Detail Information
Interactor1 | Interactor2 | |
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Symbol | hsa-miR-196b-5p | NS5A |
miRBase Accession/Entrez ID |
MIMAT0001080 | NS5A |
Organism | Homo sapiens | Hepacivirus C (Hepatitis C virus subtype 1b,HCV) |
Category | miRNA | mRNA |
Alias | - | - |
Resource | Symbol | SNP ID | SNP Position | Ref/Alt | |||||||||||||||
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miRNASNP-v3 | hsa-miR-196b-5p |
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Resource | Symbol | Subcellular Localization | Tissue or Cell Line | PMID | ||||||||||||||||||||||||||||||
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RNALocate | hsa-miR-196b-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ncDR | hsa-miR-196b-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID |
Function | Link | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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RNAInter | hsa-miR-196b-5p |
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Resource | Symbol | Drug Name | PubChem ID | PMID |
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NoncoRNA | hsa-miR-196b-5p |
Interactor1: hsa-miR-196b-5p | Interactor2: NS5A |
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Strong-Evidence | Luciferase reporter assay//qPCR//qRT-PCR//Western blot | |
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Weak-Evidence | Microarray | |
Prediction-Evidence | Targetscan | |
Support Database | ViRBase |
PMID | 20127796 | Target region | None |
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Source | ViRBase | Interactor1 expression | None |
Tissue or cell line | Con1 cells//Huh7.5.1 cells | Interactor2 expression | Downregulation |
Description | 50 nM of miR-196 transfection still resulted in a significant reduction of HCV core and NS5A expression in Huh-7. 5 cells transfected with Con1-Mut RNA, as observed in Huh-7. 5 cells transfected with Con1-WT RNA (Figure 7B & C), but the effect of miR-196 on HCV core and NS5A in Con1-Mut-transfected cells was slightly less than that in Con-WT-transfected cell (Figure 7D). |