Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00010005

  Virus:  

Zika virus (ZIKV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.1828

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol zikv-mir-1 ZNF876P
miRBase
Accession/Entrez ID		 zikv-mir-1 642280
Organism Zika virus (ZIKV) Homo sapiens
Category miRNA pseudo
Alias - -

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR ZNF876P
chr4:249609(+) A-I      ncRNA
chr4:249614(+) A-I      ncRNA
chr4:249629(+) A-I      ncRNA
chr4:249499(+) A-I      ncRNA
chr4:249662(+) A-I      ncRNA
chr4:249500(+) A-I      ncRNA
chr4:249684(+) A-I      ncRNA
chr4:249501(+) A-I      ncRNA
chr4:249507(+) A-I      ncRNA
chr4:249509(+) A-I      ncRNA
chr4:249518(+) A-I      ncRNA
chr4:249519(+) A-I      ncRNA
chr4:249645(+) A-I      ncRNA
chr4:249543(+) A-I      ncRNA
chr4:249544(+) A-I      ncRNA
chr4:249548(+) A-I      ncRNA
chr4:249559(+) A-I      ncRNA
chr4:249562(+) A-I      ncRNA
chr4:249563(+) A-I      ncRNA
chr4:249569(+) A-I      ncRNA
chr4:249570(+) A-I      ncRNA
chr4:249578(+) A-I      ncRNA
chr4:247779(+) A-I      ncRNA
chr4:249655(+) A-I      ncRNA
chr4:249568(+) A-I      ncRNA
chr4:249580(+) A-I      ncRNA
chr4:249584(+) A-I      ncRNA
chr4:249585(+) A-I      ncRNA
chr4:249668(+) A-I      ncRNA
chr4:249680(+) A-I      ncRNA
chr4:249589(+) A-I      ncRNA
chr4:249617(+) A-I      ncRNA
chr4:249496(+) A-I      ncRNA
chr4:249495(+) A-I      ncRNA
chr4:249494(+) A-I      ncRNA
chr4:249487(+) A-I      ncRNA
chr4:249483(+) A-I      ncRNA
chr4:249474(+) A-I      ncRNA
chr4:249460(+) A-I      ncRNA
chr4:249459(+) A-I      ncRNA
chr4:249456(+) A-I      ncRNA
chr4:249455(+) A-I      ncRNA
chr4:249448(+) A-I      ncRNA
chr4:249445(+) A-I      ncRNA
chr4:249444(+) A-I      ncRNA
chr4:249440(+) A-I      ncRNA
chr4:247784(+) A-I      ncRNA
chr4:247782(+) A-I      ncRNA
chr4:247778(+) A-I      ncRNA
chr4:247773(+) A-I      ncRNA
chr4:249273(+) A-I      ncRNA
chr4:249230(+) A-I      ncRNA
chr4:249219(+) A-I      ncRNA
chr4:249207(+) A-I      ncRNA
chr4:248914(+) A-I      ncRNA
chr4:227800(+) A-I      intronic
chr4:227975(+) A-I      intronic
chr4:227941(+) A-I      intronic
chr4:215104(+) A-I      intronic
chr4:215121(+) A-I      intronic
chr4:227761(+) A-I      intronic
chr4:227752(+) A-I      intronic
chr4:214697(+) A-I      intronic
chr4:213430(+) A-I      intronic
chr4:214501(+) A-I      intronic
chr4:213411(+) A-I      intronic
chr4:215043(+) A-I      intronic
chr4:213511(+) A-I      intronic
chr4:213523(+) A-I      intronic
chr4:215065(+) A-I      intronic
chr4:213435(+) A-I      intronic
chr4:213627(+) A-I      intronic
chr4:227731(+) A-I      intronic
chr4:215053(+) A-I      intronic
chr4:222727(+) A-I      intronic
chr4:214568(+) A-I      intronic
chr4:213419(+) A-I      intronic
chr4:213527(+) A-I      intronic
chr4:212136(+) A-I      intronic
chr4:213546(+) A-I      intronic
chr4:214572(+) A-I      intronic
chr4:215058(+) A-I      intronic
chr4:213505(+) A-I      intronic
chr4:213549(+) A-I      intronic
chr4:214645(+) A-I      intronic
chr4:213555(+) A-I      intronic
chr4:215028(+) A-I      intronic
chr4:213445(+) A-I      intronic
chr4:214557(+) A-I      intronic
chr4:212279(+) A-I      intronic
chr4:214582(+) A-I      intronic
chr4:213640(+) A-I      intronic
chr4:215004(+) A-I      intronic
chr4:215013(+) A-I      intronic
chr4:214961(+) A-I      intronic
chr4:215094(+) A-I      intronic
chr4:213459(+) A-I      intronic
chr4:213629(+) A-I      intronic
chr4:230635(+) A-I      intronic
chr4:230524(+) A-I      intronic
chr4:213566(+) A-I      intronic
chr4:215054(+) A-I      intronic
chr4:214660(+) A-I      intronic
chr4:214562(+) A-I      intronic
chr4:212345(+) A-I      intronic
chr4:213469(+) A-I      intronic
chr4:214477(+) A-I      intronic
chr4:248840(+) A-I      ncRNA
chr4:248996(+) A-I      ncRNA
Resource Symbol Editing Position Change SeqReg exReg PMID
DARNED ZNF876P
chr4:213469(+) A-G intron -    22484847
chr4:213505(+) A-G intron -    22484847
chr4:213549(+) A-G intron -    22484847
chr4:213555(+) A-G intron -    22484847
chr4:215004(+) A-G intron -    22484847
chr4:215052(+) A-G intron -    22484847

RNA Modification:


Resource Symbol ModificationPosition Type Genomic Context PMID
RMBase ZNF876P
chr4:247517-247518(+) m6A exon       24981863
chr4:247603-247604(+) m6A exon       24981863
chr4:247613-247614(+) m6A exon       24981863
chr4:247800-247801(+) m6A exon       24981863
chr4:247855-247856(+) m6A exon       24981863
chr4:247882-247883(+) m6A exon       24981863
chr4:247916-247917(+) m6A exon       24981863
chr4:247937-247938(+) m6A exon       24981863
chr4:247964-247965(+) m6A exon       24981863
chr4:248000-248001(+) m6A exon       24981863
chr4:248021-248022(+) m6A exon       24981863
chr4:248048-248049(+) m6A exon       24981863
chr4:248125-248126(+) m6A exon       24981863
chr4:248131-248132(+) m6A exon       24981863
chr4:248188-248189(+) m6A exon       24981863
chr4:248213-248214(+) m6A exon       24981863
chr4:248270-248271(+) m6A exon       -
chr4:248354-248355(+) m6A exon       24981863
chr4:248381-248382(+) m6A exon       24981863
chr4:248417-248418(+) m6A exon       24981863
chr4:248438-248439(+) m6A exon       24981863
chr4:248465-248466(+) m6A exon       24981863
chr4:248522-248523(+) m6A exon       24981863
chr4:248549-248550(+) m6A exon       24981863

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate ZNF876P
Exosome Blood     -

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: zikv-mir-1
Interactor2: ZNF876P

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda
Support Database ZIKV-CDB

Starting a new search, please wait ...