Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00066582

  Virus:  

Zika virus (ZIKV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.1828

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol zikv-mir-8 TXLNGY
miRBase
Accession/Entrez ID		 zikv-mir-8 246126
Organism Zika virus (ZIKV) Homo sapiens
Category miRNA pseudo
Alias - CYorf15A//CYorf15B//TXLNG2P

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR TXLNGY
chrY:21738779(+) A-I      intronic
chrY:21739457(+) A-I      intronic
chrY:21739391(+) A-I      intronic
chrY:21738777(+) A-I      intronic
chrY:21739372(+) A-I      intronic
chrY:21738809(+) A-I      intronic
chrY:21738788(+) A-I      intronic
chrY:21738784(+) A-I      intronic
chrY:21738783(+) A-I      intronic
chrY:21761987(+) A-I      intronic
chrY:21761152(+) A-I      intronic
chrY:21748797(+) A-I      intronic
chrY:21739479(+) A-I      intronic
chrY:21750324(+) A-I      NonSyn:Lys->Glu
chrY:21739505(+) A-I      intronic
chrY:21739393(+) A-I      intronic
chrY:21739476(+) A-I      intronic
chrY:21737720(+) A-I      intronic
chrY:21748689(+) A-I      intronic
chrY:21761189(+) A-I      intronic
chrY:21748745(+) A-I      intronic
chrY:21761097(+) A-I      intronic

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase TXLNGY
chrY:21729340-21729341(+) m6A exon       25456834//24981863
chrY:21729733-21729734(+) m6A exon//intron       24981863
chrY:21729767-21729768(+) m6A exon//intron       24981863
chrY:21749124-21749125(+) m6A exon       24981863
chrY:21749195-21749196(+) m6A exon       24981863
chrY:21749223-21749224(+) m6A exon       24981863
chrY:21749267-21749268(+) m6A exon       24981863
chrY:21750325-21750326(+) m6A exon//intron       24981863
chrY:21750356-21750357(+) m6A exon//intron       24981863
chrY:21752019-21752020(+) m6A exon//intron       24981863
chrY:21752039-21752040(+) m6A exon//intron       24981863
chrY:21752048-21752049(+) m6A exon//intron       24981863
chrY:21752065-21752066(+) m6A exon//intron       24981863
chrY:21752075-21752076(+) m6A exon//intron       24981863
chrY:21752108-21752109(+) m6A exon//intron       24981863
chrY:21752171-21752172(+) m6A exon//intron       24981863
chrY:21755365-21755366(+) m6A exon       24981863
chrY:21755382-21755383(+) m6A exon       24981863
chrY:21755406-21755407(+) m6A exon       24981863
chrY:21755420-21755421(+) m6A exon       24981863
chrY:21755505-21755506(+) m6A exon//intron       24981863
chrY:21755552-21755553(+) m6A exon//intron       24981863
chrY:21755565-21755566(+) m6A exon//intron       24981863
chrY:21755578-21755579(+) m6A exon//intron       24981863
chrY:21755630-21755631(+) m6A exon//intron       24981863
chrY:21755638-21755639(+) m6A exon//intron       24981863
chrY:21761660-21761661(+) m6A exon       24981863
chrY:21761675-21761676(+) m6A exon       24981863
chrY:21761683-21761684(+) m6A exon       24981863
chrY:21764121-21764122(+) m6A exon       24981863
chrY:21765685-21765686(+) m6A exon       24981863
chrY:21765774-21765775(+) m6A exon       25456834//24981863
chrY:21765786-21765787(+) m6A exon       25456834//24981863
chrY:21765890-21765891(+) m6A exon       25456834//24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate TXLNGY
Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: zikv-mir-8
Interactor2: TXLNGY

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda
Support Database ZIKV-CDB

Starting a new search, please wait ...