Detail Information
Binding sites in PDB | ||
---|---|---|
PDB | 1CZY |
Interactor1 | Interactor2 | |
---|---|---|
Symbol | hsa-miR-146a-5p | LMP-1 |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0000449 | 3783750 |
Organism | Homo sapiens | Human gammaherpesvirus 4 (Epstein-Barr virus, EPV) |
Category | miRNA | protein |
Alias | - | HHV4_LMP-1 |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
miRNASNP-v3 | hsa-miR-146a-5p |
|
Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RNALocate | hsa-miR-146a-5p |
|
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ncDR | hsa-miR-146a-5p |
|
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RNAInter | hsa-miR-146a-5p |
|
Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | PMID | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NoncoRNA | hsa-miR-146a-5p |
|
Interactor1: hsa-miR-146a-5p | Interactor2: LMP-1 |
---|
Strong-Evidence | IFA//Luciferase reporter assay//qRT-PCR//Western blot | |
---|---|---|
Support Database | ViRBase |
[1]PMID | 18057241 | Target region | 3'UTR |
---|---|---|---|
Source | ViRBase | Interactor1 expression | Upregulation |
Tissue or cell line | A549 cells//Akata cells//JY cells//Jijoye cells//Mutu cells//X50-7 cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | Through miRNA microarray analysis, we demonstrate that LMP1 dysregulates the expression of several cellular miRNAs, including the most highly regulated of these, miR-146a. Quantitative reverse transcription-PCR analysis confirmed induced expression of miR-146a by LMP1. Reporter studies demonstrated that LMP1 induces miR-146a predominantly through two NF-kappaB binding sites in the miR-146a promoter and identified a role for an Oct-1 site in conferring basal and induced expression. |
[2]PMID | 21152115 | Target region | 3'UTR |
---|---|---|---|
Source | ViRBase | Interactor1 expression | Upregulation |
Tissue or cell line | A549 cells//Akata cells//JY cells//Jijoye cells//Mutu cells//X50-7 cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | EBV oncoprotein LMP1 dysregulates the expression of several cellular miRNAs. LMP1 induces miR-146a predominantly through two NF-KB-binding sites in the miR-146a promoter. |
[3]PMID | 22843060 | Target region | None |
---|---|---|---|
Source | ViRBase | Interactor1 expression | Upregulation |
Tissue or cell line | CNE1 cells//CNE1-GL cells | Interactor2 expression | None |
Description | The results showed that when compared to CNE1 cells (no LMP1 expression), the pri-miRNA-146a level in CNE1-GL cells (LMP1 expressing) was significantly upregulated. The dual luciferase reporter assay indicated that in NPC cells LMP1 protein significantly enhanced the expression of miRNA-146a via promoter activation. |