Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00066588

  Virus:  

Zika virus (ZIKV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.1828

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol zikv-mir-8 LRRC37A6P
miRBase
Accession/Entrez ID		 zikv-mir-8 387646
Organism Zika virus (ZIKV) Homo sapiens
Category miRNA pseudo
Alias - LRRC37E

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase LRRC37A6P
chr10:27535449-27535450(-) m6A exon       27773535
chr10:27535483-27535484(-) m6A exon       25456834//27773535
chr10:27535490-27535491(-) m6A exon       25456834//27773535
chr10:27535501-27535502(-) m6A exon       25456834//27773535
chr10:27535571-27535572(-) m6A exon       25456834//27773535
chr10:27535610-27535611(-) m6A exon       27773535
chr10:27535621-27535622(-) m6A exon       27773535
chr10:27535634-27535635(-) m6A exon       27773535
chr10:27535805-27535806(-) m6A exon       27773535
chr10:27535811-27535812(-) m6A exon       27773535
chr10:27535844-27535845(-) m6A exon       27773535
chr10:27535885-27535886(-) m6A exon       27773535
chr10:27535918-27535919(-) m6A exon       27773535
chr10:27535933-27535934(-) m6A exon       27773535
chr10:27535963-27535964(-) m6A exon       27773535
chr10:27535978-27535979(-) m6A exon       27773535
chr10:27536180-27536181(-) m6A exon       27773535
chr10:27536204-27536205(-) m6A exon       27773535
chr10:27536244-27536245(-) m6A exon       27773535
chr10:27536311-27536312(-) m6A exon       27773535
chr10:27536323-27536324(-) m6A exon       27773535
chr10:27537239-27537240(-) m6A exon       27773535
chr10:27537276-27537277(-) m6A exon       27773535
chr10:27537346-27537347(-) m6A exon       27773535
chr10:27537355-27537356(-) m6A exon       27773535
chr10:27537408-27537409(-) m6A exon       24981863
chr10:27537416-27537417(-) m6A exon       24981863
chr10:27537531-27537532(-) m6A exon       27773535
chr10:27537544-27537545(-) m6A exon       27773535
chr10:27537595-27537596(-) m6A exon       27773535
chr10:27537607-27537608(-) m6A exon       27773535
chr10:27537850-27537851(-) m6A exon       27773535
chr10:27537934-27537935(-) m6A exon       27773535
chr10:27538148-27538149(-) m6A exon       27773535
chr10:27538167-27538168(-) m6A exon       27773535
chr10:27538189-27538190(-) m6A exon       27773535
chr10:27538207-27538208(-) m6A exon       27773535
chr10:27538232-27538233(-) m6A exon       27773535
chr10:27538262-27538263(-) m6A exon       27773535
chr10:27538286-27538287(-) m6A exon       27773535
chr10:27538315-27538316(-) m6A exon       27773535
chr10:27538354-27538355(-) m6A exon       27773535
chr10:27538427-27538428(-) m6A exon       27773535
chr10:27538440-27538441(-) m6A exon       27773535
chr10:27538451-27538452(-) m6A exon       27773535
chr10:27538784-27538785(-) m6A exon       25456834
chr10:27538792-27538793(-) m6A exon       25456834
chr10:27538833-27538834(-) m6A exon       25456834
chr10:27538884-27538885(-) m6A exon       25456834
chr10:27539047-27539048(-) m6A exon       -
chr10:27539065-27539066(-) m6A exon       -
chr10:27539106-27539107(-) m6A exon       -
chr10:27539150-27539151(-) m6A exon       -
chr10:27539193-27539194(-) m6A exon       -
chr10:27539233-27539234(-) m6A exon       -
chr10:27539253-27539254(-) m6A exon       -
chr10:27539497-27539498(-) m6A exon       -
chr10:27539557-27539558(-) m6A exon       -
chr10:27539659-27539660(-) m6A exon       -
chr10:27539739-27539740(-) m6A exon       -
chr10:27539867-27539868(-) m6A exon       25456834
chr10:27539882-27539883(-) m6A exon       25456834
chr10:27539910-27539911(-) m6A exon       -
chr10:27539947-27539948(-) m6A exon       24981863
chr10:27539958-27539959(-) m6A exon       24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate LRRC37A6P
Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: zikv-mir-8
Interactor2: LRRC37A6P

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda
Support Database ZIKV-CDB

Starting a new search, please wait ...