Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa-miR-296-5p | VP3 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0000690 | VP3 |
Organism | Homo sapiens | Enterovirus A71 (EV-A71) |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | - |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-296-5p |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||||||||||||||
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RNALocate | hsa-miR-296-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ncDR | hsa-miR-296-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNAInter | hsa-miR-296-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | PMID |
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NoncoRNA | hsa-miR-296-5p |
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | ||
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RNAactDrug | hsa-miR-296-5p |
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Interactor1: hsa-miR-296-5p | Interactor2: VP3 |
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Strong-Evidence | Luciferase reporter assay//qRT-PCR//Western blot | |
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Prediction-Evidence | ViTa | |
Support Database | VIRmiRNA//VmiReg |
PMID | 23468506 | Target region | None |
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Source | VIRmiRNA//VmiReg | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | RD cells//SK-N-SH cells | Interactor2 expression | None |
Description | Two potential hsa-miR-296-5p targets (nt 2115 to 2135 and nt 2896 to 2920) located in the EV71 genome (strain BrCr) were bioinformatically predicted and validated by luciferase reporter assays and Western blotting. nt 2115 to 2135 and nt 2896 to 2920 are located in the coding regions for the VP3 and VP1 proteins, respectively. |