Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00057399

  Virus:  

Zika virus (ZIKV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.1828

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol zikv-mir-7 AP3B1
miRBase
Accession/Entrez ID		 zikv-mir-7 8546
Organism Zika virus (ZIKV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - ADTB3//ADTB3A//HPS//HPS2//PE

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR AP3B1
chr5:77349466(-) A-I      intronic
chr5:77349458(-) A-I      intronic
chr5:77319225(-) A-I      intronic
chr5:77309949(-) A-I      intronic
chr5:77309868(-) A-I      intronic
chr5:77309798(-) A-I      intronic
chr5:77309082(-) A-I      intronic
chr5:77308984(-) A-I      intronic
chr5:77308920(-) A-I      intronic
chr5:77434073(-) A-I      intronic
chr5:77308870(-) A-I      intronic
chr5:77306999(-) A-I      intronic
chr5:77306978(-) A-I      intronic
chr5:77305218(-) A-I      intronic
chr5:77305198(-) A-I      intronic
chr5:77305172(-) A-I      intronic
chr5:77305165(-) A-I      intronic
chr5:77305107(-) A-I      intronic
chr5:77305022(-) A-I      intronic
chr5:77305019(-) A-I      intronic
chr5:77545575(-) A-I      intronic
chr5:77305197(-) A-I      intronic
chr5:77508898(-) A-I      intronic
chr5:77508932(-) A-I      intronic
chr5:77508937(-) A-I      intronic
chr5:77524885(-) A-I      intronic
chr5:77525033(-) A-I      intronic
chr5:77308951(-) A-I      intronic
chr5:77525451(-) A-I      intronic
chr5:77526844(-) A-I      intronic
chr5:77533577(-) A-I      intronic
chr5:77533580(-) A-I      intronic
chr5:77533593(-) A-I      intronic
chr5:77533599(-) A-I      intronic
chr5:77308952(-) A-I      intronic
chr5:77565869(-) A-I      intronic
chr5:77545515(-) A-I      intronic
chr5:77308903(-) A-I      intronic
chr5:77545519(-) A-I      intronic
chr5:77544936(-) A-I      intronic
chr5:77544996(-) A-I      intronic
chr5:77545142(-) A-I      intronic
chr5:77545523(-) A-I      intronic
chr5:77498050(-) A-I      intronic
chr5:77556380(-) A-I      intronic
chr5:77565874(-) A-I      intronic
chr5:77565875(-) A-I      intronic
chr5:77569117(-) A-I      intronic
chr5:77572028(-) A-I      intronic
chr5:77572299(-) A-I      intronic
chr5:77572344(-) A-I      intronic
chr5:77572385(-) A-I      intronic
chr5:77577087(-) A-I      intronic
chr5:77577139(-) A-I      intronic
chr5:77545529(-) A-I      intronic
chr5:77545532(-) A-I      intronic
chr5:77537176(-) A-I      intronic
chr5:77537180(-) A-I      intronic
chr5:77538342(-) A-I      intronic
chr5:77308915(-) A-I      intronic
chr5:77545536(-) A-I      intronic
chr5:77434208(-) A-I      intronic
chr5:77434579(-) A-I      intronic
chr5:77434623(-) A-I      intronic
chr5:77434659(-) A-I      intronic
chr5:77434675(-) A-I      intronic
chr5:77434711(-) A-I      intronic
chr5:77453742(-) A-I      intronic
chr5:77453748(-) A-I      intronic
chr5:77430529(-) A-I      intronic
chr5:77308940(-) A-I      intronic
chr5:77461743(-) A-I      intronic
chr5:77461780(-) A-I      intronic
chr5:77461816(-) A-I      intronic
chr5:77461887(-) A-I      intronic
chr5:77430476(-) A-I      intronic
chr5:77461905(-) A-I      intronic
chr5:77464163(-) A-I      intronic
chr5:77487777(-) A-I      intronic
chr5:77488390(-) A-I      intronic
chr5:77488460(-) A-I      intronic
chr5:77430470(-) A-I      intronic
chr5:77349468(-) A-I      intronic
chr5:77305202(-) A-I      intronic
chr5:77434179(-) A-I      intronic
chr5:77443746(-) A-I      intronic
chr5:77434578(-) A-I      intronic
chr5:77309062(-) A-I      intronic
chr5:77430532(-) A-I      intronic
chr5:77465391(-) A-I      intronic
chr5:77430640(-) A-I      intronic
chr5:77571440(-) A-I      intronic
chr5:77465503(-) A-I      intronic
chr5:77487878(-) A-I      intronic
chr5:77305250(-) A-I      intronic
chr5:77443669(-) A-I      intronic
chr5:77395709(-) A-I      intronic
chr5:77390516(-) A-I      intronic
chr5:77465341(-) A-I      intronic
chr5:77526776(-) A-I      intronic
chr5:77508840(-) A-I      intronic
chr5:77465479(-) A-I      intronic
chr5:77305168(-) A-I      intronic
chr5:77339163(-) A-I      intronic
chr5:77368825(-) A-I      intronic
chr5:77453752(-) A-I      intronic
chr5:77306963(-) A-I      intronic
chr5:77464294(-) A-I      intronic
chr5:77572091(-) A-I      intronic
chr5:77572018(-) A-I      intronic
chr5:77305184(-) A-I      intronic
chr5:77545499(-) A-I      intronic
chr5:77454246(-) A-I      intronic
chr5:77309072(-) A-I      intronic
chr5:77430502(-) A-I      intronic
chr5:77464213(-) A-I      intronic
chr5:77309111(-) A-I      intronic
chr5:77454260(-) A-I      intronic
chr5:77306980(-) A-I      intronic
chr5:77561190(-) A-I      intronic
chr5:77376012(-) A-I      intronic
chr5:77571982(-) A-I      intronic
chr5:77430549(-) A-I      intronic
chr5:77434055(-) A-I      intronic
chr5:77588770(-) A-I      intronic
chr5:77527201(-) A-I      intronic
chr5:77308930(-) A-I      intronic
chr5:77376009(-) A-I      intronic
chr5:77588785(-) A-I      intronic
chr5:77309001(-) A-I      intronic
chr5:77487813(-) A-I      intronic
chr5:77545031(-) A-I      intronic
chr5:77461858(-) A-I      intronic
chr5:77537218(-) A-I      intronic
chr5:77464186(-) A-I      intronic
chr5:77461793(-) A-I      intronic
chr5:77368538(-) A-I      intronic
chr5:77319198(-) A-I      intronic
chr5:77461881(-) A-I      intronic
chr5:77429826(-) A-I      intronic
chr5:77386814(-) A-I      intronic
chr5:77376106(-) A-I      intronic
chr5:77465451(-) A-I      intronic
chr5:77323838(-) A-I      intronic
chr5:77326679(-) A-I      intronic
chr5:77309007(-) A-I      intronic
chr5:77464216(-) A-I      intronic
chr5:77388628(-) A-I      intronic
chr5:77324225(-) A-I      intronic
chr5:77326702(-) A-I      intronic
chr5:77434682(-) A-I      intronic
chr5:77528724(-) A-I      intronic
chr5:77545577(-) A-I      intronic
chr5:77434725(-) A-I      intronic
chr5:77461744(-) A-I      intronic
chr5:77572569(-) A-I      intronic
chr5:77308928(-) A-I      intronic
chr5:77572117(-) A-I      intronic
chr5:77339227(-) A-I      intronic
chr5:77544987(-) A-I      intronic
chr5:77572041(-) A-I      intronic
chr5:77430540(-) A-I      intronic
chr5:77308989(-) A-I      intronic
chr5:77395704(-) A-I      intronic
chr5:77561184(-) A-I      intronic
chr5:77465381(-) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED AP3B1
chr5:77308989(-) A-I intron -    22327324
chr5:77497893(-) A-G intron -    22484847
chr5:77497924(-) A-G intron -    22484847
chr5:77499045(-) A-G intron -    22484847
chr5:77566799(-) A-G intron -    22484847
chr5:77581488(-) G-A intron -    22484847
chr5:77305115(-) G-T intron -    22484847
chr5:77305280(-) A-G intron -    22484847
chr5:77306963(-) A-G intron -    22484847
chr5:77306980(-) A-G intron -    22484847
chr5:77307004(-) A-G intron -    22484847
chr5:77308928(-) A-G intron -    22484847
chr5:77308930(-) A-G intron -    22484847
chr5:77308966(-) A-G intron -    22484847
chr5:77308989(-) A-G intron -    22484847
chr5:77309001(-) A-G intron -    22484847
chr5:77309007(-) A-G intron -    22484847
chr5:77309072(-) A-G intron -    22484847
chr5:77309073(-) A-G intron -    22484847
chr5:77309111(-) A-G intron -    22484847
chr5:77319198(-) A-G intron -    22484847
chr5:77319206(-) A-G intron -    22484847
chr5:77320325(-) A-G intron -    22484847
chr5:77339163(-) A-G intron -    22484847
chr5:77354248(-) G-A intron -    22484847
chr5:77378730(-) A-G intron -    22484847
chr5:77380345(-) G-T intron -    22484847
chr5:77430502(-) A-G intron -    22484847
chr5:77430540(-) A-G intron -    22484847
chr5:77430640(-) A-G intron -    22484847
chr5:77434055(-) A-G intron -    22484847
chr5:77434209(-) A-G intron -    22484847
chr5:77434617(-) C-T intron -    22484847
chr5:77434725(-) A-G intron -    22484847
chr5:77453743(-) A-G intron -    22484847
chr5:77453752(-) A-G intron -    22484847
chr5:77461701(-) A-G intron -    22484847
chr5:77461793(-) A-G intron -    22484847
chr5:77464275(-) A-G intron -    22484847
chr5:77465451(-) A-G intron -    22484847
chr5:77487813(-) A-G intron -    22484847
chr5:77487877(-) A-G intron -    22484847
chr5:77487878(-) A-G intron -    22484847
chr5:77488371(-) A-G intron -    22484847
chr5:77508840(-) A-G intron -    22484847
chr5:77524895(-) A-G intron -    22484847
chr5:77527201(-) A-G intron -    22484847
chr5:77540148(-) T-C intron -    22484847
chr5:77544922(-) A-G intron -    22484847
chr5:77544987(-) A-G intron -    22484847
chr5:77545082(-) A-G intron -    22484847
chr5:77545091(-) A-G intron -    22484847
chr5:77545175(-) A-G intron -    22484847
chr5:77567075(-) T-C intron -    22484847
chr5:77571438(-) A-G intron -    22484847
chr5:77571440(-) A-G intron -    22484847
chr5:77572018(-) A-G intron -    22484847
chr5:77572041(-) A-G intron -    22484847
chr5:77572091(-) A-G intron -    22484847
chr5:77572693(-) A-T intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase AP3B1
chr5:77298709-77298710(-) m6A 3'UTR       24284625//24981863
chr5:77298752-77298753(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625//24981863
chr5:77298781-77298782(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625
chr5:77298792-77298793(-) m6A 3'UTR//CDS       24284625
chr5:77298827-77298828(-) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625
chr5:77339170-77339171(-) m6A intron       27773535
chr5:77339185-77339186(-) m6A intron       27773535
chr5:77339217-77339218(-) m6A intron       27773535
chr5:77383324-77383325(-) m6A exon//intron       24981863//27773535//22608085
chr5:77383381-77383382(-) m6A exon//intron       24981863//27773535//22608085
chr5:77383421-77383422(-) m6A exon//intron       24981863//27773535//22608085
chr5:77384837-77384838(-) m6A exon//intron       27773535//22608085
chr5:77384886-77384887(-) m6A exon//intron       27773535
chr5:77384918-77384919(-) m6A exon//intron       27773535
chr5:77406137-77406138(-) m6A CDS//exon       24981863//27773535
chr5:77409596-77409597(-) m6A CDS//exon       24981863//28052920//27773535//27371828
chr5:77409609-77409610(-) m6A CDS//exon       24981863//28052920//27773535//27371828
chr5:77409617-77409618(-) m6A CDS//exon       24981863//28052920//27773535//27371828
chr5:77409650-77409651(-) m6A CDS//exon       24209618//24981863//28052920//27773535//27371828
chr5:77409668-77409669(-) m6A CDS//exon       24209618//24981863//28052920//27773535//27371828
chr5:77409680-77409681(-) m6A CDS//exon       24209618//24981863//28052920//27773535//27371828//22575960
chr5:77409692-77409693(-) m6A CDS//exon       24209618//24981863//28052920//27773535//27371828//22575960
chr5:77409718-77409719(-) m6A CDS//exon       24209618//24981863//28052920//27773535//27371828//22575960
chr5:77411975-77411976(-) m6A CDS//exon       24209618//24981863//27773535
chr5:77412045-77412046(-) m6A CDS       24981863//27773535
chr5:77417548-77417549(-) m6A exon//intron       -
chr5:77425066-77425067(-) m6A CDS//exon       24981863
chr5:77425081-77425082(-) m6A CDS//exon       24981863
chr5:77436969-77436970(-) m6A CDS//exon       24981863
chr5:77590432-77590433(-) m6A 5'UTR       -
chr5:77590444-77590445(-) m6A 5'UTR       -
chr5:77590458-77590459(-) m6A 5'UTR       -
chr5:77590464-77590465(-) m6A 5'UTR       -
chr5:77590489-77590490(-) m6A 5'UTR       -

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate AP3B1
Chromatin K562 cells     -
Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Insoluble cytoplasm HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Membrane HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: zikv-mir-7
Interactor2: AP3B1

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda
Support Database ZIKV-CDB

Starting a new search, please wait ...