Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00024615

  Virus:  

Zika virus (ZIKV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.1828

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol zikv-mir-3 ZNF138
miRBase
Accession/Entrez ID		 zikv-mir-3 7697
Organism Zika virus (ZIKV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - pHZ-32

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR ZNF138
chr7:64284145(+) A-I      intronic
chr7:64284140(+) A-I      intronic
chr7:64283974(+) A-I      intronic
chr7:64283863(+) A-I      intronic
chr7:64283799(+) A-I      intronic
chr7:64283438(+) A-I      intronic
chr7:64283432(+) A-I      intronic
chr7:64283398(+) A-I      intronic
chr7:64275973(+) A-I      NonSyn:Thr->Ala
chr7:64283385(+) A-I      intronic
chr7:64282035(+) A-I      intronic
chr7:64281091(+) A-I      intronic
chr7:64280985(+) A-I      intronic
chr7:64280223(+) A-I      intronic
chr7:64280021(+) A-I      intronic
chr7:64280009(+) A-I      intronic
chr7:64279882(+) A-I      intronic
chr7:64279839(+) A-I      intronic
chr7:64279832(+) A-I      intronic
chr7:64278875(+) A-I      intronic
chr7:64278640(+) A-I      intronic
chr7:64278549(+) A-I      intronic
chr7:64273997(+) A-I      intronic
chr7:64273941(+) A-I      intronic
chr7:64278451(+) A-I      intronic
chr7:64275123(+) A-I      intronic
chr7:64275003(+) A-I      intronic
chr7:64274957(+) A-I      intronic
chr7:64274933(+) A-I      intronic
chr7:64271804(+) A-I      intronic
chr7:64265065(+) A-I      intronic
chr7:64265007(+) A-I      intronic
chr7:64274086(+) A-I      intronic
chr7:64284231(+) A-I      intronic
chr7:64259662(+) A-I      intronic
chr7:64272588(+) A-I      intronic
chr7:64271863(+) A-I      intronic
chr7:64264989(+) A-I      intronic
chr7:64259744(+) A-I      intronic
chr7:64257297(+) A-I      intronic
chr7:64284276(+) A-I      intronic
chr7:64284236(+) A-I      intronic
chr7:64284222(+) A-I      intronic
chr7:64284205(+) A-I      intronic
chr7:64259728(+) A-I      intronic
chr7:64284166(+) A-I      intronic
chr7:64284158(+) A-I      intronic
chr7:64284157(+) A-I      intronic
chr7:64284154(+) A-I      intronic
chr7:64258541(+) A-I      intronic
chr7:64258528(+) A-I      intronic
chr7:64258434(+) A-I      intronic
chr7:64284151(+) A-I      intronic
chr7:64259077(+) A-I      intronic
chr7:64259724(+) A-I      intronic
chr7:64281203(+) A-I      intronic
chr7:64279013(+) A-I      intronic
chr7:64257211(+) A-I      intronic
chr7:64284049(+) A-I      intronic
chr7:64272777(+) A-I      intronic
chr7:64279040(+) A-I      intronic
chr7:64283307(+) A-I      intronic
chr7:64283949(+) A-I      intronic
chr7:64283826(+) A-I      intronic
chr7:64283904(+) A-I      intronic
chr7:64272585(+) A-I      intronic
chr7:64287242(+) A-I      intronic
chr7:64259139(+) A-I      intronic
chr7:64281022(+) A-I      intronic
chr7:64259644(+) A-I      intronic
chr7:64278966(+) A-I      intronic
chr7:64258458(+) A-I      intronic
chr7:64285337(+) A-I      intronic
chr7:64265574(+) A-I      intronic
chr7:64274889(+) A-I      intronic
chr7:64284062(+) A-I      intronic
chr7:64278952(+) A-I      intronic
chr7:64283315(+) A-I      intronic
chr7:64274019(+) A-I      intronic
chr7:64278403(+) A-I      intronic
chr7:64279956(+) A-I      intronic
chr7:64281042(+) A-I      intronic
chr7:64259674(+) A-I      intronic
chr7:64278638(+) A-I      intronic
chr7:64278866(+) A-I      intronic
chr7:64281043(+) A-I      intronic
chr7:64287263(+) A-I      intronic
chr7:64279048(+) A-I      intronic
chr7:64278989(+) A-I      intronic
chr7:64280250(+) A-I      intronic
chr7:64280363(+) A-I      intronic
chr7:64286813(+) A-I      intronic
chr7:64258521(+) A-I      intronic
chr7:64259750(+) A-I      intronic
chr7:64271853(+) A-I      intronic
chr7:64259684(+) A-I      intronic
chr7:64283814(+) A-I      intronic
chr7:64285319(+) A-I      intronic
chr7:64283993(+) A-I      intronic
chr7:64278544(+) A-I      intronic
chr7:64275091(+) A-I      intronic
chr7:64283996(+) A-I      intronic
chr7:64285320(+) A-I      intronic
chr7:64280195(+) A-I      intronic
chr7:64272776(+) A-I      intronic
chr7:64279007(+) A-I      intronic
chr7:64257237(+) A-I      intronic
chr7:64259769(+) A-I      intronic
chr7:64258505(+) A-I      intronic
chr7:64257393(+) A-I      intronic
chr7:64278942(+) A-I      intronic
chr7:64259606(+) A-I      intronic
chr7:64281176(+) A-I      intronic
chr7:64258519(+) A-I      intronic
chr7:64258385(+) A-I      intronic
chr7:64278564(+) A-I      intronic
chr7:64280390(+) A-I      intronic
chr7:64281674(+) A-I      intronic
chr7:64258342(+) A-I      intronic
chr7:64284268(+) A-I      intronic
chr7:64258350(+) A-I      intronic
chr7:64258974(+) A-I      intronic
chr7:64258581(+) A-I      intronic
chr7:64281083(+) A-I      intronic
chr7:64273951(+) A-I      intronic
chr7:64271913(+) A-I      intronic
chr7:64274966(+) A-I      intronic
chr7:64284237(+) A-I      intronic
chr7:64271780(+) A-I      intronic
chr7:64265616(+) A-I      intronic
chr7:64271986(+) A-I      intronic
chr7:64283358(+) A-I      intronic
chr7:64258971(+) A-I      intronic
chr7:64287290(+) A-I      intronic
chr7:64283987(+) A-I      intronic
chr7:64278547(+) A-I      intronic
chr7:64259770(+) A-I      intronic
chr7:64259727(+) A-I      intronic
chr7:64271774(+) A-I      intronic
chr7:64259601(+) A-I      intronic
chr7:64259815(+) A-I      intronic
chr7:64282185(+) A-I      intronic
chr7:64285264(+) A-I      intronic
chr7:64283843(+) A-I      intronic
chr7:64259716(+) A-I      intronic
chr7:64275024(+) A-I      intronic
chr7:64283853(+) A-I      intronic
chr7:64284063(+) A-I      intronic
chr7:64283855(+) A-I      intronic
chr7:64275001(+) A-I      intronic
chr7:64257369(+) A-I      intronic
chr7:64272676(+) A-I      intronic
chr7:64272812(+) A-I      intronic
chr7:64280201(+) A-I      intronic
chr7:64259036(+) A-I      intronic
chr7:64281151(+) A-I      intronic
chr7:64280371(+) A-I      intronic
chr7:64280231(+) A-I      intronic
chr7:64279846(+) A-I      intronic
chr7:64257245(+) A-I      intronic
chr7:64283831(+) A-I      intronic
chr7:64282005(+) A-I      intronic
chr7:64258969(+) A-I      intronic
chr7:64260224(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED ZNF138
chr7:64258342(+) A-G intron -    22484847
chr7:64258350(+) A-G intron -    22484847
chr7:64258458(+) A-G intron -    22484847
chr7:64258521(+) A-G intron -    22484847
chr7:64258539(+) A-G intron -    22484847
chr7:64258571(+) A-G intron -    22484847
chr7:64258936(+) A-G intron -    22484847
chr7:64259036(+) A-G intron -    22484847
chr7:64259037(+) A-G intron -    22484847
chr7:64259078(+) A-G intron -    22484847
chr7:64259567(+) A-G intron -    22484847
chr7:64259601(+) A-G intron -    22484847
chr7:64259606(+) A-G intron -    22484847
chr7:64259644(+) A-G intron -    22484847
chr7:64259674(+) A-G intron -    22484847
chr7:64259681(+) A-G intron -    22484847
chr7:64259684(+) A-G intron -    22484847
chr7:64259793(+) T-A intron -    22484847
chr7:64271780(+) A-G intron -    22484847
chr7:64271853(+) A-G intron -    22484847
chr7:64271913(+) A-G intron -    22484847
chr7:64272585(+) A-G intron -    22484847
chr7:64273951(+) A-G intron -    22484847
chr7:64274961(+) A-G intron -    22484847
chr7:64274966(+) A-G intron -    22484847
chr7:64275001(+) A-G intron -    22484847
chr7:64275033(+) A-G intron -    22484847
chr7:64275091(+) A-G intron -    22484847
chr7:64278403(+) A-G intron -    22484847
chr7:64278544(+) A-G intron -    22484847
chr7:64278547(+) A-G intron -    22484847
chr7:64278564(+) A-G intron -    22484847
chr7:64278578(+) A-G intron -    22484847
chr7:64278874(+) A-G intron -    22484847
chr7:64278966(+) A-G intron -    22484847
chr7:64279013(+) A-G intron -    22484847
chr7:64279021(+) A-G intron -    22484847
chr7:64279049(+) A-G intron -    22484847
chr7:64279879(+) A-G intron -    22484847
chr7:64280231(+) A-G intron -    22484847
chr7:64280362(+) A-G intron -    22484847
chr7:64280363(+) A-G intron -    22484847
chr7:64281022(+) A-G intron -    22484847
chr7:64281043(+) A-G intron -    22484847
chr7:64283261(+) T-A intron -    22484847
chr7:64283307(+) A-G intron -    22484847
chr7:64283315(+) A-G intron -    22484847
chr7:64283358(+) A-G intron -    22484847
chr7:64283813(+) A-G intron -    22484847
chr7:64283814(+) A-G intron -    22484847
chr7:64283825(+) A-G intron -    22484847
chr7:64283826(+) A-G intron -    22484847
chr7:64283831(+) A-G intron -    22484847
chr7:64283853(+) A-G intron -    22484847
chr7:64283855(+) A-G intron -    22484847
chr7:64283987(+) A-G intron -    22484847
chr7:64283989(+) A-G intron -    22484847
chr7:64283996(+) A-G intron -    22484847
chr7:64284063(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase ZNF138
chr7:64291407-64291408(+) m6A CDS//intron       22608085
chr7:64291413-64291414(+) m6A CDS//intron       22608085
chr7:64291852-64291853(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr7:64291870-64291871(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22608085
chr7:64291922-64291923(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085
chr7:64291976-64291977(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085
chr7:64291997-64291998(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24209618//24981863//27773535//22575960//22608085
chr7:64292087-64292088(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr7:64292099-64292100(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//27773535//22608085
chr7:64292114-64292115(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//27773535//22608085
chr7:64292226-64292227(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//22608085
chr7:64292245-64292246(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//22608085
chr7:64292255-64292256(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24981863//22608085
chr7:64292282-64292283(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64292339-64292340(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64292366-64292367(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64292402-64292403(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64292423-64292424(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64292450-64292451(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64292465-64292466(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64292507-64292508(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64292534-64292535(+) m6A 3'UTR//CDS//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64292591-64292592(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085
chr7:64292702-64292703(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64292759-64292760(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64292786-64292787(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64292870-64292871(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085
chr7:64292954-64292955(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64293011-64293012(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64293038-64293039(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64293053-64293054(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64293122-64293123(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64293169-64293170(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64293179-64293180(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64293206-64293207(+) m6A 3'UTR//exon       24284625//24981863//22608085
chr7:64293290-64293291(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085
chr7:64293337-64293338(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085
chr7:64293363-64293364(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085
chr7:64293374-64293375(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085
chr7:64293458-64293459(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085
chr7:64293486-64293487(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085
chr7:64293502-64293503(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085
chr7:64293535-64293536(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085
chr7:64293619-64293620(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085
chr7:64293676-64293677(+) m6A 3'UTR//exon       24981863//22608085
chr7:64293703-64293704(+) m6A 3'UTR//exon       22608085
chr7:64293734-64293735(+) m6A 3'UTR//exon       22608085
chr7:64293752-64293753(+) m6A 3'UTR//exon       22608085
chr7:64293862-64293863(+) m6A 3'UTR//exon       22608085
chr7:64293891-64293892(+) m6A 3'UTR//exon       22608085

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate ZNF138
Chromatin K562 cells     -
Cytosol Human myelogenous leukemia cell line (K-562)     21613539
Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: zikv-mir-3
Interactor2: ZNF138

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda
Support Database ZIKV-CDB

Starting a new search, please wait ...