Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00010010

  Virus:  

Zika virus (ZIKV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.1828

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol zikv-mir-1 CCT6P3
miRBase
Accession/Entrez ID		 zikv-mir-1 643180
Organism Zika virus (ZIKV) Homo sapiens
Category miRNA pseudo
Alias - CCT6-3P

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR CCT6P3
chr7:64504122(+) A-I      intronic
chr7:64504131(+) A-I      intronic
chr7:64505475(+) A-I      intronic
chr7:64504802(+) A-I      intronic
chr7:64510057(+) A-I      intronic
chr7:64504054(+) A-I      intronic
chr7:64504016(+) A-I      intronic
chr7:64503367(+) A-I      intronic
chr7:64502919(+) A-I      intronic
chr7:64521676(+) A-I      intronic
chr7:64504925(+) A-I      intronic
chr7:64504879(+) A-I      intronic
chr7:64504875(+) A-I      intronic
chr7:64504974(+) A-I      intronic
chr7:64521592(+) A-I      intronic
chr7:64505450(+) A-I      intronic
chr7:64521577(+) A-I      intronic
chr7:64521576(+) A-I      intronic
chr7:64521657(+) A-I      intronic
chr7:64504916(+) A-I      intronic
chr7:64511061(+) A-I      intronic
chr7:64502979(+) A-I      intronic
chr7:64502967(+) A-I      intronic
chr7:64513091(+) A-I      intronic
chr7:64505406(+) A-I      intronic
chr7:64511078(+) A-I      intronic
chr7:64504071(+) A-I      intronic
chr7:64504885(+) A-I      intronic
chr7:64511065(+) A-I      intronic
chr7:64505415(+) A-I      intronic
chr7:64504815(+) A-I      intronic
chr7:64504107(+) A-I      intronic
chr7:64511103(+) A-I      intronic
chr7:64504820(+) A-I      intronic
chr7:64505425(+) A-I      intronic
chr7:64504986(+) A-I      intronic
chr7:64504942(+) A-I      intronic
chr7:64502973(+) A-I      intronic
chr7:64502963(+) A-I      intronic
chr7:64504851(+) A-I      intronic
chr7:64505421(+) A-I      intronic
chr7:64500807(+) A-I      intronic
chr7:64500888(+) A-I      intronic
chr7:64501349(+) A-I      intronic
chr7:64502911(+) A-I      intronic
chr7:64504839(+) A-I      intronic
chr7:64519222(+) A-I      intronic
chr7:64513456(+) A-I      intronic
chr7:64513426(+) A-I      intronic
chr7:64513282(+) A-I      intronic
chr7:64513242(+) A-I      intronic
chr7:64513226(+) A-I      intronic
chr7:64510986(+) A-I      intronic
chr7:64510962(+) A-I      intronic
chr7:64510890(+) A-I      intronic
chr7:64510845(+) A-I      intronic
chr7:64510064(+) A-I      intronic
chr7:64510063(+) A-I      intronic
chr7:64509896(+) A-I      intronic
chr7:64509890(+) A-I      intronic
chr7:64509742(+) A-I      intronic
chr7:64509724(+) A-I      intronic
chr7:64505334(+) A-I      intronic
chr7:64506615(+) A-I      intronic
chr7:64506586(+) A-I      intronic
chr7:64506560(+) A-I      intronic
chr7:64506427(+) A-I      intronic
chr7:64506423(+) A-I      intronic
chr7:64506422(+) A-I      intronic
chr7:64504116(+) A-I      intronic
chr7:64504884(+) A-I      intronic
chr7:64524276(+) A-I      intronic
chr7:64524273(+) A-I      intronic
chr7:64521681(+) A-I      intronic
chr7:64520799(+) A-I      intronic
chr7:64520793(+) A-I      intronic
chr7:64520790(+) A-I      intronic
chr7:64519300(+) A-I      intronic
chr7:64519285(+) A-I      intronic
chr7:64519266(+) A-I      intronic
chr7:64519234(+) A-I      intronic
chr7:64508411(+) A-I      intronic
chr7:64521570(+) A-I      intronic
chr7:64504081(+) A-I      intronic
chr7:64505243(+) A-I      intronic
chr7:64502147(+) A-I      intronic
chr7:64510093(+) A-I      intronic
chr7:64520787(+) A-I      intronic
chr7:64510871(+) A-I      intronic
chr7:64508394(+) A-I      intronic
chr7:64504833(+) A-I      intronic
chr7:64504125(+) A-I      intronic
chr7:64508290(+) A-I      intronic
chr7:64511039(+) A-I      intronic
chr7:64524413(+) A-I      intronic
chr7:64502281(+) A-I      intronic
chr7:64513153(+) A-I      intronic
chr7:64524274(+) A-I      intronic
chr7:64519127(+) A-I      intronic
chr7:64519190(+) A-I      intronic
chr7:64504859(+) A-I      intronic
chr7:64520720(+) A-I      intronic
chr7:64500828(+) A-I      intronic
chr7:64524289(+) A-I      intronic
chr7:64501050(+) A-I      intronic
chr7:64523720(+) A-I      intronic
chr7:64520734(+) A-I      intronic
chr7:64517838(+) A-I      intronic
chr7:64501232(+) A-I      intronic
chr7:64506417(+) A-I      intronic
chr7:64520784(+) A-I      intronic
chr7:64506409(+) A-I      intronic
chr7:64510973(+) A-I      intronic
chr7:64521644(+) A-I      intronic
chr7:64508289(+) A-I      intronic
chr7:64509693(+) A-I      intronic
chr7:64524311(+) A-I      intronic
chr7:64513466(+) A-I      intronic
chr7:64506440(+) A-I      intronic
chr7:64511054(+) A-I      intronic
chr7:64510972(+) A-I      intronic
chr7:64524267(+) A-I      intronic
chr7:64521106(+) A-I      intronic
chr7:64510200(+) A-I      intronic
chr7:64523710(+) A-I      intronic
chr7:64521687(+) A-I      intronic
chr7:64508424(+) A-I      intronic
chr7:64513055(+) A-I      intronic
chr7:64504889(+) A-I      intronic
chr7:64513371(+) A-I      intronic
chr7:64509736(+) A-I      intronic
chr7:64506546(+) A-I      intronic
chr7:64504164(+) A-I      intronic
chr7:64509798(+) A-I      intronic
chr7:64521667(+) A-I      intronic
chr7:64513534(+) A-I      intronic
chr7:64504022(+) A-I      intronic
chr7:64524356(+) A-I      intronic
chr7:64506516(+) A-I      intronic
chr7:64506486(+) A-I      intronic
chr7:64504042(+) A-I      intronic
chr7:64510129(+) A-I      intronic
chr7:64502908(+) A-I      intronic
chr7:64510236(+) A-I      intronic
chr7:64504981(+) A-I      intronic
chr7:64520802(+) A-I      intronic
chr7:64509793(+) A-I      intronic
chr7:64519297(+) A-I      intronic
chr7:64524326(+) A-I      intronic
chr7:64509748(+) A-I      intronic
chr7:64509707(+) A-I      intronic
chr7:64506435(+) A-I      intronic
chr7:64510147(+) A-I      intronic
chr7:64527486(+) A-I      intronic
chr7:64521114(+) A-I      intronic
chr7:64502974(+) A-I      intronic
chr7:64509878(+) A-I      intronic
chr7:64502269(+) A-I      intronic
chr7:64511098(+) A-I      intronic
chr7:64502214(+) A-I      intronic
chr7:64513401(+) A-I      intronic
chr7:64520693(+) A-I      intronic
chr7:64520694(+) A-I      intronic
chr7:64504980(+) A-I      intronic
chr7:64511018(+) A-I      intronic
chr7:64513511(+) A-I      intronic
chr7:64505353(+) A-I      intronic
chr7:64519164(+) A-I      intronic
chr7:64513391(+) A-I      intronic
chr7:64509746(+) A-I      intronic
chr7:64521656(+) A-I      intronic
chr7:64510968(+) A-I      intronic
chr7:64506523(+) A-I      intronic
chr7:64505265(+) A-I      intronic
chr7:64513452(+) A-I      intronic
chr7:64506390(+) A-I      intronic
chr7:64504011(+) A-I      intronic
chr7:64527503(+) A-I      intronic
chr7:64508325(+) A-I      intronic
chr7:64501065(+) A-I      intronic
chr7:64510850(+) A-I      intronic
chr7:64508393(+) A-I      intronic
chr7:64519130(+) A-I      intronic
chr7:64513427(+) A-I      intronic
chr7:64513468(+) A-I      intronic
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED CCT6P3
chr7:64502909(+) A-I intron -    22327324
chr7:64504011(+) A-I intron -    22327324
chr7:64504042(+) A-I intron -    22327324
chr7:64506435(+) A-I intron -    22327324
chr7:64506587(+) A-I intron -    22327324
chr7:64509746(+) A-I intron -    22327324
chr7:64513427(+) A-I intron -    22327324
chr7:64513431(+) A-I intron -    22327324
chr7:64513534(+) A-I intron -    22327324
chr7:64530466(+) G-T intron -    21725310
chr7:64534250(+) G-A intron -    21725310
chr7:64500918(+) A-G intron -    22484847
chr7:64502214(+) A-G intron -    22484847
chr7:64502908(+) A-G intron -    22484847
chr7:64502909(+) A-G intron -    22484847
chr7:64502924(+) G-A intron -    22484847
chr7:64502960(+) A-G intron -    22484847
chr7:64502974(+) A-G intron -    22484847
chr7:64503038(+) A-G intron -    22484847
chr7:64504011(+) A-G intron -    22484847
chr7:64504022(+) A-G intron -    22484847
chr7:64504042(+) A-G intron -    22484847
chr7:64504081(+) A-G intron -    22484847
chr7:64504125(+) A-G intron -    22484847
chr7:64504164(+) A-G intron -    22484847
chr7:64504763(+) A-G intron -    22484847
chr7:64504780(+) A-G intron -    22484847
chr7:64504825(+) A-G intron -    22484847
chr7:64504833(+) A-G intron -    22484847
chr7:64504859(+) A-G intron -    22484847
chr7:64504889(+) A-G intron -    22484847
chr7:64505243(+) A-G intron -    22484847
chr7:64506354(+) A-G intron -    22484847
chr7:64506387(+) A-G intron -    22484847
chr7:64506417(+) A-G intron -    22484847
chr7:64506435(+) A-G intron -    22484847
chr7:64506440(+) A-G intron -    22484847
chr7:64506509(+) A-G intron -    22484847
chr7:64506546(+) A-G intron -    22484847
chr7:64508289(+) A-G intron -    22484847
chr7:64508290(+) A-G intron -    22484847
chr7:64508394(+) A-G intron -    22484847
chr7:64508411(+) A-G intron -    22484847
chr7:64508424(+) A-G intron -    22484847
chr7:64509693(+) A-G intron -    22484847
chr7:64509700(+) A-G intron -    22484847
chr7:64509707(+) A-G intron -    22484847
chr7:64509746(+) A-G intron -    22484847
chr7:64509748(+) A-G intron -    22484847
chr7:64509793(+) A-G intron -    22484847
chr7:64509796(+) A-G intron -    22484847
chr7:64510129(+) A-G intron -    22484847
chr7:64510147(+) A-G intron -    22484847
chr7:64510871(+) A-G intron -    22484847
chr7:64510947(+) A-G intron -    22484847
chr7:64510968(+) A-G intron -    22484847
chr7:64510973(+) A-G intron -    22484847
chr7:64510974(+) A-G intron -    22484847
chr7:64510977(+) A-G intron -    22484847
chr7:64510982(+) A-G intron -    22484847
chr7:64511022(+) A-G intron -    22484847
chr7:64511039(+) A-G intron -    22484847
chr7:64511045(+) A-G intron -    22484847
chr7:64513427(+) A-G intron -    22484847
chr7:64513431(+) A-G intron -    22484847
chr7:64513534(+) A-G intron -    22484847
chr7:64517852(+) A-G intron -    22484847
chr7:64519130(+) A-G intron -    22484847
chr7:64519190(+) A-G intron -    22484847
chr7:64520784(+) A-G intron -    22484847
chr7:64520802(+) A-G intron -    22484847
chr7:64521644(+) A-G intron -    22484847
chr7:64524266(+) T-C intron -    22484847
chr7:64524267(+) A-G intron -    22484847
chr7:64524332(+) T-C intron -    22484847
chr7:64524413(+) A-G intron -    22484847
chr7:64532957(+) C-T intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase CCT6P3
chr7:64529718-64529719(+) m6A exon//intron       27773535

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate CCT6P3
Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: zikv-mir-1
Interactor2: CCT6P3

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda
Support Database ZIKV-CDB

Starting a new search, please wait ...