Detail Information

Basic Information:


  VIRBase ID:  

VHID00004072

  Virus:  

Zika virus (ZIKV)

  Host:  

Homo sapiens

  Confidence Score:  

0.1828

  Interaction Type:  

Virus-Host interaction

Interactor Information:


Interactor1 Interactor2
Symbol zikv-mir-1 CEP43
miRBase
Accession/Entrez ID		 zikv-mir-1 11116
Organism Zika virus (ZIKV) Homo sapiens
Category miRNA mRNA
Alias - FGFR1OP//FOP

RNA Editing:


Resource Symbol Editing Position Change Genetic Region
RADAR CEP43
chr6:167423098(+) A-I      intronic
chr6:167423055(+) A-I      intronic
chr6:167423103(+) A-I      intronic
chr6:167422948(+) A-I      intronic
chr6:167432044(+) A-I      intronic
chr6:167422624(+) A-I      intronic
chr6:167427310(+) A-I      intronic
chr6:167422851(+) A-I      intronic
chr6:167427276(+) A-I      intronic
chr6:167422493(+) A-I      intronic
chr6:167422224(+) A-I      intronic
chr6:167422113(+) A-I      intronic
chr6:167419970(+) A-I      intronic
chr6:167452735(+) A-I      intronic
chr6:167446765(+) A-I      intronic
chr6:167423226(+) A-I      intronic
chr6:167446764(+) A-I      intronic
chr6:167434290(+) A-I      intronic
chr6:167434236(+) A-I      intronic
chr6:167432088(+) A-I      intronic
chr6:167423203(+) A-I      intronic
chr6:167427413(+) A-I      intronic
chr6:167423105(+) A-I      intronic
chr6:167422487(+) A-I      intronic
chr6:167434275(+) A-I      intronic
chr6:167432005(+) A-I      intronic
chr6:167427300(+) A-I      intronic
chr6:167422162(+) A-I      intronic
chr6:167434517(+) A-I      intronic
chr6:167434385(+) A-I      intronic
chr6:167427301(+) A-I      intronic
chr6:167431978(+) A-I      intronic
chr6:167419950(+) A-I      intronic
chr6:167434325(+) A-I      intronic
chr6:167423060(+) A-I      intronic
chr6:167449329(+) A-I      intronic
chr6:167422145(+) A-I      intronic
chr6:167423166(+) A-I      intronic
chr6:167422465(+) A-I      intronic
chr6:167422625(+) A-I      intronic
chr6:167422150(+) A-I      intronic
chr6:167430690(+) A-I      intronic
chr6:167422848(+) A-I      intronic
chr6:167434293(+) A-I      intronic
chr6:167422900(+) A-I      intronic
chr6:167422008(+) A-I      intronic
chr6:167434241(+) A-I      intronic
chr6:167434470(+) A-I      intronic
chr6:167434573(+) A-I      intronic
chr6:167432064(+) A-I      intronic
chr6:167452770(+) A-I      intronic
chr6:167434238(+) A-I      intronic
chr6:167419816(+) A-I      intronic
chr6:167434276(+) A-I      intronic
chr6:167422236(+) A-I      intronic
chr6:167427346(+) A-I      intronic
chr6:167429874(+) A-I      intronic
chr6:167430744(+) A-I      intronic
chr6:167422859(+) A-I      intronic
chr6:167429882(+) A-I      intronic
chr6:167434347(+) A-I      intronic
chr6:167427207(+) A-I      intronic
chr6:167432062(+) A-I      intronic
chr6:167422943(+) A-I      intronic
chr6:167419965(+) A-I      intronic
chr6:167434235(+) A-I      intronic
chr6:167422904(+) A-I      intronic
chr6:167422073(+) A-I      intronic
chr6:167455509(+) A-I      3'UTR
chr6:167455557(+) A-I      3'UTR
chr6:167455512(+) A-I      3'UTR
chr6:167455429(+) A-I      3'UTR
chr6:167455365(+) A-I      3'UTR
chr6:167430601(+) A-I      intronic
chr6:167427308(+) A-I      intronic
chr6:167434317(+) A-I      intronic
chr6:167434357(+) A-I      intronic
chr6:167430623(+) A-I      intronic
chr6:167419888(+) A-I      intronic
chr6:167427314(+) A-I      intronic
chr6:167432008(+) A-I      intronic
chr6:167419925(+) A-I      intronic
chr6:167430665(+) A-I      intronic
chr6:167422694(+) A-I      intronic
chr6:167423201(+) A-I      intronic
chr6:167434306(+) A-I      intronic
chr6:167434282(+) A-I      intronic
chr6:167434190(+) A-I      intronic
chr6:167422022(+) A-I      intronic
chr6:167432079(+) A-I      intronic
chr6:167429931(+) A-I      intronic
chr6:167422887(+) A-I      intronic
chr6:167427341(+) A-I      intronic
chr6:167434239(+) A-I      intronic
chr6:167422085(+) A-I      intronic
chr6:167429791(+) A-I      intronic
chr6:167434133(+) A-I      intronic
chr6:167434211(+) A-I      intronic
chr6:167434277(+) A-I      intronic
chr6:167427309(+) A-I      intronic
chr6:167422015(+) A-I      intronic
chr6:167434141(+) A-I      intronic
chr6:167423341(+) A-I      intronic
chr6:167422095(+) A-I      intronic
chr6:167422223(+) A-I      intronic
chr6:167434210(+) A-I      intronic
chr6:167434309(+) A-I      intronic
chr6:167431979(+) A-I      intronic
chr6:167430743(+) A-I      intronic
chr6:167429985(+) A-I      intronic
chr6:167434574(+) A-I      intronic
chr6:167422799(+) A-I      intronic
chr6:167427350(+) A-I      intronic
chr6:167422820(+) A-I      intronic
chr6:167434566(+) A-I      intronic
chr6:167430548(+) A-I      intronic
chr6:167434213(+) A-I      intronic
chr6:167429879(+) A-I      intronic
chr6:167423204(+) A-I      intronic
chr6:167422205(+) A-I      intronic
chr6:167422587(+) A-I      intronic
chr6:167429772(+) A-I      intronic
chr6:167423102(+) A-I      intronic
chr6:167423124(+) A-I      intronic
chr6:167434245(+) A-I      intronic
chr6:167422822(+) A-I      intronic
chr6:167434219(+) A-I      intronic
chr6:167419892(+) A-I      intronic
chr6:167430011(+) A-I      intronic
chr6:167430024(+) A-I      intronic
chr6:167422097(+) A-I      intronic
chr6:167434379(+) A-I      intronic
chr6:167434220(+) A-I      intronic
chr6:167434221(+) A-I      intronic
chr6:167432139(+) A-I      intronic
chr6:167434237(+) A-I      intronic
chr6:167434142(+) A-I      intronic
chr6:167430564(+) A-I      intronic
chr6:167434303(+) A-I      intronic
chr6:167422877(+) A-I      intronic
chr6:167422488(+) A-I      intronic

RNA Localization:


Resource Symbol Subcellular Localization Tissue or Cell Line PMID
RNALocate CEP43
Chromatin K562 cells     -
Cytosol HCC cell line (HepG2)|K562 cells     -
Exosome Blood     -
Membrane HCC cell line (HepG2)     -
Nucleolus K562 cells     -
Nucleoplasm K562 cells     -
Nucleus K562 cells     -
Ribosome Colon cancer cells     24393600

Interaction Network (The top 100 interactions):


Interactor1: zikv-mir-1
Interactor2: CEP43

Evidence Support:


Prediction-Evidence miRanda
Support Database ZIKV-CDB

Starting a new search, please wait ...