Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa-miR-17-5p | ORF1ab |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0000070 | 43740578 |
Organism | Homo sapiens | SARS-CoV-2 (NC_045512.2) |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | GU280_gp01 |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | |||||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-17-5p |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | hsa-miR-17-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ncDR | hsa-miR-17-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNAInter | hsa-miR-17-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NoncoRNA | hsa-miR-17-5p |
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Interactor1: hsa-miR-17-5p | Interactor2: ORF1ab |
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Prediction-Evidence | IntaRNA//miRanda//psRNATarget | |
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Support Database | ViRBase |
[1]PMID | 32765592 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | None | Interactor2 expression | None |
Description | From our rigorous analysis pipeline, which covers three different well-established algorithms (IntaRNA, miRanda, and psRNATarget) to predict RNA-RNA interactions, we have identified 122 and 106 host antiviral miRNAs against SARS-CoV (R) and SARS-CoV-2 (R), respectively (Figures 2A,B, Supplementary File 2). |
[2]PMID | 33173539 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | None | Interactor2 expression | None |
Description | We identified 1,018 miRNAs to target SARS-CoV-2 genes, among which 98 miRNAs are predicted to target SARS-CoV-2 genes uniquely when compared with other viruses studied here (Supplementary Table S6). |