
chr11:6735272(-) A-G intron -    22484847
chr11:6735278(-) A-G intron -    22484847
chr11:6735281(-) A-G intron -    22484847
chr11:6735331(-) A-G intron -    22484847
chr11:6735343(-) A-G intron -    22484847
chr11:6735360(-) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase GVINP1
chr11:6735667-6735668(-) m6A exon       -
chr11:6735751-6735752(-) m6A exon       -
chr11:6735773-6735774(-) m6A exon       -
chr11:6735784-6735785(-) m6A exon       27773535
chr11:6735847-6735848(-) m6A exon       -
chr11:6735857-6735858(-) m6A exon       -
chr11:6736046-6736047(-) m6A exon       -
chr11:6736137-6736138(-) m6A exon       27371828
chr11:6736193-6736194(-) m6A exon       27371828
chr11:6736217-6736218(-) m6A exon       27371828
chr11:6736249-6736250(-) m6A exon       27371828
chr11:6736270-6736271(-) m6A exon       27371828
chr11:6736333-6736334(-) m6A exon       26404942//27371828
chr11:6736396-6736397(-) m6A exon       26404942//27371828
chr11:6736411-6736412(-) m6A exon       26404942//27371828
chr11:6736427-6736428(-) m6A exon       26404942//27371828
chr11:6736584-6736585(-) m6A exon       28052920//27773535
chr11:6736607-6736608(-) m6A exon       28052920//26404942//27773535
chr11:6736694-6736695(-) m6A exon       26404942
chr11:6736726-6736727(-) m6A exon       26404942
chr11:6736740-6736741(-) m6A exon       26404942
chr11:6736745-6736746(-) m6A exon       26404942
chr11:6736778-6736779(-) m6A exon       -
chr11:6736802-6736803(-) m6A exon       -
chr11:6736863-6736864(-) m6A exon       -
chr11:6736937-6736938(-) m6A exon       -
chr11:6737091-6737092(-) m6A exon       26404942
chr11:6737137-6737138(-) m6A exon       26404942
chr11:6737535-6737536(-) m6A exon       -
chr11:6737567-6737568(-) m6A exon       -
chr11:6737584-6737585(-) m6A exon       26404942
chr11:6737596-6737597(-) m6A exon       26404942
chr11:6737617-6737618(-) m6A exon       26404942
chr11:6737651-6737652(-) m6A exon       26404942
chr11:6737710-6737711(-) m6A exon       26404942
chr11:6737772-6737773(-) m6A exon       26404942//27371828
chr11:6737810-6737811(-) m6A exon       26404942//27371828
chr11:6737847-6737848(-) m6A exon       26404942//27371828
chr11:6737865-6737866(-) m6A exon       26404942//27371828
chr11:6737876-6737877(-) m6A exon       26404942//27371828
chr11:6737900-6737901(-) m6A exon       26404942//27371828
chr11:6737921-6737922(-) m6A exon       26404942//27371828
chr11:6737987-6737988(-) m6A exon       27371828
chr11:6738240-6738241(-) m6A exon       26404942
chr11:6738245-6738246(-) m6A exon       26404942
chr11:6738310-6738311(-) m6A exon       26404942
chr11:6738398-6738399(-) m6A exon       26404942//27371828
chr11:6738406-6738407(-) m6A exon       26404942//27371828
chr11:6738434-6738435(-) m6A exon       26404942//27371828
chr11:6738460-6738461(-) m6A exon       27371828
chr11:6738475-6738476(-) m6A exon       27371828
chr11:6738485-6738486(-) m6A exon       27371828
chr11:6738514-6738515(-) m6A exon       27371828
chr11:6738528-6738529(-) m6A exon       27371828
chr11:6738674-6738675(-) m6A exon       -
chr11:6738682-6738683(-) m6A exon       -
chr11:6738782-6738783(-) m6A exon       -
chr11:6738978-6738979(-) m6A exon       27773535//27371828
chr11:6739018-6739019(-) m6A exon       27371828
chr11:6739030-6739031(-) m6A exon       27371828
chr11:6739046-6739047(-) m6A exon       27371828
chr11:6739081-6739082(-) m6A exon       27371828
chr11:6739165-6739166(-) m6A exon       27773535
chr11:6739183-6739184(-) m6A exon       27773535
chr11:6739191-6739192(-) m6A exon       27773535
chr11:6739213-6739214(-) m6A exon       27773535
chr11:6739252-6739253(-) m6A exon       27773535
chr11:6739259-6739260(-) m6A exon       27773535
chr11:6739288-6739289(-) m6A exon       27773535//27371828
chr11:6739385-6739386(-) m6A exon       27371828
chr11:6739394-6739395(-) m6A exon       27371828
chr11:6739439-6739440(-) m6A exon       27371828
chr11:6739468-6739469(-) m6A exon       27371828
chr11:6739480-6739481(-) m6A exon       27371828
chr11:6739498-6739499(-) m6A exon       27371828
chr11:6739778-6739779(-) m6A exon       27371828
chr11:6739841-6739842(-) m6A exon       27371828
chr11:6739885-6739886(-) m6A exon       -
chr11:6739907-6739908(-) m6A exon       -
chr11:6740006-6740007(-) m6A exon       -
chr11:6740158-6740159(-) m6A exon       -
chr11:6740261-6740262(-) m6A exon       27773535
chr11:6740273-6740274(-) m6A exon       27773535
chr11:6740332-6740333(-) m6A exon       27773535
chr11:6740339-6740340(-) m6A exon       27773535
chr11:6740392-6740393(-) m6A exon       27773535
chr11:6740422-6740423(-) m6A exon       27773535
chr11:6740506-6740507(-) m6A exon       -
chr11:6740531-6740532(-) m6A exon       -
chr11:6740587-6740588(-) m6A exon       27773535
chr11:6740599-6740600(-) m6A exon       27773535
chr11:6740696-6740697(-) m6A exon       26404942
chr11:6740708-6740709(-) m6A exon       26404942
chr11:6740734-6740735(-) m6A exon       26404942
chr11:6740773-6740774(-) m6A exon       26404942
chr11:6740785-6740786(-) m6A exon       26404942
chr11:6740808-6740809(-) m6A exon       26404942
chr11:6741048-6741049(-) m6A exon       -
chr11:6741057-6741058(-) m6A exon       -
chr11:6741135-6741136(-) m6A exon       -
chr11:6741183-6741184(-) m6A exon       -
chr11:6741290-6741291(-) m6A exon       -
chr11:6741351-6741352(-) m6A exon       -
chr11:6741389-6741390(-) m6A exon       -
chr11:6741457-6741458(-) m6A exon       -
chr11:6741490-6741491(-) m6A exon       -
chr11:6741629-6741630(-) m6A exon       27371828
chr11:6741695-6741696(-) m6A exon       -
chr11:6741741-6741742(-) m6A exon       27371828
chr11:6741807-6741808(-) m6A exon       27371828
chr11:6741834-6741835(-) m6A exon       27371828
chr11:6741842-6741843(-) m6A exon       27371828
chr11:6741852-6741853(-) m6A exon       27371828
chr11:6741858-6741859(-) m6A exon       27371828
chr11:6741870-6741871(-) m6A exon       27371828
chr11:6741884-6741885(-) m6A exon       27371828
chr11:6741935-6741936(-) m6A exon       27371828
chr11:6741950-6741951(-) m6A exon       27371828
chr11:6742088-6742089(-) m6A exon       -
chr11:6742601-6742602(-) m6A exon       27773535//27371828
chr11:6742620-6742621(-) m6A exon       27773535//27371828
chr11:6742642-6742643(-) m6A exon       27773535//27371828
chr11:6742652-6742653(-) m6A exon       27773535//27371828
chr11:6742663-6742664(-) m6A exon       27773535//27371828
chr11:6742709-6742710(-) m6A exon       27773535//27371828
chr11:6742740-6742741(-) m6A exon       27773535//27371828
chr11:6742759-6742760(-) m6A exon       27773535//27371828
chr11:6742784-6742785(-) m6A exon       27773535//27371828
chr11:6742807-6742808(-) m6A exon       27773535//27371828
chr11:6742915-6742916(-) m6A exon       27773535//27371828
chr11:6742941-6742942(-) m6A exon       27773535//27371828
chr11:6742947-6742948(-) m6A exon       27773535//27371828
chr11:6742988-6742989(-) m6A exon       27371828
chr11:6743052-6743053(-) m6A exon       27371828
chr11:6767582-6767583(-) m6A exon       27371828
chr11:6767601-6767602(-) m6A exon       27371828
chr11:6767640-6767641(-) m6A exon       27371828

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate GVINP1
Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: zikv-mir-9
Interactor2: GVINP1

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda
Support Database ZIKV-CDB

Starting a new search, please wait ...