Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00052922

  Virus:  

Zika virus (ZIKV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.1828

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol zikv-mir-6 EIF3L
miRBase
Accession/Entrez ID		 zikv-mir-6 51386
Organism Zika virus (ZIKV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - EIF3EIP//EIF3S11//EIF3S6IP//HSPC021//HSPC025//MSTP005

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR EIF3L
chr22:38268249(+) A-I      intronic
chr22:38284888(+) A-I      3'UTR
chr22:38268730(+) A-I      intronic
chr22:38276577(+) A-I      intronic
chr22:38276541(+) A-I      intronic
chr22:38268700(+) A-I      intronic
chr22:38268229(+) A-I      intronic
chr22:38267817(+) A-I      intronic
chr22:38267715(+) A-I      intronic
chr22:38267714(+) A-I      intronic
chr22:38263571(+) A-I      intronic
chr22:38263559(+) A-I      intronic
chr22:38285268(+) A-I      3'UTR
chr22:38285264(+) A-I      3'UTR
chr22:38276537(+) A-I      intronic
chr22:38263546(+) A-I      intronic
chr22:38263510(+) A-I      intronic
chr22:38285232(+) A-I      3'UTR
chr22:38268284(+) A-I      intronic
chr22:38275999(+) A-I      intronic
chr22:38275993(+) A-I      intronic
chr22:38282488(+) A-I      intronic
chr22:38267282(+) A-I      ncRNA
chr22:38283458(+) A-I      intronic
chr22:38283451(+) A-I      intronic
chr22:38275984(+) A-I      intronic
chr22:38283450(+) A-I      intronic
chr22:38275381(+) A-I      intronic
chr22:38282482(+) A-I      intronic
chr22:38282433(+) A-I      intronic
chr22:38282420(+) A-I      intronic
chr22:38281752(+) A-I      intronic
chr22:38281725(+) A-I      intronic
chr22:38279862(+) A-I      intronic
chr22:38278788(+) A-I      intronic
chr22:38278781(+) A-I      intronic
chr22:38278755(+) A-I      intronic
chr22:38276551(+) A-I      intronic
chr22:38278754(+) A-I      intronic
chr22:38278771(+) A-I      intronic
chr22:38277345(+) A-I      intronic
chr22:38276578(+) A-I      intronic
chr22:38276758(+) A-I      intronic
chr22:38277316(+) A-I      intronic
chr22:38277545(+) A-I      intronic
chr22:38277569(+) A-I      intronic
chr22:38277578(+) A-I      intronic
chr22:38277596(+) A-I      intronic
chr22:38277638(+) A-I      intronic
chr22:38277650(+) A-I      intronic
chr22:38277902(+) A-I      intronic
chr22:38277972(+) A-I      intronic
chr22:38278104(+) A-I      intronic
chr22:38278138(+) A-I      intronic
chr22:38278167(+) A-I      intronic
chr22:38278183(+) A-I      intronic
chr22:38278194(+) A-I      intronic
chr22:38278229(+) A-I      intronic
chr22:38278503(+) A-I      intronic
chr22:38278545(+) A-I      intronic
chr22:38278625(+) A-I      intronic
chr22:38278760(+) A-I      intronic
chr22:38278806(+) A-I      intronic
chr22:38278847(+) A-I      intronic
chr22:38278948(+) A-I      intronic
chr22:38278951(+) A-I      intronic
chr22:38278956(+) A-I      intronic
chr22:38278616(+) A-I      intronic
chr22:38279529(+) A-I      intronic
chr22:38279532(+) A-I      intronic
chr22:38279533(+) A-I      intronic
chr22:38279800(+) A-I      intronic
chr22:38279801(+) A-I      intronic
chr22:38279810(+) A-I      intronic
chr22:38279830(+) A-I      intronic
chr22:38279833(+) A-I      intronic
chr22:38279846(+) A-I      intronic
chr22:38280664(+) A-I      intronic
chr22:38281710(+) A-I      intronic
chr22:38281855(+) A-I      intronic
chr22:38281942(+) A-I      intronic
chr22:38282058(+) A-I      intronic
chr22:38282080(+) A-I      intronic
chr22:38282429(+) A-I      intronic
chr22:38282455(+) A-I      intronic
chr22:38282473(+) A-I      intronic
chr22:38282562(+) A-I      intronic
chr22:38282564(+) A-I      intronic
chr22:38283114(+) A-I      intronic
chr22:38283345(+) A-I      intronic
chr22:38247704(+) A-I      intronic
chr22:38247784(+) A-I      intronic
chr22:38247875(+) A-I      intronic
chr22:38249557(+) A-I      intronic
chr22:38250604(+) A-I      intronic
chr22:38252250(+) A-I      intronic
chr22:38252271(+) A-I      intronic
chr22:38252331(+) A-I      intronic
chr22:38252364(+) A-I      intronic
chr22:38252389(+) A-I      intronic
chr22:38252602(+) A-I      intronic
chr22:38252704(+) A-I      intronic
chr22:38252740(+) A-I      intronic
chr22:38252757(+) A-I      intronic
chr22:38252766(+) A-I      intronic
chr22:38252803(+) A-I      intronic
chr22:38253114(+) A-I      intronic
chr22:38253309(+) A-I      intronic
chr22:38253364(+) A-I      intronic
chr22:38253631(+) A-I      intronic
chr22:38253750(+) A-I      intronic
chr22:38253803(+) A-I      intronic
chr22:38254032(+) A-I      intronic
chr22:38254311(+) A-I      intronic
chr22:38255442(+) A-I      intronic
chr22:38255458(+) A-I      intronic
chr22:38255482(+) A-I      intronic
chr22:38255571(+) A-I      intronic
chr22:38255663(+) A-I      intronic
chr22:38255898(+) A-I      intronic
chr22:38255908(+) A-I      intronic
chr22:38255915(+) A-I      intronic
chr22:38255948(+) A-I      intronic
chr22:38255964(+) A-I      intronic
chr22:38257443(+) A-I      intronic
chr22:38259817(+) A-I      intronic
chr22:38259818(+) A-I      intronic
chr22:38259869(+) A-I      intronic
chr22:38259885(+) A-I      intronic
chr22:38259906(+) A-I      intronic
chr22:38259961(+) A-I      intronic
chr22:38260058(+) A-I      intronic
chr22:38260092(+) A-I      intronic
chr22:38260133(+) A-I      intronic
chr22:38260163(+) A-I      intronic
chr22:38260577(+) A-I      intronic
chr22:38260707(+) A-I      intronic
chr22:38260806(+) A-I      intronic
chr22:38261286(+) A-I      intronic
chr22:38262576(+) A-I      intronic
chr22:38262581(+) A-I      intronic
chr22:38262615(+) A-I      intronic
chr22:38262699(+) A-I      intronic
chr22:38262713(+) A-I      intronic
chr22:38262714(+) A-I      intronic
chr22:38262743(+) A-I      intronic
chr22:38262745(+) A-I      intronic
chr22:38262780(+) A-I      intronic
chr22:38263100(+) A-I      intronic
chr22:38263272(+) A-I      intronic
chr22:38263605(+) A-I      intronic
chr22:38263619(+) A-I      intronic
chr22:38263750(+) A-I      intronic
chr22:38263751(+) A-I      intronic
chr22:38263776(+) A-I      intronic
chr22:38263784(+) A-I      intronic
chr22:38263804(+) A-I      intronic
chr22:38263868(+) A-I      intronic
chr22:38263887(+) A-I      intronic
chr22:38264743(+) A-I      intronic
chr22:38264750(+) A-I      intronic
chr22:38264754(+) A-I      intronic
chr22:38265159(+) A-I      intronic
chr22:38265319(+) A-I      intronic
chr22:38266981(+) A-I      intronic
chr22:38267024(+) A-I      intronic
chr22:38267064(+) A-I      intronic
chr22:38267620(+) A-I      intronic
chr22:38267704(+) A-I      intronic
chr22:38267723(+) A-I      intronic
chr22:38283494(+) A-I      intronic
chr22:38283501(+) A-I      intronic
chr22:38283511(+) A-I      intronic
chr22:38283550(+) A-I      intronic
chr22:38279876(+) A-I      intronic
chr22:38267725(+) A-I      intronic
chr22:38267749(+) A-I      intronic
chr22:38267761(+) A-I      intronic
chr22:38267765(+) A-I      intronic
chr22:38267772(+) A-I      intronic
chr22:38267782(+) A-I      intronic
chr22:38267796(+) A-I      intronic
chr22:38267808(+) A-I      intronic
chr22:38267821(+) A-I      intronic
chr22:38267826(+) A-I      intronic
chr22:38267881(+) A-I      intronic
chr22:38267882(+) A-I      intronic
chr22:38268287(+) A-I      intronic
chr22:38268365(+) A-I      intronic
chr22:38268690(+) A-I      intronic
chr22:38268755(+) A-I      intronic
chr22:38268775(+) A-I      intronic
chr22:38269039(+) A-I      intronic
chr22:38269090(+) A-I      intronic
chr22:38269122(+) A-I      intronic
chr22:38269369(+) A-I      intronic
chr22:38269370(+) A-I      intronic
chr22:38269380(+) A-I      intronic
chr22:38269386(+) A-I      intronic
chr22:38269507(+) A-I      intronic
chr22:38270791(+) A-I      intronic
chr22:38270835(+) A-I      intronic
chr22:38270865(+) A-I      intronic
chr22:38270962(+) A-I      intronic
chr22:38271166(+) A-I      intronic
chr22:38271300(+) A-I      intronic
chr22:38271340(+) A-I      intronic
chr22:38274496(+) A-I      intronic
chr22:38274522(+) A-I      intronic
chr22:38274564(+) A-I      intronic
chr22:38274600(+) A-I      intronic
chr22:38274616(+) A-I      intronic
chr22:38274679(+) A-I      intronic
chr22:38275014(+) A-I      intronic
chr22:38275160(+) A-I      intronic
chr22:38275344(+) A-I      intronic
chr22:38275363(+) A-I      intronic
chr22:38275387(+) A-I      intronic
chr22:38275391(+) A-I      intronic
chr22:38275408(+) A-I      intronic
chr22:38275443(+) A-I      intronic
chr22:38275483(+) A-I      intronic
chr22:38275826(+) A-I      intronic
chr22:38275881(+) A-I      intronic
chr22:38275887(+) A-I      intronic
chr22:38275946(+) A-I      intronic
chr22:38276068(+) A-I      intronic
chr22:38276237(+) A-I      intronic
chr22:38276302(+) A-I      intronic
chr22:38276327(+) A-I      intronic
chr22:38276342(+) A-I      intronic
chr22:38276434(+) A-I      intronic
chr22:38276486(+) A-I      intronic
chr22:38276524(+) A-I      intronic
chr22:38276546(+) A-I      intronic
chr22:38276734(+) A-I      intronic
chr22:38276749(+) A-I      intronic
chr22:38276750(+) A-I      intronic
chr22:38284955(+) A-I      3'UTR
chr22:38284967(+) A-I      3'UTR
chr22:38285150(+) A-I      3'UTR
chr22:38285297(+) A-I      3'UTR
chr22:38284873(+) A-I      3'UTR
chr22:38284864(+) A-I      3'UTR
chr22:38284908(+) A-I      3'UTR
chr22:38284904(+) A-I      3'UTR
chr22:38264789(+) A-I      intronic
chr22:38271114(+) A-I      intronic
chr22:38254062(+) A-I      intronic
chr22:38263162(+) A-I      intronic
chr22:38267636(+) A-I      intronic
chr22:38255801(+) A-I      intronic
chr22:38252128(+) A-I      intronic
chr22:38281772(+) A-I      intronic
chr22:38265205(+) A-I      intronic
chr22:38277916(+) A-I      intronic
chr22:38252258(+) A-I      intronic
chr22:38253632(+) A-I      intronic
chr22:38267205(+) A-I      intronic
chr22:38267699(+) A-I      intronic
chr22:38252497(+) A-I      intronic
chr22:38281109(+) A-I      intronic
chr22:38269831(+) A-I      intronic
chr22:38270836(+) A-I      intronic
chr22:38252249(+) A-I      intronic
chr22:38252084(+) A-I      intronic
chr22:38269176(+) A-I      intronic
chr22:38259978(+) A-I      intronic
chr22:38268823(+) A-I      intronic
chr22:38283077(+) A-I      intronic
chr22:38255984(+) A-I      intronic
chr22:38267756(+) A-I      intronic
chr22:38267726(+) A-I      intronic
chr22:38268194(+) A-I      intronic
chr22:38260650(+) A-I      intronic
chr22:38268738(+) A-I      intronic
chr22:38253724(+) A-I      intronic
chr22:38282020(+) A-I      intronic
chr22:38279314(+) A-I      intronic
chr22:38253802(+) A-I      intronic
chr22:38254306(+) A-I      intronic
chr22:38274326(+) A-I      intronic
chr22:38274653(+) A-I      intronic
chr22:38269561(+) A-I      intronic
chr22:38275990(+) A-I      intronic
chr22:38279325(+) A-I      intronic
chr22:38265373(+) A-I      intronic
chr22:38260645(+) A-I      intronic
chr22:38275936(+) A-I      intronic
chr22:38269125(+) A-I      intronic
chr22:38269060(+) A-I      intronic
chr22:38261347(+) A-I      intronic
chr22:38253721(+) A-I      intronic
chr22:38260729(+) A-I      intronic
chr22:38255825(+) A-I      intronic
chr22:38274610(+) A-I      intronic
chr22:38262638(+) A-I      intronic
chr22:38279841(+) A-I      intronic
chr22:38268273(+) A-I      intronic
chr22:38271121(+) A-I      intronic
chr22:38275427(+) A-I      intronic
chr22:38271120(+) A-I      intronic
chr22:38268225(+) A-I      intronic
chr22:38253995(+) A-I      intronic
chr22:38268712(+) A-I      intronic
chr22:38279148(+) A-I      intronic
chr22:38275512(+) A-I      intronic
chr22:38253726(+) A-I      intronic
chr22:38271220(+) A-I      intronic
chr22:38267755(+) A-I      intronic
chr22:38277678(+) A-I      intronic
chr22:38282054(+) A-I      intronic
chr22:38269057(+) A-I      intronic
chr22:38274489(+) A-I      intronic
chr22:38281193(+) A-I      intronic
chr22:38281788(+) A-I      intronic
chr22:38281943(+) A-I      intronic
chr22:38275417(+) A-I      intronic
chr22:38252681(+) A-I      intronic
chr22:38268315(+) A-I      intronic
chr22:38254103(+) A-I      intronic
chr22:38252632(+) A-I      intronic
chr22:38254312(+) A-I      intronic
chr22:38253191(+) A-I      intronic
chr22:38252145(+) A-I      intronic
chr22:38260176(+) A-I      intronic
chr22:38269059(+) A-I      intronic
chr22:38276082(+) A-I      intronic
chr22:38264248(+) A-I      intronic
chr22:38264994(+) A-I      intronic
chr22:38265327(+) A-I      intronic
chr22:38252201(+) A-I      intronic
chr22:38277945(+) A-I      intronic
chr22:38275346(+) A-I      intronic
chr22:38269005(+) A-I      intronic
chr22:38283362(+) A-I      intronic
chr22:38275341(+) A-I      intronic
chr22:38277359(+) A-I      intronic
chr22:38252783(+) A-I      intronic
chr22:38267092(+) A-I      intronic
chr22:38266971(+) A-I      intronic
chr22:38267020(+) A-I      intronic
chr22:38275423(+) A-I      intronic
chr22:38260100(+) A-I      intronic
chr22:38281714(+) A-I      intronic
chr22:38255969(+) A-I      intronic
chr22:38253651(+) A-I      intronic
chr22:38277935(+) A-I      intronic
chr22:38268181(+) A-I      intronic
chr22:38265187(+) A-I      intronic
chr22:38264247(+) A-I      intronic
chr22:38252486(+) A-I      intronic
chr22:38271223(+) A-I      intronic
chr22:38284808(+) A-I      3'UTR
chr22:38284843(+) A-I      3'UTR
chr22:38284968(+) A-I      3'UTR
chr22:38285022(+) A-I      3'UTR
chr22:38284927(+) A-I      3'UTR
chr22:38285088(+) A-I      3'UTR
chr22:38285239(+) A-I      3'UTR
chr22:38285076(+) A-I      3'UTR
chr22:38285016(+) A-I      3'UTR
chr22:38285323(+) A-I      3'UTR
chr22:38285186(+) A-I      3'UTR
chr22:38284886(+) A-I      3'UTR
chr22:38285354(+) A-I      3'UTR
chr22:38284819(+) A-I      3'UTR
chr22:38284872(+) A-I      3'UTR
chr22:38262560(+) A-I      intronic
chr22:38252126(+) A-I      intronic
chr22:38253741(+) A-I      intronic
chr22:38252114(+) A-I      intronic
chr22:38257666(+) A-I      intronic
chr22:38257438(+) A-I      intronic
chr22:38277515(+) A-I      intronic
chr22:38275131(+) A-I      intronic
chr22:38263271(+) A-I      intronic
chr22:38269562(+) A-I      intronic
chr22:38281038(+) A-I      intronic
chr22:38252144(+) A-I      intronic
chr22:38274329(+) A-I      intronic
chr22:38263148(+) A-I      intronic
chr22:38283016(+) A-I      intronic
chr22:38271190(+) A-I      intronic
chr22:38253189(+) A-I      intronic
chr22:38269486(+) A-I      intronic
chr22:38255756(+) A-I      intronic
chr22:38255824(+) A-I      intronic
chr22:38253183(+) A-I      intronic
chr22:38266972(+) A-I      intronic
chr22:38276019(+) A-I      intronic
chr22:38252393(+) A-I      intronic
chr22:38279803(+) A-I      intronic
chr22:38252118(+) A-I      intronic
chr22:38256364(+) A-I      intronic
chr22:38254266(+) A-I      intronic
chr22:38258063(+) A-I      intronic
chr22:38276076(+) A-I      intronic
chr22:38263285(+) A-I      intronic
chr22:38279128(+) A-I      intronic
chr22:38275315(+) A-I      intronic
chr22:38270815(+) A-I      intronic
chr22:38267674(+) A-I      intronic
chr22:38277677(+) A-I      intronic
chr22:38281025(+) A-I      intronic
chr22:38252196(+) A-I      intronic
chr22:38275031(+) A-I      intronic
chr22:38269264(+) A-I      intronic
chr22:38261448(+) A-I      intronic
chr22:38281803(+) A-I      intronic
chr22:38252352(+) A-I      intronic
chr22:38269547(+) A-I      intronic
chr22:38252465(+) A-I      intronic
chr22:38268689(+) A-I      intronic
chr22:38282521(+) A-I      intronic
chr22:38268830(+) A-I      intronic
chr22:38281695(+) A-I      intronic
chr22:38275350(+) A-I      intronic
chr22:38278246(+) A-I      intronic
chr22:38279315(+) A-I      intronic
chr22:38282338(+) A-I      intronic
chr22:38252223(+) A-I      intronic
chr22:38267833(+) A-I      intronic
chr22:38267014(+) A-I      intronic
chr22:38253681(+) A-I      intronic
chr22:38269216(+) A-I      intronic
chr22:38254092(+) A-I      intronic
chr22:38264208(+) A-I      intronic
chr22:38263545(+) A-I      intronic
chr22:38269435(+) A-I      intronic
chr22:38277259(+) A-I      intronic
chr22:38269470(+) A-I      intronic
chr22:38267673(+) A-I      intronic
chr22:38252336(+) A-I      intronic
chr22:38253281(+) A-I      intronic
chr22:38278240(+) A-I      intronic
chr22:38267797(+) A-I      intronic
chr22:38278471(+) A-I      intronic
chr22:38267031(+) A-I      intronic
chr22:38275964(+) A-I      intronic
chr22:38275322(+) A-I      intronic
chr22:38253283(+) A-I      intronic
chr22:38279774(+) A-I      intronic
chr22:38260675(+) A-I      intronic
chr22:38274532(+) A-I      intronic
chr22:38281924(+) A-I      intronic
chr22:38253987(+) A-I      intronic
chr22:38267055(+) A-I      intronic
chr22:38271264(+) A-I      intronic
chr22:38271265(+) A-I      intronic
chr22:38275054(+) A-I      intronic
chr22:38277265(+) A-I      intronic
chr22:38279342(+) A-I      intronic
chr22:38256509(+) A-I      intronic
chr22:38282426(+) A-I      intronic
chr22:38260685(+) A-I      intronic
chr22:38257459(+) A-I      intronic
chr22:38270840(+) A-I      intronic
chr22:38283075(+) A-I      intronic
chr22:38276715(+) A-I      intronic
chr22:38267665(+) A-I      intronic
chr22:38252687(+) A-I      intronic
chr22:38255596(+) A-I      intronic
chr22:38259915(+) A-I      intronic
chr22:38281750(+) A-I      intronic
chr22:38252696(+) A-I      intronic
chr22:38269179(+) A-I      intronic
chr22:38253921(+) A-I      intronic
chr22:38271229(+) A-I      intronic
chr22:38268819(+) A-I      intronic
chr22:38253266(+) A-I      intronic
chr22:38277556(+) A-I      intronic
chr22:38281682(+) A-I      intronic
chr22:38275375(+) A-I      intronic
chr22:38253256(+) A-I      intronic
chr22:38253250(+) A-I      intronic
chr22:38255834(+) A-I      intronic
chr22:38263555(+) A-I      intronic
chr22:38275134(+) A-I      intronic
chr22:38283498(+) A-I      intronic
chr22:38282397(+) A-I      intronic
chr22:38269096(+) A-I      intronic
chr22:38252580(+) A-I      intronic
chr22:38260808(+) A-I      intronic
chr22:38253656(+) A-I      intronic
chr22:38252693(+) A-I      intronic
chr22:38266973(+) A-I      intronic
chr22:38279871(+) A-I      intronic
chr22:38283404(+) A-I      intronic
chr22:38268180(+) A-I      intronic
chr22:38275330(+) A-I      intronic
chr22:38252158(+) A-I      intronic
chr22:38283484(+) A-I      intronic
chr22:38275044(+) A-I      intronic
chr22:38260117(+) A-I      intronic
chr22:38259912(+) A-I      intronic
chr22:38265301(+) A-I      intronic
chr22:38283361(+) A-I      intronic
chr22:38276748(+) A-I      intronic
chr22:38264600(+) A-I      intronic
chr22:38279849(+) A-I      intronic
chr22:38276538(+) A-I      intronic
chr22:38269444(+) A-I      intronic
chr22:38253190(+) A-I      intronic
chr22:38252306(+) A-I      intronic
chr22:38277583(+) A-I      intronic
chr22:38268657(+) A-I      intronic
chr22:38258139(+) A-I      intronic
chr22:38271226(+) A-I      intronic
chr22:38270805(+) A-I      intronic
chr22:38252491(+) A-I      intronic
chr22:38266870(+) A-I      intronic
chr22:38260646(+) A-I      intronic
chr22:38283485(+) A-I      intronic
chr22:38263157(+) A-I      intronic
chr22:38252637(+) A-I      intronic
chr22:38250575(+) A-I      intronic
chr22:38260181(+) A-I      intronic
chr22:38254332(+) A-I      intronic
chr22:38265321(+) A-I      intronic
chr22:38270875(+) A-I      intronic
chr22:38267791(+) A-I      intronic
chr22:38276684(+) A-I      intronic
chr22:38254112(+) A-I      intronic
chr22:38255835(+) A-I      intronic
chr22:38253922(+) A-I      intronic
chr22:38277590(+) A-I      intronic
chr22:38257437(+) A-I      intronic
chr22:38263706(+) A-I      intronic
chr22:38267221(+) A-I      ncRNA
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED EIF3L
chr22:38265338(+) A-I intron -    22327324
chr22:38268181(+) A-I intron -    22327324
chr22:38268194(+) A-I intron -    22327324
chr22:38268224(+) A-I intron -    22327324
chr22:38268225(+) A-I intron -    22327324
chr22:38268366(+) A-I intron -    22327324
chr22:38268657(+) A-I intron -    21960545
chr22:38269804(+) A-I intron -    21960545
chr22:38252345(+) A-G intron -    22484847
chr22:38252352(+) A-G intron -    22484847
chr22:38252681(+) A-G intron -    22484847
chr22:38252690(+) A-G intron -    22484847
chr22:38253939(+) A-G intron -    22484847
chr22:38254266(+) A-G intron -    22484847
chr22:38260100(+) A-G intron -    22484847
chr22:38262537(+) A-G intron -    22484847
chr22:38262560(+) A-G intron -    22484847
chr22:38267665(+) A-G intron -    22484847
chr22:38268181(+) A-G intron -    22484847
chr22:38268194(+) A-G intron -    22484847
chr22:38268224(+) A-G intron -    22484847
chr22:38268225(+) A-G intron -    22484847
chr22:38268366(+) A-G intron -    22484847
chr22:38268657(+) A-G intron -    22484847
chr22:38268687(+) A-G intron -    22484847
chr22:38268689(+) A-G intron -    22484847
chr22:38269125(+) A-G intron -    22484847
chr22:38271264(+) A-G intron -    22484847
chr22:38271265(+) A-G intron -    22484847
chr22:38278516(+) A-G intron -    22484847
chr22:38278846(+) A-G intron -    22484847
chr22:38278848(+) A-G intron -    22484847
chr22:38282019(+) A-G intron -    22484847
chr22:38282020(+) A-G intron -    22484847
chr22:38282054(+) A-G intron -    22484847
chr22:38283075(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase EIF3L
chr22:38245214-38245215(+) m6A 5'UTR       24209618//24981863
chr22:38245260-38245261(+) m6A 5'UTR       24209618//24981863
chr22:38245383-38245384(+) m6A 5'UTR//CDS       24981863
chr22:38245540-38245541(+) m6A 5'UTR//intron       -
chr22:38247364-38247365(+) m6A 3'UTR//5'UTR//CDS//exon       27773535
chr22:38247387-38247388(+) m6A 3'UTR//5'UTR//CDS//exon       27773535
chr22:38271896-38271897(+) Y CDS//exon       26075521
chr22:38271997-38271998(+) m6A CDS//exon       22575960//22608085
chr22:38273789-38273790(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22575960//22608085
chr22:38273835-38273836(+) m6A CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr22:38273845-38273846(+) Y CDS//exon       26075521
chr22:38274041-38274042(+) m6A CDS//exon       22575960
chr22:38282790-38282791(+) m6A CDS//exon       27773535
chr22:38284441-38284442(+) m6A CDS//exon       27773535
chr22:38284458-38284459(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773535
chr22:38284464-38284465(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       27773535
chr22:38284493-38284494(+) m6A 3'UTR//exon       27773535
chr22:38284540-38284541(+) m6A 3'UTR//exon       27773535
chr22:38284591-38284592(+) m6A 3'UTR//exon       27773535

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate EIF3L
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Cytosol K562 cells     -
Exosome Blood     -
Membrane K562 cells     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus HeLa-S3 cells|K562 cells     -
Ribosome-free cytosol Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: zikv-mir-6
Interactor2: EIF3L

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda
Support Database ZIKV-CDB

Starting a new search, please wait ...