Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00066560

  Virus:  

Zika virus (ZIKV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.1828

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol zikv-mir-8 C8orf44-SGK3
miRBase
Accession/Entrez ID		 zikv-mir-8 100533105
Organism Zika virus (ZIKV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - -

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED C8orf44-SGK3
chr8:67597080(+) A-I intron -    22327324
chr8:67597123(+) A-I intron -    22327324
chr8:67597124(+) A-I intron -    22327324
chr8:67597246(+) A-I intron -    21960545
chr8:67597258(+) A-I intron -    21960545
chr8:67597262(+) A-I intron -    21960545
chr8:67593985(+) A-G intron -    22484847
chr8:67594069(+) A-G intron -    22484847
chr8:67594123(+) A-G intron -    22484847
chr8:67594135(+) A-G intron -    22484847
chr8:67595482(+) A-G intron -    22484847
chr8:67595488(+) A-G intron -    22484847
chr8:67595498(+) A-G intron -    22484847
chr8:67595692(+) A-G intron -    22484847
chr8:67595955(+) A-G intron -    22484847
chr8:67595979(+) A-G intron -    22484847
chr8:67596057(+) A-G intron -    22484847
chr8:67596163(+) C-A intron -    22484847
chr8:67597080(+) A-G intron -    22484847
chr8:67597123(+) A-G intron -    22484847
chr8:67597124(+) A-G intron -    22484847
chr8:67597127(+) A-G intron -    22484847
chr8:67597149(+) A-G intron -    22484847
chr8:67597150(+) A-G intron -    22484847
chr8:67597153(+) A-G intron -    22484847
chr8:67597163(+) A-G intron -    22484847
chr8:67597204(+) A-G intron -    22484847
chr8:67597207(+) A-G intron -    22484847
chr8:67597224(+) A-G intron -    22484847
chr8:67597233(+) A-G intron -    22484847
chr8:67597246(+) A-G intron -    22484847
chr8:67597258(+) A-G intron -    22484847
chr8:67597286(+) A-G intron -    22484847
chr8:67597298(+) A-G intron -    22484847
chr8:67603625(+) C-T intron -    22484847
chr8:67606602(+) A-G intron -    22484847
chr8:67606637(+) A-G intron -    22484847
chr8:67606680(+) A-G intron -    22484847
chr8:67606702(+) A-G intron -    22484847
chr8:67607006(+) A-G intron -    22484847
chr8:67608011(+) A-G intron -    22484847
chr8:67609680(+) A-G intron -    22484847
chr8:67611407(+) A-G intron -    22484847
chr8:67611699(+) A-G intron -    22484847
chr8:67615182(+) A-G intron -    22484847
chr8:67619765(+) A-G intron -    22484847
chr8:67620003(+) A-G intron -    22484847
chr8:67620568(+) A-G intron -    22484847
chr8:67622913(+) A-G intron -    22484847
chr8:67622927(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase C8orf44-SGK3
chr8:67579848-67579849(+) m6A exon       24981863//22608085
chr8:67588507-67588508(+) m6A intron       24981863
chr8:67592074-67592075(+) m6A 5'UTR//exon       24981863
chr8:67592137-67592138(+) m6A 5'UTR//exon       25456834//24981863//22608085
chr8:67592189-67592190(+) m6A 5'UTR//exon       24981863//22608085
chr8:67592321-67592322(+) m6A intron       24284625//25456834//24981863//22608085
chr8:67592327-67592328(+) m6A intron       24284625//25456834//24981863//22608085
chr8:67592340-67592341(+) m6A intron       24284625//25456834//24981863//22608085
chr8:67592354-67592355(+) m6A intron       24284625//25456834//24981863//22608085
chr8:67592449-67592450(+) m6A intron       22608085
chr8:67602969-67602970(+) m6A 5'UTR//intron       22608085
chr8:67624696-67624697(+) m6A intron       24981863
chr8:67624701-67624702(+) m6A intron       24981863
chr8:67624720-67624721(+) m6A intron       24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate C8orf44-SGK3
Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: zikv-mir-8
Interactor2: C8orf44-SGK3

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda
Support Database ZIKV-CDB

Starting a new search, please wait ...